CDC5L

CDC5L
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2DIM, 2DIN
Идентификаторы
Псевдонимы	CDC5L , CDC5, CDC5-LIKE, CEF1, PCDC5RP, dJ319D22.1, цикл деления клеток 5 типа
Внешние идентификаторы	Опустить : 602868 ; МГИ : 1918952 ; Гомологен : 13291 ; Генные карты : CDC5L ; OMA : CDC5L — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	44,450,425 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	45,744,663 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	buccal mucosa cell; ; sperm; ; tibia; ; tendon of biceps brachii; ; internal globus pallidus; ; secondary oocyte; ; amniotic fluid; ; glutes; ; biceps brachii; ; Brodmann area 23;
	Top expressed in
	genital tubercle; ; tail of embryo; ; maxillary prominence; ; mandibular prominence; ; primitive streak; ; morula; ; renal corpuscle; ; morula; ; vestibular membrane of cochlear duct; ; blastocyst;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; protein phosphatase 1 binding; leucine zipper domain binding; WD40-repeat domain binding; protein binding; transcription corepressor binding; protein kinase binding; sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; RNA binding; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	cytoplasm; nuclear speck; catalytic step 2 spliceosome; membrane; Prp19 complex; nucleoplasm; protein-DNA complex; perinuclear region of cytoplasm; DNA replication factor A complex; spliceosomal complex; nucleus; U2-type catalytic step 2 spliceosome;
Biological process	mRNA splicing, via spliceosome; cellular response to nerve growth factor stimulus; regulation of transcription, DNA-templated; mRNA processing; cellular response to fibroblast growth factor stimulus; transcription, DNA-templated; cellular response to interleukin-2; cellular response to prolactin; cellular response to DNA damage stimulus; cellular response to wortmannin; mitotic cell cycle; cell cycle; DNA repair; cell differentiation; RNA splicing; regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription by RNA polymerase II; positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	988
	71702
	ENSG00000096401
	ENSMUSG00000023932
	Q99459
	Q6A068
	НМ_001253
	НМ_152810
	НП_001244
	НП_690023
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок, подобный 5-му циклу деления клеток, представляет собой белок , который у человека кодируется CDC5L геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, имеет значительное сходство с продуктом гена cdc5 Schizosaccharomyces pombe , который является регулятором клеточного цикла , важным для G ₂ / M. перехода Было продемонстрировано, что этот белок действует как положительный регулятор развития клеточного цикла G ₂ /M. Также было обнаружено, что он является важным компонентом сплайсосомы, не содержащей мяРНК, которая содержит по крайней мере пять дополнительных белковых факторов и необходима для второго каталитического этапа сплайсинга пре-мРНК. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что CDC5L взаимодействует с:

АСФ/СФ2 , ^{[ 8 ]}
БЗВ1 , ^{[ 8 ]}
КВК15 , ^{[ 8 ]}
ДНК-ПКкс , ^{[ 8 ]}
ДИНЦ1H1 , ^{[ 8 ]}
ГЦН1Л1 , ^{[ 8 ]}
HSPA8 , ^{[ 8 ]}
ИЛФ2 , ^{[ 8 ]}
ПЛРГ1 , ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}
ППМ1Д , ^{[ 8 ]}
ППП1КА , ^{[ 8 ]}
ПРПФ19 , ^{[ 8 ]}
РБМХ ^{[ 8 ]} и
РПЛ12 , ^{[ 8 ]}
РПЛ13 , ^{[ 8 ]}
РПС16 , ^{[ 8 ]}
РПС25 , ^{[ 8 ]}
СФ3А1 , ^{[ 8 ]}
СФ3Б1 , ^{[ 8 ]}
СФ3Б2 , ^{[ 8 ]}
СФ3Б4 , ^{[ 8 ]}
СФПК , ^{[ 8 ]}
СРСФ2 , ^{[ 8 ]}
СНРПА1 , ^{[ 8 ]}
СНРПД3 , ^{[ 8 ]}
СРРМ1 , ^{[ 8 ]}
Малый ядерный рибонуклеопротеин D1 , ^{[ 8 ]}
Малый ядерный рибонуклеопротеин D2 , ^{[ 8 ]}
Малый ядерный рибонуклеопротеин полипептид А , ^{[ 8 ]}
ТОП2А , ^{[ 8 ]} и
ТТФ2 . ^{[ 12 ]}

