60S рибосомальный белок L5

РПЛ5
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	4UG0, 4V6X, 5AJ0, 4UJD, 4D67, 4D5Y, 4UJE, 4UJC
Идентификаторы
Псевдонимы	RPL5 , DBA6, L5, PPP1R135, MSTP030, рибосомальный белок L5, uL18
Внешние идентификаторы	Опустить : 603634 ; МГИ : 102854 ; Гомологен : 110649 ; Генные карты : RPL5 ; ОМА : RPL5 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	92,841,924 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	108,056,871 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	germinal epithelium; ; gonad; ; parietal pleura; ; epithelium of nasopharynx; ; left ovary; ; tibia; ; right ovary; ; palpebral conjunctiva; ; ventricular zone; ; body of uterus;
	Top expressed in
	epiblast; ; uterus; ; ovary; ; ventricular zone; ; embryo; ; ganglionic eminence; ; embryo; ; lens; ; spermatocyte; ; ileum;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	rRNA binding; protein binding; RNA binding; structural constituent of ribosome; mRNA 3'-UTR binding; 5S rRNA binding; ubiquitin protein ligase binding; mRNA 5'-UTR binding; ubiquitin ligase inhibitor activity;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; ribosome; membrane; focal adhesion; intracellular anatomical structure; nucleolus; cytosolic large ribosomal subunit; extracellular exosome; nucleus; nucleoplasm; endoplasmic reticulum; protein-containing complex; synapse; ribonucleoprotein complex;
Biological process	viral transcription; SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; ribosomal large subunit biogenesis; translational initiation; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; rRNA processing; ribosomal large subunit assembly; protein biosynthesis; positive regulation of gene expression; positive regulation of translation; protein stabilization; negative regulation of ubiquitin protein ligase activity; negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process; negative regulation of protein neddylation; regulation of signal transduction by p53 class mediator;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	6125
	100503670
	ENSG00000122406
	ENSMUSG00000058558
	P46777 ; Q5T7N0
	P47962
	НМ_000969
	НМ_016980
	НП_000960
	НП_058676
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

60S рибосомальный белок L5 — это белок , который у человека кодируется RPL5 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Рибосомы , органеллы , катализирующие синтез белка , состоят из небольшой субъединицы 40S и большой субъединицы 60S . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомальный белок , который является компонентом субъединицы 60S. Белок принадлежит к семейству рибосомальных белков L18P. Он расположен в цитоплазме . Белок связывает 5S рРНК с образованием стабильного комплекса, называемого 5S рибонуклеопротеиновой частицей (РНП), который необходим для транспорта нерибосомной цитоплазматической 5S рРНК в ядрышко для сборки в рибосомы. Белок специфически взаимодействует с бета-субъединицей казеинкиназы 2 .

Клиническое значение

вариабельная экспрессия этого гена при колоректальном раке Наблюдалась по сравнению с прилегающими нормальными тканями, хотя корреляции между уровнем экспрессии и тяжестью заболевания не обнаружено. Этот ген котранскрибируется с малой ядрышковой РНК геном U21 , который расположен в его пятом интроне . Как это типично для генов, кодирующих рибосомальные белки, по геному рассеяно множество процессированных псевдогенов этого гена. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что рибосомальный белок L5 взаимодействует с:

