40S рибосомальный белок S4, X-изоформа

РПС4Х
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4UG0, 4V6X, 5A2Q, 3J7R, 3J7P
Идентификаторы
Псевдонимы	RPS4X , CCG2, DXS306, RPS4, S4, SCAR, SCR10, рибосомальный белок S4, Х-связанный, рибосомальный белок S4, Х-связанный
Внешние идентификаторы	Опустить : 312760 ; МГИ : 98158 ; Гомологен : 90857 ; Генные карты : RPS4X ; ОМА : RPS4X — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	X chromosome (human)
End	72,277,248 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	X chromosome (mouse)
End	101,233,000 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	germinal epithelium; ; lactiferous duct; ; tibia; ; visceral pleura; ; parietal pleura; ; corpus epididymis; ; vulva; ; epithelium of nasopharynx; ; mucosa of paranasal sinus; ; superficial temporal artery;
	Top expressed in
	epiblast; ; ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; uterus; ; zone of skin; ; spleen; ; esophagus; ; thymus; ; embryo; ; urinary bladder;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	rRNA binding; structural constituent of ribosome; protein binding; RNA binding;
Cellular component	cytoplasm; polysome; cytosol; ribosome; membrane; focal adhesion; intracellular anatomical structure; cytosolic small ribosomal subunit; small ribosomal subunit; cytoplasmic ribonucleoprotein granule; extracellular exosome; extracellular matrix; nucleoplasm; ribonucleoprotein complex; synapse;
Biological process	viral transcription; positive regulation of translation; SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; multicellular organism development; positive regulation of cell population proliferation; translational initiation; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; rRNA processing; protein biosynthesis;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6191
	20102
	ENSG00000198034
	ENSMUSG00000031320
	P62701
	P62702
	НМ_001007
	НМ_009094
	НП_000998
	НП_033120
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

40S рибосомальный белок S4, изоформа X представляет собой белок , который у человека кодируется RPS4X геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Рибосомы , органеллы , катализирующие синтез белка , состоят из небольшой субъединицы 40S и большой субъединицы 60S . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомальный белок S4, компонент субъединицы 40S. Рибосомальный белок S4 — единственный рибосомальный белок, который, как известно, кодируется более чем одним геном, а именно этим геном и рибосомальным белком S4, Y-связанным (RPS4Y). Две изоформы, кодируемые этими генами, не идентичны, но функционально эквивалентны. Рибосомальный белок S4 принадлежит к семейству рибосомальных белков S4E. Этот ген не подвержен Х-инактивации . Было высказано предположение, что гаплонедостаточность генов рибосомального белка S4 играет роль в синдроме Тернера ; однако эта гипотеза спорна. Как это типично для генов, кодирующих рибосомальные белки, по геному рассеяно множество процессированных псевдогенов этого гена. ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000198034 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031320 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ватанабэ М., Фуруно Н., Гёбл М., Го М., Мияучи К., Секигути Т., Базилико К., Нишимито Т. (апрель 1992 г.). «Молекулярное клонирование человеческого гена CCG2, который дополняет термочувствительный мутант клеточного цикла tsBN63, полученный из BHK: идентичность CCG2 с геном SCAR/RPS4X Х-хромосомы человека». J Cell Sci . 100 (1): 35–43. дои : 10.1242/jcs.100.1.35 . ПМИД 1795030 .
^ Зинн А.Р., Алагаппан Р.К., Браун Л.Г., Шерсть I, Пейдж DC (апрель 1994 г.). «Структура и функция генов рибосомального белка S4 на половых хромосомах человека и мыши» . Мол Клеточная Биол . 14 (4): 2485–92. дои : 10.1128/mcb.14.4.2485 . ПМК 358616 . ПМИД 8139551 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок S4 RPS4X, Х-связанный» .

