60S рибосомальный белок L29

РПЛ29
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4UG0, 4V6X, 5AJ0, 4UJD, 4D67, 4D5Y, 4UJE, 4UJC
Идентификаторы
Псевдонимы	RPL29 , HIP, HUML29, RPL29P10, RPL29_3_370, рибосомальный белок L29
Внешние идентификаторы	Опустить : 601832 ; МГИ : 99687 ; Гомологен : 133570 ; Генные карты : RPL29 ; ОМА : RPL29 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 3 (human)
End	51,995,895 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 9 (mouse)
End	106,308,767 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	stromal cell of endometrium; ; skin of leg; ; left ovary; ; skin of abdomen; ; right ovary; ; ganglionic eminence; ; right uterine tube; ; right adrenal cortex; ; muscle of thigh; ; subcutaneous adipose tissue;
	Top expressed in
	urinary bladder; ; ventricular zone; ; lip; ; tail of embryo; ; genital tubercle; ; ganglionic eminence; ; thymus; ; lens; ; adrenal gland; ; epiblast;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	heparin binding; RNA binding; structural constituent of ribosome; cadherin binding;
Cellular component	intracellular anatomical structure; cytosol; membrane; cytosolic large ribosomal subunit; ribosome;
Biological process	translational initiation; SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; cytoplasmic translation; embryo implantation; protein biosynthesis; viral transcription; rRNA processing;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6159
	19944
	ENSG00000162244
	ENSMUSG00000048758
	P47914
	P47915
	НМ_000992
	НМ_009082 ; НМ_001324533 ; НМ_001324534
	НП_000983
	НП_001311462 ; НП_001311463 ; НП_033108
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

60S рибосомальный белок L29 — это белок , который у человека кодируется RPL29 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Рибосомы , органеллы , катализирующие синтез белка , состоят из небольшой субъединицы 40S и большой субъединицы 60S . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует цитоплазматический рибосомальный белок , который является компонентом субъединицы 60S. Белок принадлежит к семейству рибосомальных белков L29E. Этот белок также является белком периферической мембраны, экспрессируемым на поверхности клетки и напрямую связывающим гепарин . Хотя ранее сообщалось, что этот ген картируется в 3q29-qter, считается, что он расположен в районе 3p21.3-p21.2. Как это типично для генов, кодирующих рибосомальные белки, по геному рассеяно множество процессированных псевдогенов этого гена. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что RPL29 взаимодействует с BLMH . ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000162244 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000048758 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Лоу П.Т., Цуй С.К., Лам Вайоминг, Лук С.К., Хван Д.М., Лью К.С., Ли С.К., Фунг К.П., Уэй М.М. (апрель 1996 г.). «Новая кДНК, кодирующая человеческий гомолог рибосомального белка L29». Биохим Биофиз Акта . 1305 (3): 105–8. дои : 10.1016/0167-4781(95)00224-3 . ПМИД 8597591 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок L29 RPL29» .
^ Колдамова Р.П., Лефтеров И.М., ДиСабелла М.Т., Альмонте С., Уоткинс С.С., Лазо Дж.С. (июнь 1999 г.). «Человеческая блеомицингидролаза связывает рибосомальные белки». Биохимия . 38 (22): 7111–7. дои : 10.1021/bi990135l . ПМИД 10353821 .

