40S рибосомальный белок S16

РПС16
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 4KZY, 3J7R, 4D61, 4KZX, 4D5L, 4V5Z, 5FLX, 4UJD, 3J7P, 4KZZ, 4UJE, 4UJC
Идентификаторы
Псевдонимы	RPS16 , S16, рибосомальный белок S16
Внешние идентификаторы	Опустить : 603675 ; МГИ : 98118 ; Гомологен : 794 ; Генные карты : RPS16 ; ОМА : RPS16 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	39,435,949 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	28,052,580 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	epithelium of nasopharynx; ; germinal epithelium; ; visceral pleura; ; parietal pleura; ; superficial temporal artery; ; skin of hip; ; nipple; ; skin of thigh; ; cardia; ; pericardium;
	Top expressed in
	yolk sac; ; epiblast; ; embryo; ; spleen; ; thymus; ; morula; ; embryo; ; lip; ; pancreas; ; ventricular zone;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	structural constituent of ribosome; protein binding; RNA binding;
Cellular component	cytosol; ribosome; membrane; focal adhesion; small ribosomal subunit; extracellular exosome; nucleoplasm; extracellular matrix; cytosolic small ribosomal subunit;
Biological process	maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA); viral transcription; SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; translational initiation; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; ribosomal small subunit biogenesis; protein biosynthesis; rRNA processing; cellular response to leukemia inhibitory factor; liver regeneration;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6217
	20055
	ENSG00000105193
	ENSMUSG00000037563
	P62249
	P14131
	НМ_001020 ; НМ_001321111 ; НМ_001363860
	НМ_013647
	НП_001011 ; НП_001308040 ; НП_001350789
	НП_038675
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

40S рибосомальный белок S16’ — это белок , который у человека кодируется RPS16 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Рибосомы , органеллы , катализирующие синтез белка , состоят из небольшой субъединицы 40S и большой субъединицы 60S . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомальный белок , который является компонентом субъединицы 40S. Белок принадлежит к семейству рибосомальных белков S9P. Он расположен в цитоплазме . Как это типично для генов, кодирующих рибосомальные белки, по геному рассеяно множество процессированных псевдогенов этого гена. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Рибосомальный белок S16 — один из белков малой субъединицы рибосомы. Он принадлежит к семейству рибосомальных белков, которое по сходству последовательностей делится на три группы:

* Эубактериальный S16.

* Водоросли и хлоропласты растений S16.

* Цианель S16.

* Митохондриальный S24 Neurospora crassa (cyt-21).

Белки S16 содержат около 100 аминокислотных остатков. У Arabidopsis thaliana есть два паралога: RPS16-1 (хлоропласт) и RPS16-2 (нацеленный на хлоропласты и митохондрии).

[4].

Было показано, что RPS16 взаимодействует с CDC5L . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000105193 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037563 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Батра С.К., Мецгар Р.С., Холлингсворт Массачусетс (май 1991 г.). «Молекулярное клонирование и анализ последовательности рибосомного белка S16 человека» . J Биол Хим . 266 (11): 6830–3. дои : 10.1016/S0021-9258(20)89575-1 . ПМИД 2016298 .
^ Кенмоти Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Э., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж DC (август 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геном Рез . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок S16 RPS16» .
^ Аджух П., Кастер Б., Панов К., Зомердейк Дж.К., Манн М., Ламонд А.И. (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии» . ЭМБО Дж . 19 (23). АНГЛИЯ: 6569–81. дои : 10.1093/emboj/19.23.6569 . ISSN 0261-4189 . ПМК 305846 . ПМИД 11101529 .

