EIF4A3

EIF4A3
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB показывать Список идентификационных кодов PDB 2HXY, 2HYI, 2J0Q, 2J0S, 2J0U, 2XB2, 3EX7, 4C9B
Идентификаторы
Псевдонимы	EIF4A3 , DDX48, MUK34, NMP265, NUK34, RCPS, eIF4AIII, эукариотический фактор инициации трансляции 4A3, Fal1, eIF4A-III, eIF-4A-III
Внешние идентификаторы	Опустить : 608546 ; МГИ : 1923731 ; Гомологен : 5602 ; Генные карты : EIF4A3 ; ОМА : EIF4A3 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 17 (human) Band 17q25.3 Start 80,134,369 bp End 80,147,151 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 11 (mouse) Band 11|11 E2 Start 119,179,189 bp End 119,190,915 bp
показывать экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in beta cell gonad left uterine tube mucosa of pharynx olfactory bulb ventricular zone mucosa of esophagus mucosa of urinary bladder gingival epithelium left ovary Top expressed in morula epiblast embryo primary oocyte embryo neural tube ventricular zone thymus mesencephalon spleen More reference expression data BioGPS More reference expression data
показывать Генная онтология Molecular function nucleotide binding selenocysteine insertion sequence binding helicase activity poly(A) binding RNA stem-loop binding protein binding nucleic acid binding ribonucleoprotein complex binding hydrolase activity ATP binding mRNA binding RNA binding translation regulator activity Cellular component cytoplasm cytosol nuclear speck catalytic step 2 spliceosome membrane exon-exon junction complex neuronal cell body dendrite spliceosomal complex nucleus nucleoplasm nucleolus glutamatergic synapse postsynaptic cytosol ribonucleoprotein complex U2-type catalytic step 1 spliceosome Biological process nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening mRNA transport negative regulation of translation associative learning response to organic cyclic compound regulation of mRNA binding mRNA processing positive regulation of translation negative regulation of gene expression negative regulation of excitatory postsynaptic potential cellular response to brain-derived neurotrophic factor stimulus cellular response to selenite ion exploration behavior RNA secondary structure unwinding RNA splicing rRNA processing embryonic cranial skeleton morphogenesis negative regulation of selenocysteine insertion sequence binding nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay regulation of translation negative regulation of selenocysteine incorporation mRNA splicing, via spliceosome RNA export from nucleus termination of RNA polymerase II transcription mRNA export from nucleus mRNA 3'-end processing positive regulation of transcription by RNA polymerase II positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome transport regulation of translation at postsynapse, modulating synaptic transmission Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи Разновидность Человек Мышь Входить 9775 192170 Вместе ENSG00000141543 ENSMUSG00000025580 ЮниПрот P38919 Q91VC3 RefSeq (мРНК) НМ_014740 НМ_138669 RefSeq (белок) НП_055555 НП_619610 Местоположение (UCSC) Чр 17: 80,13 – 80,15 Мб Чр 11: 119,18 – 119,19 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Фактор инициации эукариот 4A-III представляет собой белок , который у человека кодируется EIF4A3 геном .

Функция

Этот ген кодирует члена семейства белков DEAD-бокса . Белки DEAD-бокса, характеризующиеся консервативным мотивом Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), представляют собой предполагаемые РНК-хеликазы . Они участвуют в ряде клеточных процессов, включающих изменение вторичной структуры РНК, таких как инициация трансляции, ядерный и митохондриальный сплайсинг, а также сборка рибосом и сплайсосом . Судя по характеру распределения, некоторые члены этого семейства, как полагают, участвуют в эмбриогенезе , сперматогенезе , а также росте и делении клеток. Белок, кодируемый этим геном, представляет собой белок ядерного матрикса. Его аминокислотная последовательность очень похожа на аминокислотные последовательности факторов инициации трансляции eIF4A-I и eIF4A-II , двух других членов семейства белков DEAD-бокса.

