ЭИФ6

ЭИФ6
Идентификаторы
Псевдонимы	EIF6 , CAB, EIF3A, ITGB4BP, b(2)gcn, eIF-6, p27(BBP), p27BBP, эукариотический фактор инициации трансляции 6
Внешние идентификаторы	Опустить : 602912 ; МГИ : 1196288 ; Гомологен : 7135 ; Генные карты : EIF6 ; OMA : EIF6 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 20 (human)
End	35,284,985 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	155,668,845 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	mucosa of esophagus; ; mucosa of transverse colon; ; skin of leg; ; skin of abdomen; ; duodenum; ; rectum; ; vagina; ; human kidney; ; smooth muscle tissue; ; right lobe of liver;
	Top expressed in
	epiblast; ; primitive streak; ; morula; ; morula; ; endothelial cell of lymphatic vessel; ; esophagus; ; duodenum; ; jejunum; ; lip; ; primary oocyte;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	ribosome binding; protein binding; translation initiation factor activity; ribosomal large subunit binding;
Cellular component	cytoplasm; extracellular exosome; nucleus; nucleoplasm; nucleolus; cytosol; preribosome, large subunit precursor; lamin filament; intermediate filament;
Biological process	translational initiation; mature ribosome assembly; protein biosynthesis; ribosome biogenesis; response to insulin; maturation of LSU-rRNA; gene silencing by miRNA; regulation of glycolytic process; assembly of large subunit precursor of preribosome; maturation of 5.8S rRNA; regulation of fatty acid biosynthetic process; regulation of reactive oxygen species metabolic process; positive regulation of translation; regulation of megakaryocyte differentiation; miRNA-mediated gene silencing by inhibition of translation; ribosomal subunit export from nucleus; ribosomal large subunit biogenesis;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	3692
	16418
	ENSG00000242372
	ENSMUSG00000027613
	P56537
	О55135
показывать НМ_001267810 ; НМ_002212 ; НМ_181466 ; НМ_181467 ; НМ_181468 ;
	NM_181469
	НМ_010579
	НП_001254739 ; НП_002203 ; НП_852131 ; НП_852133
	НП_034709
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Эукариотический фактор инициации трансляции 6 ( EIF6 ), также известный как белок, связывающий интегрин бета 4 ( ITGB4BP ), представляет собой человеческий ген . ^{[ 5 ]}

Гемидесмосомы представляют собой структуры, которые связывают базальную пластинку промежуточных филаментов с цитоскелетом . Важным функциональным компонентом гемидесмосом является субъединица интегрина бета-4 ( ITGB4 ), белок, содержащий два домена фибронектина типа III. Белок, кодируемый этим геном, связывается с доменами фибронектина типа III ITGB4 и может помочь связать ITGB4 с цитоскелетом промежуточных филаментов. Кодируемый белок, который нерастворим и находится как в ядре , так и в цитоплазме , может функционировать как фактор инициации трансляции и катализировать ассоциацию 40S и 60S рибосомальных субъединиц вместе с eIF5, связанным с GTP. множество вариантов транскрипта, кодирующих несколько различных изоформ . Для этого гена было обнаружено ^{[ 5 ]}

EIF6 играет важную роль в формировании 80S-рибосом эукариот, росте клеток и экспрессии генов. Рибосома 80S, которая может разделяться на субъединицы 40S и 60S. EIF6 помогает защитить зрелую субъединицу 60s, а затем EIF6 должен диссоциировать с субъединицей 60s, чтобы он мог связаться с субъединицей 40s с образованием рибосомы. Поддержание баланса EIF6 важно для организма: небольшое количество EIF6 помогает синтезу нормальных рибосом, в то время как большое количество ингибированных EIF6 60-субъединиц связывается с 40-субъединицами. ^{[ 6 ]}

