Jump to content

Сплайсосомная РНК U6

Сплайсосомная РНК U6
Идентификаторы
Символ U6
Рфам RF00026
Другие данные
РНК Тип Джин ; мяРНК ; сращивание
Домен(ы) Эукариоты
ИДТИ GO:0000351 GO:0000353 GO:0030621 GO:0005688 GO:0046540
ТАК ТАК: 0000396
PDB Структуры ПДБе

мяРНК U6 — это некодирующий компонент малой ядерной РНК U6 (мяРНК) мяРНП ( малого ядерного рибонуклеопротеина ), комплекса РНК-белок, который объединяется с другими мяРНП, немодифицированной пре-мРНК и различными другими белками для сборки сплайсосомы , большого Молекулярный комплекс РНК-белок, катализирующий вырезание интронов из пре-мРНК . , или удаление интронов , является основным аспектом посттранскрипционной модификации и происходит только в ядре эукариот Сплайсинг .

Последовательность РНК U6 является наиболее консервативной среди всех пяти видов мяРНК, участвующих в сплайсосоме. [ 1 ] предполагая, что функция мяРНК U6 осталась одновременно важной и неизменной в ходе эволюции.

В геномах позвоночных часто можно обнаружить множество копий гена мяРНК U6 или псевдогенов , производных от U6 . [ 2 ] Эта распространенность «резервных копий» гена мяРНК U6 у позвоночных дополнительно предполагает его эволюционную важность для жизнеспособности организма.

Ген мяРНК U6 выделен у многих организмов. [ 3 ] включая C. elegans . [ 4 ] Среди них пекарские дрожжи ( Saccharomyces cerevisiae ) являются широко используемым модельным организмом при изучении мяРНК.

Структура и каталитический механизм мяРНК U6 напоминают структуру домена V интронов группы II. [ 5 ] [ 6 ] Считается, что образование тройной спирали в мяРНК U6 важно для активности сплайсинга, где ее роль заключается в переносе каталитического сайта в сайт сплайсинга. [ 6 ]

Специфичность пары оснований мяРНК U6 позволяет мяРНП U6 прочно связываться с мяРНК U4 и свободно с мяРНК U5 тройного мяРНП во время начальной фазы реакции сплайсинга. По мере развития реакции мяРНК U6 отрывается от U4 и связывается с мяРНК U2. На каждом этапе этой реакции вторичная структура мяРНК U6 претерпевает значительные конформационные изменения. [ 7 ]

Ассоциация мяРНК U6 с 5'-концом интрона посредством спаривания оснований во время реакции сплайсинга происходит до образования лариатного ( или лассо ) промежуточного соединения и необходима для продолжения процесса сплайсинга. Ассоциация мяРНП U6 с мяРНП U2 посредством спаривания оснований образует комплекс U6-U2, структуру, которая включает центр сплайсосомы активный . [ 8 ] : 433–437 

Вторичная структура

[ редактировать ]

Хотя предполагаемая консенсусная пара оснований вторичной структуры ограничена короткой 5'- стежкой-петлей , для конкретных организмов, таких как дрожжи, были предложены гораздо более обширные структуры. [ 9 ] В дополнение к 5'-стеблевой петле все подтвержденные мяРНК U6 могут образовывать предполагаемую 3'-стволовую петлю. [ 10 ]

Комплекс мяРНК U4/U6

Известно, что мяРНК U6 образует обширные взаимодействия пар оснований с мяРНК U4 . [ 11 ] Было показано, что это взаимодействие является взаимоисключающим по сравнению с взаимодействием внутримолекулярной стволовой петли 3'. [ 7 ]

Связанные белки

[ редактировать ]
Lsm-связывание мяРНК U6

Обнаружено, что свободная мяРНК U6 связана с белками Prp24 и LSms . Считается, что Prp24 образует промежуточный комплекс с мяРНК U6, чтобы облегчить обширное спаривание оснований между мяРНК U4 и U6, а Lsms могут способствовать связыванию Prp24. Было определено приблизительное расположение этих связывающих белок доменов, а затем белки были визуализированы с помощью электронной микроскопии. Это исследование предполагает, что в свободной форме U6 Prp24 связывается с телестеблем, а богатый уридином 3'-хвост мяРНК U6 проходит через кольцо Lsms. Другим важным белком, родственным NTC, связанным с U6, является Cwc2, который путем взаимодействия с важными каталитическими элементами РНК индуцирует образование функционального каталитического ядра в сплайсосоме. Cwc2 и U6 достигают образования этого комплекса за счет взаимодействия с ISL и областями, расположенными вблизи 5'-сайта сплайсинга. [ 12 ]

