EIF5A

EIF5A
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: I3L397 PDBe I3L397 RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3CPF, 5DLQ
Идентификаторы
Псевдонимы	EIF5A , EIF-5A, EIF5A1, eIF5AI, эукариотический фактор инициации трансляции 5A, eIF-4D, FABAS
Внешние идентификаторы	Опустить : 600187 ; МГИ : 106248 ; Гомологен : 133803 ; Генные карты : EIF5A ; ОМА : EIF5A — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 17 (human)
End	7,312,463 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	69,812,784 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	skin of abdomen; ; skin of leg; ; stromal cell of endometrium; ; mucosa of transverse colon; ; right testis; ; appendix; ; left testis; ; gastrocnemius muscle; ; islet of Langerhans; ; right adrenal gland;
	Top expressed in
	somite; ; primitive streak; ; hand; ; mandibular prominence; ; dermis; ; maxillary prominence; ; human fetus; ; abdominal wall; ; Gonadal ridge; ; migratory enteric neural crest cell;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein N-terminus binding; ribosome binding; translation elongation factor activity; protein binding; RNA binding; U6 snRNA binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; endoplasmic reticulum membrane; membrane; nuclear pore; lamellae anulatae; endoplasmic reticulum; extracellular exosome; nucleus; dendrite; neuronal cell body;
Biological process	mRNA transport; protein biosynthesis; positive regulation of translational elongation; translational elongation; mRNA export from nucleus; peptidyl-lysine modification to peptidyl-hypusine; nucleocytoplasmic transport; protein export from nucleus; positive regulation of cell population proliferation; protein transport; translational frameshifting; positive regulation of translational termination; apoptotic process; positive regulation of cytosolic calcium ion concentration; human ageing; positive regulation of cardiac muscle cell apoptotic process; positive regulation of apoptotic process; negative regulation of apoptotic process; positive regulation of muscle cell differentiation; cellular response to thyroid hormone stimulus; positive regulation of reactive oxygen species metabolic process; transport;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1984
	276770
	ENSG00000132507 ; ENSG00000288145
	ENSMUSG00000078812
	P63241
	P63242
showНМ_001143760 ; НМ_001143761 ; НМ_001143762 ; НМ_001970 ; НМ_001370420 ;
	NM_001370421
showНМ_001166589 ; НМ_001166590 ; НМ_001166591 ; НМ_001166592 ; НМ_001166593 ;
	NM_001166594; NM_001166595; NM_001166596; NM_181582
showНП_001137232 ; НП_001137233 ; НП_001137234 ; НП_001961 ; НП_001357349 ;
	NP_001357350
showНП_001160061 ; НП_001160062 ; НП_001160063 ; НП_001160064 ; НП_001160065 ;
	NP_001160066; NP_001160067; NP_001160068; NP_853613
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Эукариотический фактор инициации трансляции 5А-1 представляет собой белок , который у человека кодируется EIF5A геном . ^[5]

Это единственный известный белок, содержащий необычную аминокислоту гипузин [ N ^е-(4-амино-2-гидроксибутил)-лизин], который синтезируется на eIF5A по специфическому остатку лизина из полиамина спермидина в две каталитические стадии. ^[6]

EF-P является бактериальным гомологом eIF5A, который модифицируется посттрансляционно аналогичным, но отличным способом. ^[7]^[8] Считается, что оба белка катализируют образование пептидных связей и помогают устранить задержку рибосом, что делает их факторами элонгации, несмотря на первоначально присвоенное название « фактор инициации ». ^[9]

