40S рибосомальный белок S10

РПС10
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 5FLX
Идентификаторы
Псевдонимы	RPS10 , DBA9, S10, рибосомальный белок S10
Внешние идентификаторы	Опустить : 603632 ; МГИ : 1914347 ; Гомологен : 788 ; Генные карты : RPS10 ; ОМА : RPS10 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	34,426,069 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	27,855,643 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	gonad; ; left ovary; ; right ovary; ; right uterine tube; ; canal of the cervix; ; lymph node; ; skin of abdomen; ; skin of leg; ; ectocervix; ; body of uterus;
	Top expressed in
	saccule; ; medial ganglionic eminence; ; Gonadal ridge; ; migratory enteric neural crest cell; ; otic placode; ; condyle; ; otic vesicle; ; fossa; ; mesenteric lymph nodes; ; vas deferens;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	structural constituent of ribosome; protein binding; RNA binding;
Cellular component	cytoplasm; ribosome; membrane; focal adhesion; cytosolic small ribosomal subunit; nucleolus; extracellular exosome; nucleus; nucleoplasm; extracellular matrix; cytosol;
Biological process	viral transcription; SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; translational initiation; ribosomal small subunit assembly; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; protein biosynthesis; rRNA processing;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6204
	67097
	ENSG00000124614
	ENSMUSG00000052146
	P46783
	P63325
	НМ_001204091 ; НМ_001014 ; НМ_001203245
	НМ_025963 ; НМ_001364934
	НП_001005 ; НП_001190174 ; НП_001191020
	НП_080239 ; НП_001351863
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

40S рибосомальный белок S10 — это белок , который у человека кодируется RPS10 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Рибосомы , органеллы , катализирующие синтез белка , состоят из небольшой субъединицы 40S и большой субъединицы 60S . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомальный белок , который является компонентом субъединицы 40S. Белок принадлежит к семейству рибосомальных белков S10E. Он расположен в цитоплазме . Как это типично для генов, кодирующих рибосомальные белки, по геному рассеяно множество процессированных псевдогенов этого гена. ^{[ 7 ]}

Клиническое значение

вариабельная экспрессия этого гена при колоректальном раке по сравнению с прилегающими нормальными тканями, хотя корреляции между уровнем экспрессии и тяжестью заболевания не обнаружено. Наблюдалась ^{[ 7 ]} Мутации в гене RPS10 могут вызывать анемию Даймонда-Блэкфана , врожденную анемию, иногда связанную с недостаточностью костного мозга . ^{[ 8 ]}

Взаимодействия

Было показано, что RPS10 взаимодействует с PTTG1 . ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000124614 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000052146 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Фриджерио Дж. М., Дагорн Дж. К., Йованна Дж. Л. (июль 1995 г.). «Клонирование, секвенирование и экспрессия мРНК рибосомальных белков человека L5, L21, L27a, L28, S5, S9, S10 и S29». Биохим Биофиз Акта . 1262 (1): 64–8. дои : 10.1016/0167-4781(95)00045-i . ПМИД 7772601 .
^ Кенмочи Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Э., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж DC (август 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геном Рез . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: рибосомальный белок S10 RPS10» .
^ Доэрти, Л; Шин, MR; Влахос, А; Чосмель, В; О'Донохью, МФ; Клинтон, К; Шнайдер, HE; Сифф, Калифорния; Ньюбургер, ЧП; Болл, ЮВ; Невядомска, Э; Матысяк, М; Глэйдер, Б; Арчечи, Р.Дж.; Фаррар, Дж. Э.; Ацидафтос, Е; Липтон, Дж. М.; Глейз, ЧП; Газда (февраль 2010 г.). «Гены рибосомальных белков RPS10 и RPS26 обычно мутируют при анемии Даймонда-Блэкфана. HT» . Ам Джей Хум Жене . 86 (2): 222–8. дои : 10.1016/j.ajhg.2009.12.015 . ПМК 2820177 . ПМИД 20116044 .
^ Пей, Л. (январь 1999 г.). «Генный белок, трансформирующий опухоли гипофиза, ассоциируется с рибосомальным белком S10 и новым человеческим гомологом DnaJ в клетках яичка» . Ж. Биол. Хим . 274 (5): 3151–8. дои : 10.1074/jbc.274.5.3151 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 9915854 .

