ПРПФ6

ПРПФ6
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	3JCR
Идентификаторы
Псевдонимы	PRPF6 , ANT-1, ANT1, C20orf14, Prp6, RP60, SNRNP102, TOM, U5-102K, hPrp6, фактор процессинга пре-мРНК 6
Внешние идентификаторы	Опустить : 613979 ; МГИ : 1922946 ; Гомологен : 5368 ; Генные карты : PRPF6 ; ОМА : PRPF6 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 20 (human)
End	64,033,100 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	181,297,453 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	tendon of biceps brachii; ; paraflocculus of cerebellum; ; beta cell; ; right hemisphere of cerebellum; ; ganglionic eminence; ; right uterine tube; ; ventricular zone; ; skin of leg; ; Achilles tendon; ; popliteal artery;
	Top expressed in
	supraoptic nucleus; ; aortic valve; ; ascending aorta; ; Rostral migratory stream; ; fossa; ; condyle; ; internal carotid artery; ; external carotid artery; ; zygote; ; primary oocyte;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	transcription coactivator activity; protein binding; androgen receptor binding; RNA binding; ribonucleoprotein complex binding;
Cellular component	U4/U6 x U5 tri-snRNP complex; catalytic step 2 spliceosome; membrane; U5 snRNP; spliceosomal complex; nucleus; nucleoplasm; nuclear speck; U2-type precatalytic spliceosome;
Biological process	mRNA splicing, via spliceosome; RNA processing; spliceosomal tri-snRNP complex assembly; RNA splicing, via transesterification reactions; mRNA processing; spliceosomal complex assembly; RNA localization; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; RNA splicing;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	24148
	68879
	ENSG00000101161
	ENSMUSG00000002455
	О94906
	Q91YR7
	НМ_012469
	НМ_133701
	НП_036601
	НП_598462
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фактор процессинга пре-мРНК 6 представляет собой белок , который у человека кодируется PRPF6 геном . ^[5]^[6]^[7]

Белок, кодируемый этим геном, по-видимому, участвует в сплайсинге пре-мРНК, возможно, действуя как связующий фактор между мяРНП U5 и U4/U6 при формировании сплайсосомы. Кодируемый белок также может связываться с рецептором андрогена, обеспечивая связь между активацией транскрипции и сплайсингом. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что PRPF6 взаимодействует с TXNL4B . ^[8] МЕДЛЕННЫЙ ^[9]^[10] и рецептор андрогенов . ^[11]

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000101161 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000002455 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Нишикими А., Мукаи Дж., Киока Н., Ямада М. (январь 2000 г.). «Новый ядерный белок млекопитающих, аналогичный факторам сплайсинга пре-мРНК Schizosaccharomyces pombe Prp1p/Zer1p и Saccharomyces cerevisiae Prp6p». Биохим Биофиз Акта . 1435 (1–2): 147–52. дои : 10.1016/s0167-4838(99)00203-4 . ПМИД 10561546 .
^ Макаров Е.М., Макарова О.В., Аксель Т., Лурманн Р. (июнь 2000 г.). «Человеческий гомолог дрожжевого фактора сплайсинга prp6p содержит несколько элементов TPR и стабильно связан с мяРНП U5 посредством белок-белковых взаимодействий». Дж Мол Биол . 298 (4): 567–75. дои : 10.1006/jmbi.2000.3685 . ПМИД 10788320 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Entrez: гомолог фактора 6 процессинга пре-мРНК PRP6 PRPF6 (S. cerevisiae)» .
^ Сунь, Сяоцзин; Чжан Хуа; Ван Дэн; Ма Далонг; Шэнь Янь; Шан Юнфэн (июль 2004 г.). «DLP, новый белок семейства Dim1, участвующий в сплайсинге пре-мРНК и развитии клеточного цикла» . Ж. Биол. Хим . 279 (31). США: 32839–47. дои : 10.1074/jbc.M402522200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 15161931 .
^ Юрьев Антон; Венногл Лоуренс П. (февраль 2003 г.). «Новые белок-белковые взаимодействия киназы raf, обнаруженные с помощью исчерпывающего двухгибридного анализа дрожжей». Геномика . 81 (2). США: 112–25. дои : 10.1016/S0888-7543(02)00008-3 . ISSN 0888-7543 . ПМИД 12620389 .
^ Юрьев А; Оно М; Гофф С.А.; Макалузо Ф; Венногл LP (июль 2000 г.). «Изоформ-специфическая локализация A-RAF в митохондриях» . Мол. Клетка. Биол . 20 (13). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 4870–8. дои : 10.1128/MCB.20.13.4870-4878.2000 . ISSN 0270-7306 . ПМК 85938 . ПМИД 10848612 .
^ Чжао, Юэ; Гото Киминобу; Сайто Масаюки; Янасэ Тошихико; Номура Масатоши; Окабе Тайджиро; Такаянаги Рёичи; Навата Хадзиме (август 2002 г.). «Домен функции активации-1 андрогенного рецептора способствует взаимодействию между отсеком субъядерного фактора сплайсинга и отсеком ядерного рецептора. Идентификация белка, связывающего малые ядерные рибонуклеопротеиновые частицы p102 U5, в качестве коактиватора рецептора» . Ж. Биол. Хим . 277 (33). США: 30031–9. дои : 10.1074/jbc.M203811200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 12039962 .

Дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Сузуки И., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Юрьев А, Оно М, Гофф С.А. и др. (2000). «Изоформ-специфическая локализация A-RAF в митохондриях» . Мол. Клетка. Биол . 20 (13): 4870–8. дои : 10.1128/MCB.20.13.4870-4878.2000 . ПМК 85938 . ПМИД 10848612 .
Делоукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. и др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ 20 хромосомы человека» . Природа . 414 (6866): 865–71. Бибкод : 2001Natur.414..865D . дои : 10.1038/414865a . ПМИД 11780052 .
Юрица М.С., Ликлайдер Л.Дж., Гиги С.Р. и др. (2002). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, подходящих для трехмерного структурного анализа» . РНК . 8 (4): 426–39. дои : 10.1017/S1355838202021088 . ПМК 1370266 . ПМИД 11991638 .
Чжао Ю., Гото К., Сайто М. и др. (2002). «Домен функции активации-1 андрогенного рецептора способствует взаимодействию между отсеком субъядерного фактора сплайсинга и отсеком ядерного рецептора. Идентификация белка, связывающего малые ядерные рибонуклеопротеиновые частицы p102 U5, в качестве коактиватора рецептора» . Ж. Биол. Хим . 277 (33): 30031–9. дои : 10.1074/jbc.M203811200 . ПМИД 12039962 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Юрьев А, Венногле Л.П. (2003). «Новые белок-белковые взаимодействия киназы raf, обнаруженные с помощью исчерпывающего двухгибридного анализа дрожжей». Геномика . 81 (2): 112–25. дои : 10.1016/S0888-7543(02)00008-3 . ПМИД 12620389 .
Гото К., Чжао Ю., Сайто М. и др. (2003). «Домен функции активации-1 андрогенного рецептора способствует взаимодействию между двумя отдельными субъядерными компартментами». J. Стероидная биохимия. Мол. Биол . 85 (2–5): 201–8. дои : 10.1016/S0960-0760(03)00196-1 . ПМИД 12943705 . S2CID 46683850 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Уилл С.Л., Шнайдер С., Хоссбах М. и др. (2004). «Человеческий 18S U11/U12 snRNP содержит набор новых белков, не обнаруженных в U2-зависимой сплайсосоме» . РНК . 10 (6): 929–41. дои : 10.1261/rna.7320604 . ПМЦ 1370585 . ПМИД 15146077 .
Сунь X, Чжан Х, Ван Д и др. (2004). «DLP, новый белок семейства Dim1, участвующий в сплайсинге пре-мРНК и развитии клеточного цикла» . Ж. Биол. Хим . 279 (31): 32839–47. дои : 10.1074/jbc.M402522200 . ПМИД 15161931 .
Сузуки Ю., Ямашита Р., Широта М. и др. (2004). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в областях промотора» . Геном Рез . 14 (9): 1711–8. дои : 10.1101/гр.2435604 . ПМК 515316 . ПМИД 15342556 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Лаггербауэр Б., Лю С., Макаров Е. и др. (2005). «Белок U5 snRNP 52K человека (CD2BP2) взаимодействует с U5-102K (hPrp6), мостиковым белком три-snRNP U4/U6.U5, но диссоциирует при образовании три-snRNP» . РНК . 11 (5): 598–608. дои : 10.1261/rna.2300805 . ПМК 1370748 . ПМИД 15840814 .
Батше Э., Янив М., Мухард С. (2006). «Субъединица Brm человека SWI/SNF является регулятором альтернативного сплайсинга». Нат. Структура. Мол. Биол . 13 (1): 22–9. дои : 10.1038/nsmb1030 . ПМИД 16341228 . S2CID 11587161 .
Фан С., Гото К., Чен Г. и др. (2006). «Идентификация функциональных доменов ANT-1, нового коактиватора андрогенного рецептора». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 341 (1): 192–201. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.12.167 . ПМИД 16414017 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

