60S рибосомальный белок L3

Для языка программирования RPL-3 см. Filetab .

РПЛ3
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB показывать Список идентификационных кодов PDB 4UG0, 4V6X, 5AJ0
Идентификаторы
Псевдонимы	RPL3 , ASC-1, L3, TARBP-B, рибосомальный белок L3
Внешние идентификаторы	Опустить : 604163 ; МГИ : 1351605 ; Гомологен : 747 ; Генные карты : RPL3 ; ОМА : RPL3 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 22 (human) Band 22q13.1 Start 39,312,882 bp End 39,320,389 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 15 (mouse) Band 15|15 E1 Start 79,961,992 bp End 79,976,069 bp
показывать экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in left ovary right ovary beta cell ventricular zone anterior pituitary skin of arm canal of the cervix stromal cell of endometrium ganglionic eminence body of uterus Top expressed in ventricular zone ovary dentate gyrus of hippocampal formation granule cell epiblast hypothalamus ganglionic eminence lens blastocyst zone of skin hippocampus proper More reference expression data BioGPS n/a
показывать Генная онтология Molecular function protein binding 5S rRNA binding RNA binding structural constituent of ribosome Cellular component ribosome focal adhesion intracellular anatomical structure extracellular exosome nucleolus nucleus cytoplasm cytosolic large ribosomal subunit cytosol protein-containing complex synapse Biological process cellular response to interleukin-4 viral transcription SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane translational initiation nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay rRNA processing ribosomal large subunit assembly protein biosynthesis Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи Разновидность Человек Мышь Входить 6122 27367 Вместе ENSG00000100316 ENSMUSG00000060036 ЮниПрот P39023 P27659 RefSeq (мРНК) НМ_001033853 НМ_000967 НМ_013762 RefSeq (белок) НП_000958 НП_001029025 НП_038790 Местоположение (UCSC) Чр 22: 39,31 – 39,32 Мб Чр 15: 79,96 – 79,98 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Рибосомальный белок 60S L3 — это белок , который у человека кодируется RPL3 геном .

Функция

Рибосомы , комплексы, катализирующие синтез белка, состоят из небольшой субъединицы 40S и большой субъединицы 60S . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и примерно 80 структурно различных белков. Ген RPL3 кодирует рибосомальный белок , который является компонентом субъединицы 60S. Белок принадлежит к семейству рибосомальных белков L3P и расположен в цитоплазме . Белок может связываться с ВИЧ-1 TAR мРНК , и было высказано предположение, что белок способствует tat -опосредованной трансактивации . Этот ген котранскрибируется с несколькими небольшими генами ядрышковой РНК , которые расположены в нескольких интронах этого гена . альтернативные варианты транскрипционного сплайсинга Охарактеризованы , кодирующие разные изоформы. Как это типично для генов, кодирующих рибосомальные белки, по геному рассеяно множество процессированных псевдогенов этого гена.