Синдром Фаундеса-Банка

Вредные гетерозиготные варианты EIF5A зародышевой линии вызывают синдром Фаундеса-Банка . ^[10]^[11] Это редкое заболевание человека характеризуется различными сочетаниями задержки развития, микроцефалии , микрогнатии и дисморфических особенностей . Он был назван в честь Виктора Фаундеса и Сиддхарта Банка.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000288145 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000132507, ENSG00000288145 — Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000078812 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Стайнкассерер А., Джонс Т., Шир Д., Кеттниц К., Хаубер Дж., Бевек Д. (февраль 1995 г.). «Эукариотический кофактор белка rev вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1), eIF-5A, картируется на хромосоме 17p12-p13: три псевдогена eIF-5A сопоставляются с 10q23.3, 17q25 и 19q13.2». Геномика . 25 (3): 749–752. дои : 10.1016/0888-7543(95)80025-H . ПМИД 7759117 .
^ Вольф Э.К., Канг К.Р., Ким Ю.С., Парк М.Х. (август 2007 г.). «Посттрансляционный синтез гипузина: эволюционное развитие и специфика модификации гипузина» . Аминокислоты . 33 (2): 341–350. дои : 10.1007/s00726-007-0525-0 . ПМК 2572820 . ПМИД 17476569 .
^ Пак Дж. Х., Йоханссон Х. Э., Аоки Х., Хуанг Б. Х., Ким Х. И., Ганоза MC. Пак М. Х. (январь 2012 г.). «Для активности фактора элонгации P Escherichia coli (EF-P) необходима посттрансляционная модификация путем β-лизирования» . Журнал биологической химии . 287 (4): 2579–2590. дои : 10.1074/jbc.M111.309633 . ПМК 3268417 . ПМИД 22128152 .
^ Пейл Л., Староста А.Л., Вирумяэ К., Аткинсон Г.К., Тенсон Т., Ремме Дж., Уилсон Д.Н. (август 2012 г.). «Lys34 фактора элонгации трансляции EF-P гидроксилируется YfcM». Химическая биология природы . 8 (8): 695–697. дои : 10.1038/nchembio.1001 . ПМИД 22706199 .
^ Росси Д., Курошу Р., Занелли К.Ф., Валентини С.Р. (2013). «eIF5A и EF-P: два уникальных фактора перевода теперь идут одной дорогой». Междисциплинарные обзоры Wiley. РНК . 5 (2): 209–222. дои : 10.1002/wrna.1211 . ПМИД 24402910 . S2CID 25447826 .
^ Фаундс В., Дженнингс М.Д., Крилли С., Легрей С., Уизерс С.Э., Кувертино С., Дэвис С.Дж., Дуглас А.Г., Фрай А.Э., Харрисон В., Амиэль Дж., Лехалле Д., Ньюман В.Г., Ньюкирк П., Ранеллс Дж., Сплитт М., Кросс Л.А. , Сондерс С.Дж., Салливан Б.Р., Гранадилло Дж.Л., Гордон С.Т., Кашер П.Р., Павитт Г.Д., Банка С. (февраль 2021 г.). «Нарушение функции eIF5A вызывает менделевское расстройство, которое частично устраняется в модельных системах спермидином» . Природные коммуникации . 12 (1): 833. Бибкод : 2021NatCo..12..833F . дои : 10.1038/s41467-021-21053-2 . ПМЦ 7864902 . ПМИД 33547280 .
^ «Запись OMIM — #619376 — СИНДРОМ ФАУНДЕС-БАНКЫ; ФАБАС» . omim.org . Проверено 3 января 2022 г.