ЦСНК2Б , ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}
ЭИФ5А , ^{[ 12 ]}
Мдм2 , ^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}^{[ 15 ]} и
ПДКД4 . ^{[ 16 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000122406 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000058558 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Цюй Л.Х., Николозо М., Мишо Б., Азум М.К., Кайзерг-Феррер М., Реналье М.Х., Bachellerie JP (ноябрь 1994 г.). «U21, новая малая ядрышковая РНК с 13-нуклеотидной комплементарностью 28S рРНК, кодируется в интроне гена рибосомального белка L5 у кур и млекопитающих» . Нуклеиновые кислоты Рез . 22 (20): 4073–81. дои : 10.1093/нар/22.20.4073 . ПМК 331892 . ПМИД 7937132 .
^ Фригерио Дж. М., Дагорн Дж. К., Йованна Дж. Л. (июль 1995 г.). «Клонирование, секвенирование и экспрессия мРНК рибосомальных белков человека L5, L21, L27a, L28, S5, S9, S10 и S29». Биохим Биофиз Акта . 1262 (1): 64–8. дои : 10.1016/0167-4781(95)00045-i . ПМИД 7772601 .
^ «Ген Энтрез: рибосомальный белок L5 RPL5» .
^ Ленер Б., Семпл Дж.И., Браун С.Е., Адвокат Д., Кэмпбелл Р.Д., Сандерсон К.М. (январь 2004 г.). «Анализ высокопроизводительной дрожжевой двухгибридной системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области III класса MHC человека». Геномика . 83 (1): 153–67. дои : 10.1016/s0888-7543(03)00235-0 . ПМИД 14667819 .
^ Болдырев Б., Иссингер О.Г. (февраль 1997 г.). «Киназа A-Raf является новым взаимодействующим партнером бета-субъединицы протеинкиназы CK2». ФЭБС Летт . 403 (2): 197–9. дои : 10.1016/s0014-5793(97)00010-0 . ПМИД 9042965 . S2CID 84557809 .
^ Ким Дж.М., Ча Дж.Й., Маршак Д.Р., Бэ Ю.С. (сентябрь 1996 г.). «Взаимодействие бета-субъединицы казеинкиназы II с рибосомальным белком L5» . Биохим. Биофиз. Рез. Общий . 226 (1): 180–6. дои : 10.1006/bbrc.1996.1330 . ПМИД 8806611 .
^ Ан Б.Х., Ким Т.Х., Бэ Ю.С. (октябрь 2001 г.). «Картирование домена взаимодействия бета-субъединицы протеинкиназы CKII с белками-мишенями» . Мол. Клетки . 12 (2): 158–63. дои : 10.1016/S1016-8478(23)17077-4 . ПМИД 11710515 .
^ Шац О, Офт М, Дашер С, Шебеста М, Розориус О, Якше Х, Добровник М, Бевек Д, Хаубер Дж (февраль 1998 г.). «Взаимодействие фактора инициации эукариот 5А, кофактора rev ВИЧ-1, с рибосомальным белком L5» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 95 (4): 1607–12. Бибкод : 1998PNAS...95.1607S . дои : 10.1073/pnas.95.4.1607 . ЧВК 19115 . ПМИД 9465063 .
^ Чжан Ю., Вольф Г.В., Бхат К., Джин А., Аллио Т., Буркхарт В.А., Сюн Ю. (декабрь 2003 г.). «Рибосомальный белок L11 отрицательно регулирует онкопротеин MDM2 и опосредует p53-зависимый путь рибосомально-стрессовой контрольной точки» . Мол. Клетка. Биол . 23 (23): 8902–12. дои : 10.1128/mcb.23.23.8902-8912.2003 . ПМК 262682 . ПМИД 14612427 .
^ Марешаль В., Эленбаас Б., Пиетт Дж., Николас Дж.К., Левин А.Дж. (ноябрь 1994 г.). «Рибосомальный белок L5 связан с комплексами mdm-2 и mdm-2-p53» . Мол. Клетка. Биол . 14 (11): 7414–20. дои : 10.1128/mcb.14.11.7414 . ПМК 359276 . ПМИД 7935455 .
^ Дай М.С., Сан XX, Лу Х (июль 2008 г.). «Аберрантная экспрессия нуклеостемина активирует р53 и вызывает остановку клеточного цикла посредством ингибирования MDM2» . Мол. Клетка. Биол . 28 (13): 4365–76. дои : 10.1128/MCB.01662-07 . ПМК 2447154 . ПМИД 18426907 .
^ Кан М.Дж., Ан Х.С., Ли Дж.И., Мацухаши С., Пак Вайоминг (апрель 2002 г.). «Повышение уровня регуляции PDCD4 в стареющих диплоидных фибробластах человека». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 293 (1): 617–21. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00264-4 . ПМИД 12054647 .

