40S рибосомальный белок S5

РПС5
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 3J7P, 4KZX, 4UJE, 4KZY, 4D5L, 4KZZ, 3J7R, 4UJD, 4V5Z, 5FLX, 4D61, 4UJC,%%s4KZY, 3J7R, 4D61, 4KZX, 4D5L, 4V5Z, 5A2Q, 4V6X, 4UJD, 3J7P, 5AJ0, 4KZZ, 4UG0, 4UJE, 4UJC, 5FLX
Идентификаторы
Псевдонимы	RPS5 , S5, рибосомальный белок S5
Внешние идентификаторы	ПРОПУСКАТЬ : 603630 ; МГИ : 1097682 ; Гомологен : 783 ; Генные карты : РПС5 ; ОМА : РПС5 - ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	58,394,806 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	12,660,613 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	gonad; ; vulva; ; trabecular bone; ; mucosa of sigmoid colon; ; skin of arm; ; human penis; ; left ovary; ; oral cavity; ; superficial temporal artery; ; skin of thigh;
	Top expressed in
	Gonadal ridge; ; mandibular prominence; ; maxillary prominence; ; efferent ductule; ; internal carotid artery; ; somite; ; medial ganglionic eminence; ; precursor cell; ; migratory enteric neural crest cell; ; external carotid artery;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	structural constituent of ribosome; protein binding; mRNA binding; RNA binding; rRNA binding;
Cellular component	cytosol; ribosome; membrane; focal adhesion; small ribosomal subunit; extracellular exosome; extracellular matrix; nucleoplasm; cytosolic small ribosomal subunit; ribonucleoprotein complex;
Biological process	viral transcription; SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; translational initiation; regulation of translational fidelity; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; rRNA processing; protein biosynthesis; ribosomal small subunit assembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	6193
	20103
	ENSG00000083845
	ENSMUSG00000012848
	P46782
	P97461
	НМ_001009
	НМ_009095
	НП_001000 ; НП_001000.2
	НП_033121
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

40S рибосомный белок S5 представляет собой рибосомальную субъединицу эукариотического рибосомного (80S) комплекса. У человека он кодируется RPS5 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Рибосомы , органеллы, катализирующие синтез белка , у эукариот состоят из небольшой субъединицы 40S и большой субъединицы 60S (тогда как прокариотические рибосомы представляют собой 70 единиц Сведберга , состоящих из субъединиц 50S и 30S ). Они расположены в цитоплазме. Вместе эти субъединицы состоят из четырех видов РНК и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомальный белок, который является компонентом субъединицы 40S эукариот. Белок принадлежит к семейству рибосомальных белков S7P. вариабельная экспрессия этого гена при колоректальном раке Наблюдалась по сравнению с прилегающими нормальными тканями, хотя корреляции между уровнем экспрессии и тяжестью заболевания не обнаружено. Как это типично для генов, кодирующих рибосомальные белки, по геному рассеяно множество процессированных псевдогенов этого гена. ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000083845 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000012848 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Фриджерио Дж. М., Дагорн Дж. К., Йованна Дж. Л. (июль 1995 г.). «Клонирование, секвенирование и экспрессия мРНК рибосомальных белков человека L5, L21, L27a, L28, S5, S9, S10 и S29». Биохим Биофиз Акта . 1262 (1): 64–8. дои : 10.1016/0167-4781(95)00045-i . ПМИД 7772601 .
^ Кенмочи Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Э., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж DC (август 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геном Рез . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок S5 RPS5» .

Дальнейшее чтение

Вул И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомальных белков млекопитающих». Биохим. Клеточная Биол . 73 (11–12): 933–47. дои : 10.1139/o95-101 . ПМИД 8722009 .
Като С., Секин С., О С.В. и др. (1995). «Создание банка полноразмерной кДНК человека». Джин . 150 (2): 243–50. дои : 10.1016/0378-1119(94)90433-2 . ПМИД 7821789 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Мундус Д.А., Булыгин К.Н., Ямковой В.И. и др. (1993). «Структурная организация области взаимодействия кодон-антикодон в рибосомах плаценты человека. Аффинное мечение субъединиц 40S производными олигорибонуклеотидов, содержащих кодон AUG». Биохим. Биофиз. Акта . 1173 (3): 273–82. дои : 10.1016/0167-4781(93)90124-в . ПМИД 8318536 .
Владимиров С.Н., Иванов А.В., Карпова Г.Г. и др. (1996). «Характеристика белков малых рибосомальных субъединиц человека с помощью N-концевого и внутреннего секвенирования, а также масс-спектрометрии» . Евро. Дж. Биохим . 239 (1): 144–9. дои : 10.1111/j.1432-1033.1996.0144u.x . ПМИД 8706699 .
Сузуки И., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Бортолуцци С., д'Алесси Ф., Ромуальди С., Даниэли Г.А. (2002). «Дифференциальная экспрессия генов, кодирующих рибосомальные белки, в разных тканях человека» . Биоинформатика . 17 (12): 1152–7. дои : 10.1093/биоинформатика/17.12.1152 . ПМИД 11751223 .
Андерсен Дж.С., Лион К.Э., Фокс А.Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Курс. Биол . 12 (1): 1–11. Бибкод : 2002CBio...12....1A . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . ПМИД 11790298 . S2CID 14132033 .
Ёшихама М., Уэчи Т., Асакава С. и др. (2002). «Гены рибосомальных белков человека: секвенирование и сравнительный анализ 73 генов» . Геном Рез . 12 (3): 379–90. дои : 10.1101/гр.214202 . ПМК 155282 . ПМИД 11875025 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Малыгин А, Барановская О, Иванов А, Карпова Г (2003). «Экспрессия и очистка рибосомальных белков человека S3, S5, S10, S19 и S26». Экспр. белка Пуриф . 28 (1): 57–62. дои : 10.1016/S1046-5928(02)00652-6 . ПМИД 12651107 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К. и др. (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД 15635413 . S2CID 4344740 .
Ю Ю, Джи Х, Дудна Дж. А., Лири Дж. А. (2005). «Масс-спектрометрический анализ 40S рибосомальной субъединицы человека: нативные и IRES-связанные комплексы ВГС» . Белковая наука . 14 (6): 1438–46. дои : 10.1110/ps.041293005 . ПМЦ 2253395 . ПМИД 15883184 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P46782 (40S рибосомальный белок S5) в PDBe-KB .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 19 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000083845 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000012848 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7772601-5] Фриджерио Дж. М., Дагорн Дж. К., Йованна Дж. Л. (июль 1995 г.). «Клонирование, секвенирование и экспрессия мРНК рибосомальных белков человека L5, L21, L27a, L28, S5, S9, S10 и S29». Биохим Биофиз Акта . 1262 (1): 64–8. дои : 10.1016/0167-4781(95)00045-i . ПМИД 7772601 .

[pmid9582194-6] Кенмочи Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Э., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж DC (август 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геном Рез . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок S5 RPS5» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]