См. также

Контрольно-пропускной пункт G2/M

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000096401 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023932 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Гроенен П.М., Вандерлинден Г., Девриендт К., Фринс Дж.П., Ван де Вен У.Дж. (апрель 1998 г.). «Перестройка человеческого гена CDC5L с помощью at(6;19)(p21;q13.1) у пациента с поликистозной дисплазией почек». Геномика . 49 (2): 218–29. дои : 10.1006/geno.1998.5254 . ПМИД 9598309 .
^ Бернштейн Х.С., Кофлин С.Р. (февраль 1997 г.). «Белок, родственный Pombe Cdc5. Предполагаемый фактор транскрипции человека, участвующий в передаче сигналов, активируемой митогеном» . Журнал биологической химии . 272 (9): 5833–7. дои : 10.1074/jbc.272.9.5833 . ПМИД 9038199 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: CDC5L, подобный 5-му циклу клеточного деления CDC5 (S. pombe)» .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в ^v ^В ^х ^и ^С ^аа ^аб ^и ^{объявление} Аджух П., Кастер Б., Панов К., Зомердейк Дж.К., Манн М., Ламонд А.И. (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии» . Журнал ЭМБО . 19 (23): 6569–81. дои : 10.1093/emboj/19.23.6569 . ПМК 305846 . ПМИД 11101529 .
^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Серажевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О., Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дювел. Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 : 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .
^ Аджух П., Ламонд А.И. (ноябрь 2003 г.). «Идентификация пептидных ингибиторов сплайсинга пре-мРНК, полученных из доменов существенного взаимодействия CDC5L и PLRG1» . Исследования нуклеиновых кислот . 31 (21): 6104–16. дои : 10.1093/нар/gkg817 . ПМК 275459 . ПМИД 14576297 .
^ Аджух П., Слиман Дж., Чусейнов Дж., Ламонд А.И. (ноябрь 2001 г.). «Прямое взаимодействие между карбоксильной концевой областью CDC5L и доменом WD40 PLRG1 имеет важное значение для сплайсинга пре-мРНК» . Журнал биологической химии . 276 (45): 42370–81. дои : 10.1074/jbc.M105453200 . ПМИД 11544257 .
^ Леонард Д., Аджу П., Ламонд А.И., Легерски Р.Дж. (сентябрь 2003 г.). «hLodestar/HuF2 взаимодействует с CDC5L и участвует в сплайсинге пре-мРНК». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 308 (4): 793–801. CiteSeerX 10.1.1.539.8359 . дои : 10.1016/s0006-291x(03)01486-4 . ПМИД 12927788 .

