Прп24
Prp24 ( p рекурсора РНК - процессинг , ген 24 ) представляет собой белковую часть премессенджерной РНК процесса сплайсинга и способствует связыванию мяРНК U6 с мяРНК U4 во время образования сплайсосом . Prp24, обнаруженный у эукариот от дрожжей до E. coli , грибов и человека, был первоначально обнаружен как важный элемент сплайсинга РНК в 1989 году. [ 1 ] [ 2 ] Позже в 1991 году были обнаружены мутации в Prp24, подавляющие мутации в U4, которые привели к появлению чувствительных к холоду штаммов дрожжей, что указывает на его участие в преобразовании дуплекса U4/U6 после каталитических стадий сплайсинга. [ 3 ]
Биологическая роль
[ редактировать ]В процессе образования сплайсосомы участвуют мяРНП U4 и U6, связывающиеся и образующие ди-мяРНП в ядре клетки . Этот ди-мяРНП затем рекрутирует другого члена ( U5 ), чтобы стать три-мяРНП. Затем U6 должен диссоциировать от U4, чтобы связаться с U2 и стать каталитически активным. После завершения сплайсинга U6 должен диссоциировать от сплайсосомы и снова соединиться с U4, чтобы возобновить цикл.
Было показано, что Prp24 способствует связыванию мяРНП U4 и U6. Удаление Prp24 приводит к накоплению свободных U4 и U6, а последующее добавление Prp24 регенерирует U4/U6 и уменьшает количество свободных U4 и U6. [ 4 ] Голая мяРНК U6 очень компактна и имеет мало места для образования пар оснований с другой РНК. Однако когда мяРНП U6 связывается с такими белками, как Prp24, структура становится гораздо более открытой, что облегчает связывание с U4. [ 5 ] Prp24 не присутствует в самом дуплексе U6/U4, и было высказано предположение, что Prp24 должен покинуть комплекс, чтобы образовались правильные пары оснований. [ 6 ] [ 7 ] Также было высказано предположение, что Prp24 может играть роль в дестабилизации U4/U6, чтобы U6 соединял основания с U2. [ 8 ]
Структура
[ редактировать ]
Prp24 имеет молекулярную массу 50 кДа и, как было показано, содержит четыре мотива узнавания РНК (RRM) и консервативную последовательность из 12 аминокислот на С-конце . [ 9 ] [ 10 ] Было показано, что RRM 1 и 2 важны для с высоким сродством , тогда как RRM 3 и 4 связываются с сайтами с более низким сродством на U6. связывания U6 [ 11 ] Первые три RRM активно взаимодействуют друг с другом и содержат канонические складки, содержащие четырехцепочечный бета-лист и две альфа-спирали . Электроположительная поверхность RRM 1 и 2 представляет собой домен отжига РНК , тогда как щель между RRM 1 и 2, включая поверхность бета-листа RRM2, представляет собой специфичный для последовательности сайт связывания РНК. [ 1 ] С-концевой мотив необходим для ассоциации с белками LSm и способствует связыванию субстрата (U6), а не каталитической скорости сплайсинга. [ 10 ]
Взаимодействия
[ редактировать ]Prp24 взаимодействует с мяРНК U6 через свои RRM. было показано на химическую модификацию С помощью испытаний , что нуклеотиды 39–57 U6 (в частности, 40–43) [ 5 ] участвуют в связывании Prp24. [ 12 ]
Белки LSm имеют согласованную конфигурацию на РНК U6. [ 9 ] [ нужны разъяснения ] Было высказано предположение, что белки LSm и Prp24 взаимодействуют как физически, так и функционально. [ 6 ] и С-концевой мотив Prp24 важен для этого взаимодействия. [ 10 ] Связывание Prp24 с U6 усиливается за счет связывания белков Lsm с U6, как и связывание U4 и U6. [ 13 ] было обнаружено С помощью электронной микроскопии , что Prp24 может взаимодействовать с белковым кольцом LSm на уровне LSm2. [ 9 ]
Гомологи
[ редактировать ]имеет человеческий гомолог SART3 Prp24 . опухолевого отторжения SART3 представляет собой антиген (SART3 означает « четырехклеточной карциномы антиген , распознаваемый клетками Т- , ген 3 »). RRM 1 и 2 в дрожжах аналогичны RRM в SART3 человека. [ 1 ] [ 11 ] С-концевой домен также высоко консервативен от дрожжей до человека. [ 14 ] Этот белок, как и Prp24, взаимодействует с белками LSm. [ 9 ] [ 15 ] для переработки U6 в мяРНП U4/U6. Было предложено, чтобы SART3 нацеливал U6 на тело Кахаля или ядерное включение в качестве места сборки мяРНП U4/U6. [ 15 ] SART3 расположен на хромосоме 12 , и мутация , вероятно, является причиной диссеминированного поверхностного актинического порокератоза . [ 16 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с Бэ, Э.; и др. (2007). «Структура и взаимодействие первых трех мотивов узнавания РНК фактора сплайсинга Prp24» . Журнал молекулярной биологии . 367 (5): 1447–1458. дои : 10.1016/j.jmb.2007.01.078 . ЧВК 1939982 . ПМИД 17320109 .