Дальнейшее чтение

Бевек Д., Хаубер Дж. (1997). «Активность эукариотического фактора инициации 5А и функция ВИЧ-1 Rev». Биологические сигналы . 6 (3): 124–133. дои : 10.1159/000109118 . ПМИД 9285095 .
Ли Л, Ли Х.С., Пауза К.Д., Букринский М., Чжао Р.Ю. (2006). «Роль вспомогательных белков ВИЧ-1 в вирусном патогенезе и взаимодействии хозяин-патоген» . Клеточные исследования . 15 (11–12): 923–934. дои : 10.1038/sj.cr.7290370 . ПМИД 16354571 .
Расмуссен Х.Х., Ван Дамм Дж., Пуйпе М., Гессер Б., Селис Дж.Э., Вандекеркхове Дж. (декабрь 1992 г.). «Микропоследовательности 145 белков, записанные в базе данных двумерных гелевых белков нормальных эпидермальных кератиноцитов человека». Электрофорез . 13 (12): 960–969. дои : 10.1002/elps.11501301199 . ПМИД 1286667 . S2CID 41855774 .
Чунг С.И., Пак М.Х., Фолк Дж.Э., Льюис М.С. (февраль 1991 г.). «Эукариотический фактор инициации 5А: молекулярная форма гипузинсодержащего белка из эритроцитов человека». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Структура белка и молекулярная энзимология . 1076 (3): 448–451. дои : 10.1016/0167-4838(91)90490-q . ПМИД 1900436 .
Смит-Макбрайд З., Девер Т.Е., Херши Дж.В., Меррик В.К. (январь 1989 г.). «Определение последовательности и клонирование кДНК эукариотического фактора инициации 4D, белка, содержащего гипузин» . Журнал биологической химии . 264 (3): 1578–1583. дои : 10.1016/S0021-9258(18)94226-2 . ПМИД 2492279 .
Пак М.Х., Лю Т.Я., Нис Ш., Свиггард В.Дж. (ноябрь 1986 г.). «Эукариотический фактор инициации 4D. Очистка эритроцитов человека и последовательность аминокислот вокруг его единственного остатка гипузина» . Журнал биологической химии . 261 (31): 14515–14519. дои : 10.1016/S0021-9258(18)66899-1 . ПМИД 3095320 .
Кеттниц К., Каппель Б., Баумрукер Т., Хаубер Дж., Бевек Д. (июль 1994 г.). «Геномная структура, кодирующая человеческий фактор инициации eIF-5A». Джин . 144 (2): 249–252. дои : 10.1016/0378-1119(94)90385-9 . ПМИД 7545941 .
Клиер Х., Чонга Р., Жоао ХК, Экерскорн К., Ауэр М., Лотспайх Ф., Эдер Дж. (ноябрь 1995 г.). «Выделение и структурная характеристика различных изоформ гипузинсодержащего белка eIF-5A из клеток HeLa». Биохимия . 34 (45): 14693–14702. дои : 10.1021/bi00045a010 . ПМИД 7578077 .
Кеттниц К., Вёль Т., Каппель Б., Лотспайх Ф., Хаубер Дж., Бевек Д. (июль 1995 г.). «Идентификация нового члена семейства генов человека eIF-5A». Джин . 159 (2): 283–284. дои : 10.1016/0378-1119(95)00136-Т . ПМИД 7622067 .
Джо Ю.А., Парк М.Х. (октябрь 1994 г.). «Структурные особенности предшественника eIF-5A, необходимые для посттрансляционного синтеза дезоксигипузина» . Журнал биологической химии . 269 (41): 25916–25921. дои : 10.1016/S0021-9258(18)47333-4 . ПМИД 7929297 .
Бевек Д., Клиер Х., Холтер В., Чахлер Э., Валент П., Лотспейх Ф. и др. (ноябрь 1994 г.). «Индуцированная экспрессия гена гипузинсодержащего белка фактора инициации эукариот 5А в активированных Т-лимфоцитах человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (23): 10829–10833. Бибкод : 1994PNAS...9110829B . дои : 10.1073/pnas.91.23.10829 . ПМЦ 45119 . ПМИД 7971969 .
Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–174. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Рул М., Химмельспах М., Бахр Г.М., Хаммершмид Ф., Якше Х., Вольф Б. и др. (декабрь 1993 г.). «Эукариотический фактор инициации 5А является клеточной мишенью домена активации Rev вируса иммунодефицита человека типа 1, опосредующего трансактивацию» . Журнал клеточной биологии . 123 (6 Пт 1): 1309–1320. дои : 10.1083/jcb.123.6.1309 . ПМК 2290910 . ПМИД 8253832 .
Лю Ю.П., Немерофф М., Ян Ю.П., Чен К.Ю. (1997). «Взаимодействие эукариотического фактора инициации 5А с РНК элемента ответа Rev вируса иммунодефицита человека типа 1 и мяРНК U6 требует модификации дезоксигипузина или гипузина». Биологические сигналы . 6 (3): 166–174. дои : 10.1159/000109123 . ПМИД 9285100 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–156. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Сингх США, Ли Кью, Серион Р. (январь 1998 г.). «Идентификация эукариотического фактора инициации 5А как стимулируемого ретиноевой кислотой клеточного партнера по связыванию тканевой трансглутаминазы II» . Журнал биологической химии . 273 (4): 1946–1950. дои : 10.1074/jbc.273.4.1946 . ПМИД 9442029 .
Шац О, Офт М, Дашер С, Шебеста М, Розориус О, Якше Х и др. (февраль 1998 г.). «Взаимодействие фактора инициации эукариот 5А, кофактора rev ВИЧ-1, с рибосомальным белком L5» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (4): 1607–1612. Бибкод : 1998PNAS...95.1607S . дои : 10.1073/pnas.95.4.1607 . ЧВК 19115 . ПМИД 9465063 .
Ли Ю.Б., Джо Ю.А., Вольф Э.К., Димитриадис Э.К., Парк М.Х. (май 1999 г.). «Образование комплекса между дезоксигипузинсинтазой и ее белковым субстратом, предшественником эукариотического фактора инициации трансляции 5А (eIF5A)» . Биохимический журнал . 340 (1): 273–281. дои : 10.1042/0264-6021:3400273 . ПМК 1220246 . ПМИД 10229683 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 17 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000288145 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000132507, ENSG00000288145 — Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000078812 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7759117-5] Стайнкассерер А., Джонс Т., Шир Д., Кеттниц К., Хаубер Дж., Бевек Д. (февраль 1995 г.). «Эукариотический кофактор белка rev вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1), eIF-5A, картируется на хромосоме 17p12-p13: три псевдогена eIF-5A сопоставляются с 10q23.3, 17q25 и 19q13.2». Геномика . 25 (3): 749–752. дои : 10.1016/0888-7543(95)80025-H . ПМИД 7759117 .