Дальнейшее чтение

Вул И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомальных белков млекопитающих». Биохим. Клеточная Биол . 73 (11–12): 933–47. дои : 10.1139/o95-101 . ПМИД 8722009 .
Пог-Гейл К., Гейзер-младший, Шу М., Миллер С., Вул И.Г., Мейслер А.И., Пипас Дж.М. (1991). «Гены рибосомальных белков сверхэкспрессируются при колоректальном раке: выделение клона кДНК, кодирующего рибосомальный белок S3 человека» . Мол. Клетка. Биол . 11 (8): 3842–9. дои : 10.1128/MCB.11.8.3842 . ПМК 361167 . ПМИД 1712897 .
Стейц Дж.А., Берг С., Хендрик Дж.П., Ла Бранш-Шабо Х., Метспалу А., Ринке Дж., Ярио Т. (1988). «Комплекс 5S рРНК/L5 является предшественником сборки рибосомы в клетках млекопитающих» . Дж. Клеточная Биол . 106 (3): 545–56. дои : 10.1083/jcb.106.3.545 . ПМК 2115095 . ПМИД 3279045 .
Хирано К., Ито М., Хартшорн DJ (1995). «Взаимодействие рибосомного белка L5 с протеинфосфатазой типа 1» . Ж. Биол. Хим . 270 (34): 19786–90. дои : 10.1074/jbc.270.34.19786 . ПМИД 7649987 .
Марешаль В., Эленбаас Б., Пиетт Дж., Николас Дж.К., Левин А.Дж. (1994). «Рибосомальный белок L5 связан с комплексами mdm-2 и mdm-2-p53» . Мол. Клетка. Биол . 14 (11): 7414–20. дои : 10.1128/mcb.14.11.7414 . ПМК 359276 . ПМИД 7935455 .
Огата К., Курахаси А., Нисияма С., Терао К. (1994). «Присутствие роли белкового комплекса 5SrRNA-L5 (5SRNP) в комплексе треонил- и гистидил-тРНК синтетазы в цитозоле печени крыс». Биохим. Биофиз. Акта . 1218 (3): 388–400. дои : 10.1016/0167-4781(94)90192-9 . ПМИД 8049265 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Майкл В.М., Дрейфус Г. (1996). «Отдельные домены в рибосомальном белке L5 опосредуют связывание 5S рРНК и ядрышковую локализацию» . Ж. Биол. Хим . 271 (19): 11571–4. дои : 10.1074/jbc.271.19.11571 . ПМИД 8626719 .
Ким Дж. М., Ча Дж. Я., Маршак Д. Р., Бэ Ю. С. (1996). «Взаимодействие бета-субъединицы казеинкиназы II с рибосомальным белком L5» . Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 226 (1): 180–6. дои : 10.1006/bbrc.1996.1330 . ПМИД 8806611 .
Болдырев Б., Иссингер О.Г. (1997). «Киназа A-Raf является новым взаимодействующим партнером бета-субъединицы протеинкиназы CK2». ФЭБС Летт . 403 (2): 197–9. дои : 10.1016/S0014-5793(97)00010-0 . ПМИД 9042965 . S2CID 84557809 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Шац О, Офт М, Дашер С, Шебеста М, Розориус О, Якше Х, Добровник М, Бевек Д, Хаубер Дж (1998). «Взаимодействие фактора инициации эукариот 5А, кофактора rev ВИЧ-1, с рибосомальным белком L5» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 95 (4): 1607–12. Бибкод : 1998PNAS...95.1607S . дои : 10.1073/pnas.95.4.1607 . ЧВК 19115 . ПМИД 9465063 .
Кенмоти Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Э., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж DC (1998). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геном Рез . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .
Якель С., Герлих Д. (1998). «Импортин бета, транспортин, RanBP5 и RanBP7 опосредуют ядерный импорт рибосомальных белков в клетках млекопитающих» . ЭМБО Дж . 17 (15): 4491–502. дои : 10.1093/emboj/17.15.4491 . ПМК 1170780 . ПМИД 9687515 .
Герра Б., Иссингер О.Г. (1998). «p53 и рибосомальный белок L5 участвуют в образовании высокомолекулярного комплекса с протеинкиназой CK2 в клеточной линии F9 тератокарциномы мышей после стимуляции сывороткой и лечения цисплатином». ФЭБС Летт . 434 (1–2): 115–20. дои : 10.1016/S0014-5793(98)00962-4 . ПМИД 9738462 . S2CID 7694535 .
Пак Дж.В., Бэ Ю.С. (1999). «Фосфорилирование рибосомального белка L5 протеинкиназой CKII снижает его активность связывания 5S рРНК». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 263 (2): 475–81. дои : 10.1006/bbrc.1999.1345 . ПМИД 10491318 .
Розориус О., Фрис Б., Стаубер Р.Х., Хиршманн Н., Бевек Д., Хаубер Дж. (2000). «Человеческий рибосомальный белок L5 содержит определенные сигналы ядерной локализации и экспорта» . Ж. Биол. Хим . 275 (16): 12061–8. дои : 10.1074/jbc.275.16.12061 . PMID 10766838 .

Внешние ссылки

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000122406 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000058558 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7937132-5] Цюй Л.Х., Николозо М., Мишо Б., Азум М.К., Кайзерг-Феррер М., Реналье М.Х., Bachellerie JP (ноябрь 1994 г.). «U21, новая малая ядрышковая РНК с 13-нуклеотидной комплементарностью 28S рРНК, кодируется в интроне гена рибосомального белка L5 у кур и млекопитающих» . Нуклеиновые кислоты Рез . 22 (20): 4073–81. дои : 10.1093/нар/22.20.4073 . ПМК 331892 . ПМИД 7937132 .

