EIF1AX

EIF1AX
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1D7Q, 3ZJY, 4KZY, 4KZZ
Идентификаторы
Псевдонимы	EIF1AX , EIF1A, EIF1AP1, EIF4C, eIF-1A, eIF-4C, эукариотический фактор инициации трансляции 1А, Х-связанный, эукариотический фактор инициации трансляции 1А, Х-связанный
Внешние идентификаторы	Опустить : 300186 ; МГИ : 95298 ; Гомологен : 20364 ; Генные карты : EIF1AX ; OMA : EIF1AX — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	X chromosome (human)
End	20,141,838 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 18 (mouse)
End	46,749,523 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	endothelial cell; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; gonad; ; lateral nuclear group of thalamus; ; biceps brachii; ; pons; ; ganglionic eminence; ; pericardium; ; Skeletal muscle tissue of biceps brachii; ; postcentral gyrus;
	Top expressed in
	seminal vesicula; ; otic placode; ; saccule; ; pineal gland; ; otic vesicle; ; decidua; ; corneal stroma; ; epiblast; ; tail of embryo; ; calvaria;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	translation factor activity, RNA binding; protein binding; translation initiation factor activity; RNA binding;
Cellular component	cytosol;
Biological process	translational initiation; protein biosynthesis;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1964
	13664
	ENSG00000173674
	ENSMUSG00000057561
	P47813
	Q60872
	НМ_001412
	НМ_010120 ; НМ_001374654
	НП_001403
	НП_034250
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Эукариотический фактор инициации трансляции 1А, Х-хромосома ( eIF1A ) — белок , который у человека кодируется EIF1AX геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Этот ген кодирует важный эукариотический фактор инициации трансляции. Белок является компонентом преинициаторного комплекса 43S (PIC), который опосредует привлечение небольшой рибосомальной субъединицы 40S к 5'-кэпу информационных РНК. ^{[ 7 ]}

Функция

eIF1A представляет собой небольшой белок (17 кДа у почкующихся дрожжей) и компонент преинициаторных комплексов 43S (PIC). eIF1A связывается вблизи рибосомального A-сайта аналогично функционально родственному бактериальному аналогу IF1 . ^{[ 8 ]}

Клиническое значение

Мутации в этом гене неоднократно наблюдались в случаях увеальной меланомы с дисомией 3. ^{[ 9 ]} eIF1A мутирует при раке щитовидной железы . ^{[ 10 ]}

Взаимодействия

Было показано, что EIF1AX взаимодействует с IPO13 . ^{[ 11 ]}

См. также

Факторы инициации эукариот

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000173674 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000057561 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Девер Т.Е., Вэй К.Л., Бенковски Л.А., Браунинг К., Меррик В.К., Херши Дж.В. (февраль 1994 г.). «Определение аминокислотной последовательности фактора синтеза белка кролика, человека и зародышей пшеницы eIF-4C путем клонирования и химического секвенирования» . Журнал биологической химии . 269 (5): 3212–8. дои : 10.1016/S0021-9258(17)41850-3 . ПМИД 8106356 .
^ Лан Б.Т., Пейдж, округ Колумбия (октябрь 1997 г.). «Функциональная когерентность Y-хромосомы человека». Наука . 278 (5338): 675–80. Бибкод : 1997Sci...278..675L . дои : 10.1126/science.278.5338.675 . ПМИД 9381176 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: эукариотический фактор инициации трансляции EIF1AX 1A, Х-связанный» .
^ Фрейзер, Кристофер С. (2015). «Количественные исследования рекрутирования мРНК в рибосому эукариот» . Биохимия . 114 : 58–71. дои : 10.1016/j.biochi.2015.02.017 . ПМЦ 4458453 . ПМИД 25742741 .
^ Мартин М., Масхёфер Л., Темминг П., Рахманн С., Мец С., Борнфельд Н., ван де Нес Дж., Кляйн-Хитпасс Л., Хиннебуш А.Г., Хорстемке Б., Ломанн Д.Р., Зешнигк М. (август 2013 г.). «Секвенирование экзома выявляет рецидивирующие соматические мутации в EIF1AX и SF3B1 при увеальной меланоме с дисомией 3» . Природная генетика . 45 (8): 933–6. дои : 10.1038/ng.2674 . ПМК 4307600 . ПМИД 23793026 .
^ Сюй, Ичэнь; Руджеро, Давиде (09 марта 2020 г.). «Роль контроля трансляции в онкогенезе и его терапевтические последствия» . Ежегодный обзор биологии рака . 4 (1): 437–457. doi : 10.1146/annurev-cancerbio-030419-033420 . ISSN 2472-3428 .
^ Мингот Дж. М., Костка С., Крафт Р., Хартманн Э., Герлих Д. (июль 2001 г.). «Импортин 13: новый посредник ядерного импорта и экспорта» . Журнал ЭМБО . 20 (14): 3685–94. дои : 10.1093/emboj/20.14.3685 . ПМК 125545 . ПМИД 11447110 .

