60S рибосомальный белок L13

РПЛ13
Доступные структуры
ПДБ	Поиск Human UniProt: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4UG0, 4V6X, 5AJ0, 4UJD, 4D67, 4D5Y, 4UJE, 4UJC
Идентификаторы
Псевдонимы	RPL13 , BBC1, D16S444E, D16S44E, L13, рибосомальный белок L13, SEMDIST
Внешние идентификаторы	Опустить : 113703 ; МГИ : 3642685 ; Гомологен : 5568 ; Генные карты : RPL13 ; ОМА : RPL13 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 16 (human)
End	89,564,542 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	58,895,226 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	left ovary; ; right ovary; ; right uterine tube; ; skin of abdomen; ; skin of leg; ; canal of the cervix; ; ectocervix; ; anterior pituitary; ; body of uterus; ; olfactory zone of nasal mucosa;
	Top expressed in
	dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; embryo; ; embryo; ; morula; ; blastocyst; ; epiblast; ; lens; ; urinary bladder; ; duodenum; ; proximal tubule;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; structural constituent of ribosome; RNA binding;
Cellular component	cytosol; ribosome; cytosolic ribosome; membrane; intracellular anatomical structure; cytosolic large ribosomal subunit; nucleus; nucleolus; endoplasmic reticulum;
Biological process	viral transcription; SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; translational initiation; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; rRNA processing; protein biosynthesis;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6137
	100040416
	ENSG00000167526
	ENSMUSG00000059776
	P26373
	н/д
	НМ_033251 ; НМ_000977 ; НМ_001243130 ; НМ_001243131
	XM_036163486
	НП_000968 ; НП_001230060 ; НП_150254
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

60S рибосомальный белок L13 — это белок , который у человека кодируется RPL13 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Рибосомы , органеллы , катализирующие синтез белка , состоят из небольшой субъединицы 40S и большой субъединицы 60S . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомальный белок , который является компонентом субъединицы 60S. Белок принадлежит к семейству рибосомальных белков L13E. Он расположен в цитоплазме . Этот ген экспрессируется на значительно более высоких уровнях в доброкачественных образованиях молочной железы, чем в карциномах молочной железы . варианты транскрипта, полученные в результате альтернативного сплайсинга и/или альтернативного полиаденилирования Существуют ; эти варианты кодируют один и тот же белок. Как это типично для генов, кодирующих рибосомальные белки, по геному рассеяно множество процессированных псевдогенов этого гена. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что RPL13 взаимодействует с CDC5L . ^{[ 7 ]}

Би-би-си1

Bbc1 (Mti1p) — это белок, экспрессируемый дрожжами, который, как полагают, связан с актиновыми сетями. Bbc1 является сокращением от синтетического летального комплекса Bni1 и члена комплекса Bee1 ( las17 ). ^{[ 8 ]} Альтернативное название, Mti1p, является сокращением от миозина . белка, взаимодействующего с хвостовой областью ^{[ 9 ]} Bbc1 участвует в цитоскелета регуляции во время эндоцитоза . Почкующиеся дрожжи Bbc1 ингибируют активатор комплекса Arp2/3 Las17 ( гомолог WASp ). ^{[ 10 ]} Белок также взаимодействует с хвостом белков миозина 1 . ^{[ 9 ]}

