ЭИФ3D

ЭИФ3D
Идентификаторы
Псевдонимы	EIF3D , EIF3S7, eIF3-p66, eIF3-zeta, субъединица D эукариотического фактора инициации трансляции 3
Внешние идентификаторы	Опустить : 603915 ; МГИ : 1933181 ; Гомологен : 2782 ; Генные карты : EIF3D ; ОМА : EIF3D — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 22 (human)
End	36,529,184 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 15 (mouse)
End	77,855,013 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	body of pancreas; ; left ovary; ; skin of abdomen; ; skin of leg; ; epithelium of nasopharynx; ; parotid gland; ; right uterine tube; ; right ovary; ; spleen; ; body of stomach;
	Top expressed in
	epiblast; ; mandibular prominence; ; somite; ; abdominal wall; ; maxillary prominence; ; fetal liver hematopoietic progenitor cell; ; human fetus; ; efferent ductule; ; endothelial cell of lymphatic vessel; ; ventricular zone;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; translation initiation factor activity; RNA binding; mRNA cap binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m; membrane; eukaryotic translation initiation factor 3 complex; eukaryotic 43S preinitiation complex; eukaryotic 48S preinitiation complex;
Biological process	formation of cytoplasmic translation initiation complex; viral translational termination-reinitiation; translational initiation; protein biosynthesis; IRES-dependent viral translational initiation; cap-dependent translational initiation; positive regulation of translation; positive regulation of mRNA binding; cytoplasmic translational initiation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	8664
	55944
	ENSG00000100353
	ENSMUSG00000016554
	О15371
	О70194
	НМ_003753
	НМ_018749
	НП_003744
	НП_061219
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица D фактора инициации трансляции 3 эукариот ( eIF3d ) представляет собой белок , который у человека кодируется EIF3D геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Эукариотический фактор инициации трансляции-3 (eIF3), самый крупный из eIF , представляет собой мультибелковый комплекс , состоящий как минимум из десяти неидентичных субъединиц. Комплекс связывается с рибосомой 40S и помогает поддерживать субъединицы рибосом 40S и 60S в диссоциированном состоянии. Также считается, что он играет роль в образовании инициирующего комплекса 40S, взаимодействуя с тройным комплексом eIF2/GTP/метионил-тРНК и способствуя связыванию мРНК . Белок, кодируемый этим геном, является основной РНК-связывающей субъединицей комплекса eIF3. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что EIF3D взаимодействует с PHLDA1. ^{[ 7 ]} и EIF3A . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

Также было показано, что EIF3D взаимодействует с мРНК c-Jun по неканоническому механизму. Было показано, что вместо белка EIF4G, действующего как кэп-связывающий белок для обеспечения трансляции, EIF3D является кэп-связывающим белком для определенных мРНК, таких как c-Jun , который имеет структуры в 5'-UTR, ингибирующие связывание EIF4G и способствующие связыванию ЭИФ3Д. ^{[ 11 ]} EIF3D как белок, связывающий кэп, считается критически важным для регуляции экспрессии генов в условиях клеточного стресса, например, во время лишения глюкозы. При трансляции c-Jun в условиях дефицита глюкозы активность связывания кэпа EIF3D увеличивалась в 10 раз. ^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}

См. также

Фактор инициации эукариот 3 (eIF3)

