40S рибосомальный белок S25

РПС25
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 5FLX
Идентификаторы
Псевдонимы	RPS25 , S25, рибосомальный белок S25
Внешние идентификаторы	Опустить : 180465 ; МГИ : 1922867 ; Гомологен : 133893 ; Генные карты : RPS25 ; ОМА : RPS25 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	119,018,691 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 9 (mouse)
End	44,321,724 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	left ovary; ; right ovary; ; Achilles tendon; ; pituitary gland; ; anterior pituitary; ; right uterine tube; ; gastric mucosa; ; thyroid gland; ; left lobe of thyroid gland; ; right lobe of thyroid gland;
	Top expressed in
	morula; ; embryo; ; blastocyst; ; embryo; ; ventricular zone; ; yolk sac; ; lip; ; genital tubercle; ; tail of embryo; ; granulocyte;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; RNA binding; structural constituent of ribosome;
Cellular component	cytosol; ribosome; cytosolic small ribosomal subunit; nucleolus; small ribosomal subunit; extracellular exosome; nucleus; nucleoplasm; extracellular matrix; postsynaptic density;
Biological process	viral transcription; SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; translational initiation; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; rRNA processing; protein biosynthesis;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6230
	75617
	ENSG00000118181
	ENSMUSG00000009927
	P62851
	P62852
	НМ_001028
	НМ_024266
	НП_001019
	НП_077228
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

40S рибосомальный белок S25 (eS25) — это белок , который у человека кодируется RPS25 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Рибосомы — это клеточные макромолекулы, которые катализируют синтез белка во всех сферах жизни. Эукариотическая рибосома состоит из небольшой субъединицы 40S и большой субъединицы 60S . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и примерно 80 различных белков. Ген RPS25 кодирует специфичный для эукариот рибосомальный белок eS25, который является компонентом субъединицы 40S. Как это типично для генов, кодирующих рибосомальные белки, по геному рассеяно множество процессированных псевдогенов этого гена. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Помимо взаимодействий, которые позиционируют eS25 в области E-сайта субъединицы 40S рибосомы, было высказано предположение, что eS25 взаимодействует с другими клеточными белками. Одно исследование показало, что eS25 взаимодействует с MDM2 как часть регуляторной петли обратной связи, которая стабилизирует p53 . ^{[ 7 ]} Кроме того, было показано, что eS25 взаимодействует с CDC5L . ^{[ 8 ]}

Функция

Как рибосомальный белок eS25, вероятно, играет роль в общем синтезе белка; однако ген RPS25 не важен для жизнеспособности клеток у почкующихся дрожжей и в некоторых клеточных линиях млекопитающих, что означает, что он не важен для синтеза эукариотического белка. ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} Исследования показали, что eS25 участвует в контроле нескольких специализированных форм трансляции, в том числе опосредованной вирусными IRES . ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000118181 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000009927 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ли М.Л., Латуд С., Центр MS (ноябрь 1991 г.). «Клонирование и секвенирование кДНК, кодирующей рибосомальный белок S25 человека». Джин . 107 (2): 329–33. дои : 10.1016/0378-1119(91)90335-9 . ПМИД 1748303 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок S25 RPS25» .
^ Чжан X, Ван В, Ван Х, Ван МХ, Сюй В, Чжан Р (май 2013 г.). «Идентификация петли регуляторной обратной связи рибосомального белка S25 (RPS25)-MDM2-p53» . Онкоген . 32 (22): 2782–91. дои : 10.1038/onc.2012.289 . ПМК 6714567 . ПМИД 22777350 .
^ Аджух П., Кастер Б., Панов К., Зомердейк Дж.К., Манн М., Ламонд А.И. (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии» . Журнал ЭМБО . 19 (23): 6569–81. дои : 10.1093/emboj/19.23.6569 . ПМК 305846 . ПМИД 11101529 .
^ Стеффен К.К., Маккормик М.А., Фам К.М., Маккей В.Л., Делани Дж.Р., Мураками С.Дж. и др. (май 2012 г.). «Дефицит рибосом защищает от стресса ЭР у Saccharomyces cerevisiae» . Генетика . 191 (1): 107–18. дои : 10.1534/genetics.111.136549 . ПМЦ 3338253 . ПМИД 22377630 .
^ Фукс Г., Петров А.Н., Марсо С.Д., Попов Л.М., Чен Дж., О'Лири С.Э. и др. (январь 2015 г.). «Кинетический путь рекрутирования субъединицы рибосомы 40S во внутреннее место входа рибосомы вируса гепатита С» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (2): 319–25. Бибкод : 2015PNAS..112..319F . дои : 10.1073/pnas.1421328111 . ПМК 4299178 . ПМИД 25516984 .
^ Лэндри Д.М., Герц М.И., Томпсон С.Р. (декабрь 2009 г.). «RPS25 необходим для инициации трансляции IRES дицистовирусов и вируса гепатита С» . Гены и развитие . 23 (23): 2753–64. дои : 10.1101/gad.1832209 . ПМЦ 2788332 . ПМИД 19952110 .
^ Герц М.И., Лэндри Д.М., Уиллис А.Е., Луо Г., Томпсон С.Р. (март 2013 г.). «Зависимость от рибосомального белка S25 обнаруживает общий механизм различных внутренних мест входа в рибосомы и шунтирования рибосом» . Молекулярная и клеточная биология . 33 (5): 1016–26. дои : 10.1128/MCB.00879-12 . ПМК 3623076 . ПМИД 23275440 .

