САРТ3

САРТ3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	2DO4, 5JJW, 5JJX, 5CTT, 5CTR, 5JPZ, 5CTQ
Идентификаторы
Псевдонимы	SART3 , DSAP1, P100, RP11-13G14, TIP110, p110, p110(nrb), антиген плоскоклеточной карциномы, распознаваемый Т-клетками 3, антиген плоскоклеточной карциномы, распознаваемый Т-клетками 3, фактор 3, связанный со сплайсосомой, рециклирующий белок U4/U6
Внешние идентификаторы	Опустить : 611684 ; МГИ : 1858230 ; Гомологен : 40977 ; Генные карты : SART3 ; ОМА : SART3 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 12 (human)
End	108,561,400 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	113,910,571 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	endothelial cell; ; secondary oocyte; ; tendon of biceps brachii; ; sural nerve; ; Achilles tendon; ; nipple; ; internal globus pallidus; ; cerebellar hemisphere; ; cerebellar vermis; ; epithelium of colon;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; zygote; ; neural layer of retina; ; oocyte; ; primary oocyte; ; secondary oocyte; ; genital tubercle; ; epiblast; ; ventricular zone; ; lumbar subsegment of spinal cord;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	U6atac snRNA binding; histone binding; U4 snRNA binding; protein binding; nucleic acid binding; ubiquitin-specific protease binding; U6 snRNA binding; RNA binding;
Cellular component	cytoplasm; Cajal body; nuclear speck; U4/U6 x U5 tri-snRNP complex; nucleoplasm; U4/U6 snRNP; U6atac snRNP; U4atac/U6atac snRNP; nucleus; ASAP complex;
Biological process	mRNA splicing, via spliceosome; nucleosome assembly; RNA processing; spliceosomal tri-snRNP complex assembly; homeostasis of number of cells; positive regulation of histone deubiquitination; hematopoietic stem cell proliferation; mRNA processing; spliceosomal snRNP assembly; cell morphogenesis; RNA splicing; regulation of gene expression; regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	9733
	53890
	ENSG00000075856
	ENSMUSG00000018974
	Q15020
	Q9JLI8
	НМ_014706
	НМ_016926 ; НМ_001356621 ; НМ_001356623
	НП_055521
	НП_058622 ; НП_001343550 ; НП_001343552
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Антиген плоскоклеточной карциномы, распознаваемый Т-клетками 3, представляет собой белок , который у человека кодируется SART3 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Белок , кодируемый этим геном, представляет собой РНК-связывающий ядерный белок, который является антигеном отторжения опухоли . Этот антиген обладает опухолевыми эпитопами, способными индуцировать HLA-A24 -рестриктированные и опухолеспецифические цитотоксические Т-лимфоциты у онкологических больных и может быть полезен для специфической иммунотерапии . Обнаружено, что этот генный продукт является важным клеточным фактором экспрессии гена ВИЧ-1 и репликации вируса. U6 и U4/U6 Он также временно связывается с мяРНП во время фазы рециркуляции сплайсосомного цикла. Считается, что этот кодируемый белок участвует в регуляции сплайсинга мРНК . ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что SART3 взаимодействует с RNPS1. ^{[ 8 ]} и рецептор андрогенов . ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000075856 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018974 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Нагасе Т., Секи Н., Танака А., Исикава К., Номура Н. (август 1995 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. IV. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0121-KIAA0160), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1» . Исследование ДНК . 2 (4): 167–74, 199–210. дои : 10.1093/dnares/2.4.167 . ПМИД 8590280 .
^ Харада К., Ямада А., Мине Т., Каваго Н., Такасу Х., Ито К. (февраль 2000 г.). «Мышиный гомолог человеческого гена SART3, кодирующего антиген опухолевого отторжения» . Японский журнал исследований рака . 91 (2): 239–47. дои : 10.1111/j.1349-7006.2000.tb00937.x . ПМЦ 5926322 . ПМИД 10761712 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: антиген плоскоклеточной карциномы SART3, распознаваемый Т-клетками 3» .
^ Харада К., Ямада А., Ян Д., Ито К., Ситидзё С. (сентябрь 2001 г.). «Связывание опухолевого антигена SART3 с фактором сплайсинга пре-мРНК RNPS1: возможная регуляция сплайсинга путем образования комплекса» . Международный журнал рака . 93 (5): 623–8. дои : 10.1002/ijc.1391 . ПМИД 11477570 . S2CID 24724555 .
^ Лю Ю, Ким Б.О., Као С., Юнг С., Далтон Дж.Т., Хэ Дж.Дж. (май 2004 г.). «Tip110, Tat-взаимодействующий белок вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) массой 110 кДа как негативный регулятор активации транскрипции андрогенного рецептора (AR)» . Журнал биологической химии . 279 (21): 21766–73. дои : 10.1074/jbc.M314321200 . ПМИД 15031286 .

Дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Ян Д., Накао М., Ситидзё С., Сасатоми Т., Такасу Х., Мацумото Х., Мори К., Хаяши А., Ямана Х., Ширузу К., Ито К. (август 1999 г.). «Идентификация гена, кодирующего белок, обладающий общими опухолевыми эпитопами, способными индуцировать HLA-A24-рестриктированные цитотоксические Т-лимфоциты у онкологических больных». Исследования рака . 59 (16): 4056–63. ПМИД 10463607 .
Танака С., Цуда Н., Кавано К., Сакамото М., Нисида Т., Хашимото Т., Ситидзё С., Камура Т., Ито К. (ноябрь 2000 г.). «Экспрессия антигенов опухолевого отторжения при гинекологическом раке» . Японский журнал исследований рака . 91 (11): 1177–84. дои : 10.1111/j.1349-7006.2000.tb00902.x . ПМК 5926290 . ПМИД 11092984 .
Харада К., Ямада А., Ян Д., Ито К., Ситидзё С. (сентябрь 2001 г.). «Связывание опухолевого антигена SART3 с фактором сплайсинга пре-мРНК RNPS1: возможная регуляция сплайсинга путем образования комплекса» . Международный журнал рака . 93 (5): 623–8. дои : 10.1002/ijc.1391 . ПМИД 11477570 . S2CID 24724555 .
Сасатоми Т., Суэфудзи Ю., Мацунага К., Ямана Х., Мияги Ю., Араки Ю., Огата Ю., Ито К., Ширузу К. (март 2002 г.). «Экспрессия антигенов опухолевого отторжения при колоректальном раке» . Рак . 94 (6): 1636–41. дои : 10.1002/cncr.10421 . ПМИД 11920522 . S2CID 33045822 .
Лю Ю, Ли Джей, Ким БО, Пейс Б.С., Хэ Джей-Джей (июнь 2002 г.). «Опосредованная белком Tat ВИЧ-1 трансактивация промотора длинного концевого повтора ВИЧ-1 усиливается новым ядерным Tat-взаимодействующим белком массой 110 кДа, Tip110» . Журнал биологической химии . 277 (26): 23854–63. дои : 10.1074/jbc.M200773200 . ПМИД 11959860 .
Белл М., Шрайнер С., Дамианов А., Редди Р., Биндерейф А. (июнь 2002 г.). «p110, новый человеческий белок мяРНП U6 и фактор рециркуляции мяРНП U4/U6» . Журнал ЭМБО . 21 (11): 2724–35. дои : 10.1093/emboj/21.11.2724 . ПМК 126028 . ПМИД 12032085 .
Ноттротт С., Урлауб Х., Люрманн Р. (октябрь 2002 г.). «Иерархические кластерные белковые взаимодействия с мяРНК U4/U6: биохимическая роль белков U4/U6» . Журнал ЭМБО . 21 (20): 5527–38. дои : 10.1093/emboj/cdf544 . ПМК 129076 . ПМИД 12374753 .
Накаяма М., Кикуно Р., Охара О (ноябрь 2002 г.). «Белко-белковые взаимодействия между крупными белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК» . Геномные исследования . 12 (11): 1773–84. дои : 10.1101/гр.406902 . ПМК 187542 . ПМИД 12421765 .
Станек Д., Радер С.Д., Клингауф М., Нойгебауэр К.М. (февраль 2003 г.). «Нацеливание фактора сборки малого ядерного RNP U4/U6 SART3/p110 на тела Кахаля» . Журнал клеточной биологии . 160 (4): 505–16. дои : 10.1083/jcb.200210087 . ПМК 2173746 . ПМИД 12578909 .
Дамианов А, Шрайнер С, Биндерейф А (февраль 2004 г.). «Переработка сплайсосомы типа U12 требует p110, компонента мяРНП U6atac» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (4): 1700–8. дои : 10.1128/MCB.24.4.1700-1708.2004 . ПМК 344176 . ПМИД 14749385 .
Лю Ю, Ким Б.О., Као С., Юнг С., Далтон Дж.Т., Хэ Дж.Дж. (май 2004 г.). «Tip110, Tat-взаимодействующий белок вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) массой 110 кДа как негативный регулятор активации транскрипции андрогенного рецептора (AR)» . Журнал биологической химии . 279 (21): 21766–73. дои : 10.1074/jbc.M314321200 . ПМИД 15031286 .
Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С., Лей С., Мурадж Дж., Фиск Г.Дж., Ли Ю, Сюй С., Фанг Р., Гуглер К., Рао М.С., Мандалам Р., Лебковски Дж., Стэнтон Л.В. (июнь 2004 г.). «Описание характеристик транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Природная биотехнология . 22 (6): 707–16. дои : 10.1038/nbt971 . ПМИД 15146197 . S2CID 27764390 .
Меденбах Дж., Шрайнер С., Лю С., Люрманн Р., Биндерейф А. (сентябрь 2004 г.). «Фактор рециркуляции snRNP человека U4/U6 p110: мутационный анализ выявляет функцию повторного домена тетратрикопептида при рециркуляции» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (17): 7392–401. дои : 10.1128/MCB.24.17.7392-7401.2004 . ПМК 506986 . ПМИД 15314151 .
Станек Д., Нойгебауэр К.М. (сентябрь 2004 г.). «Обнаружение промежуточных продуктов сборки мяРНП в тельцах Кахаля методом резонансного переноса энергии флуоресценции» . Журнал клеточной биологии . 166 (7): 1015–25. дои : 10.1083/jcb.200405160 . ПМК 2172029 . ПМИД 15452143 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 12 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000075856 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018974 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8590280-5] Нагасе Т., Секи Н., Танака А., Исикава К., Номура Н. (август 1995 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. IV. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0121-KIAA0160), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1» . Исследование ДНК . 2 (4): 167–74, 199–210. дои : 10.1093/dnares/2.4.167 . ПМИД 8590280 .

