60S рибосомальный белок L6

РПЛ6
Доступные структуры
ПДБ	Поиск Human UniProt: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4UG0, 4V6X, 5AJ0, 4D67, 4D5Y, 4UJE
Идентификаторы
Псевдонимы	RPL6 , L6, SHUJUN-2, TAXREB107, TXREB1, рибосомальный белок L6
Внешние идентификаторы	Опустить : 603703 ; МГИ : 3647789 ; Гомологен : 31001 ; Генные карты : RPL6 ; ОМА : RPL6 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 12 (human)
End	112,418,838 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ganglionic eminence; ; ventricular zone; ; gonad; ; islet of Langerhans; ; pituitary gland; ; Achilles tendon; ; lymph node; ; left ovary; ; smooth muscle tissue; ; monocyte;
	n/a
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; structural constituent of ribosome; cadherin binding; RNA binding;
Cellular component	cytosol; ribosome; membrane; focal adhesion; intracellular anatomical structure; cytoplasmic ribonucleoprotein granule; cytosolic large ribosomal subunit; nucleus; cytoplasm; endoplasmic reticulum; rough endoplasmic reticulum; postsynaptic density; polysomal ribosome; synapse;
Biological process	cytoplasmic translation; regulation of transcription, DNA-templated; protein biosynthesis; viral transcription; SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; ribosomal large subunit assembly; translational initiation; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; rRNA processing;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6128
	432502
	ENSG00000089009
	н/д
	Q02878
	н/д
showНМ_000970 ; НМ_001024662 ; НМ_001320137 ; НМ_001320138 ; НМ_001320139 ;
	NM_001320140; NM_001320141; NM_001320142
	XM_036156129
showНП_000961 ; НП_001019833 ; НП_001307066 ; НП_001307067 ; НП_001307068 ;
	NP_001307069; NP_001307070; NP_001307071
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

60S рибосомальный белок L6 — это белок , который у человека кодируется RPL6 геном . ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Рибосомы , органеллы , катализирующие синтез белка , состоят из небольшой субъединицы 40S и большой субъединицы 60S . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомальный белок , который является компонентом субъединицы 60S. Белок принадлежит к семейству рибосомальных белков L6E. Он расположен в цитоплазме . Белок может специфически связываться с доменом C реагирующего на налог энхансерного элемента вируса Т-клеточного лейкоза человека типа 1 , и было высказано предположение, что белок может участвовать в опосредованной налогом трансактивации транскрипции. Как это типично для генов, кодирующих рибосомальные белки, по геному рассеяно множество процессированных псевдогенов этого гена. два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок. Для этого гена были обнаружены ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что RPL6 взаимодействует с основным фактором роста фибробластов . ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000089009 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Заман Г.Дж. (май 1993 г.). «Последовательность кДНК, кодирующей рибосомальный белок человека L26, и кДНК, вероятно, кодирующей рибосомальный белок человека L6» . Нуклеиновые кислоты Рез . 21 (7): 1673. doi : 10.1093/nar/21.7.1673 . ПМК 309386 . ПМИД 8479925 .
^ Морита Т., Сато Т., Нюноя Х., Цудзимото А., Такахара Дж., Ирино С., Симотоно К. (апрель 1993 г.). «Выделение клона кДНК, кодирующего ДНК-связывающий белок (TAXREB107), который специфически связывается с доменом C реагирующего на налог энхансерного элемента в длинном концевом повторе вируса Т-клеточного лейкоза человека типа I». Ретровирусы СПИДа . 9 (2): 115–21. дои : 10.1089/aid.1993.9.115 . ПМИД 8457378 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок L6 RPL6» .
^ Шен, Б; Арезе М; Гуаландрис А; Рифкин Д.Б. (ноябрь 1998 г.). «Внутриклеточная ассоциация FGF-2 с рибосомальным белком L6/TAXREB107» . Биохим. Биофиз. Рез. Общий . 252 (2). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 524–8. дои : 10.1006/bbrc.1998.9677 . ISSN 0006-291X . ПМИД 9826564 .