Дальнейшее чтение

Вул И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомальных белков млекопитающих». Биохимия и клеточная биология . 73 (11–12): 933–47. дои : 10.1139/o95-101 . ПМИД 8722009 .
Ли М., Центр МС (февраль 1992 г.). «Регуляция рибосомального белка S25 в клетках HL60, выделенных на устойчивость к адриамицину» . Письма ФЭБС . 298 (2–3): 142–4. дои : 10.1016/0014-5793(92)80041-E . ПМИД 1544436 . S2CID 9001148 .
Мэрион М.Дж., Мэрион С. (май 1988 г.). «Рибосомальные белки S2, S6, S10, S14, S15 и S25 локализуются на поверхности 40 S-субъединиц млекопитающих и стабилизируют их конформацию. Исследование с иммобилизованным трипсином» . Письма ФЭБС . 232 (2): 281–5. дои : 10.1016/0014-5793(88)80753-1 . ПМИД 3378620 . S2CID 44333810 .
Като С., Секине С., О С.В., Ким Н.С., Умезава Ю., Абэ Н. и др. (декабрь 1994 г.). «Создание банка полноразмерной кДНК человека». Джин . 150 (2): 243–50. дои : 10.1016/0378-1119(94)90433-2 . ПМИД 7821789 .
Имаи Т., Судо К., Мива Т. (март 1994 г.). «Отнесение гена человеческого рибосомного белка S25 (RPS25) к хромосоме 11q23.3 путем анализа последовательности маркера D11S456». Геномика . 20 (1): 142–3. дои : 10.1006/geno.1994.1145 . ПМИД 8020948 .
Мива Т., Судо К., Накамура Ю., Имаи Т. (июль 1993 г.). «Пятьдесят секвенированных сайтов на хромосоме 11 человека». Геномика . 17 (1): 211–4. дои : 10.1006/geno.1993.1304 . ПМИД 8406452 .
Владимиров С.Н., Иванов А.В., Карпова Г.Г., Мусолямов АК, Егоров Т.А., Тиде Б. и др. (июль 1996 г.). «Характеристика белков малых рибосомальных субъединиц человека с помощью N-концевого и внутреннего секвенирования, а также масс-спектрометрии» . Европейский журнал биохимии . 239 (1): 144–9. дои : 10.1111/j.1432-1033.1996.0144u.x . ПМИД 8706699 .
Кенмоти Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Э., Гудман Н., Хадсон Т.Дж. и др. (май 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геномные исследования . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .
Кубота С., Коупленд Т.Д., Померанц Р.Дж. (февраль 1999 г.). «Ядерное и ядрышковое нацеливание на рибосомальный белок S25 человека: общие черты с регуляторными белками ВИЧ-1». Онкоген . 18 (7): 1503–14. дои : 10.1038/sj.onc.1202429 . ПМИД 10050887 . S2CID 25682899 .
Аджух П., Кастер Б., Панов К., Зомердейк Дж.К., Манн М., Ламонд А.И. (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии» . Журнал ЭМБО . 19 (23): 6569–81. дои : 10.1093/emboj/19.23.6569 . ПМК 305846 . ПМИД 11101529 .
Ёшихама М., Уэчи Т., Асакава С., Кавасаки К., Като С., Хига С. и др. (март 2002 г.). «Гены рибосомальных белков человека: секвенирование и сравнительный анализ 73 генов» . Геномные исследования . 12 (3): 379–90. дои : 10.1101/гр.214202 . ПМК 155282 . ПМИД 11875025 .
Ленер Б., Сандерсон К.М. (июль 2004 г.). «Схема взаимодействия белков для деградации мРНК человека» . Геномные исследования . 14 (7): 1315–23. дои : 10.1101/гр.2122004 . ПМК 442147 . ПМИД 15231747 .
Ю Ю, Джи Х, Дудна Дж. А., Лири Дж. А. (июнь 2005 г.). «Масс-спектрометрический анализ 40S рибосомальной субъединицы человека: нативные и IRES-связанные комплексы ВГС» . Белковая наука . 14 (6): 1438–46. дои : 10.1110/ps.041293005 . ПМЦ 2253395 . ПМИД 15883184 .
Стельцль У., Ворм У., Лаловски М., Хениг С., Брембек Ф.Х., Гёлер Х. и др. (сентябрь 2005 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . ПМИД 16169070 . S2CID 8235923 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 11 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000118181 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000009927 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1748303-5] Ли М.Л., Латуд С., Центр MS (ноябрь 1991 г.). «Клонирование и секвенирование кДНК, кодирующей рибосомальный белок S25 человека». Джин . 107 (2): 329–33. дои : 10.1016/0378-1119(91)90335-9 . ПМИД 1748303 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок S25 RPS25» .

