НХП2L1

СНУ13
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1E7K, 2JNB, 2OZB, 3SIU, 3SIV, 3JCR
Идентификаторы
Псевдонимы	SNU13 , 15,5K, FA-1, FA1, NHPX, OTK27, SNRNP15-5, SPAG12, SSFA1, NHP2L1, гомолог SNU13, малый ядерный рибонуклеопротеин (U4/U6.U5), малый ядерный рибонуклеопротеин 13
Внешние идентификаторы	Опустить : 601304 ; МГИ : 893586 ; Гомологен : 3672 ; Генные карты : SNU13 ; ОМА : SNU13 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 22 (human)
End	41,690,504 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	beta cell; ; prefrontal cortex; ; hypothalamus; ; right frontal lobe; ; muscle of thigh; ; right ventricle; ; stromal cell of endometrium; ; left testis; ; right auricle; ; Brodmann area 9;
	n/a
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	U3 snoRNA binding; ATPase binding; U4 snRNA binding; U4atac snRNA binding; protein binding; snoRNA binding; RNA binding; box C/D RNA binding;
Cellular component	nucleoplasm; spliceosomal complex; nucleus; small-subunit processome; U4/U6 x U5 tri-snRNP complex; nucleolus; dense fibrillar component; cytosolic large ribosomal subunit; precatalytic spliceosome; box C/D RNP complex; U4atac snRNP; protein-containing complex; U2-type precatalytic spliceosome; ribonucleoprotein complex;
Biological process	mRNA processing; ribosome biogenesis; mRNA splicing, via spliceosome; RNA splicing; maturation of LSU-rRNA; maturation of SSU-rRNA; protein biosynthesis; rRNA processing; single fertilization; box C/D snoRNP assembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	4809
	20826
	ENSG00000100138
	ENSMUSG00000063480
	P55769
	Q9D0T1
	НМ_001003796 ; НМ_005008
	НМ_011482
	НП_001003796 ; НП_004999
	НП_035612
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

NHP2-подобный белок 1 — это белок , который у человека кодируется SNU13 геном . ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}

Функция

Первоначально названный из-за сходства последовательности с NHP2 Saccharomyces cerevisiae (негистоновый белок 2), этот белок, по-видимому, представляет собой высококонсервативный ядерный белок, который является компонентом [U4/U6.U5] три-мяРНП . Он связывается с 5'- стебельной петлей мяРНК U4 . Для этого гена обнаружено два варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок. ^{[ 5 ]}

Взаимодействия

Было показано, что SNU13 взаимодействует с RAD17 . ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000100138 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Сайто Х., Фудзивара Т., Шин С., Окуи К., Накамура Ю. (январь 1997 г.). «Клонирование и картирование новой кДНК человека (NHP2L1), которая кодирует белок, высоко гомологичный дрожжевому ядерному белку NHP2». Цитогенетика и клеточная генетика . 72 (2–3): 191–3. дои : 10.1159/000134186 . ПМИД 8978773 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: NHP2L1 NHP2 негистоновый хромосомный белок 2-подобный 1 (S. cerevisiae)» .
^ Чанг М.С., Сасаки Х., Кэмпбелл М.С., Крафт С.К., Сазерленд Р., Ян С.И., Лю Ю., Оклер Д., Хао Л., Сонода Х., Ферланд Л.Х., Чен Л.Б. (декабрь 1999 г.). «HRad17 колокализуется с NHP2L1 в ядрышке и перераспределяется после УФ-облучения» . Журнал биологической химии . 274 (51): 36544–9. дои : 10.1074/jbc.274.51.36544 . ПМИД 10593953 .

Дальнейшее чтение

Ноттротт С., Хартмут К., Фабрицио П., Урлауб Х., Видович И., Фикнер Р., Люрманн Р. (ноябрь 1999 г.). «Функциональное взаимодействие нового белка три-мяРНП массой 15,5 кДа [U4/U6.U5] с 5'-стебельной петлей мяРНК U4» . Журнал ЭМБО . 18 (21): 6119–33. дои : 10.1093/emboj/18.21.6119 . ПМК 1171676 . ПМИД 10545122 .
Данхэм И, Симидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж.Э., Брускевич Р., Беар Д.М., Клэмп М., Сминк Л.Дж., Эйнско Р., Алмейда Дж.П., Бэббидж А., Бэггули С., Бэйли Дж., Барлоу К., Бейтс К.Н. , Бизли О, Бёрд С.П., Блейки С., Бриджмен А.М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл WD, О'Брайен КП (декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК 22 хромосомы человека» . Природа . 402 (6761): 489–95. Бибкод : 1999Natur.402..489D . дои : 10.1038/990031 . ПМИД 10591208 .
Чанг М.С., Сасаки Х., Кэмпбелл М.С., Крафт С.К., Сазерленд Р., Ян С.И., Лю Ю., Оклер Д., Хао Л., Сонода Х., Ферланд Л.Х., Чен Л.Б. (декабрь 1999 г.). «HRad17 колокализуется с NHP2L1 в ядрышке и перераспределяется после УФ-облучения» . Журнал биологической химии . 274 (51): 36544–9. дои : 10.1074/jbc.274.51.36544 . ПМИД 10593953 .
Видович И., Ноттрот С., Хартмут К., Люрманн Р., Фикнер Р. (декабрь 2000 г.). «Кристаллическая структура сплайсосомного белка массой 15,5 кДа, связанного с фрагментом мяРНК U4» . Молекулярная клетка . 6 (6): 1331–42. дои : 10.1016/S1097-2765(00)00131-3 . hdl : 11858/00-001M-0000-0012-F75C-F . ПМИД 11163207 .
Андерсен Дж.С., Лион CE, Фокс А.Х., Люнг А.К., Лам Ю.В., Стин Х., Манн М., Ламонд А.И. (январь 2002 г.). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Современная биология . 12 (1): 1–11. Бибкод : 2002CBio...12....1A . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . ПМИД 11790298 .
Люнг А.К., Ламонд А.И. (май 2002 г.). «Анализ NHPX in vivo выявил новый путь ядрышковой локализации, включающий временное накопление в сплайсинговых крапинках» . Журнал клеточной биологии . 157 (4): 615–29. дои : 10.1083/jcb.200201120 . ПМК 2173864 . ПМИД 12011111 .
Уоткинс, Нью-Джерси, Дикманнс А., Люрманн Р. (декабрь 2002 г.). «Консервативный стебель II бокса C/D-мотива важен для ядрышковой локализации и необходим, наряду с белком 15,5К, для иерархической сборки бокса C/D snoRNP» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (23): 8342–52. дои : 10.1128/MCB.22.23.8342-8352.2002 . ПМК 134055 . ПМИД 12417735 .
Шерл А., Куте И., Деон С., Калле А., Киндбайтер К., Санчес Х.К., Греко А., Хохштрассер Д., Диас Дж.Дж. (ноябрь 2002 г.). «Функциональный протеомный анализ ядрышка человека» . Молекулярная биология клетки . 13 (11): 4100–9. doi : 10.1091/mbc.E02-05-0271 . ПМЦ 133617 . ПМИД 12429849 .
Коллинз Дж. Э., Райт К. Л., Эдвардс К. А., Дэвис М. П., Гринхэм Дж. А., Коул К. Г., Говард М. Е., Агуадо Б., Малля М., Мокраб Ю., Хакл Э. Дж., Беар Д. М., Данэм I (2005). «Подход к клонированию ORFeome человека на основе аннотаций генома» . Геномная биология . 5 (10): Р84. дои : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . ПМК 545604 . ПМИД 15461802 .
Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К., Онг С.Е., Лион К.Э., Ламонд А.И., Манн М. (январь 2005 г.). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД 15635413 . S2CID 4344740 .
Стелцль Ю, Ворм Ю, Лаловски М, Хениг К, Брембек Ф.Х., Гёлер Х, Стродике М, Ценкнер М, Шенхерр А, Кеппен С, Тимм Дж, Минцлафф С, Абрахам С, Бок Н, Китцманн С, Гёдде А, Токсёз Е , Дроге А., Кробич С., Корн Б., Бирчмайер В., Лерах Х., Ванкер Э.Э. (сентябрь 2005 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . ПМИД 16169070 . S2CID 8235923 .
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж, Зогби Х.И., Смоляр А, Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .

Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000100138 – Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8978773-4] Сайто Х., Фудзивара Т., Шин С., Окуи К., Накамура Ю. (январь 1997 г.). «Клонирование и картирование новой кДНК человека (NHP2L1), которая кодирует белок, высоко гомологичный дрожжевому ядерному белку NHP2». Цитогенетика и клеточная генетика . 72 (2–3): 191–3. дои : 10.1159/000134186 . ПМИД 8978773 .

[entrez-5] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: NHP2L1 NHP2 негистоновый хромосомный белок 2-подобный 1 (S. cerevisiae)» .

[pmid10593953-6] Чанг М.С., Сасаки Х., Кэмпбелл М.С., Крафт С.К., Сазерленд Р., Ян С.И., Лю Ю., Оклер Д., Хао Л., Сонода Х., Ферланд Л.Х., Чен Л.Б. (декабрь 1999 г.). «HRad17 колокализуется с NHP2L1 в ядрышке и перераспределяется после УФ-облучения» . Журнал биологической химии . 274 (51): 36544–9. дои : 10.1074/jbc.274.51.36544 . ПМИД 10593953 .

[1]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]