40S рибосомальный белок S13

РПС13
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 4KZY, 3J7R, 4D61, 4KZX, 4D5L, 5FLX, 4UJD, 3J7P, 4KZZ, 4UJE, 4UJC
Идентификаторы
Псевдонимы	RPS13 , S13, рибосомальный белок S13
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 180476 ; МГИ : 1915302 ; Гомологен : 128182 ; Генные карты : RPS13 ; ОМА : RPS13 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	17,077,715 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	115,933,430 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	monocyte; ; ganglionic eminence; ; lymph node; ; left ovary; ; right ovary; ; canal of the cervix; ; gonad; ; gallbladder; ; uterine tube; ; endometrium;
	Top expressed in
	epiblast; ; embryo; ; embryo; ; lens; ; ventricular zone; ; spleen; ; ganglionic eminence; ; thymus; ; primary oocyte; ; neural tube;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	small ribosomal subunit rRNA binding; structural constituent of ribosome; protein binding; mRNA binding; 5.8S rRNA binding; RNA binding; mRNA 5'-UTR binding;
Cellular component	cytosol; ribosome; membrane; focal adhesion; intracellular anatomical structure; cytosolic small ribosomal subunit; nucleolus; extracellular exosome; nucleus; nucleoplasm; extracellular matrix; postsynaptic density;
Biological process	viral transcription; SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; translational initiation; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; negative regulation of RNA splicing; protein biosynthesis; rRNA processing;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	6207
	68052
	ENSG00000110700
	ENSMUSG00000090862
	P62277
	P62301
	НМ_001017
	НМ_026533
	НП_001008
	НП_080809
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

40S рибосомальный белок S13 — это белок , который у человека кодируется RPS13 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Рибосомы , органеллы , катализирующие синтез белка , состоят из небольшой субъединицы 40S и большой субъединицы 60S . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомальный белок , который является компонентом субъединицы 40S. Белок принадлежит к семейству рибосомальных белков S15P. Он расположен в цитоплазме . Было показано, что белок связывается с 5,8S рРНК у крыс. Генный продукт ортолога E. coli (рибосомальный белок S15) функционирует на ранних этапах сборки рибосомы. Этот ген котранскрибируется с двумя U14 генами малых ядрышковых РНК , которые расположены в его третьем и пятом интронах. Как это типично для генов, кодирующих рибосомальные белки, по геному рассеяно множество процессированных псевдогенов этого гена. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что RPS13 взаимодействует с PDCD4 . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000110700 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000090862 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Шадено С., ЛеМуллак Б., Дени М.Г. (август 1993 г.). «Клонирование и анализ кДНК рибосомного белка S13 человека» . Нуклеиновые кислоты Рез . 21 (12): 2945. doi : 10.1093/nar/21.12.2945 . ПМК 309694 . ПМИД 8332508 .
^ Кенмочи Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Э., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж DC (август 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геном Рез . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок S13 RPS13» .
^ Кан М.Дж., Ан Х.С., Ли Дж.И., Мацухаши С., Пак Вайоминг (апрель 2002 г.). «Повышение уровня регуляции PDCD4 в стареющих диплоидных фибробластах человека». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 293 (1): 617–21. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00264-4 . ПМИД 12054647 .