Дальнейшее чтение

Вул И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомальных белков млекопитающих». Биохим. Клеточная Биол . 73 (11–12): 933–47. дои : 10.1139/o95-101 . ПМИД 8722009 .
Владимиров С.Н., Иванов А.В., Карпова Г.Г. и др. (1996). «Характеристика белков малых рибосомальных субъединиц человека с помощью N-концевого и внутреннего секвенирования, а также масс-спектрометрии» . Евро. Дж. Биохим . 239 (1): 144–9. дои : 10.1111/j.1432-1033.1996.0144u.x . ПМИД 8706699 .
Пей Л. (1999). «Генный белок, трансформирующий опухоли гипофиза, ассоциируется с рибосомальным белком S10 и новым человеческим гомологом DnaJ в клетках яичка» . Ж. Биол. Хим . 274 (5): 3151–8. дои : 10.1074/jbc.274.5.3151 . ПМИД 9915854 .
Малыгин А.А., Шауло Д.Д., Карпова Г.Г. (2001). «Белки S7, S10, S16 и S19 40S рибосомальной субъединицы человека наиболее устойчивы к диссоциации солью». Биохим. Биофиз. Акта . 1494 (3): 213–6. дои : 10.1016/s0167-4781(00)00252-9 . ПМИД 11121577 .
Бортолуцци С., д'Алесси Ф., Ромуальди С., Даниэли Г.А. (2002). «Дифференциальная экспрессия генов, кодирующих рибосомальные белки, в разных тканях человека» . Биоинформатика . 17 (12): 1152–7. дои : 10.1093/биоинформатика/17.12.1152 . ПМИД 11751223 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Малыгин А, Барановская О, Иванов А, Карпова Г (2003). «Экспрессия и очистка рибосомальных белков человека S3, S5, S10, S19 и S26». Экспр. белка Пуриф . 28 (1): 57–62. дои : 10.1016/S1046-5928(02)00652-6 . ПМИД 12651107 .
Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А. и др. (2005). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши» . Мол. Клетка. Протеомика . 3 (11): 1093–101. дои : 10.1074/mcp.M400085-MCP200 . ПМИД 15345747 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Нат. Биотехнология . 23 (1): 94–101. дои : 10.1038/nbt1046 . ПМИД 15592455 . S2CID 7200157 .
Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К. и др. (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД 15635413 . S2CID 4344740 .
Ю Ю, Джи Х, Дудна Дж. А., Лири Дж. А. (2005). «Масс-спектрометрический анализ 40S рибосомальной субъединицы человека: нативные и IRES-связанные комплексы ВГС» . Белковая наука . 14 (6): 1438–46. дои : 10.1110/ps.041293005 . ПМЦ 2253395 . ПМИД 15883184 .
Стельзл Ю., Ворм Ю., Лаловски М. и др. (2005). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома» . Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . ПМИД 16169070 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

Внешние ссылки

Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000124614 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000052146 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7772601-5] Фриджерио Дж. М., Дагорн Дж. К., Йованна Дж. Л. (июль 1995 г.). «Клонирование, секвенирование и экспрессия мРНК рибосомальных белков человека L5, L21, L27a, L28, S5, S9, S10 и S29». Биохим Биофиз Акта . 1262 (1): 64–8. дои : 10.1016/0167-4781(95)00045-i . ПМИД 7772601 .

[pmid9582194-6] Кенмочи Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Э., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж DC (август 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геном Рез . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: рибосомальный белок S10 RPS10» .

[8] Доэрти, Л; Шин, MR; Влахос, А; Чосмель, В; О'Донохью, МФ; Клинтон, К; Шнайдер, HE; Сифф, Калифорния; Ньюбургер, ЧП; Болл, ЮВ; Невядомска, Э; Матысяк, М; Глэйдер, Б; Арчечи, Р.Дж.; Фаррар, Дж. Э.; Ацидафтос, Е; Липтон, Дж. М.; Глейз, ЧП; Газда (февраль 2010 г.). «Гены рибосомальных белков RPS10 и RPS26 обычно мутируют при анемии Даймонда-Блэкфана. HT» . Ам Джей Хум Жене . 86 (2): 222–8. дои : 10.1016/j.ajhg.2009.12.015 . ПМК 2820177 . ПМИД 20116044 .

[pmid9915854-9] Пей, Л. (январь 1999 г.). «Генный белок, трансформирующий опухоли гипофиза, ассоциируется с рибосомальным белком S10 и новым человеческим гомологом DnaJ в клетках яичка» . Ж. Биол. Хим . 274 (5): 3151–8. дои : 10.1074/jbc.274.5.3151 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 9915854 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]