[pmid17476569-6] Вольф Э.К., Канг К.Р., Ким Ю.С., Парк М.Х. (август 2007 г.). «Посттрансляционный синтез гипузина: эволюционное развитие и специфика модификации гипузина» . Аминокислоты . 33 (2): 341–350. дои : 10.1007/s00726-007-0525-0 . ПМК 2572820 . ПМИД 17476569 .

[pmid22128152-7] Пак Дж. Х., Йоханссон Х. Э., Аоки Х., Хуанг Б. Х., Ким Х. И., Ганоза MC. Пак М. Х. (январь 2012 г.). «Для активности фактора элонгации P Escherichia coli (EF-P) необходима посттрансляционная модификация путем β-лизирования» . Журнал биологической химии . 287 (4): 2579–2590. дои : 10.1074/jbc.M111.309633 . ПМК 3268417 . ПМИД 22128152 .

[pmid22706199-8] Пейл Л., Староста А.Л., Вирумяэ К., Аткинсон Г.К., Тенсон Т., Ремме Дж., Уилсон Д.Н. (август 2012 г.). «Lys34 фактора элонгации трансляции EF-P гидроксилируется YfcM». Химическая биология природы . 8 (8): 695–697. дои : 10.1038/nchembio.1001 . ПМИД 22706199 .

[pmid24402910-9] Росси Д., Курошу Р., Занелли К.Ф., Валентини С.Р. (2013). «eIF5A и EF-P: два уникальных фактора перевода теперь идут одной дорогой». Междисциплинарные обзоры Wiley. РНК . 5 (2): 209–222. дои : 10.1002/wrna.1211 . ПМИД 24402910 . S2CID 25447826 .

[10] Фаундс В., Дженнингс М.Д., Крилли С., Легрей С., Уизерс С.Э., Кувертино С., Дэвис С.Дж., Дуглас А.Г., Фрай А.Э., Харрисон В., Амиэль Дж., Лехалле Д., Ньюман В.Г., Ньюкирк П., Ранеллс Дж., Сплитт М., Кросс Л.А. , Сондерс С.Дж., Салливан Б.Р., Гранадилло Дж.Л., Гордон С.Т., Кашер П.Р., Павитт Г.Д., Банка С. (февраль 2021 г.). «Нарушение функции eIF5A вызывает менделевское расстройство, которое частично устраняется в модельных системах спермидином» . Природные коммуникации . 12 (1): 833. Бибкод : 2021NatCo..12..833F . дои : 10.1038/s41467-021-21053-2 . ПМЦ 7864902 . ПМИД 33547280 .

[11] «Запись OMIM — #619376 — СИНДРОМ ФАУНДЕС-БАНКЫ; ФАБАС» . omim.org . Проверено 3 января 2022 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]