40S рибосомальный белок S19

РПС19
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 5FLX, 3J7R, 4D61, 4D5L, 4UJD, 3J7P, 4UJE, 4UJC
Идентификаторы
Псевдонимы	RPS19 , DBA, DBA1, S19, рибосомальный белок S19, eS19, LOH19CR1
Внешние идентификаторы	Опустить : 603474 ; МГИ : 1333780 ; Гомологен : 37416 ; Генные карты : RPS19 ; ОМА : RPS19 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	41,872,925 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	24,889,806 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	skin of thigh; ; skin of hip; ; right uterine tube; ; granulocyte; ; human penis; ; gingival epithelium; ; embryo; ; vulva; ; nipple; ; skin of abdomen;
	Top expressed in
	blastocyst; ; ventricular zone; ; embryo; ; embryo; ; ganglionic eminence; ; uterus; ; morula; ; lip; ; bone marrow; ; neural tube;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	protein kinase binding; protein homodimerization activity; fibroblast growth factor binding; structural constituent of ribosome; protein binding; RNA binding;
Cellular component	extracellular exosome; ribosome; nucleolus; cytoplasm; nucleus; membrane; focal adhesion; intracellular anatomical structure; cytosolic small ribosomal subunit; cytosol; extracellular matrix; nucleoplasm; postsynaptic density; synapse;
Biological process	Notch signaling pathway; SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; negative regulation of respiratory burst involved in inflammatory response; viral transcription; monocyte chemotaxis; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; ribosomal small subunit assembly; response to extracellular stimulus; positive regulation of respiratory burst involved in inflammatory response; nucleolus organization; protein tetramerization; maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA); translational initiation; erythrocyte differentiation; maturation of SSU-rRNA; ribosomal small subunit biogenesis; protein biosynthesis; rRNA processing; antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6223
	20085
	ENSG00000105372
	ENSMUSG00000040952
	P39019
	Q9CZX8
	НМ_001022 ; НМ_001321483 ; НМ_001321484 ; НМ_001321485
	НМ_023133
	НП_001013 ; НП_001308412 ; НП_001308413 ; НП_001308414
showНП_075622 ; НП_001347044 ; НП_001347045 ; НП_001347047 ; НП_001347048 ;
	NP_001347054; NP_001347057
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

40S рибосомальный белок S19 — это белок , который у человека кодируется RPS19 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Рибосомы , органеллы , катализирующие синтез белка , состоят из небольшой субъединицы 40S и большой субъединицы 60S . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомальный белок , который является компонентом субъединицы 40S. Белок принадлежит к семейству рибосомальных белков S19E. Он расположен в цитоплазме . Как это типично для генов, кодирующих рибосомальные белки, по геному рассеяно множество процессированных псевдогенов этого гена. ^{[ 6 ]}

Клиническое значение

Мутации в этом гене вызывают анемию Даймонда-Блэкфана (DBA), конституциональную эритробластопению , характеризующуюся отсутствием или уменьшением количества предшественников эритроида у части пациентов . Это предполагает возможную экстрарибосомальную функцию этого гена в эритропоэтической дифференцировке и пролиферации в дополнение к его рибосомальной функции. более высокие уровни экспрессии этого гена в некоторых первичных карциномах толстой кишки по сравнению с соответствующими нормальными тканями толстой кишки. Наблюдались ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что рибосомальный белок S19 взаимодействует с основным фактором роста фибробластов . ^{[ 7 ]} RPS19 также секретируется внеклеточно, и его внеклеточные олигомеры (сшитые трансглутаминазой фактора свертывания крови XIII ) также, как известно, связывают и, вероятно, ингибируют фактор, ингибирующий миграцию макрофагов ; хотя сами олигомеры S19 разделяют функцию MCIP как еще один очень сильный хемоаттрактант макрофагов и связываются с рецептором анафилотоксина C5. ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000105372 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040952 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Кенмоти Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Э., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж DC (август 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геном Рез . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: рибосомальный белок S19 RPS19» .
^ Суле Ф, Аль Саати Т, Рога С, Амальрик Ф, Буш Дж (ноябрь 2001 г.). «Фактор роста фибробластов-2 взаимодействует со свободным рибосомальным белком S19». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 289 (2): 591–6. дои : 10.1006/bbrc.2001.5960 . ПМИД 11716516 .
^ Молекулярные основы клеточной биологии и биологии развития: Ана-Мария Филип, Йорг Клуг, Севиль Кайли, Суада Фрелих, Тамара Хенке, Филипп Лахер, Регина Эйкхофф, Патрик Булау, Моника Линдер, Кристин Карлссон-Сквирут, Лин Ленг, Ричард Букала, Сандра Кремер, Юрген Бернхаген и Андреас Мейнхардт. «Рибосомальный белок S19 взаимодействует с фактором ингибирования миграции макрофагов и ослабляет его провоспалительную функцию» J. Biol. хим. 2009 284: 7977–7985. Впервые опубликовано 20 января 2009 г., doi:10.1074/jbc.M808620200.