Внешние ссылки

Запись GeneReviews/NCBI/NIH/UW об обзоре пигментного ретинита

Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000101161 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000002455 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10561546-5] Нишикими А., Мукаи Дж., Киока Н., Ямада М. (январь 2000 г.). «Новый ядерный белок млекопитающих, аналогичный факторам сплайсинга пре-мРНК Schizosaccharomyces pombe Prp1p/Zer1p и Saccharomyces cerevisiae Prp6p». Биохим Биофиз Акта . 1435 (1–2): 147–52. дои : 10.1016/s0167-4838(99)00203-4 . ПМИД 10561546 .

[pmid10788320-6] Макаров Е.М., Макарова О.В., Аксель Т., Лурманн Р. (июнь 2000 г.). «Человеческий гомолог дрожжевого фактора сплайсинга prp6p содержит несколько элементов TPR и стабильно связан с мяРНП U5 посредством белок-белковых взаимодействий». Дж Мол Биол . 298 (4): 567–75. дои : 10.1006/jmbi.2000.3685 . ПМИД 10788320 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Entrez: гомолог фактора 6 процессинга пре-мРНК PRP6 PRPF6 (S. cerevisiae)» .

[pmid15161931-8] Сунь, Сяоцзин; Чжан Хуа; Ван Дэн; Ма Далонг; Шэнь Янь; Шан Юнфэн (июль 2004 г.). «DLP, новый белок семейства Dim1, участвующий в сплайсинге пре-мРНК и развитии клеточного цикла» . Ж. Биол. Хим . 279 (31). США: 32839–47. дои : 10.1074/jbc.M402522200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 15161931 .

[pmid12620389-9] Юрьев Антон; Венногл Лоуренс П. (февраль 2003 г.). «Новые белок-белковые взаимодействия киназы raf, обнаруженные с помощью исчерпывающего двухгибридного анализа дрожжей». Геномика . 81 (2). США: 112–25. дои : 10.1016/S0888-7543(02)00008-3 . ISSN 0888-7543 . ПМИД 12620389 .

[pmid10848612-10] Юрьев А; Оно М; Гофф С.А.; Макалузо Ф; Венногл LP (июль 2000 г.). «Изоформ-специфическая локализация A-RAF в митохондриях» . Мол. Клетка. Биол . 20 (13). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 4870–8. дои : 10.1128/MCB.20.13.4870-4878.2000 . ISSN 0270-7306 . ПМК 85938 . ПМИД 10848612 .

[pmid12039962-11] Чжао, Юэ; Гото Киминобу; Сайто Масаюки; Янасэ Тошихико; Номура Масатоши; Окабе Тайджиро; Такаянаги Рёичи; Навата Хадзиме (август 2002 г.). «Домен функции активации-1 андрогенного рецептора способствует взаимодействию между отсеком субъядерного фактора сплайсинга и отсеком ядерного рецептора. Идентификация белка, связывающего малые ядерные рибонуклеопротеиновые частицы p102 U5, в качестве коактиватора рецептора» . Ж. Биол. Хим . 277 (33). США: 30031–9. дои : 10.1074/jbc.M203811200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 12039962 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]