- ^ Виджайрагаван, У.; Компания, М.; Абельсон, Дж. (1989). «Выделение и характеристика мутантов сплайсинга пре-мРНК Saccharomyces cerevisiae » . Гены и развитие . 3 (8): 1206–1216. дои : 10.1101/gad.3.8.1206 . ПМИД 2676722 .
- ^ Шеннон, КВ; Гатри, К. (1991). «Супрессоры мутации мяРНК U4 определяют новый белок мяРНП U6 с РНК-связывающими мотивами» . Гены и развитие . 5 (5): 773–785. дои : 10.1101/gad.5.5.773 . ПМИД 1827420 .
- ^ Рагунатан, Польша; Гатри, Калифорния (1998). «Фактор сплайсосомной рециркуляции, который повторно отжигает небольшие ядерные рибонуклеопротеиновые частицы U4 и U6». Наука . 279 (5352): 857–860. Бибкод : 1998Sci...279..857R . дои : 10.1126/science.279.5352.857 . ПМИД 9452384 .
- ^ Jump up to: а б Карадуман, Р.; и др. (2006). «Структура РНК и взаимодействия РНК с белками в очищенных мяРНП U6 дрожжей». Журнал молекулярной биологии . 356 (5): 1248–1262. дои : 10.1016/j.jmb.2005.12.013 . HDL : 11858/00-001M-0000-0012-E5F7-6 . ПМИД 16410014 .
- ^ Jump up to: а б Видал, вице-президент; и др. (1995). «Характеристика взаимодействий мяРНК U6 с белком» . РНК . 5 (11): 1470–1481. дои : 10.1017/S1355838299991355 . ПМЦ 1369868 . ПМИД 10580475 .
- ^ Яндрозиц, А.; Гатри, А. (1995). «Доказательства наличия сайта связывания Prp24 в мяРНК U6 и в предполагаемом промежуточном продукте при отжиге мяРНК U6 и U4» . Журнал ЭМБО . 14 (4): 820–832. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07060.x . ПМЦ 398149 . ПМИД 7882985 .
- ^ Видавер, РМ; Фортнер, DM; Лоос-Остин, Лос-Анджелес; Броу, Д.А. (1999). «Множественные функции сплайсингового белка Prp24 Saccharomyces cerevisiae в структурных перестройках РНК U6» . Генетика . 153 (3): 1205–1218. дои : 10.1093/генетика/153.3.1205 . ПМЦ 1460831 . ПМИД 10545453 .
- ^ Jump up to: а б с д Карадуман, Р.; и др. (2008). «Структура дрожжевых мяРНП U6: расположение Prp24p и комплекса LSm, выявленное с помощью электронной микроскопии» . РНК . 14 (12): 1–10. дои : 10.1261/rna.1369808 . ПМК 2590955 . ПМИД 18971323 .
- ^ Jump up to: а б с Рейдер, С.Д.; Гатри, К. (2002). «Консервативный мотив взаимодействия Lsm в Prp24, необходимый для эффективного образования ди-мяРНП U4/U6» . РНК . 8 (11): 1378–1392. дои : 10.1017/S1355838202020010 . ПМК 1370345 . ПМИД 12458792 .
- ^ Jump up to: а б Кван, СС; Броу, Д.А. (2005). «Мотивы узнавания N- и C-концевой РНК фактора сплайсинга Prp24 выполняют разные функции при связывании РНК U6» . РНК . 11 (5): 808–820. дои : 10.1261/rna.2010905 . ПМК 1370765 . ПМИД 15811912 .
- ^ Гетти, А.; Компания, М.; Абельсон, Дж. (1995). «Специфичность связывания Prp24 с РНК: роль Prp24 в динамическом взаимодействии мяРНК U4 и U6» . РНК . 1 (2): 132–145. ПМК 1369067 . ПМИД 7585243 .
- ^ Райан, Делавэр; Стивенс, Юго-Запад; Абельсон, Дж. (2002). «5' и 3' домены дрожжевой мяРНК U6: белки Lsm облегчают связывание белка Prp24 с областью телестебля U6» . РНК . 8 (8): 1011–1033. дои : 10.1017/S1355838202026092 . ПМК 1370313 . ПМИД 12212846 .
- ^ Белл, М.; и др. (2002). «p110, новый человеческий белок мяРНП U6 и фактор рециркуляции мяРНП U4/U6» . Журнал ЭМБО . 21 (11): 2724–2735. дои : 10.1093/emboj/21.11.2724 . ПМК 126028 . ПМИД 12032085 .
- ^ Jump up to: а б Станек, Д.; и др. (2003). «Нацеливание фактора сборки малого ядерного RNP U4/U6 SART3/p110 на тела Кахаля» . Журнал клеточной биологии . 160 (4): 505–516. дои : 10.1083/jcb.200210087 . ПМК 2173746 . ПМИД 12578909 .
- ^ «ОМИМ – ПОРОКЕРАТОЗ, РАСПРОСТРАНЕННАЯ ПОВЕРХНОСТНАЯ АКТИНИЦА, 1; DSAP1» . Проверено 5 апреля 2009 г.
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Биологические науки в Ланкастерском университете. Объяснение сплайсинга пре-мРНК.