Функция

EIF6 существует как в ядрышке, так и в цитоплазме. В ядрышке эукариот прерибосомальный комплекс 90S разделяется на прерибосомальный комплекс 60S и прерибосомальный комплекс 40S, которые участвуют в синтезе зрелой рибосомы. EIF6 незаменим в биогенезе субъединицы 60S, а делеция EIF6 имеет летальный эффект. Частичная делеция eIF6 приводит к уменьшению количества свободной рибосомальной субъединицы 60S, что означает, что это нарушает баланс субъединиц 40S/60S и ограничивает скорость синтеза белка. Прерибосомальный комплекс 60S, связанный с eIF6, перемещается из ядрышка в цитоплазму, а затем eIF6 диссоциируется с пре-60S, так что субъединица 60S может связываться с субъединицей 40S и продолжает дальнейшее развитие. EIF6 может действовать как фактор инициации трансляции, ограничивающий скорость, и уровни его экспрессии влияют на скорость трансляции. Небольшое количество eIF6 ускоряет трансляцию белка, тогда как большое количество eIF6 блокирует процесс трансляции, ингибируя выработку рибосомы. ^{[ 7 ]} Активность eIF6 также вызывает гликолиз и синтез жирных кислот за счет контроля трансляции мРНК. ^{[ 8 ]}

Структура

eIF6 состоит из 245 аминокислот .

Выражение

EIF6 имеет разный уровень экспрессии в разных тканях и клетках. EIF6 имеет высокий уровень экспрессии в стволовых клетках и циклических клетках, но не в постмитотических клетках; высокий уровень в мозге и эпителии и низкий уровень в мышцах. ^{[ 9 ]}

Взаимодействия

Было показано, что EIF6 взаимодействует с FHL2 . ^{[ 10 ]} ITGB4 ^{[ 11 ]} и GNB2L1 . ^{[ 12 ]}

EIF6 играет важную роль в формировании 80S рибосом, росте клеток и экспрессии генов. ^{[ 13 ]}

Эволюция

eIF6 присутствует как у дрожжей, так и у человека, и его аминокислотная последовательность у них идентична на 77%. ^{[ 7 ]} Никакие дупликации eIF6 или даже консервативные мотивы внутри белка не известны. ^{[ 7 ]}

История

Активность eIF6 была впервые описана в начале 1980-х годов в Линды Л. Спремулли и Умадаса Майтры . лабораториях ^{[ 7 ]} В конечном итоге ген был клонирован группами Майтры и Джина Карло Маркизио , опубликовавшими свои работы в 1997 году. ^{[ 7 ]}

См. также

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000242372 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027613 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: белок, связывающий интегрин бета 4 ITGB4BP» .
^ Брина Д., Гроссо С., Милуцио А., Биффо С. (октябрь 2011 г.). «Контроль трансляции посредством образования 80S и доступности 60S: центральная роль eIF6, фактора, ограничивающего скорость прогрессирования клеточного цикла и онкогенеза» . Клеточный цикл . 10 (20): 3441–6. дои : 10.4161/cc.10.20.17796 . ПМИД 22031223 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и Брина Д., Милуцио А., Риккарди С., Биффо С. (июль 2015 г.). «Антиассоциационная активность eIF6 необходима для биогенеза рибосом, контроля трансляции и прогрессирования опухоли». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Механизмы регуляции генов . 1849 (7): 830–5. дои : 10.1016/j.bbagrm.2014.09.010 . ПМИД 25252159 .
^ Биффо С., Манфрини Н., Риккарди С. (февраль 2018 г.). «Перекрестные помехи между трансляцией и метаболизмом при раке». Текущее мнение в области генетики и развития . 48 : 75–81. дои : 10.1016/j.gde.2017.10.011 . ПМИД 29153483 .
^ Милуцио А., Бенье А., Вольта В., Биффо С. (май 2009 г.). «Эукариотический фактор инициации 6 опосредует континуум между биогенезом и трансляцией 60S рибосомы» . Отчеты ЭМБО . 10 (5): 459–65. дои : 10.1038/embor.2009.70 . ПМЦ 2680881 . ПМИД 19373251 .
^ Викслер В., Гертс Д., Лаплантин Е., Вестхофф Д., Смит Н., Омейли М., Зонненберг А., Паулссон М. (октябрь 2000 г.). «Белок DRAL/FHL2, содержащий только LIM, связывается с цитоплазматическим доменом нескольких цепей альфа- и бета-интегрина и рекрутируется в адгезионные комплексы» . Журнал биологической химии . 275 (43): 33669–78. дои : 10.1074/jbc.M002519200 . ПМИД 10906324 .
^ Биффо С., Санвито Ф., Коста С., Преве Л., Пиньятелли Р., Спинарди Л., Маркизио ПК (ноябрь 1997 г.). «Выделение нового бета4-интегрин-связывающего белка (p27(BBP)) с высокой экспрессией в эпителиальных клетках» . Журнал биологической химии . 272 (48): 30314–21. дои : 10.1074/jbc.272.48.30314 . ПМИД 9374518 .
^ Сеси М., Гавираги С., Горрини С., Сала Л.А., Оффенхойзер Н., Маркизио ПК, Биффо С. (декабрь 2003 г.). «Высвобождение eIF6 (p27BBP) из субъединицы 60S обеспечивает сборку рибосомы 80S». Природа . 426 (6966): 579–84. Бибкод : 2003Natur.426..579C . дои : 10.1038/nature02160 . ПМИД 14654845 . S2CID 2431706 .
^ Брина Д., Гроссо С., Милуцио А., Биффо С. (октябрь 2011 г.). «Контроль трансляции посредством образования 80S и доступности 60S: центральная роль eIF6, фактора, ограничивающего скорость прогрессирования клеточного цикла и онкогенеза» . Клеточный цикл . 10 (20): 3441–6. дои : 10.4161/cc.10.20.17796 . ПМИД 22031223 .