Дальнейшее чтение

Вул И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомальных белков млекопитающих». Биохим. Клеточная Биол . 73 (11–12): 933–47. дои : 10.1139/o95-101 . ПМИД 8722009 .
Моримото К., Лин С., Сакамото К. (2007). «Функции RPS19 и их связь с анемией Даймонда-Блэкфана: обзор». Мол. Жене. Метаб . 90 (4): 358–62. дои : 10.1016/j.ymgme.2006.11.004 . ПМИД 17178250 .
Ямамото Т. (2007). «Роль димера рибосомного белка S19 и рецептора C5a в патофизиологических функциях фагоцитирующих лейкоцитов». Патол. Межд . 57 (1): 1–11. дои : 10.1111/j.1440-1827.2007.02049.x . ПМИД 17199736 . S2CID 22946804 .
Кондо Н., Швайнфест К.В., Хендерсон К.В., Папас Т.С. (1992). «Дифференциальная экспрессия рибосомного белка S19, ламинин-связывающего белка и информационных РНК класса I антигена лимфоцитов человека, связанная с прогрессированием и дифференцировкой карциномы толстой кишки». Рак Рез . 52 (4): 791–6. ПМИД 1339304 .
Владимиров С.Н., Иванов А.В., Карпова Г.Г., Мусолямов АК, Егоров Т.А., Тиде Б, Виттманн-Либольд Б, Отто А (1996). «Характеристика белков малых рибосомальных субъединиц человека с помощью N-концевого и внутреннего секвенирования, а также масс-спектрометрии» . Евро. Дж. Биохим . 239 (1): 144–9. дои : 10.1111/j.1432-1033.1996.0144u.x . ПМИД 8706699 .
Драпчинская Н., Густавссон П., Андерссон Б., Петтерссон М., Виллиг Т.Н., Дианзани И., Болл С., Черния Г., Клар Дж., Матссон Х., Тентлер Д., Мохандас Н., Карлссон Б., Даль Н. (1999). «Ген, кодирующий рибосомальный белок S19, мутирует при анемии Даймонда-Блэкфана». Нат. Жене . 21 (2): 169–75. дои : 10.1038/5951 . ПМИД 9988267 . S2CID 26664929 .
Виллиг Т.Н., Драпчинская Н., Дианзани И., Болл С., Нимейер С., Раменги Ю., Орфали К., Густавссон П., Гарелли Е., Бруско А., Тиманн С., Периньон Дж.Л., Бушье С., Чикьелло Л., Даль Н., Мохандас Н., Черния Г. (2000). «Мутации в гене рибосомального белка S19 и анемия Даймонда Блэкфана: широкие различия в фенотипическом проявлении». Кровь . 94 (12): 4294–306. ПМИД 10590074 .
Матссон Х., Клар Дж., Драпчинская Н., Густавссон П., Карлссон Б., Бауэрс Д., де Бонт Э., Даль Н. (2000). «Усечение мутаций рибосомного белка S19 и вариабельная клиническая экспрессия при анемии Даймонда-Блэкфана». Хм. Жене . 105 (5): 496–500. дои : 10.1007/s004390051136 . ПМИД 10598818 .
Тентлер Д., Густавссон П., Элиндер Г., Эклёф О., Гордон Л., Мандель А., Даль Н. (2000). «Микроделеция в 19q13.2, связанная с умственной отсталостью, пороками развития скелета и анемией Даймонда-Блэкфана, предполагает новый синдром смежных генов» . Дж. Мед. Жене . 37 (2): 128–31. дои : 10.1136/jmg.37.2.128 . ПМЦ 1734524 . ПМИД 10662814 .
Раменги Ю, Кампаньоли МФ, Гарелли Э, Карандо А, Бруско А, Баньяра ГП, Стрипполи П, Иззи ГЦ, Брандализ С, Риккарди Р, Дианзани I (2001). «Анемия Даймонда-Блэкфана: сообщение о семи дополнительных мутациях в гене RPS19 и доказательства гетерогенности мутаций в итальянской популяции». Клетки крови Мол. Этот . 26 (5): 417–22. дои : 10.1006/bcmd.2000.0324 . ПМИД 11112378 .
Нисимура Т., Хорино К., Нисиура Х., Сибуя Ю., Хираока Т., Танасе С., Ямамото Т. (2001). «Апоптотические клетки линии эпителиальных клеток AsPC-1 высвобождают димер хемотаксического рибосомального белка S19 моноцитов». Дж. Биохим . 129 (3): 445–54. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a002876 . ПМИД 11226885 .