Дальнейшее чтение

Вул И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомальных белков млекопитающих». Биохим. Клеточная Биол . 73 (11–12): 933–47. дои : 10.1139/o95-101 . ПМИД 8722009 .
Като С., Секин С., О С.В. и др. (1995). «Создание банка полноразмерной кДНК человека». Джин . 150 (2): 243–50. дои : 10.1016/0378-1119(94)90433-2 . ПМИД 7821789 .
Владимиров С.Н., Иванов А.В., Карпова Г.Г. и др. (1996). «Характеристика белков малых рибосомальных субъединиц человека с помощью N-концевого и внутреннего секвенирования, а также масс-спектрометрии» . Евро. Дж. Биохим . 239 (1): 144–9. дои : 10.1111/j.1432-1033.1996.0144u.x . ПМИД 8706699 .
Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геном Рез . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .
Лей XH, Шен X, Сюй XQ, Бернштейн HS (2001). «Человеческий Cdc5, регулятор митотического входа, может действовать как сайт-специфический ДНК-связывающий белок». Дж. Клеточная наука . 113 Пт 24 (24): 4523–31. дои : 10.1242/jcs.113.24.4523 . ПМИД 11082045 .
Аджух П., Кастер Б., Панов К. и др. (2001). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии» . ЭМБО Дж . 19 (23): 6569–81. дои : 10.1093/emboj/19.23.6569 . ПМК 305846 . ПМИД 11101529 .
Андерсен Дж.С., Лион К.Э., Фокс А.Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Курс. Биол . 12 (1): 1–11. Бибкод : 2002CBio...12....1A . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . ПМИД 11790298 . S2CID 14132033 .
Ёшихама М., Уэчи Т., Асакава С. и др. (2002). «Гены рибосомальных белков человека: секвенирование и сравнительный анализ 73 генов» . Геном Рез . 12 (3): 379–90. дои : 10.1101/гр.214202 . ПМК 155282 . ПМИД 11875025 .
Каран Д., Келли Д.Л., Риццино А. и др. (2002). «Профиль экспрессии дифференциально регулируемых генов во время прогрессирования андроген-независимого роста клеток рака простаты человека» . Канцерогенез . 23 (6): 967–75. дои : 10.1093/carcin/23.6.967 . ПМИД 12082018 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Баумистер Т., Баух А., Раффнер Х. и др. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Нат. Клеточная Биол . 6 (2): 97–105. дои : 10.1038/ncb1086 . ПМИД 14743216 . S2CID 11683986 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К. и др. (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД 15635413 . S2CID 4344740 .
Ю Ю, Джи Х, Дудна Дж. А., Лири Дж. А. (2005). «Масс-спектрометрический анализ 40S рибосомальной субъединицы человека: нативные и IRES-связанные комплексы ВГС» . Белковая наука . 14 (6): 1438–46. дои : 10.1110/ps.041293005 . ПМЦ 2253395 . ПМИД 15883184 .
Ту LC, Ян X, Худ Л, Лин Б (2007). «Протеомный анализ интерактома нижестоящего регулируемого N-myc гена 1 и его взаимодействия с программой андрогенного ответа в клетках рака простаты» . Мол. Клетка. Протеомика . 6 (4): 575–88. дои : 10.1074/mcp.M600249-MCP200 . ПМИД 17220478 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000105193 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037563 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid2016298-5] Батра С.К., Мецгар Р.С., Холлингсворт Массачусетс (май 1991 г.). «Молекулярное клонирование и анализ последовательности рибосомного белка S16 человека» . J Биол Хим . 266 (11): 6830–3. дои : 10.1016/S0021-9258(20)89575-1 . ПМИД 2016298 .

[pmid9582194-6] Кенмоти Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Э., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж DC (август 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геном Рез . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок S16 RPS16» .

[pmid11101529-8] Аджух П., Кастер Б., Панов К., Зомердейк Дж.К., Манн М., Ламонд А.И. (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии» . ЭМБО Дж . 19 (23). АНГЛИЯ: 6569–81. дои : 10.1093/emboj/19.23.6569 . ISSN 0261-4189 . ПМК 305846 . ПМИД 11101529 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]