Продукт слияния рибосомального белка с остатком убиквитина А-52 1

УБА52
Доступные структуры ПДБ Поиск Human UniProt: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 2LJ5, 2MBH, 2MJB, 2MUR, 2RSU, 4HJK, 4JIO, 4P4H, 4PIG, 4PIH, 4PIJ, 4RF0, 4RF1, 4S1Z, 4UG0, 4V6X, 5AJ0, 4UJD, 4D67, 4UJC, 3J7P, 3J7Q, 4XKL, 3J92, 4D5Y, 3J7O, 3J7R, 3PHD, 2KOX, 4UJE, 5A5B, 2N3V, 2N3U, 2N3W, 2NBD, 2NBE, 3VDZ, 5HPS, 3I3T, 5HPT, 5JBV, 5HPL, 5HPK, 5J8P
Идентификаторы
Псевдонимы	UBA52 , CEP52, HUBCEP52, L40, RPL40, продукт слияния рибосомального белка с остатком убиквитина А-52 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 191321 ; МГИ : 3644625 ; Гомологен : 68307 ; Генные карты : UBA52 ; ОМА : UBA52 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 19 (human) Band 19p13.11 Start 18,571,730 bp End 18,577,550 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in blood right testis left testis granulocyte sperm stromal cell of endometrium lymph node left ovary mononuclear cell monocyte n/a More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function structural constituent of ribosome protein binding protein tag ubiquitin protein ligase binding Cellular component cytoplasm endocytic vesicle membrane nucleus ribosome extracellular exosome endosome membrane lysosomal membrane extracellular space nucleoplasm mitochondrial outer membrane endoplasmic reticulum cytosol plasma membrane endoplasmic reticulum quality control compartment vesicle endoplasmic reticulum membrane host cell cytosolic large ribosomal subunit cytosolic small ribosomal subunit synapse Biological process DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway interstrand cross-link repair nucleotide-excision repair, DNA damage recognition positive regulation of canonical Wnt signaling pathway tumor necrosis factor-mediated signaling pathway regulation of type I interferon production TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway Fc-epsilon receptor signaling pathway endosomal transport global genome nucleotide-excision repair NIK/NF-kappaB signaling G2/M transition of mitotic cell cycle stress-activated MAPK cascade transforming growth factor beta receptor signaling pathway macroautophagy negative regulation of canonical Wnt signaling pathway nucleotide-excision repair, DNA gap filling viral transcription error-free translesion synthesis regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane JNK cascade regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia nucleotide-excision repair, DNA incision I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling innate immune response Notch signaling pathway regulation of mRNA stability protein polyubiquitination negative regulation of apoptotic process negative regulation of transcription by RNA polymerase II virion assembly positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity anaphase-promoting complex-dependent catabolic process negative regulation of type I interferon production nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway intracellular transport of virus viral life cycle MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway error-prone translesion synthesis MAPK cascade fibroblast growth factor receptor signaling pathway ion transmembrane transport glycogen biosynthetic process positive regulation of apoptotic process translational initiation positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling translesion synthesis transcription-coupled nucleotide-excision repair T cell receptor signaling pathway MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway positive regulation of transcription by RNA polymerase II positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process regulation of signal transduction by p53 class mediator Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion protein biosynthesis nucleotide-excision repair, preincision complex assembly rRNA processing Wnt signaling pathway ERBB2 signaling pathway nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding protein folding negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle protein ubiquitination protein deubiquitination SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process entry of bacterium into host cell transmembrane transport regulation of necroptotic process membrane organization endoplasmic reticulum mannose trimming cellular iron ion homeostasis regulation of hematopoietic stem cell differentiation protein targeting to peroxisome cytokine-mediated signaling pathway modification-dependent protein catabolic process interleukin-1-mediated signaling pathway response to insecticide Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 7311 665964 Вместе ENSG00000221983 н/д ЮниПрот P62987 н/д RefSeq (мРНК) showНМ_001033930 НМ_003333 НМ_001321017 НМ_001321018 НМ_001321019 NM_001321020 NM_001321021 NM_001321022 н/д RefSeq (белок) showНП_001029102 НП_001307946 НП_001307947 НП_001307948 НП_001307949 NP_001307950 NP_001307951 NP_003324 н/д Местоположение (UCSC) Чр 19: 18.57 – 18.58 Мб н/д в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

60S рибосомальный белок L40 (RPL40) — это белок , который у человека кодируется UBA52 геном .