Дальнейшее чтение

Накадзима Д., Оказаки Н., Ямакава Х., Кикуно Р., Охара О., Нагасе Т. (июнь 2002 г.). «Создание готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное курирование 330 клонов кДНК KIAA». Исследование ДНК . 9 (3): 99–106. CiteSeerX 10.1.1.500.923 . дои : 10.1093/dnares/9.3.99 . ПМИД 12168954 .
Хини Дж. П., Джейкобсон А. (август 1975 г.). «Упрощенный контроль кровотечения в верхней части брюшной полости из полой вены». Операция . 78 (2): 138–41. ПМИД 1154257 .
Хираяма Т., Шинозаки К. (ноябрь 1996 г.). «Гомолог cdc5+ высшего растения Arabidopsis thaliana» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (23): 13371–6. дои : 10.1073/pnas.93.23.13371 . ПМК 24100 . ПМИД 8917598 .
Исикава К., Нагасе Т., Накадзима Д., Секи Н., Охира М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (октябрь 1997 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. VIII. 78 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 4 (5): 307–13. дои : 10.1093/dnares/4.5.307 . ПМИД 9455477 .
Бернштейн Х.С., Кофлин С.Р. (февраль 1998 г.). «Гомолог делящихся дрожжей Cdc5 у млекопитающих регулирует прогрессию G2 и вступление в митоз» . Журнал биологической химии . 273 (8): 4666–71. дои : 10.1074/jbc.273.8.4666 . ПМИД 9468527 .
Охи Р., Феоктистова А., Макканн С., Валентайн В., Look AT, Липсик Дж.С. , Гулд К.Л. (июль 1998 г.). «Связанные с Myb Schizosaccharomyces pombe cdc5p структурно и функционально консервативны у эукариот» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (7): 4097–108. дои : 10.1128/mcb.18.7.4097 . ПМЦ 108994 . ПМИД 9632794 .
Нойбауэр Г., Кинг А., Раппсилбер Дж., Кальвио С., Уотсон М., Аджух П., Слиман Дж., Ламонд А., Манн М. (сентябрь 1998 г.). «Масс-спектрометрия и поиск в базе данных EST позволяют охарактеризовать мультибелковый сплайсосомный комплекс». Природная генетика . 20 (1): 46–50. дои : 10.1038/1700 . ПМИД 9731529 . S2CID 585778 .
Бернс К.Г., Охи Р., Крайнер А.Р., Гулд К.Л. (ноябрь 1999 г.). «Доказательства того, что родственные Myb белки CDC5 необходимы для сплайсинга пре-мРНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (24): 13789–94. Бибкод : 1999PNAS...9613789B . дои : 10.1073/pnas.96.24.13789 . ПМК 24143 . ПМИД 10570151 .
Будрез А., Бёлленс М., Гроенен П., Ван Эйнде А., Вульстеке В., Ягайло И., Мюррей М., Крайнер А.Р., Сталманс В., Боллен М. (август 2000 г.). «NIPP1-опосредованное взаимодействие протеинфосфатазы-1 с CDC5L, регулятором сплайсинга пре-мРНК и вступления в митоз» . Журнал биологической химии . 275 (33): 25411–7. дои : 10.1074/jbc.M001676200 . ПМИД 10827081 .
Лэй XH, Шен X, Сюй XQ, Бернштейн HS (декабрь 2000 г.). «Человеческий Cdc5, регулятор митотического входа, может действовать как сайт-специфический ДНК-связывающий белок». Журнал клеточной науки . 113. 113 (24): 4523–31. дои : 10.1242/jcs.113.24.4523 . ПМИД 11082045 .
Аджух П., Кастер Б., Панов К., Зомердейк Дж.К., Манн М., Ламонд А.И. (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии» . Журнал ЭМБО . 19 (23): 6569–81. дои : 10.1093/emboj/19.23.6569 . ПМК 305846 . ПМИД 11101529 .
Харрингтон Дж.Дж., Шерф Б., Рандлетт С., Джексон П.Д., Перри Р., Кейн С., Левенталь С., Торнтон М., Рамачандран Р., Уиттингтон Дж., Лернер Л., Костанцо Д., МакЭллиготт К., Бузер С., Мейс Р., Смит Э., Велосо Н. , Клика А, Хесс Дж, Котрен К, Ло К, Оффенбахер Дж, Данциг Дж, Дукар М (май 2001 г.). «Создание библиотек полногеномной экспрессии белков с использованием случайной активации экспрессии генов». Природная биотехнология . 19 (5): 440–5. дои : 10.1038/88107 . ПМИД 11329013 . S2CID 25064683 .
Аджух П., Слиман Дж., Чусейнов Дж., Ламонд А.И. (ноябрь 2001 г.). «Прямое взаимодействие между карбоксильной концевой областью CDC5L и доменом WD40 PLRG1 имеет важное значение для сплайсинга пре-мРНК» . Журнал биологической химии . 276 (45): 42370–81. дои : 10.1074/jbc.M105453200 . ПМИД 11544257 .
Юрица М.С., Ликлайдер Л.Дж., Гиги С.Р., Григорьев Н., Мур М.Дж. (апрель 2002 г.). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, подходящих для трехмерного структурного анализа» . РНК . 8 (4): 426–39. дои : 10.1017/S1355838202021088 . ПМК 1370266 . ПМИД 11991638 .
Леонард Д., Аджу П., Ламонд А.И., Легерски Р.Дж. (сентябрь 2003 г.). «hLodestar/HuF2 взаимодействует с CDC5L и участвует в сплайсинге пре-мРНК». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 308 (4): 793–801. CiteSeerX 10.1.1.539.8359 . дои : 10.1016/S0006-291X(03)01486-4 . ПМИД 12927788 .
Лю Л., Груб Р., Хлаинг М., Эптинг К.Л., Терк К.В., Сюй XQ, Чжан Л., Бернштейн Х.С. (2004). «Отдельные домены CDC5 человека направляют его ядерный импорт и ассоциацию со сплайсосомой». Клеточная биохимия и биофизика . 39 (2): 119–32. дои : 10.1385/CBB:39:2:119 . ПМИД 14515018 . S2CID 22472390 .

