EDC3

EDC3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	2VC8, 2WAX, 2WAY, 3D3J, 3D3K
Идентификаторы
Псевдонимы	EDC3 , LSM16, YJDC, YJEFN2, MRT50, усилитель декапирования мРНК 3, hYjeF_N2-15q23
Внешние идентификаторы	Опустить : 609842 ; МГИ : 2142951 ; Гомологен : 11827 ; Генные карты : EDC3 ; ОМА : EDC3 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 15 (human)
End	74,696,292 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 9 (mouse)
End	57,659,782 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	left testis; ; right testis; ; stromal cell of endometrium; ; ganglionic eminence; ; ventricular zone; ; testicle; ; islet of Langerhans; ; gonad; ; granulocyte; ; right lobe of thyroid gland;
	Top expressed in
	primitive streak; ; hand; ; otolith organ; ; yolk sac; ; Rostral migratory stream; ; utricle; ; otic vesicle; ; external carotid artery; ; trigeminal ganglion; ; internal carotid artery;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	protein binding; phosphodiesterase decapping endonuclease activity; identical protein binding; RNA binding; mRNA binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; membrane; P-body; cytoplasmic ribonucleoprotein granule;
Biological process	P-body assembly; exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA; RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic; deadenylation-independent decapping of nuclear-transcribed mRNA;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	80153
	353190
	ENSG00000179151
	ENSMUSG00000038957
	Q96F86
	Q8K2D3
	НМ_001142443 ; НМ_001142444 ; НМ_025083 ; НМ_001351378 ; НМ_001351379
	НМ_153799
	НП_001135915 ; НП_001135916 ; НП_079359 ; НП_001338307 ; НП_001338308
	НП_722494
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Энхансер белка 3, декапирующего мРНК, представляет собой белок , который у человека кодируется EDC3 геном . ^[5]^[6]^[7]

EDC3 связан с комплексом, декапирующим мРНК , необходимым для удаления 5-м штрихом кэпа с мРНК перед ее деградацией с 5-конца (Fenger-Gron et al., 2005). [предоставлено OMIM] ^[7]

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000179151 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038957 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Альбрехт М., Ленгауэр Т. (июнь 2004 г.). «Новые Sm-подобные белки с длинными С-концевыми хвостами и связанными с ними метилтрансферазами» . ФЭБС Летт . 569 (1–3): 18–26. дои : 10.1016/j.febslet.2004.03.126 . ПМИД 15225602 .
^ Рудольф С, Сигрюнер А, Хартманн А, Орсо Е, Бальс-Прач М, Гронвальд В, Зайферт Б, Кальбитцер ХР, Вердорфер И, Лютьенс СМ, Ортманн О, Борнштейн С.Р., Шмитц Г (май 2007 г.). «АпоА-I-связывающий белок (AI-BP) и его гомологи hYjeF_N2 и hYjeF_N3 составляют семейство белков домена YjeF_N у людей, играющих роль в спермиогенезе и оогенезе». Горм Метаб Рез . 39 (5): 322–35. дои : 10.1055/s-2007-977699 . ПМИД 17533573 . S2CID 10679128 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: энхансер EDC3 гомолога мРНК, декапирующего 3 (S. cerevisiae)» .

Дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Э.А., Гроуз Л.Х., Дерге Дж.Г., Клаузнер Р.Д., Коллинз Ф.С., Вагнер Л., Шенмен К.М., Шулер Г.Д. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ота Т., Судзуки Ю., Нишикава Т., Оцуки Т., Сугияма Т., Ирие Р., Вакамацу А., Хаяси К., Сато Х (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Джин Дж., Смит Ф.Д., Старк С., Уэллс К.Д., Фосетт Дж.П., Кулкарни С., Металников П., О'Доннелл П., Тейлор П. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3-связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации» . Курс. Биол . 14 (16): 1436–50. Бибкод : 2004CBio...14.1436J . дои : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . ПМИД 15324660 . S2CID 2371325 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Файнгольд Э.А., Шенмен К.М., Граус Л.Х., Шулер Г., Кляйн С.Л., Олд С., Расули Р. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Ван Д., Гун Ю, Цинь В., Чжан П., Ли Дж., Вэй Л., Чжоу Икс, Ли Х, Цю Икс (2004). «Крупномасштабный скрининг трансфекции кДНК генов, связанных с развитием и прогрессированием рака» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (44): 15724–9. Бибкод : 2004PNAS..10115724W . дои : 10.1073/pnas.0404089101 . ПМК 524842 . ПМИД 15498874 .
Фенгер-Грён М., Филлман С., Норрильд Б., Люкке-Андерсен Дж. (2006). «Множественные факторы обработки тела и ARE-связывающий белок TTP активируют декапирование мРНК» . Мол. Клетка . 20 (6): 905–15. doi : 10.1016/j.molcel.2005.10.031 . ПМИД 16364915 .
Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Нат. Биотехнология . 24 (10): 1285–92. дои : 10.1038/nbt1240 . ПМИД 16964243 . S2CID 14294292 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Цераевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .
Тритшлер Ф., Эулалио А., Трюффо В., Хартманн, доктор медицинских наук, Хелмс С., Шмидт С., Коулз М., Изаурральде Е., Вайхенридер О (2007). «Дивергентная складка Sm в белках EDC3 опосредует связывание DCP1 и нацеливание на P-тела» . Мол. Клетка. Биол . 27 (24): 8600–11. дои : 10.1128/MCB.01506-07 . ПМК 2169425 . ПМИД 17923697 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 15 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000179151 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038957 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid15225602-5] Альбрехт М., Ленгауэр Т. (июнь 2004 г.). «Новые Sm-подобные белки с длинными С-концевыми хвостами и связанными с ними метилтрансферазами» . ФЭБС Летт . 569 (1–3): 18–26. дои : 10.1016/j.febslet.2004.03.126 . ПМИД 15225602 .

[pmid17533573-6] Рудольф С, Сигрюнер А, Хартманн А, Орсо Е, Бальс-Прач М, Гронвальд В, Зайферт Б, Кальбитцер ХР, Вердорфер И, Лютьенс СМ, Ортманн О, Борнштейн С.Р., Шмитц Г (май 2007 г.). «АпоА-I-связывающий белок (AI-BP) и его гомологи hYjeF_N2 и hYjeF_N3 составляют семейство белков домена YjeF_N у людей, играющих роль в спермиогенезе и оогенезе». Горм Метаб Рез . 39 (5): 322–35. дои : 10.1055/s-2007-977699 . ПМИД 17533573 . S2CID 10679128 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: энхансер EDC3 гомолога мРНК, декапирующего 3 (S. cerevisiae)» .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]