Дальнейшее чтение

Вул И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомальных белков млекопитающих». Биохим. Клеточная Биол . 73 (11–12): 933–47. дои : 10.1139/o95-101 . ПМИД 8722009 .
Ника Х, Халтин Т (1984). «Расположение сульфгидрильных групп, участвующих в дисульфидном взаимодействии между соседними белками L6 и L29 в рибосомах млекопитающих. S-расщепление цианилированных белков в полиакриламидных гелях после разделения электрофорезом в додецилсульфатном геле» . Евро. Дж. Биохим . 142 (3): 521–6. дои : 10.1111/j.1432-1033.1984.tb08316.x . ПМИД 6468376 .
Лю С., Смит С.Э., Джулиан Дж., Роде Л.Х., Карин Н.Дж., Карсон Д.Д. (1996). «Клонирование кДНК и экспрессия HIP, нового гепарансульфата/гепаринсвязывающего белка клеточной поверхности эпителиальных клеток и клеточных линий матки человека» . Ж. Биол. Хим . 271 (20): 11817–23. дои : 10.1074/jbc.271.20.11817 . ПМИД 8662616 .
Роде Л.Х., Джулиан Дж., Бабакния А., Карсон Д.Д. (1996). «Экспрессия на клеточной поверхности HIP, нового белка, связывающего гепарин/гепарансульфат, в эпителиальных клетках и клеточных линиях матки человека» . Ж. Биол. Хим . 271 (20): 11824–30. дои : 10.1074/jbc.271.20.11824 . ПМИД 8662617 .
Джейкобс А.Л., Джулиан Дж., Шахин А.А., Карсон Д.Д. (1997). «Экспрессия и функции белка, взаимодействующего с гепарином/гепарансульфатом, в клетках рака молочной железы человека и нормальном эпителии молочной железы». Рак Рез . 57 (22): 5148–54. ПМИД 9371517 .
Гарсиа-Барсело М., Лоу П.Т., Цуй С.К., Фунг К.П., Ли С.И., Уэй М.М. (1998). «Картирование гена белка большой субъединицы рибосомы человека RPL29 с хромосомой человека 3q29-qter». Геномика . 46 (1): 148–51. дои : 10.1006/geno.1997.4990 . ПМИД 9403071 .
Колдамова Р.П., Лефтеров И.М., ДиСабелла М.Т., Альмонте С., Уоткинс С.К., Лазо Дж.С. (1999). «Человеческая блеомицингидролаза связывает рибосомальные белки». Биохимия . 38 (22): 7111–7. дои : 10.1021/bi990135l . ПМИД 10353821 .
Кудо Х, Сенджу С, Мицуя Х, Нисимура Ю (2000). «Мышиный и человеческий GTPBP2, недавно идентифицированные члены семейства ГТФазы GP-1». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 272 (2): 456–65. дои : 10.1006/bbrc.2000.2763 . ПМИД 10833435 .
Уэчи Т., Танака Т., Кенмоти Н. (2001). «Полная карта генов рибосомальных белков человека: отнесение 80 генов к цитогенетической карте и последствия для заболеваний человека». Геномика . 72 (3): 223–30. дои : 10.1006/geno.2000.6470 . ПМИД 11401437 .
Кирн-Сафран CB, Джулиан Дж., Фонгеми Дж.Э., Хок Д.Е., Чиммек К.Дж., Карсон Д.Д. (2002). «Изменения в цитологическом распределении взаимодействующего с гепарином/гепарансульфатом белка/рибосомального белка L29 (HIP/RPL29) во время экспрессии и дифференцировки эпителиальных клеток молочной железы мышей in vivo и in vitro» . Дев. Дин . 223 (1): 70–84. дои : 10.1002/dvdy.1226 . ПМИД 11803571 . S2CID 13577595 .
Хок Д.Е., Карсон Д.Д., Хёк М. (2006). «Синтетический пептид, связывающий гепарин, из человеческого HIP/RPL29, не способен специфически различать антикоагулянтно активные и неактивные виды гепарина» . Журнал отрицательных результатов в биомедицине . 2 :1. дои : 10.1186/1477-5751-2-1 . ПМК 152653 . ПМИД 12659638 .
Одинцова Т.И., Мюллер ЕС, Иванов А.В., Егоров Т.А., Бинерт Р., Владимиров С.Н., Костка С., Отто А., Виттманн-Либольд Б., Карпова Г.Г. (2004). «Характеристика и анализ посттрансляционных модификаций белков больших цитоплазматических субъединиц рибосом человека с помощью масс-спектрометрии и секвенирования Эдмана». J. Протеиновая химия . 22 (3): 249–58. дои : 10.1023/А:1025068419698 . ПМИД 12962325 . S2CID 10710245 .
Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К., Онг С.Е., Лион К.Э., Ламонд А.И., Манн М. (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД 15635413 . S2CID 4344740 .
Наканиси К., Комацу Ю., Когава Н., Мацусита Х. (2005). «Анализ элюированных пептидов из молекул HLA класса II, чувствительных к диабету 1 типа, выявил новый островковый белок, белок, взаимодействующий с гепарином/гепарансульфатом». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 329 (1): 356–61. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.01.144 . ПМИД 15721314 .
Стелцль Ю, Ворм Ю, Лаловски М, Хениг К, Брембек Ф.Х., Гёлер Х, Стродике М, Ценкнер М, Шенхерр А, Кеппен С, Тимм Дж, Минцлафф С, Абрахам С, Бок Н, Китцманн С, Гёдде А, Токсёз Е , Дроге А., Кробич С., Корн Б., Бирчмайер В., Лерах Х., Ванкер Э.Э. (2005). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . ПМИД 16169070 . S2CID 8235923 .
Лю Джей-Джей, Хуан Б.Х., Чжан Дж., Карсон Д.Д., Хоой СК (2006). «Репрессия экспрессии HIP/RPL29 вызывает дифференцировку клеток рака толстой кишки». Дж. Селл. Физиол . 207 (2): 287–92. дои : 10.1002/jcp.20589 . ПМИД 16475173 . S2CID 6610010 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P47914 (60S рибосомальный белок L29) в PDBe-KB .

статья о гене на хромосоме 3 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000162244 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000048758 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8597591-5] Лоу П.Т., Цуй С.К., Лам Вайоминг, Лук С.К., Хван Д.М., Лью К.С., Ли С.К., Фунг К.П., Уэй М.М. (апрель 1996 г.). «Новая кДНК, кодирующая человеческий гомолог рибосомального белка L29». Биохим Биофиз Акта . 1305 (3): 105–8. дои : 10.1016/0167-4781(95)00224-3 . ПМИД 8597591 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок L29 RPL29» .

[pmid10353821-7] Колдамова Р.П., Лефтеров И.М., ДиСабелла М.Т., Альмонте С., Уоткинс С.С., Лазо Дж.С. (июнь 1999 г.). «Человеческая блеомицингидролаза связывает рибосомальные белки». Биохимия . 38 (22): 7111–7. дои : 10.1021/bi990135l . ПМИД 10353821 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]