60S рибосомальный белок L22

РПЛ22
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	4UG0, 4V6X, 5AJ0, 4UJD, 4D67, 4D5Y, 4UJE, 4UJC
Идентификаторы
Псевдонимы	RPL22 , EAP, HBP15, HBP15/L22, L22, рибосомальный белок L22
Внешние идентификаторы	Опустить : 180474 ; МГИ : 99262 ; Гомологен : 37378 ; Генные карты : RPL22 ; ОМА : RPL22 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	6,209,389 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	152,418,528 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	Achilles tendon; ; ganglionic eminence; ; left ovary; ; monocyte; ; ventricular zone; ; right ovary; ; canal of the cervix; ; body of uterus; ; skin of abdomen; ; granulocyte;
	Top expressed in
	transitional epithelium of urinary bladder; ; medial ganglionic eminence; ; dermis; ; endothelial cell of lymphatic vessel; ; efferent ductule; ; endocardial cushion; ; maxillary prominence; ; mandibular prominence; ; migratory enteric neural crest cell; ; skin of abdomen;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	heparin binding; protein binding; structural constituent of ribosome; RNA binding; translation regulator activity;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; ribosome; focal adhesion; intracellular anatomical structure; cytosolic large ribosomal subunit; extracellular exosome; nucleus; extracellular matrix; ribonucleoprotein complex; presynapse; glutamatergic synapse;
Biological process	cytoplasmic translation; protein biosynthesis; viral transcription; SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; translational initiation; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; rRNA processing; alpha-beta T cell differentiation; regulation of translation at presynapse, modulating synaptic transmission;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	6146
	19934
	ENSG00000116251
	ENSMUSG00000028936
	P35268
	P67984
	НМ_000983
	НМ_001277113 ; НМ_001277114 ; НМ_009079
	НП_000974
	НП_001264042 ; НП_001264043 ; НП_033105
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Рибосомальный белок 60S L22 — это белок , который у человека кодируется RPL22 геном на хромосоме 1. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Рибосомы , органеллы , катализирующие синтез белка , состоят из небольшой субъединицы 40S и большой субъединицы 60S . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует цитоплазматический рибосомальный белок , который является компонентом субъединицы 60S. Белок принадлежит к семейству рибосомальных белков L22E. Его инициирующий остаток метионина посттрансляционно удаляется. Белок может специфически связываться с малой РНК (EBER) 1, кодируемой вирусом Эпштейна-Барр. Было показано, что мышиный белок способен связываться с гепарином . Существуют варианты транскрипта, использующие альтернативные полиА сигналы . Как это типично для генов, кодирующих рибосомальные белки, по геному рассеяно множество процессированных псевдогенов этого гена. Ранее считалось, что этот ген картирован в 3q26 и что он слит с геном острого миелолейкоза 1 , связанным с терапией, (AML1), расположенным в 21q22, у некоторых пациентов с миелодиспластическим синдромом с 3;21 транслокации ; однако в этих слияниях на самом деле участвует псевдоген рибосомного белка L22, расположенный в 3q26, и этот ген фактически картируется с 1p36.3-p36.2. ^{[ 6 ]}

