40S рибосомальный белок S2

РПС2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 5FLX, 4D61, 4D5L, 4UJD, 4UJE, 4UJC
Идентификаторы
Псевдонимы	RPS2 , LLREP3, S2, рибосомальный белок S2
Внешние идентификаторы	Опустить : 603624 ; МГИ : 105110 ; Гомологен : 37714 ; Генные карты : RPS2 ; ОМА : RPS2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 16 (human)
End	1,964,841 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	24,940,903 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	stromal cell of endometrium; ; right uterine tube; ; right ovary; ; body of pancreas; ; left ovary; ; ventricular zone; ; mucosa of transverse colon; ; ganglionic eminence; ; granulocyte; ; zone of skin;
	Top expressed in
	ventricular zone; ; lip; ; esophagus; ; ovary; ; zone of skin; ; lens; ; ganglionic eminence; ; ileum; ; quadriceps femoris muscle; ; uterus;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	structural constituent of ribosome; protein binding; enzyme binding; fibroblast growth factor binding; mRNA binding; RNA binding; cadherin binding;
Cellular component	cytosol; ribosome; membrane; focal adhesion; cytosolic small ribosomal subunit; nucleolus; small ribosomal subunit; extracellular exosome; nucleus; nucleoplasm; synapse;
Biological process	viral transcription; SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; translational initiation; positive regulation of transferase activity; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; protein biosynthesis; rRNA processing; protein methylation; positive regulation of ubiquitin-protein transferase activity; cellular response to interleukin-4;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6187
	16898
	ENSG00000140988
	ENSMUSG00000044533
	P15880
	P25444
	НМ_002952
	НМ_008503
	НП_002943
	НП_032529
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген RPS2 — это ген , который у человека кодирует 40S рибосомальный белок S2 . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Рибосомы , органеллы , катализирующие синтез белка , состоят из небольшой субъединицы 40S и большой субъединицы 60S . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомальный белок , который является компонентом субъединицы 40S. Белок принадлежит к семейству рибосомальных белков S5P. Он расположен в цитоплазме . Этот ген имеет сходство последовательности с мышиным LLRep3. Он транскрибируется совместно с геном малой ядрышковой РНК U64, который расположен в его третьем интроне. Как это типично для генов, кодирующих рибосомальные белки, по геному рассеяно множество процессированных псевдогенов этого гена. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что RPS2 взаимодействует с PRMT3 . ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000140988 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000044533 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Кенмочи Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Э., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж DC (август 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геном Рез . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок S2 RPS2» .
^ Чой, Сиёнг; Юнг Чо-Рок; Ким Джин Ён; Им Дон Су (сентябрь 2008 г.). «PRMT3 ингибирует убиквитинирование рибосомального белка S2 и вместе образует активный ферментный комплекс». Биохим. Биофиз. Акта . 1780 (9): 1062–9. дои : 10.1016/j.bbagen.2008.05.010 . ISSN 0006-3002 . ПМИД 18573314 .

Дальнейшее чтение

Вул И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомальных белков млекопитающих». Биохим. Клеточная Биол . 73 (11–12): 933–47. дои : 10.1139/o95-101 . ПМИД 8722009 .
Слинн Дж., Дженнер Д., Поттс В. и др. (1990). «Последовательность кДНК человека, гомологичная семейству генов LLRep3 мыши» . Нуклеиновые кислоты Рез . 18 (3): 681. doi : 10.1093/nar/18.3.681 . ПМК 333503 . ПМИД 2308862 .
Владимиров С.Н., Иванов А.В., Карпова Г.Г. и др. (1996). «Характеристика белков малых рибосомальных субъединиц человека с помощью N-концевого и внутреннего секвенирования, а также масс-спектрометрии» . Евро. Дж. Биохим . 239 (1): 144–9. дои : 10.1111/j.1432-1033.1996.0144u.x . ПМИД 8706699 .
Бортолуцци С., д'Алесси Ф., Ромуальди С., Даниэли Г.А. (2002). «Дифференциальная экспрессия генов, кодирующих рибосомальные белки, в разных тканях человека» . Биоинформатика . 17 (12): 1152–7. дои : 10.1093/биоинформатика/17.12.1152 . ПМИД 11751223 .
Ковальчик П., Вощиньский М., Островский Ю. (2003). «Повышенная экспрессия рибосомального белка S2 в опухолях печени, постгепаттомированной печени и пролиферирующих гепатоцитах in vitro» . Акта Биохим. Пол . 49 (3): 615–24. дои : 10.18388/abp.2002_3770 . ПМИД 12422231 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Кога М., Ситидзё С., Ямада А. и др. (2004). «Идентификация рибосомальных белков S2 и L10a как опухолевых антигенов, распознаваемых HLA-A26-рестриктированными CTL». Тканевые антигены . 61 (2): 136–45. дои : 10.1046/j.0001-2815.2002.00009.x . ПМИД 12694581 .
Джин Дж., Смит Ф.Д., Старк С. и др. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3-связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации» . Курс. Биол . 14 (16): 1436–50. Бибкод : 2004CBio...14.1436J . дои : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . ПМИД 15324660 . S2CID 2371325 .
Сверч Р., Доктор медицинских наук, Бедфорд М.Т. (2005). «Рибосомальный белок S2 является субстратом для PRMT3 млекопитающих (белок аргининметилтрансфераза 3)» . Биохим. Дж . 386 (Часть 1): 85–91. дои : 10.1042/BJ20041466 . ПМЦ 1134769 . ПМИД 15473865 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К. и др. (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД 15635413 . S2CID 4344740 .
Ю Ю, Джи Х, Дудна Дж. А., Лири Дж. А. (2005). «Масс-спектрометрический анализ 40S рибосомальной субъединицы человека: нативные и IRES-связанные комплексы ВГС» . Белковая наука . 14 (6): 1438–46. дои : 10.1110/ps.041293005 . ПМЦ 2253395 . ПМИД 15883184 .
Антуан М., Реймерс К., Вирц В. и др. (2005). «Идентификация нетрадиционного сигнала ядерной локализации в рибосомальном белке S2 человека». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 335 (1): 146–53. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.07.069 . ПМИД 16061210 .
Антуан М., Реймерс К., Вирц В. и др. (2006). «Фактор роста фибробластов 3, белок с двойной субклеточной судьбой, взаимодействует с рибосомальным белком S2 человека». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 338 (2): 1248–55. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.10.079 . ПМИД 16263090 .
Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Нат. Биотехнология . 24 (10): 1285–92. дои : 10.1038/nbt1240 . ПМИД 16964243 . S2CID 14294292 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P15880 (40S рибосомальный белок S2) в PDBe-KB .

Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000140988 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000044533 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9582194-5] Кенмочи Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Э., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж DC (август 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геном Рез . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок S2 RPS2» .

[pmid18573314-7] Чой, Сиёнг; Юнг Чо-Рок; Ким Джин Ён; Им Дон Су (сентябрь 2008 г.). «PRMT3 ингибирует убиквитинирование рибосомального белка S2 и вместе образует активный ферментный комплекс». Биохим. Биофиз. Акта . 1780 (9): 1062–9. дои : 10.1016/j.bbagen.2008.05.010 . ISSN 0006-3002 . ПМИД 18573314 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]