60S рибосомальный белок L11

РПЛ11
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4UG0, 4V6X, 4XXB, 5AJ0, 4V5Z, 4UJD, 4D67, 4D5Y, 4UJE, 4UJC,%%s4UJE, 4XXB, 4UJD, 4D67, 4V5Z, 4V6X, 5AJ0, 4UJC, 4D5Y, 4UG0
Идентификаторы
Псевдонимы	RPL11 , DBA7, GIG34, L11, рибосомальный белок L11, uL5
Внешние идентификаторы	Опустить : 604175 ; МГИ : 1914275 ; Гомологен : 37376 ; Генные карты : RPL11 ; ОМА : RPL11 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	23,696,835 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	135,780,739 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ganglionic eminence; ; monocyte; ; ventricular zone; ; granulocyte; ; left ovary; ; skin of hip; ; right ovary; ; right lung; ; body of stomach; ; lymph node;
	Top expressed in
	yolk sac; ; embryo; ; embryo; ; lip; ; tail of embryo; ; genital tubercle; ; ventricular zone; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; morula; ; blastocyst;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	rRNA binding; protein binding; RNA binding; structural constituent of ribosome; 5S rRNA binding; ubiquitin protein ligase binding; ubiquitin ligase inhibitor activity;
Cellular component	cytosol; ribosome; membrane; intracellular anatomical structure; nucleolus; cytosolic large ribosomal subunit; extracellular exosome; nucleus; extracellular matrix; nucleoplasm; cytoplasm; protein-containing complex; polysomal ribosome;
Biological process	protein targeting; viral transcription; SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; ribosomal large subunit biogenesis; translational initiation; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; rRNA processing; protein biosynthesis; ribosomal large subunit assembly; positive regulation of gene expression; positive regulation of protein binding; protein stabilization; negative regulation of ubiquitin protein ligase activity; negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process; negative regulation of protein neddylation; regulation of signal transduction by p53 class mediator; negative regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; protein localization to nucleus; positive regulation of signal transduction by p53 class mediator; positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator; cytoplasmic translation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6135
	67025
	ENSG00000142676
	ENSMUSG00000059291
	P62913 ; Q5VVD0
	Q9CXW4
	НМ_001199802 ; НМ_000975
	НМ_025919
	НП_000966 ; НП_001186731 ; НП_000966.2
	НП_080195
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Рибосомальный белок 60S L11 — это белок , который у человека кодируется RPL11 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Рибосомы , органеллы , катализирующие синтез белка , состоят из небольшой субъединицы 40S и большой субъединицы 60S . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомальный белок , который является компонентом субъединицы 60S. Белок принадлежит к семейству рибосомальных белков L5P. Он расположен в цитоплазме . Вероятно, белок связан с 5S рРНК. Альтернативные варианты сплайсинга, кодирующие разные изоформы , могут существовать, но они не полностью охарактеризованы. Как это типично для генов, кодирующих рибосомальные белки, по геному рассеяно множество процессированных псевдогенов этого гена. ^{[ нужна ссылка ]}

Взаимодействия

Было показано, что RPL11 взаимодействует с:

БЛМХ , ^{[ 7 ]}
Мдм2 , ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}
НОП53 , ^{[ 10 ]}
П16 , ^{[ 8 ]}
Р53 , ^{[ 8 ]} и
Белок промиелоцитарного лейкоза ^{[ 11 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000142676 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000059291 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Кенмочи Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Э., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж DC (август 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геном Рез . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .
^ Графодацкий А.С., Воробьева Н.В., Филипенко М.Л., Воронина Е.В., Френген Е., Прюдз Х. (июнь 1999 г.). «Присвоение гена рибосомного белка L11 (RPL11) хромосоме человека 1p36.1 → p35 путем гибридизации in situ». Цитогенетический клеточный генетик . 84 (1–2): 97–98. дои : 10.1159/000015228 . ПМИД 10343117 . S2CID 26672114 .
^ Колдамова Р.П., Лефтеров И.М., ДиСабелла М.Т., Альмонте С., Уоткинс С.С., Лазо Дж.С. (июнь 1999 г.). «Человеческая блеомицингидролаза связывает рибосомальные белки». Биохимия . 38 (22): 7111–7. дои : 10.1021/bi990135l . ПМИД 10353821 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Чжан Ю., Вольф Г.В., Бхат К., Джин А., Аллио Т., Буркхарт В.А., Сюн Ю. (декабрь 2003 г.). «Рибосомальный белок L11 отрицательно регулирует онкопротеин MDM2 и опосредует p53-зависимый путь рибосомально-стрессовой контрольной точки» . Мол. Клетка. Биол . 23 (23): 8902–12. дои : 10.1128/mcb.23.23.8902-8912.2003 . ПМК 262682 . ПМИД 14612427 .
^ Дай М.С., Сан XX, Лу Х (июль 2008 г.). «Аберрантная экспрессия нуклеостемина активирует р53 и вызывает остановку клеточного цикла посредством ингибирования MDM2» . Мол. Клетка. Биол . 28 (13): 4365–76. дои : 10.1128/MCB.01662-07 . ПМК 2447154 . ПМИД 18426907 .
^ Учи Р., Кого Р., Кавахара К., Судо Т., Ёкобори Т., Эгучи Х. и др. (октябрь 2013 г.). «PICT1 регулирует TP53 через RPL11 и участвует в прогрессировании рака желудка» . Британский журнал рака . 109 (8): 2199–206. дои : 10.1038/bjc.2013.561 . ПМЦ 3798961 . ПМИД 24045667 .
^ Бернарди Р., Скальони П.П., Бергманн С., Хорн Х.Ф., Вусден К.Х., Пандольфи П.П. (июль 2004 г.). «PML регулирует стабильность p53 путем секвестрации Mdm2 в ядрышке». Нат. Клеточная Биол . 6 (7): 665–72. дои : 10.1038/ncb1147 . ПМИД 15195100 . S2CID 26281860 .