У делящихся дрожжей Bbc1 считается цитоскелетным белком семейства WIP. Bbc1 локализуется в актиновых кортикальных участках, местах деления клеток, кончике клетки и цитозоле. Клетки с делецией гена bbc1 жизнеспособны. ^{[ 11 ]} Bbc1 аффинно захватывается Nebulin. белком Cyk3, закрепляющим актиновые филаменты семейства ^{[ 12 ]} и SMARCAD1 -зависимая ДНК-геликаза Fft3 семейства АТФ . ^{[ 11 ]}^{[ 13 ]} Bbc1 конкурирует с гомологом WIP Vrp1 за связывание хвоста миозина 1 и регуляцию сборки актина в сайтах эндоцитов . ^{[ 14 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000167526 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000059776 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Кенмоти Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Э., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж DC (август 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геном Рез . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок L13 RPL13» .
^ Аджух П., Кастер Б., Панов К., Зомердейк Дж.К., Манн М., Ламонд А.И. (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии» . ЭМБО Дж . 19 (23): 6569–81. дои : 10.1093/emboj/19.23.6569 . ПМК 305846 . ПМИД 11101529 .
^ «BBC1 | SGD» . www.yeastgenome.org . Проверено 9 января 2020 г.
^ Jump up to: ^а ^б Мочида Дж., Ямамото Т., Фудзимура-Камада К., Танака К. (март 2002 г.). «Новый адаптерный белок, Mti1p, и Vrp1p, гомолог белка, взаимодействующего с белками синдрома Вискотта-Олдрича (WIP), могут антагонистически регулировать миозины типа I в Saccharomyces cerevisiae» . Генетика . 160 (3): 923–34. дои : 10.1093/генетика/160.3.923 . OCLC 678661938 . ПМК 1462009 . ПМИД 11901111 .
^ Родал А.А., Мэннинг А.Л., Гуд Б.Л., Друбин Д.Г. (июнь 2003 г.). «Негативная регуляция дрожжевого WASP двумя белками, содержащими домен SH3» . Современная биология . 13 (12): 1000–8. Бибкод : 2003CBio...13.1000R . дои : 10.1016/s0960-9822(03)00383-x . ПМИД 12814545 . S2CID 11363803 .
^ Jump up to: ^а ^б «Помбасе» . www.pombase.org . Проверено 9 января 2020 г.
^ Робертс-Гэлбрейт Р.Х., Охай, доктор медицинских наук, Баллиф Б.А., Чен Дж.С., МакЛеод И., Макдональд У.Х. и др. (июль 2010 г.). «Дефосфорилирование белка F-BAR Cdc15 модулирует его конформацию и стимулирует его каркасную активность в месте деления клеток» . Молекулярная клетка . 39 (1): 86–99. doi : 10.1016/j.molcel.2010.06.012 . ПМК 2916701 . ПМИД 20603077 .
^ Ли Дж., Чхве Э.С., Со Х.Д., Кан К., Гилмор Дж.М., Флоренс Л. и др. (февраль 2017 г.). «Fft3 индуцирует разборку нуклеосомы, облегчая элонгацию РНК-полимеразы II» . Природные коммуникации . 8 : 14527. Бибкод : 2017NatCo...814527L . дои : 10.1038/ncomms14527 . ПМЦ 5321744 . ПМИД 28218250 .
^ МакКуорри CD, Манджионе MC, Кэрролл Р., Джеймс М., Гулд К.Л., Сироткин В. (сентябрь 2019 г.). «Адаптерный белок Bbc1 S. pombe регулирует локализацию Wsp1 и Vrp1 во время сборки эндоцитарного актинового участка» . Журнал клеточной науки . 132 (17): jcs233502. дои : 10.1242/jcs.233502 . ПМК 6771142 . ПМИД 31391237 .

Дальнейшее чтение

Вул И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомальных белков млекопитающих». Биохим. Клеточная Биол . 73 (11–12): 933–47. дои : 10.1139/o95-101 . ПМИД 8722009 .
Адамс С.М., Хелпс Н.Р., Шарп М.Г., Браммар В.Дж., Уокер Р.А., Варли Дж.М. (1993). «Выделение и характеристика нового гена с дифференциальной экспрессией в доброкачественных и злокачественных опухолях молочной железы человека». Хм. Мол. Жене . 1 (2): 91–6. дои : 10.1093/hmg/1.2.91 . ПМИД 1301162 .
Като С., Секине С., О С.В., Ким Н.С., Умезава Ю., Абэ Н., Ёкояма-Кобаяши М., Аоки Т. (1995). «Создание банка полноразмерной кДНК человека». Джин . 150 (2): 243–50. дои : 10.1016/0378-1119(94)90433-2 . ПМИД 7821789 .
Ясин Н.Р., Блобель Г. (1997). «Клонирование и характеристика кариоферина бета3 человека» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 94 (9): 4451–6. Бибкод : 1997PNAS...94.4451Y . дои : 10.1073/pnas.94.9.4451 . ПМК 20743 . ПМИД 9114010 .
Андерсен Дж.С., Лион CE, Фокс А.Х., Люнг А.К., Лам Ю.В., Стин Х., Манн М., Ламонд А.И. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Курс. Биол . 12 (1): 1–11. Бибкод : 2002CBio...12....1A . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . ПМИД 11790298 . S2CID 14132033 .
Би В., Ян Дж., Станкевич П., Парк СС, Вальц К., Буркоэль К.Ф., Потоцкий Л., Шаффер Л.Г., Девриендт К., Новачик М.Дж., Иноуэ К., Лупски Дж.Р. (2002). «Гены в уточненном критическом интервале делеции синдрома Смита-Магениса на хромосоме 17p11.2 и синтенной области мыши» . Геном Рез . 12 (5): 713–28. дои : 10.1101/гр.73702 . ПМК 186594 . ПМИД 11997338 .
Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К., Онг С.Е., Лион К.Э., Ламонд А.И., Манн М. (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД 15635413 . S2CID 4344740 .
Кобаяши Т., Сасаки Ю., Осима Ю., Ямамото Х., Мита Х., Сузуки Х., Тойота М., Токино Т., Ито Ф., Имаи К., Синомура Ю. (2006). «Активация гена рибосомального белка L13 при раке желудочно-кишечного тракта человека» . Межд. Дж. Мол. Мед . 18 (1): 161–70. дои : 10.3892/ijmm.18.1.161 . ПМИД 16786168 .