Суле Ф, Аль Саати Т, Рога С, Амальрик Ф, Буш Ж (2002). «Фактор роста фибробластов-2 взаимодействует со свободным рибосомальным белком S19». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 289 (2): 591–6. дои : 10.1006/bbrc.2001.5960 . ПМИД 11716516 .
Сибуя Ю, Сиокава М, Нисиура Х, Нисимура Т, Нишино Н, Окабе Х, Такаги К, Ямамото Т (2001). «Идентификация сайтов связывания рецепторов димера хемотаксического рибосомального белка S19 моноцитов» . Являюсь. Дж. Патол . 159 (6): 2293–301. дои : 10.1016/S0002-9440(10)63079-9 . ПМК 1850605 . ПМИД 11733378 .
Ли Б, Сунь М, Хэ Б, Ю Дж, Чжан Ю.Д., Чжан Ю.Л. (2004). «Идентификация дифференциально экспрессируемых генов в лейомиоме матки человека с использованием дифференциального дисплея» . Сотовый Res . 12 (1): 39–45. дои : 10.1038/sj.cr.7290108 . ПМИД 11942409 .
Да Коста Л., Черня Г., Гаскар П., Ло А., Мирпол Дж., Нимейер С., Чесис Дж.А., Фикслер Дж., Мохандас Н. (2004). «Ядрышковая локализация белка RPS19 в нормальных клетках и неправильная локализация из-за мутаций сигналов ядрышковой локализации у 2 пациентов с анемией Даймонда-Блэкфана: потенциальное понимание патофизиологии» . Кровь . 101 (12): 5039–45. дои : 10.1182/кровь-2002-12-3878 . ПМИД 12586610 .
Шреста А., Сиокава М., Нисимура Т., Нисиура Х., Танака Ю., Нишино Н., Сибуя Ю., Ямамото Т. (2003). «Переключающая группа в двойном эффекте агониста/антагониста димера рибосомального белка S19 на хемотаксический рецептор C5a лейкоцитов» . Являюсь. Дж. Патол . 162 (4): 1381–8. дои : 10.1016/S0002-9440(10)63934-X . ПМЦ 1851224 . ПМИД 12651630 .
Пруст А., Да Коста Л., Ринс П., Ландуа А., Тамари Х., Заизов Р., Черня Г., Делоне Дж. (2003). «Десять новых мутаций анемии Даймонда-Блэкфана и три полиморфизма в гене rps19». Гематол. Дж 4 (2): 132–6. дои : 10.1038/sj.thj.6200230 . ПМИД 12750732 .

Внешние ссылки

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000105372 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040952 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9582194-5] Кенмоти Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Э., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж DC (август 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геном Рез . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: рибосомальный белок S19 RPS19» .

[pmid11716516-7] Суле Ф, Аль Саати Т, Рога С, Амальрик Ф, Буш Дж (ноябрь 2001 г.). «Фактор роста фибробластов-2 взаимодействует со свободным рибосомальным белком S19». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 289 (2): 591–6. дои : 10.1006/bbrc.2001.5960 . ПМИД 11716516 .

[8] Молекулярные основы клеточной биологии и биологии развития: Ана-Мария Филип, Йорг Клуг, Севиль Кайли, Суада Фрелих, Тамара Хенке, Филипп Лахер, Регина Эйкхофф, Патрик Булау, Моника Линдер, Кристин Карлссон-Сквирут, Лин Ленг, Ричард Букала, Сандра Кремер, Юрген Бернхаген и Андреас Мейнхардт. «Рибосомальный белок S19 взаимодействует с фактором ингибирования миграции макрофагов и ослабляет его провоспалительную функцию» J. Biol. хим. 2009 284: 7977–7985. Впервые опубликовано 20 января 2009 г., doi:10.1074/jbc.M808620200.

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]