Дальнейшее чтение

Вул И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомальных белков млекопитающих». Биохим. Клеточная Биол . 73 (11–12): 933–947. дои : 10.1139/o95-101 . ПМИД 8722009 .
Мишин В.П., Филипенко М.Л., Муравлев А.И., Карпова Г.Г., Мертвецов Н.П. (1995). «[Клонирование и определение первичной структуры ДНК, комплементарной мРНК человеческого рибосомального белка L11]». Биоорг. Хим . 21 (2): 158–60. ПМИД 7748210 .
Като С., Секине С., О С.В., Ким Н.С., Умезава Ю., Абэ Н., Ёкояма-Кобаяши М., Аоки Т. (1995). «Создание банка полноразмерной кДНК человека». Джин . 150 (2): 243–250. дои : 10.1016/0378-1119(94)90433-2 . ПМИД 7821789 .
Колдамова Р.П., Лефтеров И.М., ДиСабелла М.Т., Альмонте С., Уоткинс С.К., Лазо Дж.С. (1999). «Человеческая блеомицингидролаза связывает рибосомальные белки». Биохимия . 38 (22): 7111–7117. дои : 10.1021/bi990135l . ПМИД 10353821 .
Андерсен Дж.С., Лион CE, Фокс А.Х., Люнг А.К., Лам Ю.В., Стин Х., Манн М., Ламонд А.И. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Курс. Биол . 12 (1): 1–11. Бибкод : 2002CBio...12....1A . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . ПМИД 11790298 . S2CID 14132033 .
Воронина Е.Н., Колокольцова Т.Д., Нечаева Е.А., Филипенко М.Л. (2003). «[Структурный и функциональный анализ гена рибосомного белка L11 человека]». Мол. Биол. (Моск.) . 37 (3): 425–35. ПМИД 12815950 .
Лорум М.А., Людвиг Р.Л., Куббутат М.Х., Хэнлон М., Вусден К.Х. (2004). «Регуляция активности HDM2 рибосомальным белком L11» . Раковая клетка . 3 (6): 577–587. дои : 10.1016/S1535-6108(03)00134-X . ПМИД 12842086 .
Одинцова Т.И., Мюллер ЕС, Иванов А.В., Егоров Т.А., Бинерт Р., Владимиров С.Н., Костка С., Отто А., Виттманн-Либольд Б., Карпова Г.Г. (2004). «Характеристика и анализ посттрансляционных модификаций белков больших цитоплазматических субъединиц рибосом человека с помощью масс-спектрометрии и секвенирования Эдмана». J. Протеиновая химия . 22 (3): 249–258. дои : 10.1023/А:1025068419698 . ПМИД 12962325 . S2CID 10710245 .
Чжан Ю., Вольф Г.В., Бхат К., Джин А., Аллио Т., Буркхарт В.А., Сюн Ю. (2003). «Рибосомальный белок L11 отрицательно регулирует онкопротеин MDM2 и опосредует p53-зависимый путь рибосомально-стрессовой контрольной точки» . Мол. Клетка. Биол . 23 (23): 8902–8912. дои : 10.1128/MCB.23.23.8902-8912.2003 . ПМК 262682 . ПМИД 14612427 .
Бхат КП, Итахана К, Джин А, Чжан Ю (2004). «Основная роль рибосомального белка L11 в обеспечении активации р53, индуцированной ингибированием роста» . ЭМБО Дж . 23 (12): 2402–2412. дои : 10.1038/sj.emboj.7600247 . ПМЦ 423289 . ПМИД 15152193 .
Бернарди Р., Скальони П.П., Бергманн С., Хорн Х.Ф., Вусден К.Х., Пандольфи П.П. (2004). «PML регулирует стабильность p53 путем секвестрации Mdm2 в ядрышке». Нат. Клеточная Биол . 6 (7): 665–672. дои : 10.1038/ncb1147 . ПМИД 15195100 . S2CID 26281860 .
Дай М.С., Лу Х (2004). «Ингибирование MDM2-опосредованного убиквитинирования и деградации p53 рибосомальным белком L5» . Ж. Биол. Хим . 279 (43): 44475–44482. дои : 10.1074/jbc.M403722200 . ПМИД 15308643 .
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.Ю. , Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( 2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–1178. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Дай М.С., Ши Д., Цзинь Ю, Сунь XX, Чжан Ю, Гроссман С.Р., Лу Х (2006). «Регуляция пути MDM2-p53 с помощью рибосомального белка L11 включает механизм постубиквитинирования» . Ж. Биол. Хим . 281 (34): 24304–24313. дои : 10.1074/jbc.M602596200 . ПМЦ 1783840 . ПМИД 16803902 .
Линдстрем М.С., Джин А., Дейзенрот С., Белый Волк Г., Чжан Ю. (2007). «Связанные с раком мутации в домене цинкового пальца MDM2 нарушают взаимодействие рибосомальных белков и ослабляют деградацию p53, индуцированную MDM2» . Мол. Клетка. Биол . 27 (3): 1056–1068. дои : 10.1128/MCB.01307-06 . ПМК 1800693 . ПМИД 17116689 .