Внешние ссылки

PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для рибосомного белка 60S человека L13.

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 16 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000167526 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000059776 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9582194-5] Кенмоти Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Э., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж DC (август 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геном Рез . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок L13 RPL13» .

[pmid11101529-7] Аджух П., Кастер Б., Панов К., Зомердейк Дж.К., Манн М., Ламонд А.И. (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии» . ЭМБО Дж . 19 (23): 6569–81. дои : 10.1093/emboj/19.23.6569 . ПМК 305846 . ПМИД 11101529 .

[8] «BBC1 | SGD» . www.yeastgenome.org . Проверено 9 января 2020 г.

[:0-9] Jump up to: ^а ^б Мочида Дж., Ямамото Т., Фудзимура-Камада К., Танака К. (март 2002 г.). «Новый адаптерный белок, Mti1p, и Vrp1p, гомолог белка, взаимодействующего с белками синдрома Вискотта-Олдрича (WIP), могут антагонистически регулировать миозины типа I в Saccharomyces cerevisiae» . Генетика . 160 (3): 923–34. дои : 10.1093/генетика/160.3.923 . OCLC 678661938 . ПМК 1462009 . ПМИД 11901111 .

[10] Родал А.А., Мэннинг А.Л., Гуд Б.Л., Друбин Д.Г. (июнь 2003 г.). «Негативная регуляция дрожжевого WASP двумя белками, содержащими домен SH3» . Современная биология . 13 (12): 1000–8. Бибкод : 2003CBio...13.1000R . дои : 10.1016/s0960-9822(03)00383-x . ПМИД 12814545 . S2CID 11363803 .

[:1-11] Jump up to: ^а ^б «Помбасе» . www.pombase.org . Проверено 9 января 2020 г.

[12] Робертс-Гэлбрейт Р.Х., Охай, доктор медицинских наук, Баллиф Б.А., Чен Дж.С., МакЛеод И., Макдональд У.Х. и др. (июль 2010 г.). «Дефосфорилирование белка F-BAR Cdc15 модулирует его конформацию и стимулирует его каркасную активность в месте деления клеток» . Молекулярная клетка . 39 (1): 86–99. doi : 10.1016/j.molcel.2010.06.012 . ПМК 2916701 . ПМИД 20603077 .

[13] Ли Дж., Чхве Э.С., Со Х.Д., Кан К., Гилмор Дж.М., Флоренс Л. и др. (февраль 2017 г.). «Fft3 индуцирует разборку нуклеосомы, облегчая элонгацию РНК-полимеразы II» . Природные коммуникации . 8 : 14527. Бибкод : 2017NatCo...814527L . дои : 10.1038/ncomms14527 . ПМЦ 5321744 . ПМИД 28218250 .

[14] МакКуорри CD, Манджионе MC, Кэрролл Р., Джеймс М., Гулд К.Л., Сироткин В. (сентябрь 2019 г.). «Адаптерный белок Bbc1 S. pombe регулирует локализацию Wsp1 и Vrp1 во время сборки эндоцитарного актинового участка» . Журнал клеточной науки . 132 (17): jcs233502. дои : 10.1242/jcs.233502 . ПМК 6771142 . ПМИД 31391237 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]