Дальнейшее чтение

• Вул И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомальных белков млекопитающих». Биохим. Клеточная Биол . 73 (11–12): 933–47. дои : 10.1139/o95-101 . ПМИД   8722009 .
• Адамс М.Д., Дубник М., Керлавадж А.Р., Морено Р., Келли Дж.М., Аттербек Т.Р., Нэгл Дж.В., Филдс К., Вентер Дж.К. (1992). «Идентификация последовательностей 2375 генов мозга человека». Природа . 355 (6361): 632–4. Бибкод : 1992Natur.355..632A . дои : 10.1038/355632a0 . ПМИД   1538749 . S2CID   4234345 .
• Редди Т.Р., Сухасини М., Раппапорт Дж., Луни DJ, Краус Дж., Вонг-Стаал Ф. (1995). «Молекулярное клонирование и характеристика TAR-связывающего ядерного фактора из Т-клеток». СПИД рез. Хм. Ретровирусы . 11 (6): 663–9. дои : 10.1089/aid.1995.11.663 . ПМИД   7576925 .
• Матоба Р., Окубо К., Хори Н., Фукусима А., Мацубара К. (1994). «Добавление информации о 5'-кодировании в 3'-направленную библиотеку кДНК улучшает анализ экспрессии генов». Джин . 146 (2): 199–207. дои : 10.1016/0378-1119(94)90293-3 . ПМИД   8076819 .
• Ван Рэй Т.Дж., Коннорс Т.Д., Клингер К.В., Ландес Г.М., Берн Т.К. (1997). «Новый ген, подобный рибосомному белку L3 (RPL3L), картируется в области аутосомно-доминантного гена поликистозной болезни почек». Геномика . 37 (2): 172–6. дои : 10.1006/geno.1996.0538 . ПМИД   8921388 .
• Данхэм И, Симидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж.Э., Брускевич Р., Беар Д.М., Клэмп М., Сминк Л.Дж., Эйнско Р., Алмейда Дж.П., Бэббидж А., Бэггули С., Бэйли Дж., Барлоу К., Бейтс К.Н. , Бизли О, Берд С.П., Блейки С., Бриджман А.М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В.Д., О'Брайен К.П. (1999). «Последовательность ДНК 22 хромосомы человека» . Природа . 402 (6761): 489–95. Бибкод : 1999Natur.402..489D . дои : 10.1038/990031 . ПМИД   10591208 .
• Дуга С., Ассельта Р., Малковати М., Тенчини М.Л., Рончи С., Симоник Т. (2000). «Ген рибосомального белка L3, содержащий интрон (RPL3): анализ последовательности и идентификация U43 и двух новых интронных малых ядрышковых РНК». Биохим. Биофиз. Акта . 1490 (3): 225–36. дои : 10.1016/S0167-4781(99)00237-7 . ПМИД   10684968 .
• Уэчи Т., Танака Т., Кенмоти Н. (2001). «Полная карта генов рибосомальных белков человека: отнесение 80 генов к цитогенетической карте и последствия для заболеваний человека». Геномика . 72 (3): 223–30. дои : 10.1006/geno.2000.6470 . ПМИД   11401437 .
• Андерсен Дж.С., Лион CE, Фокс А.Х., Люнг А.К., Лам Ю.В., Стин Х., Манн М., Ламонд А.И. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Курс. Биол . 12 (1): 1–11. Бибкод : 2002CBio...12....1A . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . ПМИД   11790298 . S2CID   14132033 .
• Одинцова Т.И., Мюллер ЕС, Иванов А.В., Егоров Т.А., Бинерт Р., Владимиров С.Н., Костка С., Отто А., Виттманн-Либольд Б., Карпова Г.Г. (2004). «Характеристика и анализ посттрансляционных модификаций белков больших цитоплазматических субъединиц рибосом человека с помощью масс-спектрометрии и секвенирования Эдмана». J. Протеиновая химия . 22 (3): 249–58. дои : 10.1023/А:1025068419698 . ПМИД   12962325 . S2CID   10710245 .
• Баумистер Т , Баух А , Раффнер Х , Ангранд П.О. , Бергамини Г , Кротон К , Круциат С , Эберхард Д , Ганьёр Дж , Гиделли С , Хопф С , Хузе Б , Мангано Р , Мишон А.М. , Ширле М , Шлегль Дж , Шваб М , Стейн М.А., Бауэр А., Казари Г., Древес Г., Гэвин А.С., Джексон Д.Б., Джоберти Г., Нойбауэр Г., Рик Дж., Кастер Б., Суперти-Фурга Г. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Нат. Клеточная Биол . 6 (2): 97–105. дои : 10.1038/ncb1086 . ПМИД   14743216 . S2CID   11683986 .
• Коллинз Дж. Э., Райт К. Л., Эдвардс К. А., Дэвис М. П., Гринхэм Дж. А., Коул К. Г., Говард М. Е., Агуадо Б., Малля М., Мокраб Ю., Хакл Э. Дж., Беар Д. М., Данэм I (2005). «Подход к клонированию ORFeome человека на основе аннотаций генома» . Геном Биол . 5 (10): Р84. дои : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . ПМК   545604 . ПМИД   15461802 .
• Раш Дж., Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Дж., Чжан Х., Чжа К.М., Полакевич Р.Д., Комб М.Дж. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Нат. Биотехнология . 23 (1): 94–101. дои : 10.1038/nbt1046 . ПМИД   15592455 . S2CID   7200157 .
• Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К., Онг С.Е., Лион К.Э., Ламонд А.И., Манн М. (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД   15635413 . S2CID   4344740 .