Внешние ссылки

человека Местоположение генома CDC5L и страница сведений о гене CDC5L в браузере генома UCSC .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000096401 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023932 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9598309-5] Гроенен П.М., Вандерлинден Г., Девриендт К., Фринс Дж.П., Ван де Вен У.Дж. (апрель 1998 г.). «Перестройка человеческого гена CDC5L с помощью at(6;19)(p21;q13.1) у пациента с поликистозной дисплазией почек». Геномика . 49 (2): 218–29. дои : 10.1006/geno.1998.5254 . ПМИД 9598309 .

[pmid9038199-6] Бернштейн Х.С., Кофлин С.Р. (февраль 1997 г.). «Белок, родственный Pombe Cdc5. Предполагаемый фактор транскрипции человека, участвующий в передаче сигналов, активируемой митогеном» . Журнал биологической химии . 272 (9): 5833–7. дои : 10.1074/jbc.272.9.5833 . ПМИД 9038199 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: CDC5L, подобный 5-му циклу клеточного деления CDC5 (S. pombe)» .

[pmid11101529-8] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в ^v ^В ^х ^и ^С ^аа ^аб ^и ^{объявление} Аджух П., Кастер Б., Панов К., Зомердейк Дж.К., Манн М., Ламонд А.И. (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии» . Журнал ЭМБО . 19 (23): 6569–81. дои : 10.1093/emboj/19.23.6569 . ПМК 305846 . ПМИД 11101529 .

[pmid17353931-9] Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Серажевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О., Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дювел. Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 : 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

[pmid14576297-10] Аджух П., Ламонд А.И. (ноябрь 2003 г.). «Идентификация пептидных ингибиторов сплайсинга пре-мРНК, полученных из доменов существенного взаимодействия CDC5L и PLRG1» . Исследования нуклеиновых кислот . 31 (21): 6104–16. дои : 10.1093/нар/gkg817 . ПМК 275459 . ПМИД 14576297 .

[pmid11544257-11] Аджух П., Слиман Дж., Чусейнов Дж., Ламонд А.И. (ноябрь 2001 г.). «Прямое взаимодействие между карбоксильной концевой областью CDC5L и доменом WD40 PLRG1 имеет важное значение для сплайсинга пре-мРНК» . Журнал биологической химии . 276 (45): 42370–81. дои : 10.1074/jbc.M105453200 . ПМИД 11544257 .

[pmid12927788-12] Леонард Д., Аджу П., Ламонд А.И., Легерски Р.Дж. (сентябрь 2003 г.). «hLodestar/HuF2 взаимодействует с CDC5L и участвует в сплайсинге пре-мРНК». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 308 (4): 793–801. CiteSeerX 10.1.1.539.8359 . дои : 10.1016/s0006-291x(03)01486-4 . ПМИД 12927788 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]