Насекомые

Этот ген может играть роль в устойчивости насекомых к токсичности. У комаров кулекс это был один из нескольких рибосомальных белков, которые сверхэкспрессировались в штаммах, устойчивых к инсектициду дельтаметрину . ^{[ 7 ]} Более целенаправленный анализ показал, что резистентные комары экспрессируют RPL22 на уровне более чем в 2,5 раза выше, чем чувствительные штаммы; однако то же исследование показало, что сверхэкспрессия RPL22 в трансфицированных клетках вызывает подавление другого гена устойчивости к дельтаметрину ( CYP6A1 ) и делает эти клетки в целом менее устойчивыми к инсектициду. ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000116251 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028936 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Нусифора Дж., Беги Ч.Р., Эриксон П., Драбкин Х.А., Роули Дж.Д. (август 1993 г.). «Транслокация 3;21 при миелодисплазии приводит к слиянию транскрипта между геном AML1 и геном EAP, высококонсервативным белком, связанным с малой РНК EBER 1 вируса Эпштейна-Барра» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 90 (16): 7784–8. Бибкод : 1993PNAS...90.7784N . дои : 10.1073/pnas.90.16.7784 . ПМЦ 47227 . ПМИД 8395054 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок L22 RPL22» .
^ Ву Х.В., Тянь Х.С., Ву Г.Л., Лэнгдон Дж., Куртис Дж., Шен Б., Ма Л., Ли XL, Гу Ю, Ху XB, Чжу CL (июль 2004 г.). «Culex pipiens pallens: идентификация генов, дифференциально экспрессирующихся в штаммах, устойчивых и чувствительных к дельтаметрину». Биохимия и физиология пестицидов . 79 (3): 75–83. дои : 10.1016/j.pestbp.2004.04.004 .
^ Хэ Дж, Сунь Х, Чжан Д, Сунь Ю, Ма Л, Чен Л, Лю Цз, Сюн С, Ян Г, Чжу С (июнь 2009 г.). «Клонирование и характеристика 60S рибосомного белка L22 (RPL22) из Culex pipiens pallens» . Сравнительная биохимия и физиология. Часть B. Биохимия и молекулярная биология . 153 (2): 216–22. дои : 10.1016/j.cbpb.2009.03.003 . ПМИД 19298862 . S2CID 5058277 .

