МРПС12

МРПС12
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 3J9M
Идентификаторы
Псевдонимы	MRPS12 , MPR-S12, MT-RPS12, RPMS12, RPS12, RPSM12, митохондриальный рибосомальный белок S12
Внешние идентификаторы	Опустить : 603021 ; МГИ : 1346333 ; Гомологен : 6848 ; Генные карты : MRPS12 ; ОМА : MRPS12 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 19 (human) Band 19q13.2 Start 38,930,944 bp End 38,933,168 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 7 (mouse) Band 7|7 B1 Start 28,439,066 bp End 28,441,245 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in apex of heart mucosa of transverse colon left ventricle right auricle right lobe of liver human kidney right adrenal gland gastrocnemius muscle left adrenal gland body of stomach Top expressed in embryo right kidney yolk sac embryo islet of Langerhans parotid gland Ileal epithelium epiblast seminal vesicula left lobe of liver More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function protein binding RNA binding structural constituent of ribosome Cellular component small ribosomal subunit mitochondrial inner membrane ribosome intracellular anatomical structure mitochondrial ribosome mitochondrion mitochondrial small ribosomal subunit Biological process mitochondrial translational elongation mitochondrial translational termination protein biosynthesis mitochondrial translation Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 6183 24030 Вместе ENSG00000283018 ENSG00000128626 ENSMUSG00000045948 ЮниПрот О15235 О35680 RefSeq (мРНК) НМ_033363 НМ_021107 НМ_033362 НМ_011885 НМ_001360250 НМ_001360252 НМ_001360254 RefSeq (белок) НП_066930 НП_203526 НП_203527 НП_036015 НП_001347179 НП_001347181 НП_001347183 Местоположение (UCSC) Чр 19: 38,93 – 38,93 Мб Чр 7: 28,44 – 28,44 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

28S рибосомальный белок S12, митохондриальный, представляет собой белок , который у человека кодируется MRPS12 геном .

белки млекопитающих Митохондриальные рибосомальные кодируются ядерными генами и помогают в синтезе белка внутри митохондрий . Митохондриальные рибосомы (миторибосомы) состоят из небольшой субъединицы 28S и большой субъединицы 39S. По оценкам, они имеют состав белка по отношению к рРНК на 75% по сравнению с прокариотическими рибосомами, где это соотношение обратное. Другое различие между миторибосомами млекопитающих и рибосомами прокариот состоит в том, что последние содержат 5S рРНК . У разных видов белки, составляющие миторибосому, сильно различаются по последовательности, а иногда и по биохимическим свойствам, что препятствует легкому распознаванию по гомологии последовательностей . Этот ген кодирует белок-субъединицу 28S, принадлежащий семейству рибосомальных белков S12P. Кодируемый белок является ключевым компонентом малой субъединицы рибосомы и контролирует точность декодирования и чувствительность к аминогликозидным антибиотикам . Ген митохондриальной серил - тРНК-синтетазы расположен выше и рядом с этим геном, и оба гена являются возможными кандидатами на аутосомно-доминантный ген глухоты (DFNA4). Для этого гена были обнаружены сплайсинговые варианты , отличающиеся 5'-UTR; все три варианта кодируют один и тот же белок.

Дальнейшее чтение

• Шах З.Х., О'Делл К.М., Миллер С.С. и др. (1998). «Ядерные гены многоклеточных животных миторибосомального белка S12». Джин . 204 (1–2): 55–62. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00521-0 . ПМИД   9434165 .
• Мариоттини П., Шах З.Х., Тойвонен Дж.М. и др. (1999). «Экспрессия гена миторибосомального белка S12 контролируется в клетках человека на уровнях транскрипции, сплайсинга РНК и трансляции» . Ж. Биол. Хим . 274 (45): 31853–62. дои : 10.1074/jbc.274.45.31853 . ПМИД   10542210 .
• Чавдар Коч Э., Беркхарт В., Блэкберн К. и др. (2001). «Маленькая субъединица митохондриальной рибосомы млекопитающих. Идентификация полного набора присутствующих рибосомальных белков» (PDF) . Ж. Биол. Хим . 276 (22): 19363–74. дои : 10.1074/jbc.M100727200 . ПМИД   11279123 . S2CID   26254238 .
• Сузуки Т., Терасаки М., Такемото-Хори С. и др. (2001). «Протеомный анализ митохондриальной рибосомы млекопитающих. Идентификация белковых компонентов в малой субъединице 28 S» . Ж. Биол. Хим . 276 (35): 33181–95. дои : 10.1074/jbc.M103236200 . ПМИД   11402041 .
• Кенмоти Н., Сузуки Т., Уечи Т. и др. (2001). «Гены митохондриальных рибосомальных белков человека: картирование 54 генов на хромосомах и последствия для заболеваний человека». Геномика . 77 (1–2): 65–70. дои : 10.1006/geno.2001.6622 . ПМИД   11543634 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Чжан З, Герштейн М (2003). «Идентификация и характеристика более 100 псевдогенов митохондриальных рибосомальных белков в геноме человека». Геномика . 81 (5): 468–80. дои : 10.1016/S0888-7543(03)00004-1 . ПМИД   12706105 .
• Цуй Ю.П., Ван Дж.Б., Чжан XY и др. (2003). «Использование дрожжевой двухгибридной системы для идентификации белков, связанных с ECRG2, и их возможных взаимодействий с геном ECRG2» . Мир Дж. Гастроэнтерол . 9 (9): 1892–6. дои : 10.3748/wjg.v9.i9.1892 . ПМЦ   4656638 . ПМИД   12970870 .
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК   528928 . ПМИД   15489334 .
• Стельзл Ю., Ворм Ю., Лаловски М. и др. (2005). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . ПМИД   16169070 . S2CID   8235923 .