[ZhangWang2012-7] Чжан X, Ван В, Ван Х, Ван МХ, Сюй В, Чжан Р (май 2013 г.). «Идентификация петли регуляторной обратной связи рибосомального белка S25 (RPS25)-MDM2-p53» . Онкоген . 32 (22): 2782–91. дои : 10.1038/onc.2012.289 . ПМК 6714567 . ПМИД 22777350 .

[pmid11101529-8] Аджух П., Кастер Б., Панов К., Зомердейк Дж.К., Манн М., Ламонд А.И. (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии» . Журнал ЭМБО . 19 (23): 6569–81. дои : 10.1093/emboj/19.23.6569 . ПМК 305846 . ПМИД 11101529 .

[SteffenMcCormick2012-9] Стеффен К.К., Маккормик М.А., Фам К.М., Маккей В.Л., Делани Дж.Р., Мураками С.Дж. и др. (май 2012 г.). «Дефицит рибосом защищает от стресса ЭР у Saccharomyces cerevisiae» . Генетика . 191 (1): 107–18. дои : 10.1534/genetics.111.136549 . ПМЦ 3338253 . ПМИД 22377630 .

[FuchsPetrov2015-10] Фукс Г., Петров А.Н., Марсо С.Д., Попов Л.М., Чен Дж., О'Лири С.Э. и др. (январь 2015 г.). «Кинетический путь рекрутирования субъединицы рибосомы 40S во внутреннее место входа рибосомы вируса гепатита С» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (2): 319–25. Бибкод : 2015PNAS..112..319F . дои : 10.1073/pnas.1421328111 . ПМК 4299178 . ПМИД 25516984 .

[LandryHertz2009-11] Лэндри Д.М., Герц М.И., Томпсон С.Р. (декабрь 2009 г.). «RPS25 необходим для инициации трансляции IRES дицистовирусов и вируса гепатита С» . Гены и развитие . 23 (23): 2753–64. дои : 10.1101/gad.1832209 . ПМЦ 2788332 . ПМИД 19952110 .

[HertzLandry2012-12] Герц М.И., Лэндри Д.М., Уиллис А.Е., Луо Г., Томпсон С.Р. (март 2013 г.). «Зависимость от рибосомального белка S25 обнаруживает общий механизм различных внутренних мест входа в рибосомы и шунтирования рибосом» . Молекулярная и клеточная биология . 33 (5): 1016–26. дои : 10.1128/MCB.00879-12 . ПМК 3623076 . ПМИД 23275440 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]