40S рибосомальный белок S11

РПС11
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 4KZY, 3J7R, 4D61, 4KZX, 4D5L, 4V5Z, 5FLX, 4UJD, 3J7P, 4KZZ, 4UJE, 4UJC
Идентификаторы
Псевдонимы	RPS11 , S11, рибосомальный белок S11
Внешние идентификаторы	Опустить : 180471 ; МГИ : 1351329 ; Гомологен : 88443 ; Генные карты : RPS11 ; ОМА : RPS11 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	49,499,708 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	44,773,863 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	skin of thigh; ; ganglionic eminence; ; skin of hip; ; skin of arm; ; urethra; ; human penis; ; mucosa of sigmoid colon; ; beta cell; ; superficial temporal artery; ; nipple;
	Top expressed in
	epiblast; ; embryo; ; ventricular zone; ; embryo; ; ganglionic eminence; ; blastocyst; ; thymus; ; morula; ; zone of skin; ; ileum;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	rRNA binding; structural constituent of ribosome; protein binding; RNA binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; ribosome; focal adhesion; intracellular anatomical structure; nucleolus; extracellular exosome; nucleoplasm; extracellular matrix; membrane; cytosolic small ribosomal subunit;
Biological process	viral transcription; SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; translational initiation; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; protein biosynthesis; rRNA processing; osteoblast differentiation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6205
	27207
	ENSG00000142534
	ENSMUSG00000003429
	P62280
	P62281
	НМ_001015
	НМ_013725
	НП_001006
	НП_038753
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

40S рибосомальный белок S11 — это белок , который у человека кодируется RPS11 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Рибосомы , органеллы , катализирующие синтез белка , состоят из небольшой субъединицы 40S и большой субъединицы 60S . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомальный белок , который является компонентом субъединицы 40S. Белок принадлежит к семейству рибосомальных белков S17P. Он расположен в цитоплазме . Считается, что генный продукт ортолога E. coli (рибосомальный белок S17) участвует в распознавании терминирующих кодонов . Этот ген котранскрибируется с небольшим геном ядрышковой РНК , который расположен в его третьем интроне . Как это типично для генов, кодирующих рибосомальные белки, по геному рассеяно множество процессированных псевдогенов этого гена. ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000142534 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000003429 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Фео С., Дэвис Б., Фрид М. (июнь 1992 г.). «Картирование семи генов рибосомальных белков, содержащих интроны, показывает, что они не связаны между собой в геноме человека». Геномика . 13 (1): 201–7. дои : 10.1016/0888-7543(92)90221-D . ПМИД 1577483 .
^ Кенмочи Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Э., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж DC (август 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геном Рез . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок S11 RPS11» .

Дальнейшее чтение

Вул И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомальных белков млекопитающих». Биохим. Клеточная Биол . 73 (11–12): 933–47. дои : 10.1139/o95-101 . ПМИД 8722009 .
Феррари С., Манфредини Р., Тальяфико Э. и др. (1990). «Нескоординированная экспрессия генов рибосомальных белков S6, S11 и S14 в лейкозных бластных клетках». Рак Рез . 50 (18): 5825–8. ПМИД 1697501 .
Лотт Дж.Б., Маки Дж.А. (1988). «Последовательность клонированной кДНК, кодирующей рибосомальный белок S11 человека» . Нуклеиновые кислоты Рез . 16 (3): 1205. doi : 10.1093/nar/16.3.1205 . ПМК 334755 . ПМИД 3267208 .
Владимиров С.Н., Иванов А.В., Карпова Г.Г. и др. (1996). «Характеристика белков малых рибосомальных субъединиц человека с помощью N-концевого и внутреннего секвенирования, а также масс-спектрометрии» . Евро. Дж. Биохим . 239 (1): 144–9. дои : 10.1111/j.1432-1033.1996.0144u.x . ПМИД 8706699 .
Хига С., Ёшихама М., Танака Т., Кенмоти Н. (2000). «Организация генов и последовательность области, содержащей гены рибосомальных белков RPL13A и RPS11 в геноме человека и консервативные особенности в геноме мыши». Джин . 240 (2): 371–7. дои : 10.1016/S0378-1119(99)00429-1 . ПМИД 10580157 . S2CID 25643638 .
Андерсен Дж.С., Лион К.Э., Фокс А.Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Курс. Биол . 12 (1): 1–11. Бибкод : 2002CBio...12....1A . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . ПМИД 11790298 . S2CID 14132033 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Баумистер Т., Баух А., Раффнер Х. и др. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Нат. Клеточная Биол . 6 (2): 97–105. дои : 10.1038/ncb1086 . ПМИД 14743216 . S2CID 11683986 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Ю Ю, Джи Х, Дудна Дж. А., Лири Дж. А. (2005). «Масс-спектрометрический анализ 40S рибосомальной субъединицы человека: нативные и IRES-связанные комплексы ВГС» . Белковая наука . 14 (6): 1438–46. дои : 10.1110/ps.041293005 . ПМЦ 2253395 . ПМИД 15883184 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P62280 (40S рибосомальный белок S11) в PDBe-KB .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 19 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000142534 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000003429 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1577483-5] Фео С., Дэвис Б., Фрид М. (июнь 1992 г.). «Картирование семи генов рибосомальных белков, содержащих интроны, показывает, что они не связаны между собой в геноме человека». Геномика . 13 (1): 201–7. дои : 10.1016/0888-7543(92)90221-D . ПМИД 1577483 .

[pmid9582194-6] Кенмочи Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Э., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж DC (август 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геном Рез . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок S11 RPS11» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]