Дальнейшее чтение

Биффо С., Санвито Ф., Коста С., Преве Л., Пиньятелли Р., Спинарди Л., Маркизио ПК (ноябрь 1997 г.). «Выделение нового бета4-интегрин-связывающего белка (p27(BBP)) с высокой экспрессией в эпителиальных клетках» . Журнал биологической химии . 272 (48): 30314–21. дои : 10.1074/jbc.272.48.30314 . ПМИД 9374518 .
Си К., Чаудхури Дж., Чевесич Дж., Майтра У. (декабрь 1997 г.). «Молекулярное клонирование и функциональная экспрессия кДНК человека, кодирующей фактор инициации трансляции 6» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (26): 14285–90. Бибкод : 1997PNAS...9414285S . дои : 10.1073/pnas.94.26.14285 . ПМК 24943 . ПМИД 9405604 .
Мао М, Фу Г, Ву Дж.С., Чжан QH, Чжоу Дж, Кан LX, Хуан QH, Хэ К.Л., Гу БВ, Хань ЗГ, Шэнь Ю, Гу Цзюнь, Юй Ю.П., Сюй Ш, Ван YX, Чен С.Дж., Чэнь Z. (июль 1998 г.). «Идентификация генов, экспрессируемых в гемопоэтических стволовых клетках/клетках-предшественниках CD34(+) человека, с помощью меток экспрессируемых последовательностей и эффективного клонирования кДНК полной длины» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (14): 8175–80. Бибкод : 1998PNAS...95.8175M . дои : 10.1073/pnas.95.14.8175 . ЧВК 20949 . ПМИД 9653160 .
Санвито Ф., Арриго Г., Зуффарди О., Аньелли М., Маркизио П.С., Биффо С. (август 1998 г.). «Локализация гена белка, связывающего бета4 p27 (ITGB4BP), в области хромосомы человека 20q11.2». Геномика . 52 (1): 111–2. дои : 10.1006/geno.1998.5403 . ПМИД 9740680 .
Санвито Ф, Пьятти С, Вилла А, Босси М, Луккини Дж, Маркизио ПК, Биффо С (март 1999 г.). «Интерактор бета4-интегрина p27 (BBP/eIF6) является важным белком ядерного матрикса, участвующим в сборке субъединицы рибосомы 60S» . Журнал клеточной биологии . 144 (5): 823–37. дои : 10.1083/jcb.144.5.823 . ПМК 2148184 . ПМИД 10085284 .
Викслер В., Гертс Д., Лаплантин Е., Вестхофф Д., Смит Н., Омейли М., Зонненберг А., Паулссон М. (октябрь 2000 г.). «Белок DRAL/FHL2, содержащий только LIM, связывается с цитоплазматическим доменом нескольких цепей альфа- и бета-интегрина и рекрутируется в адгезионные комплексы» . Журнал биологической химии . 275 (43): 33669–78. дои : 10.1074/jbc.M002519200 . ПМИД 10906324 .
Чжан QH, Е М, Ву XY, Рен SX, Чжао М, Чжао CJ, Фу Г, Шен Ю, Фань ХИ, Лу Г, Чжун М, Сюй XR, Хань ZG, Чжан ЮВ, Тао Дж, Хуан QH, Чжоу Дж , Ху GX, Гу J, Чен SJ, Чен Z (октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее неопределенных генов, экспрессируемых в CD34+ гемопоэтических стволовых клетках/клетках-предшественниках» . Геномные исследования . 10 (10): 1546–60. дои : 10.1101/гр.140200 . ПМК 310934 . ПМИД 11042152 .
Донадини А., Джодини А., Санвито Ф., Маркизио ПК, Биффо С. (март 2001 г.). «Человеческий ген ITGB4BP конститутивно экспрессируется in vitro, но сильно модулируется in vivo». Джин . 266 (1–2): 35–43. дои : 10.1016/S0378-1119(01)00370-5 . ПМИД 11290417 .