См. также

[ редактировать ]
  1. ^ Брови Д.А., Гатри С. (июль 1988 г.). «Сплицеосомная РНК U6 удивительно консервативна от дрожжей до млекопитающих». Природа . 334 (6179): 213–8. Бибкод : 1988Natur.334..213B . дои : 10.1038/334213a0 . ПМИД   3041282 . S2CID   4236176 .
  2. ^ Марц М., Кирстен Т., Стадлер П.Ф. (декабрь 2008 г.). «Эволюция генов сплайсосомных мяРНК у многоклеточных животных» . Журнал молекулярной эволюции (представленная рукопись). 67 (6): 594–607. Бибкод : 2008JMolE..67..594M . дои : 10.1007/s00239-008-9149-6 . ПМИД   19030770 . S2CID   18830327 .
  3. ^ Андерсон М.А., Перселл Дж., Веркуйл С.А., Норман В.К., Лефтвич П.Т., Харви-Сэмюэл Т., Алфи Л.С. (март 2020 г.). «Валидация промоутеров Pol III in vitro» . ACS Синтетическая биология . 9 (3): 678–681. doi : 10.1021/acsynbio.9b00436 . ПМК   7093051 . ПМИД   32129976 .
  4. ^ Томас Дж., Леа К., Цукер-Априсон Э., Блюменталь Т. (май 1990 г.). «Сплайсосомные мяРНК Caenorhabditis elegans» . Исследования нуклеиновых кислот . 18 (9): 2633–42. дои : 10.1093/нар/18.9.2633 . ПМК   330746 . ПМИД   2339054 .
  5. ^ Тор Н., Китинг К.С., Тейлор С.Д., Пайл А.М. (апрель 2008 г.). «Кристаллическая структура самосплайсируемого интрона группы II» . Наука . 320 (5872): 77–82. Бибкод : 2008Sci...320...77T . дои : 10.1126/science.1153803 . ПМК   4406475 . ПМИД   18388288 .
  6. ^ Jump up to: а б Фика С.М., Меффорд М.А., Пиччирилли Дж.А., Стейли Дж.П. (май 2014 г.). «Доказательства существования интроноподобного каталитического триплекса группы II в сплайсосоме» . Структурная и молекулярная биология природы . 21 (5): 464–471. дои : 10.1038/nsmb.2815 . ПМЦ   4257784 . ПМИД   24747940 .
  7. ^ Jump up to: а б Фортнер Д.М., Трой Р.Г., Броу Д.А. (январь 1994 г.). «Стебель/петля в РНК U6 определяет конформационный переключатель, необходимый для сплайсинга пре-мРНК» . Гены и развитие . 8 (2): 221–33. дои : 10.1101/gad.8.2.221 . ПМИД   8299941 .
  8. ^ Уивер, Роберт Дж. (2008). Молекулярная биология . Бостон: Высшее образование Макгроу Хилл. ISBN  978-0-07-127548-4 .
  9. ^ Карадуман Р., Фабрицио П., Хартмут К., Урлауб Х., Люрманн Р. (март 2006 г.). «Структура РНК и взаимодействия РНК-белок в очищенных мяРНП U6 дрожжей». Журнал молекулярной биологии . 356 (5): 1248–62. дои : 10.1016/j.jmb.2005.12.013 . HDL : 11858/00-001M-0000-0012-E5F7-6 . ПМИД   16410014 .
  10. ^ Мясник С.Е., Броу Д.А. (июнь 2005 г.). «На пути к пониманию каталитической основной структуры сплайсосомы». Труды Биохимического общества . 33 (Часть 3): 447–9. дои : 10.1042/BST0330447 . ПМИД   15916538 .
  11. ^ Орум Х., Нильсен Х., Энгберг Дж. (ноябрь 1991 г.). «Сплайсосомальные малые ядерные РНК Tetrahymena thermophila и некоторые возможные взаимодействия спаривания оснований мяРНК-мяРНК». Журнал молекулярной биологии . 222 (2): 219–32. дои : 10.1016/0022-2836(91)90208-Н . ПМИД   1960724 .
  12. ^ Раше Н., Дыбков О., Шмитцова Дж., Акилдиз Б., Фабрицио П., Люрманн Р. (март 2012 г.). «Cwc2 и его человеческий гомолог RBM22 способствуют активной конформации каталитического центра сплайсосомы» . Журнал ЭМБО . 31 (6): 1591–604. дои : 10.1038/emboj.2011.502 . ПМК   3321175 . ПМИД   22246180 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 2339a38c353e90626d3226f50f692dd5__1701384240
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/23/d5/2339a38c353e90626d3226f50f692dd5.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
U6 spliceosomal RNA - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)