Дальнейшее чтение

Вул И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомальных белков млекопитающих». Биохим. Клеточная Биол . 73 (11–12): 933–47. дои : 10.1139/o95-101 . ПМИД 8722009 .
Ника Х, Халтин Т (1984). «Расположение сульфгидрильных групп, участвующих в дисульфидном взаимодействии между соседними белками L6 и L29 в рибосомах млекопитающих. S-расщепление цианилированных белков в полиакриламидных гелях после разделения электрофорезом в додецилсульфатном геле» . Евро. Дж. Биохим . 142 (3): 521–6. дои : 10.1111/j.1432-1033.1984.tb08316.x . ПМИД 6468376 .
Тодокоро К., Ульбрих Н., Чан Ю.Л., Вул И.Г. (1981). «Характеристика связывания рибосомальных белков L6, L8, L19, S9 и S13 печени крысы с 5,8S-рибосомальной рибонуклеиновой кислотой» . Ж. Биол. Хим . 256 (14): 7207–12. дои : 10.1016/S0021-9258(19)68949-0 . ПМИД 7251593 .
Като С., Секин С., О С.В. и др. (1995). «Создание банка полноразмерной кДНК человека». Джин . 150 (2): 243–50. дои : 10.1016/0378-1119(94)90433-2 . ПМИД 7821789 .
Охта К., Эндо Т., Гунджи К., Оная Т. (1994). «Выделение кДНК, экспрессия которой заметно увеличена в злокачественно трансформированных клетках FRTL и неопластических тканях щитовидной железы человека». Дж. Мол. Эндокринол . 12 (1): 85–92. дои : 10.1677/jme.0.0120085 . ПМИД 8185817 .
Монк С., Сакунтабхай А., Картер С.А. и др. (1998). «Уточненное генетическое картирование локуса Дарье с областью <1 см хромосомы 12q24.1 и построение полного контига искусственной хромосомы P1 / бактериальной искусственной хромосомы с высоким разрешением критической области» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 62 (4): 890–903. дои : 10.1086/301794 . ПМК 1377034 . ПМИД 9529352 .
Кенмоти Н., Кавагути Т., Розен С. и др. (1998). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геном Рез . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .
Шен Б., Арезе М., Гуаландрис А., Рифкин Д.Б. (1998). «Внутриклеточная ассоциация FGF-2 с рибосомальным белком L6/TAXREB107» . Биохим. Биофиз. Рез. Общий . 252 (2): 524–8. дои : 10.1006/bbrc.1998.9677 . ПМИД 9826564 .
Йе З, Коннор-младший (2000). «Клонирование кДНК путем амплификации кольцевых кДНК первой цепи выявляет нерегулируемые IRE-железо-чувствительные мРНК». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 275 (1): 223–7. дои : 10.1006/bbrc.2000.3282 . ПМИД 10944468 .
Кенмоти Н., Ёшихама М., Хига С., Танака Т. (2000). «Ген человеческого рибосомального белка L6 в критической области синдрома Нунан» . Дж. Хум. Жене . 45 (5): 290–3. дои : 10.1007/s100380070018 . ПМИД 11043511 .
Уэчи Т., Танака Т., Кенмоти Н. (2001). «Полная карта генов рибосомальных белков человека: отнесение 80 генов к цитогенетической карте и последствия для заболеваний человека». Геномика . 72 (3): 223–30. дои : 10.1006/geno.2000.6470 . ПМИД 11401437 .
Андерсен Дж.С., Лион К.Э., Фокс А.Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Курс. Биол . 12 (1): 1–11. Бибкод : 2002CBio...12....1A . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . ПМИД 11790298 . S2CID 14132033 .
Якель С., Мингот Дж.М., Шварцмайер П. и др. (2002). «Импортины выполняют двойную функцию: ядерные рецепторы импорта и цитоплазматические шапероны для открытых основных доменов» . ЭМБО Дж . 21 (3): 377–86. дои : 10.1093/emboj/21.3.377 . ПМЦ 125346 . ПМИД 11823430 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ду Дж.П., Джин С.Х., Ши Ю.К. и др. (2003). «[Дифференциальная экспрессия RPL6/Taxreb107 в лекарственно-устойчивой клеточной линии рака желудка SGC7901/ADR и ее корреляция с множественной лекарственной устойчивостью]». Чжунхуа Чжун Лю Цза Чжи . 25 (1): 21–5. ПМИД 12678981 .
Одинцова Т.И., Мюллер ЕС, Иванов А.В. и др. (2004). «Характеристика и анализ посттрансляционных модификаций белков больших цитоплазматических субъединиц рибосом человека с помощью масс-спектрометрии и секвенирования Эдмана». J. Протеиновая химия . 22 (3): 249–58. дои : 10.1023/А:1025068419698 . ПМИД 12962325 . S2CID 10710245 .
Баумистер Т., Баух А., Раффнер Х. и др. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Нат. Клеточная Биол . 6 (2): 97–105. дои : 10.1038/ncb1086 . ПМИД 14743216 . S2CID 11683986 .

Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000089009 – Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8479925-4] Заман Г.Дж. (май 1993 г.). «Последовательность кДНК, кодирующей рибосомальный белок человека L26, и кДНК, вероятно, кодирующей рибосомальный белок человека L6» . Нуклеиновые кислоты Рез . 21 (7): 1673. doi : 10.1093/nar/21.7.1673 . ПМК 309386 . ПМИД 8479925 .

[pmid8457378-5] Морита Т., Сато Т., Нюноя Х., Цудзимото А., Такахара Дж., Ирино С., Симотоно К. (апрель 1993 г.). «Выделение клона кДНК, кодирующего ДНК-связывающий белок (TAXREB107), который специфически связывается с доменом C реагирующего на налог энхансерного элемента в длинном концевом повторе вируса Т-клеточного лейкоза человека типа I». Ретровирусы СПИДа . 9 (2): 115–21. дои : 10.1089/aid.1993.9.115 . ПМИД 8457378 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок L6 RPL6» .

[pmid9826564-7] Шен, Б; Арезе М; Гуаландрис А; Рифкин Д.Б. (ноябрь 1998 г.). «Внутриклеточная ассоциация FGF-2 с рибосомальным белком L6/TAXREB107» . Биохим. Биофиз. Рез. Общий . 252 (2). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 524–8. дои : 10.1006/bbrc.1998.9677 . ISSN 0006-291X . ПМИД 9826564 .

[1]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]