Андерсен Дж.С., Лион CE, Фокс А.Х., Люнг А.К., Лам Ю.В., Стин Х., Манн М., Ламонд А.И. (январь 2002 г.). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Современная биология . 12 (1): 1–11. Бибкод : 2002CBio...12....1A . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . ПМИД 11790298 . S2CID 14132033 .
Басу У, Си К, Дэн Х, Майтра У (сентябрь 2003 г.). «Фосфорилирование фактора 6 инициации трансляции эукариот млекопитающих и его гомолога Tif6p Saccharomyces cerevisiae: свидетельство того, что фосфорилирование Tif6p регулирует его нуклеоцитоплазматическое распределение и необходимо для роста дрожжевых клеток» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (17): 6187–99. дои : 10.1128/MCB.23.17.6187-6199.2003 . ПМК 180954 . ПМИД 12917340 .
Сеси М., Гавираги С., Горрини С., Сала Л.А., Оффенхойзер Н., Маркизио ПК, Биффо С. (декабрь 2003 г.). «Высвобождение eIF6 (p27BBP) из субъединицы 60S обеспечивает сборку рибосомы 80S». Природа . 426 (6966): 579–84. Бибкод : 2003Natur.426..579C . дои : 10.1038/nature02160 . ПМИД 14654845 . S2CID 2431706 .
Россо П., Кортезина Г., Санвито Ф., Донадини А., Ди Бенедетто Б., Биффо С., Маркизио ПК (май 2004 г.). «Сверхэкспрессия p27BBP при карциномах головы и шеи и их метастазах в лимфатические узлы». Голова и шея . 26 (5): 408–17. CiteSeerX 10.1.1.503.9652 . дои : 10.1002/hed.10401 . ПМИД 15122657 . S2CID 39531947 .
Ленер Б., Сандерсон К.М. (июль 2004 г.). «Схема взаимодействия белков для деградации мРНК человека» . Геномные исследования . 14 (7): 1315–23. дои : 10.1101/гр.2122004 . ПМК 442147 . ПМИД 15231747 .
Раш Дж., Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Дж., Чжан Х., Чжа К.М., Полакевич Р.Д., Комб М.Дж. (январь 2005 г.). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Природная биотехнология . 23 (1): 94–101. дои : 10.1038/nbt1046 . ПМИД 15592455 . S2CID 7200157 .
Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К., Онг С.Е., Лион К.Э., Ламонд А.И., Манн М. (январь 2005 г.). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД 15635413 . S2CID 4344740 .
Стелцль Ю, Ворм Ю, Лаловски М, Хениг К, Брембек Ф.Х., Гёлер Х, Стродике М, Ценкнер М, Шенхерр А, Кеппен С, Тимм Дж, Минцлафф С, Абрахам С, Бок Н, Китцманн С, Гёдде А, Токсёз Е , Дроге А., Кробич С., Корн Б., Бирчмайер В., Лерах Х., Ванкер Э.Э. (сентябрь 2005 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . ПМИД 16169070 . S2CID 8235923 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 20 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000242372 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027613 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: белок, связывающий интегрин бета 4 ITGB4BP» .