Дальнейшее чтение

• Нагасе Т., Миядзима Н., Танака А., Сазука Т., Секи Н., Сато С. и др. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. III. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0081-KIAA0120), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1» . ДНК Рез . 2 (1): 37–43. дои : 10.1093/dnares/2.1.37 . ПМИД   7788527 .
• Ли Кью, Иматака Х., Морино С., Роджерс-младший Г.В., Рихтер-Кук, Нью-Джерси, Меррик В.К. и др. (1999). «Эукариотический фактор инициации трансляции 4AIII (eIF4AIII) функционально отличается от eIF4AI и eIF4AII» . Мол. Клетка. Биол . 19 (11): 7336–46. дои : 10.1128/mcb.19.11.7336 . ПМЦ   84727 . ПМИД   10523622 .
• Юрица М.С., Ликлайдер Л.Дж., Гиги С.Р., Григорьев Н., Мур М.Дж. (2002). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, подходящих для трехмерного структурного анализа» . РНК . 8 (4): 426–39. дои : 10.1017/S1355838202021088 . ПМК   1370266 . ПМИД   11991638 .
• Ли С., Пэк М., Ян Х., Бан Ю.Дж., Ким В.Х., Ха Дж.Х. и др. (2002). «Идентификация генов, дифференциально экспрессирующихся при раке желудка и нормальной слизистой оболочке желудка с помощью микрочипов кДНК». Рак Летт . 184 (2): 197–206. дои : 10.1016/S0304-3835(02)00197-0 . ПМИД   12127692 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х., Дерге Дж.Г., Клаузнер Р.Д., Коллинз Ф.С. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Паласиос И.М., Гатфилд Д., Сент-Джонстон Д., Изаурральде Э. (2004). «Комплекс, содержащий eIF4AIII, необходимый для локализации мРНК и нонсенс-опосредованного распада мРНК». Природа . 427 (6976): 753–7. Бибкод : 2004Natur.427..753P . дои : 10.1038/nature02351 . ПМИД   14973490 . S2CID   4400243 .
• Феррайуоло М.А., Ли К.С., Лер Л.В., Сюй Дж.Л., Коста-Маттиоли М., Луо М.Дж. и др. (2004). «Ядерный фактор трансляции eIF4AIII рекрутируется в мРНК во время сплайсинга и действует при нонсенс-опосредованном распаде» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (12): 4118–23. Бибкод : 2004PNAS..101.4118F . дои : 10.1073/pnas.0400933101 . ПМЦ   384704 . ПМИД   15024115 .
• Сибуя Т., Танге Т.О., Соненберг Н., Мур М.Дж. (2004). «eIF4AIII связывает сплайсированную мРНК в комплексе экзонов и необходим для нонсенс-опосредованного распада» . Нат. Структура. Мол. Биол . 11 (4): 346–51. дои : 10.1038/nsmb750 . ПМИД   15034551 . S2CID   30171314 .
• Джин Дж., Смит Ф.Д., Старк С., Уэллс К.Д., Фосетт Дж.П., Кулкарни С. и др. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3-связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации» . Курс. Биол . 14 (16): 1436–50. Бибкод : 2004CBio...14.1436J . дои : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . ПМИД   15324660 . S2CID   2371325 .
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А., Шенмен С.М., Граус Л.Х., Шулер Г. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК   528928 . ПМИД   15489334 .
• Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К., Онг С.Е., Лион К.Э., Ламонд А.И. и др. (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД   15635413 . S2CID   4344740 .
• Ся Ц, Конг XT, Чжан Га, Хоу XJ, Цян Х, Чжун RQ (2005). «Протеомная идентификация белка 48 DEAD-box как нового аутоантигена, перспективного сывороточного маркера рака поджелудочной железы». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 330 (2): 526–32. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.02.181 . ПМИД   15796914 .
• Баллю Л., Маршадье Б., Баге А., Томасетто С., Серафин Б., Ле Хир Х. (2005). «Ядерный комплекс соединения экзонов фиксируется на РНК путем ингибирования активности АТФазы eIF4AIII». Нат. Структура. Мол. Биол . 12 (10): 861–9. дои : 10.1038/nsmb990 . ПМИД   16170325 . S2CID   1359792 .
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н. и др. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД   16189514 . S2CID   4427026 .
• Геринг Н.Х., Кунц Дж.Б., Ной-Йилик Г., Брейт С., Вьегас М.Х., Хентце М.В. и др. (2005). «Компоненты комплекса экзонов-переходов определяют различные пути нонсенс-опосредованного распада мРНК с дифференциальными требованиями к кофакторам» . Мол. Клетка . 20 (1): 65–75. doi : 10.1016/j.molcel.2005.08.012 . ПМИД   16209946 .
• Андерсен CB, Баллут Л., Йохансен Дж.С., Чамие Х., Нильсен К.Х., Оливейра К.Л. и др. (2006). «Структура ядра соединения экзонов с захваченной АТФазой DEAD-бокса, связанной с РНК». Наука . 313 (5795): 1968–72. Бибкод : 2006Sci...313.1968A . дои : 10.1126/science.1131981 . ПМИД   16931718 . S2CID   26409491 .
• Ю К.Т., Ли Л.С., Ким Н.Г., Кан Х.Дж., Ко К.Х., Чвае Ю.Дж. и др. (2007). «Селективная трансляционная репрессия укороченных белков из мРНК, полученных в результате мутации сдвига рамки считывания, в опухолях» . ПЛОС Биол . 5 (5): е109. дои : 10.1371/journal.pbio.0050109 . ПМК   1854916 . ПМИД   17456004 .
• Чжан З, Крайнер А.Р. (2007). «Сплайсинг реконструирует архитектуру рибонуклеопротеина-мессенджера посредством eIF4A3-зависимого и независимого рекрутирования компонентов комплекса экзонных соединений» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 104 (28): 11574–9. Бибкод : 2007PNAS..10411574Z . дои : 10.1073/pnas.0704946104 . ПМК   1913901 . ПМИД   17606899 .