Сплайсосомная РНК U5
Сплайсосомная РНК U5 | |
---|---|
Идентификаторы | |
Символ | U5 |
Рфам | RF00020 |
Другие данные | |
РНК Тип | Джин ; мяРНК ; сращивание |
Домен(ы) | Эукариоты |
ИДТИ | GO:0000351 GO:0000353 GO:0005682 GO:0046540 |
ТАК | ТАК: 0000395 |
PDB Структуры | ПДБе |
мяРНК U5 представляет собой малую ядерную РНК (мяРНК), которая участвует в сплайсинге РНК в качестве компонента сплайсосомы . Он образует мяРНП U5 ( малый ядерный рибонуклеопротеин ) путем ассоциации с несколькими белками, включая Prp8 — самый крупный и наиболее консервативный белок в сплайсосоме, Brr2 — хеликазу , необходимую для активации сплайсосомы, Snu114 и белки 7 Sm. [ 1 ] мяРНК U5 образует серию коаксиально уложенных спиралей, которые выступают в активный центр сплайсосомы. [ 2 ] [ 3 ] Петля 1, замыкающая этот ряд спиралей, образует 4-5 пар оснований с 5'-экзоном в ходе двух химических реакций сплайсинга. [ 4 ] [ 5 ] Это взаимодействие, по-видимому, особенно важно на втором этапе сплайсинга — лигировании экзонов. [ 6 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Стивенс С.В., Барта И., Ге Х.И., Мур Р.Э., Янг М.К., Ли Т.Д., Абельсон Дж. (ноябрь 2001 г.). «Биохимический и генетический анализ малых ядерных рибонуклеопротеинов U5, U6 и U4/U6 x U5 из Saccharomyces cerevisiae» . РНК . 7 (11): 1543–53. ПМК 1370197 . ПМИД 11720284 .
- ^ Нгуен Т.Х., Галей В.П., Бай XC, Савва К.Г., Ньюман А.Дж., Шерес С.Х., Нагай К. (июль 2015 г.). «Архитектура сплайсосомного три-мяРНП U4/U6.U5» . Природа . 523 (7558): 47–52. Бибкод : 2015Natur.523...47N . дои : 10.1038/nature14548 . ПМК 4536768 . ПМИД 26106855 .
- ^ Ян С., Ханг Дж., Ван Р., Хуан М., Вонг CC, Ши Ю (сентябрь 2015 г.). «Структура дрожжевой сплайсосомы с разрешением 3,6 ангстрем». Наука . 349 (6253): 1182–91. Бибкод : 2015Sci...349.1182Y . дои : 10.1126/science.aac7629 . ПМИД 26292707 . S2CID 22194712 .
- ^ Ньюман А.Дж., Норман С. (февраль 1992 г.). «U5 мяРНК взаимодействует с последовательностями экзонов в 5'- и 3'-сайтах сплайсинга». Клетка . 68 (4): 743–54. дои : 10.1016/0092-8674(92)90149-7 . ПМИД 1739979 . S2CID 3328508 .
- ^ Зонтхаймер Э.Дж., Стейц Дж.А. (декабрь 1993 г.). «Малые ядерные РНК U5 и U6 как компоненты активного центра сплайсосомы». Наука . 262 (5142): 1989–96. Бибкод : 1993Sci...262.1989S . дои : 10.1126/science.8266094 . ПМИД 8266094 .
- ^ О'Киф RT, Норман С., Ньюман А.Дж. (август 1996 г.). «Инвариантная последовательность петли 1 мяРНК U5 необязательна для первого каталитического этапа сплайсинга пре-мРНК у дрожжей» . Клетка . 86 (4): 679–89. дои : 10.1016/s0092-8674(00)80140-3 . ПМИД 8752221 . S2CID 17484887 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Звиб С. (январь 1997 г.). «База данных мРНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 25 (1): 102–3. дои : 10.1093/нар/25.1.102 . ПМК 146409 . ПМИД 9016512 .
- Томас Дж., Лиа К., Цукер-Априсон Э., Блюменталь Т. (май 1990 г.). «Сплайсосомальные мяРНК Caenorhabditis elegans» . Исследования нуклеиновых кислот . 18 (9): 2633–42. дои : 10.1093/нар/18.9.2633 . ПМК 330746 . ПМИД 2339054 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]