[6] Брина Д., Гроссо С., Милуцио А., Биффо С. (октябрь 2011 г.). «Контроль трансляции посредством образования 80S и доступности 60S: центральная роль eIF6, фактора, ограничивающего скорость прогрессирования клеточного цикла и онкогенеза» . Клеточный цикл . 10 (20): 3441–6. дои : 10.4161/cc.10.20.17796 . ПМИД 22031223 .

[Brina2015-7] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и Брина Д., Милуцио А., Риккарди С., Биффо С. (июль 2015 г.). «Антиассоциационная активность eIF6 необходима для биогенеза рибосом, контроля трансляции и прогрессирования опухоли». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Механизмы регуляции генов . 1849 (7): 830–5. дои : 10.1016/j.bbagrm.2014.09.010 . ПМИД 25252159 .

[8] Биффо С., Манфрини Н., Риккарди С. (февраль 2018 г.). «Перекрестные помехи между трансляцией и метаболизмом при раке». Текущее мнение в области генетики и развития . 48 : 75–81. дои : 10.1016/j.gde.2017.10.011 . ПМИД 29153483 .

[9] Милуцио А., Бенье А., Вольта В., Биффо С. (май 2009 г.). «Эукариотический фактор инициации 6 опосредует континуум между биогенезом и трансляцией 60S рибосомы» . Отчеты ЭМБО . 10 (5): 459–65. дои : 10.1038/embor.2009.70 . ПМЦ 2680881 . ПМИД 19373251 .

[pmid10906324-10] Викслер В., Гертс Д., Лаплантин Е., Вестхофф Д., Смит Н., Омейли М., Зонненберг А., Паулссон М. (октябрь 2000 г.). «Белок DRAL/FHL2, содержащий только LIM, связывается с цитоплазматическим доменом нескольких цепей альфа- и бета-интегрина и рекрутируется в адгезионные комплексы» . Журнал биологической химии . 275 (43): 33669–78. дои : 10.1074/jbc.M002519200 . ПМИД 10906324 .

[pmid9374518-11] Биффо С., Санвито Ф., Коста С., Преве Л., Пиньятелли Р., Спинарди Л., Маркизио ПК (ноябрь 1997 г.). «Выделение нового бета4-интегрин-связывающего белка (p27(BBP)) с высокой экспрессией в эпителиальных клетках» . Журнал биологической химии . 272 (48): 30314–21. дои : 10.1074/jbc.272.48.30314 . ПМИД 9374518 .

[pmid14654845-12] Сеси М., Гавираги С., Горрини С., Сала Л.А., Оффенхойзер Н., Маркизио ПК, Биффо С. (декабрь 2003 г.). «Высвобождение eIF6 (p27BBP) из субъединицы 60S обеспечивает сборку рибосомы 80S». Природа . 426 (6966): 579–84. Бибкод : 2003Natur.426..579C . дои : 10.1038/nature02160 . ПМИД 14654845 . S2CID 2431706 .

[13] Брина Д., Гроссо С., Милуцио А., Биффо С. (октябрь 2011 г.). «Контроль трансляции посредством образования 80S и доступности 60S: центральная роль eIF6, фактора, ограничивающего скорость прогрессирования клеточного цикла и онкогенеза» . Клеточный цикл . 10 (20): 3441–6. дои : 10.4161/cc.10.20.17796 . ПМИД 22031223 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]