Дальнейшее чтение

Вул И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомальных белков млекопитающих». Биохим. Клеточная Биол . 73 (11–12): 933–947. дои : 10.1139/o95-101 . ПМИД 8722009 .
Фишер Э.М., Бир-Ромеро П., Браун Л.Г. и др. (1991). «Гомологичные гены рибосомальных белков на X- и Y-хромосомах человека: спасение от инактивации X и возможные последствия синдрома Тернера». Клетка . 63 (6): 1205–1218. дои : 10.1016/0092-8674(90)90416-C . ПМИД 2124517 . S2CID 16060228 .
Уайлс М.В., Александр К.М., Гудфеллоу П.Н. (1988). «Выделение обильно экспрессируемой последовательности из Х-хромосомы человека путем дифференциального скрининга». Сомат. Клетка Мол. Жене . 14 (1): 31–39. дои : 10.1007/BF01535047 . ПМИД 2829364 . S2CID 2698676 .
Матоба Р., Окубо К., Хори Н. и др. (1994). «Добавление информации о 5'-кодировании в 3'-направленную библиотеку кДНК улучшает анализ экспрессии генов». Джин . 146 (2): 199–207. дои : 10.1016/0378-1119(94)90293-3 . ПМИД 8076819 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–174. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Ватанабэ М., Зинн А.Р., Пейдж Д.С., Нисимото Т. (1993). «Функциональная эквивалентность человеческих X- и Y-кодируемых изоформ рибосомального белка S4 соответствует их роли в синдроме Тернера». Нат. Жене . 4 (3): 268–271. дои : 10.1038/ng0793-268 . ПМИД 8358435 . S2CID 11495083 .
Геркенс С., Джаст В., Хелд КР, Фогель В. (1996). «Синдром Ульриха-Тернера не вызван гаплонедостаточностью RPS4X». Хм. Жене . 97 (1): 39–44. дои : 10.1007/bf00218830 . ПМИД 8557258 . S2CID 9987276 .
Владимиров С.Н., Иванов А.В., Карпова Г.Г. и др. (1996). «Характеристика белков малых рибосомальных субъединиц человека с помощью N-концевого и внутреннего секвенирования, а также масс-спектрометрии» . Евро. Дж. Биохим . 239 (1): 144–149. дои : 10.1111/j.1432-1033.1996.0144u.x . ПМИД 8706699 .
Омоэ К., Эндо А (1996). «Связь между фенотипом моносомии X и Y-связанным рибосомальным белком S4 (Rps4) у нескольких видов млекопитающих: молекулярно-эволюционный анализ гомологов Rps4». Геномика . 31 (1): 44–50. дои : 10.1006/geno.1996.0007 . ПМИД 8808278 .
Сузуки И., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–156. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Кенмоти Н., Кавагути Т., Розен С. и др. (1998). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геном Рез . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .
Уэчи Т., Танака Т., Кенмоти Н. (2001). «Полная карта генов рибосомальных белков человека: отнесение 80 генов к цитогенетической карте и последствия для заболеваний человека». Геномика . 72 (3): 223–230. дои : 10.1006/geno.2000.6470 . ПМИД 11401437 .
Робинсон Р.К., Турбедский К., Кайзер Д.А. и др. (2001). «Кристаллическая структура комплекса Arp2/3». Наука . 294 (5547): 1679–1684. Бибкод : 2001Sci...294.1679R . дои : 10.1126/science.1066333 . ПМИД 11721045 . S2CID 18088124 .
Андерсен Дж.С., Лион К.Э., Фокс А.Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Курс. Биол . 12 (1): 1–11. Бибкод : 2002CBio...12....1A . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . ПМИД 11790298 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–16903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Агат Р.Дж., Чой М., Арнольд А.П. (2004). «Половые различия в структуре и экспрессии генов половых хромосом CHD1Z и CHD1W у зебровых амадин» . Мол. Биол. Эвол . 21 (2): 384–396. дои : 10.1093/molbev/msh027 . ПМИД 14660691 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–45. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .

Эта статья о гене человека Х-хромосомы и/или связанном с белке незавершена . ним Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000198034 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031320 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1795030-5] Ватанабэ М., Фуруно Н., Гёбл М., Го М., Мияучи К., Секигути Т., Базилико К., Нишимито Т. (апрель 1992 г.). «Молекулярное клонирование человеческого гена CCG2, который дополняет термочувствительный мутант клеточного цикла tsBN63, полученный из BHK: идентичность CCG2 с геном SCAR/RPS4X Х-хромосомы человека». J Cell Sci . 100 (1): 35–43. дои : 10.1242/jcs.100.1.35 . ПМИД 1795030 .

[pmid8139551-6] Зинн А.Р., Алагаппан Р.К., Браун Л.Г., Шерсть I, Пейдж DC (апрель 1994 г.). «Структура и функция генов рибосомального белка S4 на половых хромосомах человека и мыши» . Мол Клеточная Биол . 14 (4): 2485–92. дои : 10.1128/mcb.14.4.2485 . ПМК 358616 . ПМИД 8139551 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок S4 RPS4X, Х-связанный» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]