40S рибосомальный белок S29

РПС29
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 4KZY, 4D61, 5FLX, 4KZX, 4D5L, 4V5Z, 4UJD, 4KZZ, 4UJE, 4UJC
Идентификаторы
Псевдонимы	RPS29 , DBA13, S29, рибосомальный белок S29, uS14
Внешние идентификаторы	Опустить : 603633 ; МГИ : 107681 ; Гомологен : 83197 ; Генные карты : RPS29 ; ОМА : RPS29 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 14 (human)
End	49,599,164 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 12 (mouse)
End	69,205,960 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	caput epididymis; ; human penis; ; parietal pleura; ; mucosa of sigmoid colon; ; superficial temporal artery; ; granulocyte; ; nipple; ; ganglionic eminence; ; corpus epididymis; ; mucosa of transverse colon;
	Top expressed in
	embryo; ; epiblast; ; uterus; ; yolk sac; ; embryo; ; blastocyst; ; neural tube; ; ganglionic eminence; ; ventricular zone; ; stomach;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	structural constituent of ribosome; zinc ion binding; metal ion binding;
Cellular component	cytosol; ribosome; focal adhesion; intracellular anatomical structure; cytosolic small ribosomal subunit; small ribosomal subunit; extracellular exosome; nucleoplasm; cytoplasm; endoplasmic reticulum; rough endoplasmic reticulum; polysomal ribosome; cytoplasmic side of rough endoplasmic reticulum membrane;
Biological process	viral transcription; SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; translational initiation; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; protein biosynthesis; rRNA processing; cytoplasmic translation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6235
	20090
	ENSG00000213741
	ENSMUSG00000034892
	P62273
	P62274
	НМ_001032 ; НМ_001030001 ; НМ_001351375
	НМ_009093
	НП_001023 ; НП_001025172 ; НП_001338304
	НП_033119
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

40S рибосомальный белок S29 — это белок , который у человека кодируется RPS29 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Рибосомы , органеллы , катализирующие синтез белка , состоят из небольшой субъединицы 40S и большой субъединицы 60S . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомальный белок , который является компонентом субъединицы 40S и членом семейства рибосомальных белков S14P. Белок, который содержит домен C2-C2, похожий на цинковый палец , который может связываться с цинком , может усиливать супрессорную активность Ras -родственного белка 1A (KREV1). Он расположен в цитоплазме . вариабельная экспрессия этого гена при колоректальном раке Наблюдалась по сравнению с прилегающими нормальными тканями, хотя корреляции между уровнем экспрессии и тяжестью заболевания не обнаружено. Как это типично для генов, кодирующих рибосомальные белки, по геному рассеяно множество процессированных псевдогенов этого гена. ^{[ 7 ]}

Клиническое значение

Мутации в RPS29 вызывают анемию Даймонда-Блэкфана . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000213741 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034892 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Кондо Н., Нода М., Фишер Р.Дж., Швайнфест К.В., Папас Т.С., Кондо А., Сэмюэл К.П., Оикава Т. (август 1996 г.). «Рибосомальный белок S29 увеличивает опухолесупрессорную активность гена K rev-1 на клетках NIH3T3, трансформированных vK ras». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1313 (1): 41–6. дои : 10.1016/0167-4889(96)00052-3 . ПМИД 8781548 .
^ Фригерио Дж. М., Дагорн Дж. К., Йованна Дж. Л. (май 1995 г.). «Клонирование, секвенирование и экспрессия мРНК рибосомальных белков человека L5, L21, L27a, L28, S5, S9, S10 и S29». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1262 (1): 64–8. дои : 10.1016/0167-4781(95)00045-i . ПМИД 7772601 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок S29 RPS29» .
^ Мирабелло Л., Макари Э.Р., Джессоп Л., Эллис С.Р., Майерс Т., Гири Н., Тейлор А.М., МакГрат К.Е., Хамфрис Дж.М., Баллью Б.Дж., Йегер М., Боланд Дж.Ф., Хе Дж., Хикс Б.Д., Бердетт Л., Альтер Б.П., Зон Л. , Savage SA (июль 2014 г.). «Секвенирование всего экзома и функциональные исследования идентифицируют RPS29 как новый ген, мутировавший в многосемейных семьях с анемией Даймонда-Блэкфана» . Кровь . 124 (1): 24–32. дои : 10.1182/blood-2013-11-540278 . ПМЦ 4125351 . ПМИД 24829207 .

