60S рибосомальный белок L7

РПЛ7
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4UG0, 4V6X, 5AJ0
Идентификаторы
Псевдонимы	RPL7 , L7, humL7-1, рибосомальный белок L7, рибосомальный белок uL30
Внешние идентификаторы	Опустить : 604166 ; МГИ : 98073 ; Гомологен : 87772 ; Генные карты : RPL7 ; ОМА : RPL7 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 8 (human)
End	73,295,789 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	16,174,886 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ganglionic eminence; ; Achilles tendon; ; ventricular zone; ; left ovary; ; gastric mucosa; ; right ovary; ; canal of the cervix; ; monocyte; ; smooth muscle tissue; ; body of uterus;
	Top expressed in
	epiblast; ; ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; blastocyst; ; uterus; ; zone of skin; ; lens; ; morula; ; esophagus; ; thymus;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; protein homodimerization activity; DNA binding; mRNA binding; RNA binding; structural constituent of ribosome;
Cellular component	ribosome; nucleolus; cytoplasm; cytosol; nucleus; membrane; focal adhesion; extracellular exosome; polysome; cytosolic large ribosomal subunit; postsynaptic density; ribonucleoprotein complex;
Biological process	SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA); viral transcription; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; cytoplasmic translation; ribosomal large subunit biogenesis; translational initiation; protein biosynthesis; rRNA processing;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6129
	19989
	ENSG00000147604
	ENSMUSG00000043716
	P18124
	P14148
	НМ_000971 ; НМ_001363737
	НМ_011291
	НП_000962 ; НП_001350666
	НП_035421
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

60S рибосомальный белок L7 — это белок , который у человека кодируется RPL7 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Рибосомы , органеллы , катализирующие синтез белка , состоят из небольшой субъединицы 40S и большой субъединицы 60S . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомальный белок , который является компонентом субъединицы 60S. Белок принадлежит к семейству рибосомальных белков L30P. Он содержит N-концевой базовый домен, подобный лейциновой застежке (BZIP), и RNP консенсусный субмотив RNP2. In vitro BZIP-подобный домен опосредует гомодимеризацию и стабильное связывание с ДНК и РНК, отдавая предпочтение 28S рРНК и мРНК . Белок может ингибировать внеклеточную трансляцию мРНК, что позволяет предположить, что он играет регуляторную роль в аппарате трансляции. Он расположен в цитоплазме . Было показано, что белок является аутоантигеном у пациентов с системными аутоиммунными заболеваниями , такими как системная красная волчанка . Как это типично для генов, кодирующих рибосомальные белки, по геному рассеяно множество процессированных псевдогенов этого гена. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что RPL7 взаимодействует с ZNF7 . ^{[ 8 ]} Он взаимодействует с белком Gag ВИЧ-1 через цинковый палец Gag ВИЧ-1. ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000147604 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000043716 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Сешадри Т., Узман Дж.А., Осима Дж., Камписи Дж. (сентябрь 1993 г.). «Идентификация транскрипта, уровень регуляции которого снижен в стареющих фибробластах человека. Клонирование, анализ последовательности и регуляция гена рибосомального белка L7 человека» . Журнал биологической химии . 268 (25): 18474–80. дои : 10.1016/S0021-9258(17)46650-6 . ПМИД 8360149 .
^ Хеммерих П., фон Микеч А., Нейман Ф., Сезери О., Вольф-Ворбек Г., Цебелеин Р., Кравинкель У. (январь 1993 г.). «Структурные и функциональные свойства рибосомального белка L7 человека и грызунов» . Исследования нуклеиновых кислот . 21 (2): 223–31. дои : 10.1093/нар/21.2.223 . ПМК 309096 . ПМИД 8441630 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок L7 RPL7» .
^ Витте С., Кравинкель У. (август 1997 г.). «Специфические взаимодействия аутоантигена L7 с белком мульти-цинковых пальцев ZNF7 и рибосомальным белком S7» . Журнал биологической химии . 272 (35): 22243–7. дои : 10.1074/jbc.272.35.22243 . ПМИД 9268371 .
^ Мекдад Х.Э., Бутан Э., Карниб Х., Биедма М.Э., Шарма К.К., Малицка И. и др. (август 2016 г.). «Характеристика взаимодействия между структурным полипротеином Gag ВИЧ-1 и клеточным рибосомальным белком L7 и его участие в ремоделировании вирусных нуклеиновых кислот» . Ретровирусология . 13 (1): 54. дои : 10.1186/s12977-016-0287-4 . ПМЦ 4982112 . ПМИД 27515235 .