Дальнейшее чтение

Вул И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомальных белков млекопитающих». Биохим. Клеточная Биол . 73 (11–12): 933–47. дои : 10.1139/o95-101 . ПМИД 8722009 .
Сузуки К., Олвера Дж., Вул И.Г. (1990). «Первичная структура рибосомного белка S13 крысы». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 171 (2): 519–24. дои : 10.1016/0006-291X(90)91176-S . ПМИД 2403345 .
Владимиров С.Н., Иванов А.В., Карпова Г.Г. и др. (1996). «Характеристика белков малых рибосомальных субъединиц человека с помощью N-концевого и внутреннего секвенирования, а также масс-спектрометрии» . Евро. Дж. Биохим . 239 (1): 144–9. дои : 10.1111/j.1432-1033.1996.0144u.x . ПМИД 8706699 .
Кенмоти Н., Хига С., Ёшихама М., Танака Т. (1996). «МноРНК U14 кодируются в интронах гена рибосомального белка S13 человека». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 228 (2): 371–4. дои : 10.1006/bbrc.1996.1668 . ПМИД 8920921 .
Колдуэлл Г.М., Эдди Р.Л., Дэй К.Д. и др. (2001). «Картирование генов и транскрибируемых последовательностей в богатой генами области размером 400 т.п.н. на хромосоме человека 11p15.1 → p14». Цитогенет. Клеточная генетика . 92 (1–2): 103–7. дои : 10.1159/000056877 . ПМИД 11306805 . S2CID 46081338 .
Андерсен Дж.С., Лион К.Э., Фокс А.Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Курс. Биол . 12 (1): 1–11. Бибкод : 2002CBio...12....1A . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . ПМИД 11790298 . S2CID 14132033 .
Кан М.Дж., Ан Х.С., Ли Дж.И. и др. (2002). «Повышение уровня регуляции PDCD4 в стареющих диплоидных фибробластах человека». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 293 (1): 617–21. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00264-4 . ПМИД 12054647 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Лундгрен Дж., Массон П., Реалини К.А., Янг П. (2003). «Использование РНК-интерференции и комплементации для изучения функции субъединицы S13 26S протеасомы дрозофилы и человека» . Мол. Клетка. Биол . 23 (15): 5320–30. дои : 10.1128/MCB.23.15.5320-5330.2003 . ПМК 165711 . ПМИД 12861018 .
Баумистер Т., Баух А., Раффнер Х. и др. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Нат. Клеточная Биол . 6 (2): 97–105. дои : 10.1038/ncb1086 . ПМИД 14743216 . S2CID 11683986 .
Ши Ю, Чжай Х, Ван Х и др. (2004). «Рибосомальные белки S13 и L23 способствуют множественной лекарственной устойчивости клеток рака желудка путем подавления апоптоза, индуцированного лекарствами». Эксп. Сотовый Res . 296 (2): 337–46. дои : 10.1016/j.yexcr.2004.02.009 . ПМИД 15149863 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Нат. Биотехнология . 23 (1): 94–101. дои : 10.1038/nbt1046 . ПМИД 15592455 . S2CID 7200157 .
Малыгин А, Парахневич Н, Карпова Г (2005). «Человеческий рибосомальный белок S13: клонирование, экспрессия, рефолдинг и структурная стабильность». Биохим. Биофиз. Акта . 1747 (1): 93–7. дои : 10.1016/j.bbapap.2004.10.001 . ПМИД 15680243 .
Ю Ю, Джи Х, Дудна Дж. А., Лири Дж. А. (2005). «Масс-спектрометрический анализ 40S рибосомальной субъединицы человека: нативные и IRES-связанные комплексы ВГС» . Белковая наука . 14 (6): 1438–46. дои : 10.1110/ps.041293005 . ПМЦ 2253395 . ПМИД 15883184 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P62277 (40S рибосомальный белок S13) в PDBe-KB .

Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000110700 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000090862 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8332508-5] Шадено С., ЛеМуллак Б., Дени М.Г. (август 1993 г.). «Клонирование и анализ кДНК рибосомного белка S13 человека» . Нуклеиновые кислоты Рез . 21 (12): 2945. doi : 10.1093/nar/21.12.2945 . ПМК 309694 . ПМИД 8332508 .

[pmid9582194-6] Кенмочи Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Э., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж DC (август 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геном Рез . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок S13 RPS13» .

[pmid12054647-8] Кан М.Дж., Ан Х.С., Ли Дж.И., Мацухаши С., Пак Вайоминг (апрель 2002 г.). «Повышение уровня регуляции PDCD4 в стареющих диплоидных фибробластах человека». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 293 (1): 617–21. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00264-4 . ПМИД 12054647 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]