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000100353 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000016554 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Асано К., Ворнлохер Х.П., Рихтер-Кук, Нью-Джерси, Меррик В.К., Хиннебуш АГ, Херши Дж.В. (октябрь 1997 г.). «Структура кДНК, кодирующей субъединицы фактора 3 инициации эукариот человека. Возможная роль в связывании РНК и сборке макромолекул» . Журнал биологической химии . 272 (43): 27042–27052. дои : 10.1074/jbc.272.43.27042 . ПМИД 9341143 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: эукариотический фактор инициации трансляции EIF3S7 3, субъединица 7 дзета, 66/67 кДа» .
^ Хинц Т., Флиндт С., Маркс А., Янссен О., Кабелиц Д. (май 2001 г.). «Ингибирование синтеза белка продуктом гена TDAG51 человека, индуцируемым Т-клеточным рецептором». Сотовая сигнализация . 13 (5): 345–352. дои : 10.1016/S0898-6568(01)00141-3 . ПМИД 11369516 .
^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .
^ Майер Г.Л., Фрейзер К.С., Пейретти Ф., Блок К.Л., Херши Дж.В. (октябрь 2003 г.). «Характеристика eIF3k: недавно открытая субъединица фактора инициации трансляции elF3 у млекопитающих» . Европейский журнал биохимии . 270 (20): 4133–4139. дои : 10.1046/j.1432-1033.2003.03807.x . ПМИД 14519125 .
^ Блок К.Л., Ворнлохер Х.П., Херши Дж.В. (ноябрь 1998 г.). «Характеристика кДНК, кодирующих субъединицы p44 и p35 человеческого фактора инициации трансляции eIF3» . Журнал биологической химии . 273 (48): 31901–31908. дои : 10.1074/jbc.273.48.31901 . ПМИД 9822659 .
^ Ли А.С., Кранцуш П.Дж., Дудна Дж.А., Кейт Дж.Х. (август 2016 г.). «eIF3d — это белок, связывающий кэп мРНК, который необходим для специализированной инициации трансляции» . Природа . 536 (7614): 96–99. Бибкод : 2016Natur.536...96L . дои : 10.1038/nature18954 . ПМК 5003174 . ПМИД 27462815 .
^ Цзя Л, Цянь С.Б. (январь 2021 г.). «Универсальный eIF3d для трансляционного контроля стрессовой адаптации» . Молекулярная клетка . 81 (1): 10–12. doi : 10.1016/j.molcel.2020.12.016 . ПМИД 33417853 . S2CID 231303797 .
^ Лампер А.М., Флеминг Р.Х., Лэдд К.М., Ли А.С. (ноябрь 2020 г.). «Переключатель трансляции eIF3d, регулируемый фосфорилированием, опосредует клеточную адаптацию к метаболическому стрессу». Наука . 370 (6518): 853–856. Бибкод : 2020Sci...370..853L . дои : 10.1126/science.abb0993 . ПМИД 33184215 . S2CID 226308112 .

Дальнейшее чтение

Асано К., Кинзи Т.Г., Меррик В.К., Херши Дж.В. (январь 1997 г.). «Сохранение и разнообразие эукариотического фактора инициации трансляции eIF3» . Журнал биологической химии . 272 (2): 1101–1109. дои : 10.1074/jbc.272.2.1101 . ПМИД 8995409 .
Мето Н., Ром Э., Олсен Х., Соненберг Н. (январь 1997 г.). «Человеческий гомолог дрожжевого белка Prt1 является неотъемлемой частью комплекса эукариотического фактора инициации 3 и взаимодействует с p170» . Журнал биологической химии . 272 (2): 1110–1116. дои : 10.1074/jbc.272.2.1110 . ПМИД 8995410 .
Блок К.Л., Ворнлохер Х.П., Херши Дж.В. (ноябрь 1998 г.). «Характеристика кДНК, кодирующих субъединицы p44 и p35 человеческого фактора инициации трансляции eIF3» . Журнал биологической химии . 273 (48): 31901–31908. дои : 10.1074/jbc.273.48.31901 . ПМИД 9822659 .
Данхэм И., Симидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж.Э. и др. (декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК 22 хромосомы человека» . Природа . 402 (6761): 489–495. Бибкод : 1999Natur.402..489D . дои : 10.1038/990031 . ПМИД 10591208 .
Асано К., Шалев А., Фан Л., Нильсен К., Клейтон Дж., Валасек Л. и др. (май 2001 г.). «Множественные роли С-концевого домена eIF5 в сборке комплекса инициации трансляции и активации ГТФазы» . Журнал ЭМБО . 20 (9): 2326–2337. дои : 10.1093/emboj/20.9.2326 . ПМЦ 125443 . ПМИД 11331597 .
Хинц Т., Флиндт С., Маркс А., Янссен О., Кабелиц Д. (май 2001 г.). «Ингибирование синтеза белка продуктом гена TDAG51 человека, индуцируемым Т-клеточным рецептором». Сотовая сигнализация . 13 (5): 345–352. дои : 10.1016/S0898-6568(01)00141-3 . ПМИД 11369516 .
Моррис-Дебуа С., Рети С., Ферро М., Гарин Дж., Жалино П. (декабрь 2001 г.). «Человеческий белок HSPC021 взаимодействует с Int-6 и связан с эукариотическим фактором инициации трансляции 3» . Журнал биологической химии . 276 (49): 45988–45995. дои : 10.1074/jbc.M104966200 . ПМИД 11590142 .
Майер Г.Л., Фрейзер К.С., Пейретти Ф., Блок К.Л., Херши Дж.В. (октябрь 2003 г.). «Характеристика eIF3k: недавно открытая субъединица фактора инициации трансляции elF3 у млекопитающих» . Европейский журнал биохимии . 270 (20): 4133–4139. дои : 10.1046/j.1432-1033.2003.03807.x . ПМИД 14519125 .
Коллинз Дж.Э., Райт К.Л., Эдвардс К.А., Дэвис М.П., Гринхэм Дж.А., Коул К.Г. и др. (2004). «Подход к клонированию ORFeome человека на основе аннотаций генома» . Геномная биология . 5 (10): Р84. дои : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . ПМК 545604 . ПМИД 15461802 .
Раш Дж., Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Дж. и др. (январь 2005 г.). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Природная биотехнология . 23 (1): 94–101. дои : 10.1038/nbt1046 . ПМИД 15592455 . S2CID 7200157 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 22 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000100353 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000016554 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9341143-5] Асано К., Ворнлохер Х.П., Рихтер-Кук, Нью-Джерси, Меррик В.К., Хиннебуш АГ, Херши Дж.В. (октябрь 1997 г.). «Структура кДНК, кодирующей субъединицы фактора 3 инициации эукариот человека. Возможная роль в связывании РНК и сборке макромолекул» . Журнал биологической химии . 272 (43): 27042–27052. дои : 10.1074/jbc.272.43.27042 . ПМИД 9341143 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: эукариотический фактор инициации трансляции EIF3S7 3, субъединица 7 дзета, 66/67 кДа» .