Дальнейшее чтение

Баттист Дж.Л., Пестова Т.В., Хеллен К.У., Вагнер Г. (январь 2000 г.). «Структура раствора eIF1A обнаруживает большую поверхность связывания РНК, важную для функции сканирования» . Молекулярная клетка . 5 (1): 109–19. дои : 10.1016/S1097-2765(00)80407-4 . ПМИД 10678173 .
Чой С.К., Олсен Д.С., Ролл-Мекак А., Мартунг А., Ремо К.Л., Берли С.К., Хиннебуш А.Г., Девер Т.Е. (октябрь 2000 г.). «Физическое и функциональное взаимодействие между эукариотическими ортологами прокариотических факторов инициации трансляции IF1 и IF2» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (19): 7183–91. дои : 10.1128/MCB.20.19.7183-7191.2000 . ПМЦ 86272 . ПМИД 10982835 .
Мингот Дж. М., Костка С., Крафт Р., Хартманн Э., Герлих Д. (июль 2001 г.). «Импортин 13: новый посредник ядерного импорта и экспорта» . Журнал ЭМБО . 20 (14): 3685–94. дои : 10.1093/emboj/20.14.3685 . ПМК 125545 . ПМИД 11447110 .
Соренсен Х.П., Хедегаард Дж., Сперлинг-Петерсен Х.У., Мортенсен К.К. (май 2001 г.). «Замечательная консервативность факторов инициации трансляции: IF1/eIF1A и IF2/eIF5B являются повсеместно распространенными филогенетическими маркерами». ИУБМБ Жизнь . 51 (5): 321–7. дои : 10.1080/152165401317190842 . ПМИД 11699879 . S2CID 45654480 .
Бонсак М.Т., Регенер К., Шваппах Б., Саффрик Р., Параскева Е., Хартманн Е., Герлих Д. (ноябрь 2002 г.). «Exp5 экспортирует eEF1A через тРНК из ядер и взаимодействует с другими транспортными путями, ограничивая трансляцию цитоплазмой» . Журнал ЭМБО . 21 (22): 6205–15. дои : 10.1093/emboj/cdf613 . ПМК 137205 . ПМИД 12426392 .
Олсен Д.С., Савнер Э.М., Мэтью А., Чжан Ф., Кришнамурти Т., Фан Л., Хиннебуш А.Г. (январь 2003 г.). «Домены eIF1A, которые опосредуют связывание с eIF2, eIF3 и eIF5B и способствуют рекрутированию тройных комплексов in vivo» . Журнал ЭМБО . 22 (2): 193–204. дои : 10.1093/emboj/cdg030 . ПМК 140105 . ПМИД 12514125 .
Маринчев А., Колупаева В.Г., Пестова Т.В., Вагнер Г. (февраль 2003 г.). «Картирование интерфейса связывания между факторами инициации эукариот человека 1A и 5B: новое взаимодействие между старыми партнерами» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (4): 1535–40. Бибкод : 2003PNAS..100.1535M . дои : 10.1073/pnas.0437845100 . ПМК 149867 . ПМИД 12569173 .
Агат Р.Дж., Чой М., Арнольд А.П. (февраль 2004 г.). «Половые различия в структуре и экспрессии генов половых хромосом CHD1Z и CHD1W у зебровых амадин» . Молекулярная биология и эволюция . 21 (2): 384–96. дои : 10.1093/molbev/msh027 . ПМИД 14660691 .
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.Ю. , Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Ким С., Ким GJ, Миёси Х, Мун Ш., Ан С.Э., Ли Дж.Х., Ли Х.Дж., Ча К.И., Чунг Х.М. (август 2007 г.). «Эффективность промотора фактора элонгации-1альфа в эмбриональных стволовых клетках млекопитающих с использованием систем доставки лентивирусных генов». Стволовые клетки и развитие . 16 (4): 537–45. дои : 10.1089/scd.2006.0088 . ПМИД 17784828 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P47813 (эукариотический фактор инициации трансляции 1A, X-хромосома) в PDBe-KB .