Дальнейшее чтение

Вул И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомальных белков млекопитающих». Биохимия и клеточная биология . 73 (11–12): 933–47. дои : 10.1139/o95-101 . ПМИД 8722009 .
Точиски Д.П., Стейц Ю.А. (февраль 1991 г.). «EAP, высококонсервативный клеточный белок, связанный с малыми РНК вируса Эпштейна-Барра (EBER)» . Журнал ЭМБО . 10 (2): 459–66. дои : 10.1002/j.1460-2075.1991.tb07968.x . ПМК 452667 . ПМИД 1846807 .
Фудзита Ю., Окамото Т., Ноширо М., Маккихан В.Л., Крэбб Дж.В., Уитни Р.Г., Като Ю., Сато Дж.Д., Такада К. (март 1994 г.). «Новый гепаринсвязывающий белок HBp15 идентифицирован как рибосомальный белок L22 млекопитающих». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 199 (2): 706–13. дои : 10.1006/bbrc.1994.1286 . ПМИД 8135813 .
Центр Сэнгера, The; Центр секвенирования генома Вашингтонского университета, (ноябрь 1998 г.). «На пути к полной последовательности генома человека» . Геномные исследования . 8 (11): 1097–108. дои : 10.1101/гр.8.11.1097 . ПМИД 9847074 .
Ле С., Стернгланц Р., Грейдер К.В. (март 2000 г.). «Идентификация двух РНК-связывающих белков, связанных с теломеразной РНК человека» . Молекулярная биология клетки . 11 (3): 999–1010. дои : 10.1091/mbc.11.3.999 . ПМК 14826 . ПМИД 10712515 .
Шу-Ну С., Линь Ч., Лин А. (октябрь 2000 г.). «Кислый аминокислотный кластер регулирует ядрышковую локализацию и сборку рибосом человеческого рибосомального белка L22» . Письма ФЭБС . 484 (1): 22–8. дои : 10.1016/S0014-5793(00)02118-9 . ПМИД 11056215 . S2CID 17840004 .
Уэчи Т., Танака Т., Кенмоти Н. (март 2001 г.). «Полная карта генов рибосомальных белков человека: отнесение 80 генов к цитогенетической карте и последствия для заболеваний человека». Геномика . 72 (3): 223–30. дои : 10.1006/geno.2000.6470 . ПМИД 11401437 .
Андерсен Дж.С., Лион CE, Фокс А.Х., Люнг А.К., Лам Ю.В., Стин Х., Манн М., Ламонд А.И. (январь 2002 г.). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Современная биология . 12 (1): 1–11. Бибкод : 2002CBio...12....1A . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . ПМИД 11790298 . S2CID 14132033 .
Ёшихама М., Уэчи Т., Асакава С., Кавасаки К., Като С., Хига С., Маэда Н., Миношима С., Танака Т., Симидзу Н., Кенмоти Н. (март 2002 г.). «Гены рибосомальных белков человека: секвенирование и сравнительный анализ 73 генов» . Геномные исследования . 12 (3): 379–90. дои : 10.1101/гр.214202 . ПМК 155282 . ПМИД 11875025 .
Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К., Онг С.Е., Лион К.Э., Ламонд А.И., Манн М. (январь 2005 г.). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД 15635413 . S2CID 4344740 .
Чен К.С., Чан Х.С., Фанг С.Л. (2005). «Экспрессия EBER чистой лимфоэпителиомоподобной карциномы мочевого пузыря у двух уникальных азиатских пациентов». Международная урология . 74 (3): 280–2. дои : 10.1159/000083565 . ПМИД 15812220 . S2CID 24326120 .
Фок В., Миттон-Фрай Р.М., Греч А., Стейц Дж.А. (май 2006 г.). «Множественные домены EBER 1, некодирующей РНК вируса Эпштейна-Барра, рекрутируют рибосомальный белок L22 человека» . РНК . 12 (5): 872–82. дои : 10.1261/rna.2339606 . ПМЦ 1440895 . ПМИД 16556938 .
Накао К., Мочики М., Нибу К., Сугасава М., Уозаки Х. (апрель 2006 г.). «Анализ прогностических факторов рака носоглотки: влияние гибридизации in situ вируса Эпштейна-Барра, кодируемого малой РНК 1». Отоларингология – хирургия головы и шеи . 134 (4): 639–45. дои : 10.1016/j.otohns.2005.11.022 . ПМИД 16564389 . S2CID 29788079 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P35268 (60S рибосомальный белок L22) в PDBe-KB .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000116251 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028936 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8395054-5] Нусифора Дж., Беги Ч.Р., Эриксон П., Драбкин Х.А., Роули Дж.Д. (август 1993 г.). «Транслокация 3;21 при миелодисплазии приводит к слиянию транскрипта между геном AML1 и геном EAP, высококонсервативным белком, связанным с малой РНК EBER 1 вируса Эпштейна-Барра» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 90 (16): 7784–8. Бибкод : 1993PNAS...90.7784N . дои : 10.1073/pnas.90.16.7784 . ПМЦ 47227 . ПМИД 8395054 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок L22 RPL22» .

[Wu04-7] Ву Х.В., Тянь Х.С., Ву Г.Л., Лэнгдон Дж., Куртис Дж., Шен Б., Ма Л., Ли XL, Гу Ю, Ху XB, Чжу CL (июль 2004 г.). «Culex pipiens pallens: идентификация генов, дифференциально экспрессирующихся в штаммах, устойчивых и чувствительных к дельтаметрину». Биохимия и физиология пестицидов . 79 (3): 75–83. дои : 10.1016/j.pestbp.2004.04.004 .

[He09-8] Хэ Дж, Сунь Х, Чжан Д, Сунь Ю, Ма Л, Чен Л, Лю Цз, Сюн С, Ян Г, Чжу С (июнь 2009 г.). «Клонирование и характеристика 60S рибосомного белка L22 (RPL22) из Culex pipiens pallens» . Сравнительная биохимия и физиология. Часть B. Биохимия и молекулярная биология . 153 (2): 216–22. дои : 10.1016/j.cbpb.2009.03.003 . ПМИД 19298862 . S2CID 5058277 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]