[pmid10761712-6] Харада К., Ямада А., Мине Т., Каваго Н., Такасу Х., Ито К. (февраль 2000 г.). «Мышиный гомолог человеческого гена SART3, кодирующего антиген опухолевого отторжения» . Японский журнал исследований рака . 91 (2): 239–47. дои : 10.1111/j.1349-7006.2000.tb00937.x . ПМЦ 5926322 . ПМИД 10761712 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: антиген плоскоклеточной карциномы SART3, распознаваемый Т-клетками 3» .

[pmid11477570-8] Харада К., Ямада А., Ян Д., Ито К., Ситидзё С. (сентябрь 2001 г.). «Связывание опухолевого антигена SART3 с фактором сплайсинга пре-мРНК RNPS1: возможная регуляция сплайсинга путем образования комплекса» . Международный журнал рака . 93 (5): 623–8. дои : 10.1002/ijc.1391 . ПМИД 11477570 . S2CID 24724555 .

[pmid15031286-9] Лю Ю, Ким Б.О., Као С., Юнг С., Далтон Дж.Т., Хэ Дж.Дж. (май 2004 г.). «Tip110, Tat-взаимодействующий белок вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) массой 110 кДа как негативный регулятор активации транскрипции андрогенного рецептора (AR)» . Журнал биологической химии . 279 (21): 21766–73. дои : 10.1074/jbc.M314321200 . ПМИД 15031286 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]