Эта статья о гене человека Х-хромосомы и/или связанном с белке незавершена . ним Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000173674 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000057561 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8106356-5] Девер Т.Е., Вэй К.Л., Бенковски Л.А., Браунинг К., Меррик В.К., Херши Дж.В. (февраль 1994 г.). «Определение аминокислотной последовательности фактора синтеза белка кролика, человека и зародышей пшеницы eIF-4C путем клонирования и химического секвенирования» . Журнал биологической химии . 269 (5): 3212–8. дои : 10.1016/S0021-9258(17)41850-3 . ПМИД 8106356 .

[pmid9381176-6] Лан Б.Т., Пейдж, округ Колумбия (октябрь 1997 г.). «Функциональная когерентность Y-хромосомы человека». Наука . 278 (5338): 675–80. Бибкод : 1997Sci...278..675L . дои : 10.1126/science.278.5338.675 . ПМИД 9381176 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: эукариотический фактор инициации трансляции EIF1AX 1A, Х-связанный» .

[Fraser-8] Фрейзер, Кристофер С. (2015). «Количественные исследования рекрутирования мРНК в рибосому эукариот» . Биохимия . 114 : 58–71. дои : 10.1016/j.biochi.2015.02.017 . ПМЦ 4458453 . ПМИД 25742741 .

[9] Мартин М., Масхёфер Л., Темминг П., Рахманн С., Мец С., Борнфельд Н., ван де Нес Дж., Кляйн-Хитпасс Л., Хиннебуш А.Г., Хорстемке Б., Ломанн Д.Р., Зешнигк М. (август 2013 г.). «Секвенирование экзома выявляет рецидивирующие соматические мутации в EIF1AX и SF3B1 при увеальной меланоме с дисомией 3» . Природная генетика . 45 (8): 933–6. дои : 10.1038/ng.2674 . ПМК 4307600 . ПМИД 23793026 .

[10] Сюй, Ичэнь; Руджеро, Давиде (09 марта 2020 г.). «Роль контроля трансляции в онкогенезе и его терапевтические последствия» . Ежегодный обзор биологии рака . 4 (1): 437–457. doi : 10.1146/annurev-cancerbio-030419-033420 . ISSN 2472-3428 .

[pmid11447110-11] Мингот Дж. М., Костка С., Крафт Р., Хартманн Э., Герлих Д. (июль 2001 г.). «Импортин 13: новый посредник ядерного импорта и экспорта» . Журнал ЭМБО . 20 (14): 3685–94. дои : 10.1093/emboj/20.14.3685 . ПМК 125545 . ПМИД 11447110 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]