Дальнейшее чтение

Вул И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомальных белков млекопитающих». Биохимия и клеточная биология . 73 (11–12): 933–47. дои : 10.1139/o95-101 . ПМИД 8722009 .
фон Микеч А., Хеммерих П., Питер Х.Х., Кравинкель У. (декабрь 1994 г.). «Характеристика эукариотического белка L7 как нового аутоантигена, который часто вызывает иммунный ответ у пациентов, страдающих системным аутоиммунным заболеванием». Иммунобиология . 192 (1–2): 137–54. дои : 10.1016/S0171-2985(11)80413-4 . ПМИД 7750987 .
Нойманн Ф., Хеммерих П., фон Микец А., Петер Х.Х., Кравинкель У. (январь 1995 г.). «Человеческий рибосомальный белок L7 ингибирует внеклеточную трансляцию в лизатах ретикулоцитов и влияет на экспрессию ядерных белков при стабильной трансфекции в клетки Т-лимфомы Jurkat» . Исследования нуклеиновых кислот . 23 (2): 195–202. дои : 10.1093/нар/23.2.195 . ПМК 306654 . ПМИД 7862521 .
Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Витте С., Кравинкель У. (август 1997 г.). «Специфические взаимодействия аутоантигена L7 с белком мульти-цинковых пальцев ZNF7 и рибосомальным белком S7» . Журнал биологической химии . 272 (35): 22243–7. дои : 10.1074/jbc.272.35.22243 . ПМИД 9268371 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Кенмоти Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Э., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж DC (май 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геномные исследования . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .
Андерсен Дж.С., Лион CE, Фокс А.Х., Люнг А.К., Лам Ю.В., Стин Х., Манн М., Ламонд А.И. (январь 2002 г.). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Современная биология . 12 (1): 1–11. дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . ПМИД 11790298 . S2CID 14132033 .
Брезиллон С., Ланнуа В., Франссен Дж.Д., Ле Поль Э., Дюпри В., Луккетти Дж., Дете М., Пармантье М. (январь 2003 г.). «Идентификация природных лигандов для рецепторов, связанных с белком-сиротой G, GPR7 и GPR8» . Журнал биологической химии . 278 (2): 776–83. дои : 10.1074/jbc.M206396200 . ПМИД 12401809 .
Касаи Х., Надано Д., Хидака Э., Хигучи К., Кавакубо М., Сато Т.А., Накаяма Дж. (май 2003 г.). «Дифференциальная экспрессия рибосомальных белков в нормальной и неопластической колоректальной кишке человека». Журнал гистохимии и цитохимии . 51 (5): 567–74. дои : 10.1177/002215540305100502 . ПМИД 12704204 . S2CID 25865715 .
Одинцова Т.И., Мюллер ЕС, Иванов А.В., Егоров Т.А., Бинерт Р., Владимиров С.Н., Костка С., Отто А., Виттманн-Либольд Б., Карпова Г.Г. (апрель 2003 г.). «Характеристика и анализ посттрансляционных модификаций белков больших цитоплазматических субъединиц рибосом человека с помощью масс-спектрометрии и секвенирования Эдмана». Журнал белковой химии . 22 (3): 249–58. дои : 10.1023/А:1025068419698 . ПМИД 12962325 . S2CID 10710245 .
Раш Дж., Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Дж., Чжан Х., Чжа К.М., Полакевич Р.Д., Комб М.Дж. (январь 2005 г.). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Природная биотехнология . 23 (1): 94–101. дои : 10.1038/nbt1046 . ПМИД 15592455 . S2CID 7200157 .
Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К., Онг С.Е., Лион К.Э., Ламонд А.И., Манн М. (январь 2005 г.). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД 15635413 . S2CID 4344740 .
Ко JR, Ву JY, Кирби Р., Ли ИФ, Лин А (июль 2006 г.). «Картирование основных структур человеческого рибосомального белка L7 для входа в ядро, сборки и функционирования рибосомы» . Письма ФЭБС . 580 (16): 3804–10. дои : 10.1016/j.febslet.2006.05.073 . ПМИД 16797011 . S2CID 25168455 .
Ву ВК, Лю Х.В., Линь А. (февраль 2007 г.). «Человеческий рибосомальный белок L7 проявляет свойство связывания ER и участвует в ассоциации рибосома-ER» . Письма ФЭБС . 581 (4): 651–7. дои : 10.1016/j.febslet.2007.01.023 . ПМИД 17258209 . S2CID 30461645 .

Эта статья о гене человека й хромосомы незавершена 8 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000147604 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000043716 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8360149-5] Сешадри Т., Узман Дж.А., Осима Дж., Камписи Дж. (сентябрь 1993 г.). «Идентификация транскрипта, уровень регуляции которого снижен в стареющих фибробластах человека. Клонирование, анализ последовательности и регуляция гена рибосомального белка L7 человека» . Журнал биологической химии . 268 (25): 18474–80. дои : 10.1016/S0021-9258(17)46650-6 . ПМИД 8360149 .

[pmid8441630-6] Хеммерих П., фон Микеч А., Нейман Ф., Сезери О., Вольф-Ворбек Г., Цебелеин Р., Кравинкель У. (январь 1993 г.). «Структурные и функциональные свойства рибосомального белка L7 человека и грызунов» . Исследования нуклеиновых кислот . 21 (2): 223–31. дои : 10.1093/нар/21.2.223 . ПМК 309096 . ПМИД 8441630 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок L7 RPL7» .

[pmid9268371-8] Витте С., Кравинкель У. (август 1997 г.). «Специфические взаимодействия аутоантигена L7 с белком мульти-цинковых пальцев ZNF7 и рибосомальным белком S7» . Журнал биологической химии . 272 (35): 22243–7. дои : 10.1074/jbc.272.35.22243 . ПМИД 9268371 .

[9] Мекдад Х.Э., Бутан Э., Карниб Х., Биедма М.Э., Шарма К.К., Малицка И. и др. (август 2016 г.). «Характеристика взаимодействия между структурным полипротеином Gag ВИЧ-1 и клеточным рибосомальным белком L7 и его участие в ремоделировании вирусных нуклеиновых кислот» . Ретровирусология . 13 (1): 54. дои : 10.1186/s12977-016-0287-4 . ПМЦ 4982112 . ПМИД 27515235 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]