Дальнейшее чтение

Вул И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомальных белков млекопитающих». Биохимия и клеточная биология . 73 (11–12): 933–47. дои : 10.1139/o95-101 . ПМИД 8722009 .
Владимиров С.Н., Иванов А.В., Карпова Г.Г., Мусолямов АК, Егоров Т.А., Тиде Б, Виттманн-Либольд Б, Отто А (июль 1996 г.). «Характеристика белков малых рибосомальных субъединиц человека с помощью N-концевого и внутреннего секвенирования, а также масс-спектрометрии» . Европейский журнал биохимии . 239 (1): 144–9. дои : 10.1111/j.1432-1033.1996.0144u.x . ПМИД 8706699 .
Кенмоти Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Э., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж DC (май 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геномные исследования . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .
Коппок Д., Копман С., Гудас Дж., Сина-Поппе Д.А. (март 2000 г.). «Регуляция генов, вызывающих состояние покоя: квисцин Q6, декорин и рибосомальный белок S29». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 269 (2): 604–10. дои : 10.1006/bbrc.2000.2324 . ПМИД 10708601 .
Бортолуцци С., д'Алесси Ф., Ромуальди С., Даниэли Г.А. (декабрь 2001 г.). «Дифференциальная экспрессия генов, кодирующих рибосомальные белки, в разных тканях человека» . Биоинформатика . 17 (12): 1152–7. дои : 10.1093/биоинформатика/17.12.1152 . ПМИД 11751223 .
Ёшихама М., Уэчи Т., Асакава С., Кавасаки К., Като С., Хига С., Маэда Н., Миношима С., Танака Т., Симидзу Н., Кенмоти Н. (март 2002 г.). «Гены рибосомальных белков человека: секвенирование и сравнительный анализ 73 генов» . Геномные исследования . 12 (3): 379–90. дои : 10.1101/гр.214202 . ПМК 155282 . ПМИД 11875025 .
Чжоу З.Д., Бао Л., Лю Д.Г., Ли М.К., Гэ Ю.З., Хуан Ю.Л., Лю В.И. (февраль 2003 г.). «Низкое содержание белка S29 в рибосомах линии клеток рака легкого человека a549: обнаружено методом двумерного электрофореза». Буквы о белках и пептидах . 10 (1): 91–7. дои : 10.2174/0929866033408273 . ПМИД 12625830 .
Ю Ю, Джи Х, Дудна Дж. А., Лири Дж. А. (июнь 2005 г.). «Масс-спектрометрический анализ 40S рибосомальной субъединицы человека: нативные и IRES-связанные комплексы ВГС» . Белковая наука . 14 (6): 1438–46. дои : 10.1110/ps.041293005 . ПМЦ 2253395 . ПМИД 15883184 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Серажевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О., Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дювел. Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000213741 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034892 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8781548-5] Кондо Н., Нода М., Фишер Р.Дж., Швайнфест К.В., Папас Т.С., Кондо А., Сэмюэл К.П., Оикава Т. (август 1996 г.). «Рибосомальный белок S29 увеличивает опухолесупрессорную активность гена K rev-1 на клетках NIH3T3, трансформированных vK ras». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1313 (1): 41–6. дои : 10.1016/0167-4889(96)00052-3 . ПМИД 8781548 .

[pmid7772601-6] Фригерио Дж. М., Дагорн Дж. К., Йованна Дж. Л. (май 1995 г.). «Клонирование, секвенирование и экспрессия мРНК рибосомальных белков человека L5, L21, L27a, L28, S5, S9, S10 и S29». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1262 (1): 64–8. дои : 10.1016/0167-4781(95)00045-i . ПМИД 7772601 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок S29 RPS29» .

[8] Мирабелло Л., Макари Э.Р., Джессоп Л., Эллис С.Р., Майерс Т., Гири Н., Тейлор А.М., МакГрат К.Е., Хамфрис Дж.М., Баллью Б.Дж., Йегер М., Боланд Дж.Ф., Хе Дж., Хикс Б.Д., Бердетт Л., Альтер Б.П., Зон Л. , Savage SA (июль 2014 г.). «Секвенирование всего экзома и функциональные исследования идентифицируют RPS29 как новый ген, мутировавший в многосемейных семьях с анемией Даймонда-Блэкфана» . Кровь . 124 (1): 24–32. дои : 10.1182/blood-2013-11-540278 . ПМЦ 4125351 . ПМИД 24829207 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]