Внешние ссылки

Запись GeneReviews/NCBI/NIH/UW об анемии Даймонда-Блэкфана

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000142676 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000059291 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9582194-5] Кенмочи Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Э., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж DC (август 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геном Рез . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .

[pmid10343117-6] Графодацкий А.С., Воробьева Н.В., Филипенко М.Л., Воронина Е.В., Френген Е., Прюдз Х. (июнь 1999 г.). «Присвоение гена рибосомного белка L11 (RPL11) хромосоме человека 1p36.1 → p35 путем гибридизации in situ». Цитогенетический клеточный генетик . 84 (1–2): 97–98. дои : 10.1159/000015228 . ПМИД 10343117 . S2CID 26672114 .

[pmid10353821-7] Колдамова Р.П., Лефтеров И.М., ДиСабелла М.Т., Альмонте С., Уоткинс С.С., Лазо Дж.С. (июнь 1999 г.). «Человеческая блеомицингидролаза связывает рибосомальные белки». Биохимия . 38 (22): 7111–7. дои : 10.1021/bi990135l . ПМИД 10353821 .

[pmid14612427-8] Jump up to: ^а ^б ^с Чжан Ю., Вольф Г.В., Бхат К., Джин А., Аллио Т., Буркхарт В.А., Сюн Ю. (декабрь 2003 г.). «Рибосомальный белок L11 отрицательно регулирует онкопротеин MDM2 и опосредует p53-зависимый путь рибосомально-стрессовой контрольной точки» . Мол. Клетка. Биол . 23 (23): 8902–12. дои : 10.1128/mcb.23.23.8902-8912.2003 . ПМК 262682 . ПМИД 14612427 .

[pmid18426907-9] Дай М.С., Сан XX, Лу Х (июль 2008 г.). «Аберрантная экспрессия нуклеостемина активирует р53 и вызывает остановку клеточного цикла посредством ингибирования MDM2» . Мол. Клетка. Биол . 28 (13): 4365–76. дои : 10.1128/MCB.01662-07 . ПМК 2447154 . ПМИД 18426907 .

[10] Учи Р., Кого Р., Кавахара К., Судо Т., Ёкобори Т., Эгучи Х. и др. (октябрь 2013 г.). «PICT1 регулирует TP53 через RPL11 и участвует в прогрессировании рака желудка» . Британский журнал рака . 109 (8): 2199–206. дои : 10.1038/bjc.2013.561 . ПМЦ 3798961 . ПМИД 24045667 .

[pmid15195100-11] Бернарди Р., Скальони П.П., Бергманн С., Хорн Х.Ф., Вусден К.Х., Пандольфи П.П. (июль 2004 г.). «PML регулирует стабильность p53 путем секвестрации Mdm2 в ядрышке». Нат. Клеточная Биол . 6 (7): 665–72. дои : 10.1038/ncb1147 . ПМИД 15195100 . S2CID 26281860 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]