[pmid7772601-6] Фригерио Дж. М., Дагорн Дж. К., Йованна Дж. Л. (июль 1995 г.). «Клонирование, секвенирование и экспрессия мРНК рибосомальных белков человека L5, L21, L27a, L28, S5, S9, S10 и S29». Биохим Биофиз Акта . 1262 (1): 64–8. дои : 10.1016/0167-4781(95)00045-i . ПМИД 7772601 .

[entrez-7] «Ген Энтрез: рибосомальный белок L5 RPL5» .

[pmid14667819-8] Ленер Б., Семпл Дж.И., Браун С.Е., Адвокат Д., Кэмпбелл Р.Д., Сандерсон К.М. (январь 2004 г.). «Анализ высокопроизводительной дрожжевой двухгибридной системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области III класса MHC человека». Геномика . 83 (1): 153–67. дои : 10.1016/s0888-7543(03)00235-0 . ПМИД 14667819 .

[pmid9042965-9] Болдырев Б., Иссингер О.Г. (февраль 1997 г.). «Киназа A-Raf является новым взаимодействующим партнером бета-субъединицы протеинкиназы CK2». ФЭБС Летт . 403 (2): 197–9. дои : 10.1016/s0014-5793(97)00010-0 . ПМИД 9042965 . S2CID 84557809 .

[pmid8806611-10] Ким Дж.М., Ча Дж.Й., Маршак Д.Р., Бэ Ю.С. (сентябрь 1996 г.). «Взаимодействие бета-субъединицы казеинкиназы II с рибосомальным белком L5» . Биохим. Биофиз. Рез. Общий . 226 (1): 180–6. дои : 10.1006/bbrc.1996.1330 . ПМИД 8806611 .

[pmid11710515-11] Ан Б.Х., Ким Т.Х., Бэ Ю.С. (октябрь 2001 г.). «Картирование домена взаимодействия бета-субъединицы протеинкиназы CKII с белками-мишенями» . Мол. Клетки . 12 (2): 158–63. дои : 10.1016/S1016-8478(23)17077-4 . ПМИД 11710515 .

[pmid9465063-12] Шац О, Офт М, Дашер С, Шебеста М, Розориус О, Якше Х, Добровник М, Бевек Д, Хаубер Дж (февраль 1998 г.). «Взаимодействие фактора инициации эукариот 5А, кофактора rev ВИЧ-1, с рибосомальным белком L5» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 95 (4): 1607–12. Бибкод : 1998PNAS...95.1607S . дои : 10.1073/pnas.95.4.1607 . ЧВК 19115 . ПМИД 9465063 .

[pmid14612427-13] Чжан Ю., Вольф Г.В., Бхат К., Джин А., Аллио Т., Буркхарт В.А., Сюн Ю. (декабрь 2003 г.). «Рибосомальный белок L11 отрицательно регулирует онкопротеин MDM2 и опосредует p53-зависимый путь рибосомально-стрессовой контрольной точки» . Мол. Клетка. Биол . 23 (23): 8902–12. дои : 10.1128/mcb.23.23.8902-8912.2003 . ПМК 262682 . ПМИД 14612427 .

[pmid7935455-14] Марешаль В., Эленбаас Б., Пиетт Дж., Николас Дж.К., Левин А.Дж. (ноябрь 1994 г.). «Рибосомальный белок L5 связан с комплексами mdm-2 и mdm-2-p53» . Мол. Клетка. Биол . 14 (11): 7414–20. дои : 10.1128/mcb.14.11.7414 . ПМК 359276 . ПМИД 7935455 .

[pmid18426907-15] Дай М.С., Сан XX, Лу Х (июль 2008 г.). «Аберрантная экспрессия нуклеостемина активирует р53 и вызывает остановку клеточного цикла посредством ингибирования MDM2» . Мол. Клетка. Биол . 28 (13): 4365–76. дои : 10.1128/MCB.01662-07 . ПМК 2447154 . ПМИД 18426907 .

[pmid12054647-16] Кан М.Дж., Ан Х.С., Ли Дж.И., Мацухаши С., Пак Вайоминг (апрель 2002 г.). «Повышение уровня регуляции PDCD4 в стареющих диплоидных фибробластах человека». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 293 (1): 617–21. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00264-4 . ПМИД 12054647 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]