[pmid11369516-7] Хинц Т., Флиндт С., Маркс А., Янссен О., Кабелиц Д. (май 2001 г.). «Ингибирование синтеза белка продуктом гена TDAG51 человека, индуцируемым Т-клеточным рецептором». Сотовая сигнализация . 13 (5): 345–352. дои : 10.1016/S0898-6568(01)00141-3 . ПМИД 11369516 .

[pmid17353931-8] Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

[pmid14519125-9] Майер Г.Л., Фрейзер К.С., Пейретти Ф., Блок К.Л., Херши Дж.В. (октябрь 2003 г.). «Характеристика eIF3k: недавно открытая субъединица фактора инициации трансляции elF3 у млекопитающих» . Европейский журнал биохимии . 270 (20): 4133–4139. дои : 10.1046/j.1432-1033.2003.03807.x . ПМИД 14519125 .

[pmid9822659-10] Блок К.Л., Ворнлохер Х.П., Херши Дж.В. (ноябрь 1998 г.). «Характеристика кДНК, кодирующих субъединицы p44 и p35 человеческого фактора инициации трансляции eIF3» . Журнал биологической химии . 273 (48): 31901–31908. дои : 10.1074/jbc.273.48.31901 . ПМИД 9822659 .

[11] Ли А.С., Кранцуш П.Дж., Дудна Дж.А., Кейт Дж.Х. (август 2016 г.). «eIF3d — это белок, связывающий кэп мРНК, который необходим для специализированной инициации трансляции» . Природа . 536 (7614): 96–99. Бибкод : 2016Natur.536...96L . дои : 10.1038/nature18954 . ПМК 5003174 . ПМИД 27462815 .

[12] Цзя Л, Цянь С.Б. (январь 2021 г.). «Универсальный eIF3d для трансляционного контроля стрессовой адаптации» . Молекулярная клетка . 81 (1): 10–12. doi : 10.1016/j.molcel.2020.12.016 . ПМИД 33417853 . S2CID 231303797 .

[13] Лампер А.М., Флеминг Р.Х., Лэдд К.М., Ли А.С. (ноябрь 2020 г.). «Переключатель трансляции eIF3d, регулируемый фосфорилированием, опосредует клеточную адаптацию к метаболическому стрессу». Наука . 370 (6518): 853–856. Бибкод : 2020Sci...370..853L . дои : 10.1126/science.abb0993 . ПМИД 33184215 . S2CID 226308112 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]