Функция

Убиквитин представляет собой высококонсервативный ядерный и цитоплазматический белок, который играет важную роль в нацеливании клеточных белков на деградацию с помощью 26S протеосомы . Он также участвует в поддержании структуры хроматина , регуляции экспрессии генов и реакции на стресс. Убикитин синтезируется как белок-предшественник, состоящий либо из полиубиквитиновых цепей, либо из одного фрагмента убиквитина, слитого с несвязанным белком. Этот ген кодирует слитый белок, состоящий из убиквитина на N-конце и рибосомного белка L40 на С-конце , C-концевого удлиненного белка (CEP). многочисленные процессированные псевдогены, происходящие от этого гена. В геноме присутствуют

Дальнейшее чтение

• Вул И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомальных белков млекопитающих». Биохим. Клеточная Биол . 73 (11–12): 933–47. дои : 10.1139/o95-101 . ПМИД   8722009 .
• Мерфи Р.К., Годеншвеге Т.А. (2002). «Новая роль убиквитина в сборке и функционировании нейрональных цепей» . Нейрон . 36 (1): 5–8. дои : 10.1016/S0896-6273(02)00943-1 . ПМИД   12367500 . S2CID   15764136 .
• Бейкер RT, Board PG (1992). «Подсемейство слитых генов человеческого убиквитина / 52-остаточного рибосомального белка (UbA52) состоит в основном из процессированных псевдогенов». Геномика . 14 (2): 520–2. дои : 10.1016/S0888-7543(05)80258-7 . ПМИД   1330885 .
• Бейкер RT, Board PG (1991). «Ген белка, слитого с аминокислотой убиквитин-52 человека, имеет несколько общих структурных особенностей с генами рибосомальных белков млекопитающих» . Нуклеиновые кислоты Рез . 19 (5): 1035–40. дои : 10.1093/нар/19.5.1035 . ПМЦ   333777 . ПМИД   1850507 .
• Мония Б.П., Экер Д.Д., Джонналагадда С. и др. (1989). «Синтез генов, экспрессия и обработка белков-удлинителей убиквитина-карбоксила человека» . Ж. Биол. Хим . 264 (7): 4093–103. дои : 10.1016/S0021-9258(19)84967-0 . ПМИД   2537304 .
• Лунд П.К., Моутс-Стаатс Б.М., Симмонс Дж.Г. и др. (1985). «Анализ нуклеотидной последовательности кДНК, кодирующей убиквитин человека, показывает, что убиквитин синтезируется в качестве предшественника» . Ж. Биол. Хим . 260 (12): 7609–13. дои : 10.1016/S0021-9258(17)39652-7 . ПМИД   2581967 .
• Салвесен Г., Ллойд С., Фарли Д. (1987). «кДНК, кодирующая человеческий гомолог дрожжевого убиквитина 1» . Нуклеиновые кислоты Рез . 15 (13): 5485. doi : 10.1093/nar/15.13.5485 . ПМК   305980 . ПМИД   3037496 .
• Кросс С.Х., Чарльтон Дж.А., Нэн X, Берд А.П. (1994). «Очистка CpG-островков с использованием колонки для связывания метилированной ДНК». Нат. Жене . 6 (3): 236–44. дои : 10.1038/ng0394-236 . ПМИД   8012384 . S2CID   12847618 .
• Кук В.Дж., Джеффри Л.К., Касперек Э., Пиккарт С.М. (1994). «Структура тетраубиквитина показывает, как могут образовываться мультиубиквитиновые цепи». Дж. Мол. Биол . 236 (2): 601–9. дои : 10.1006/jmbi.1994.1169 . ПМИД   8107144 .
• Вадламуди Р.К., Йонг И., Стромингер Дж.Л., Шин Дж. (1996). «p62, фосфотирозин-независимый лиганд SH2-домена p56lck, принадлежит к новому классу убиквитин-связывающих белков» . Ж. Биол. Хим . 271 (34): 20235–7. дои : 10.1074/jbc.271.34.20235 . ПМИД   8702753 .
• Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геном Рез . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД   8889548 .
• Кенмоти Н., Кавагути Т., Розен С. и др. (1998). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геном Рез . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД   9582194 .
• Круз С., Вентура Ф., Бартронс Р., Роза Дж.Л. (2001). «Связывание HERC3 и регуляция убиквитином». ФЭБС Летт . 488 (1–2): 74–80. дои : 10.1016/S0014-5793(00)02371-1 . ПМИД   11163799 . S2CID   20091003 .
• Ли Т.А., Тайерс М. (2002). «Убиквитиновое соединение, какова ваша функция?» . Геном Биол . 2 (10): ОТЧЕТЫ4025. doi : 10.1186/gb-2001-2-10-reports4025 . ПМК   138970 . ПМИД   11597332 .
• Ёшихама М., Уэчи Т., Асакава С. и др. (2002). «Гены рибосомальных белков человека: секвенирование и сравнительный анализ 73 генов» . Геном Рез . 12 (3): 379–90. дои : 10.1101/гр.214202 . ПМК   155282 . ПМИД   11875025 .
• Бишоп Н., Хорман А., Вудман П. (2002). «Белки vps класса E млекопитающих распознают убиквитин и участвуют в удалении эндосомальных конъюгатов белок-убиквитин» . Дж. Клеточная Биол . 157 (1): 91–101. дои : 10.1083/jcb.200112080 . ПМК   2173266 . ПМИД   11916981 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .