40S рибосомальный белок S21

РПС21
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 5FLX, 3J7R, 4D61, 4D5L, 4UJD, 3J7P, 4UJE, 4UJC
Идентификаторы
Псевдонимы	RPS21 , HLDF, S21, рибосомальный белок S21
Внешние идентификаторы	Опустить : 180477 ; МГИ : 1913731 ; Гомологен : 90915 ; Генные карты : RPS21 ; ОМА : RPS21 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 20 (human)
End	62,388,520 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	180,258,445 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	nipple; ; human penis; ; trabecular bone; ; middle frontal gyrus; ; superficial temporal artery; ; caput epididymis; ; paraflocculus of cerebellum; ; thymus; ; vulva; ; oral cavity;
	Top expressed in
	hand; ; endocardial cushion; ; medial ganglionic eminence; ; vas deferens; ; atrioventricular valve; ; migratory enteric neural crest cell; ; transitional epithelium of urinary bladder; ; efferent ductule; ; condyle; ; cervix;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein N-terminus binding; structural constituent of ribosome; RNA binding;
Cellular component	small ribosomal subunit; intracellular anatomical structure; cytosol; cytosolic small ribosomal subunit; ribosome; nucleoplasm; cytoplasm; endoplasmic reticulum; rough endoplasmic reticulum; polysomal ribosome; synapse;
Biological process	endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA); endonucleolytic cleavage to generate mature 3'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA); translational initiation; SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; viral transcription; protein biosynthesis; rRNA processing; cytoplasmic translation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6227
	66481
	ENSG00000171858
	ENSMUSG00000039001
	P63220
	Q9CQR2
	НМ_001024
	НМ_025587
	НП_001015
showНП_079863 ; НП_001342445 ; НП_001342446 ; НП_001342447 ; НП_001342449 ;
	NP_001342450
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

40S рибосомальный белок S21 — белок , кодируемый у человека RPS21 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Рибосомы , органеллы , катализирующие синтез белка , состоят из небольшой субъединицы 40S и большой субъединицы 60S . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомальный белок , который является компонентом субъединицы 40S. Белок принадлежит к семейству рибосомальных белков S21E.

Он расположен в цитоплазме . альтернативные варианты сплайсинга , кодирующие разные изоформы Описаны рассеяно множество процессированных псевдогенов этого гена белка, но их существование не подтверждено. Как это типично для генов, кодирующих рибосомальные белки, по геному . ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что RPS21 взаимодействует с рибосомальным белком SA . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000171858 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039001 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Бхат К.С., Моррисон С.Г. (июнь 1993 г.). «Первичная структура рибосомного белка S21 человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 21 (12): 2939. doi : 10.1093/nar/21.12.2939 . ПМК 309688 . ПМИД 8332502 .
^ Кенмоти Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Э., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж DC (май 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геномные исследования . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок S21 RPS21» .
^ Стелцль Ю, Ворм Ю, Лаловски М, Хениг К, Брембек Ф.Х., Гёлер Х, Стродике М, Ценкнер М, Шенхерр А, Кеппен С, Тимм Дж, Минцлафф С, Абрахам С, Бок Н, Китцманн С, Гёдде А, Токсёз Е , Дроге А., Кробич С., Корн Б., Бирчмайер В., Лерах Х., Ванкер Э.Э. (сентябрь 2005 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . ПМИД 16169070 . S2CID 8235923 .
^ Сато М., Саэки Ю., Танака К., Канеда Ю. (март 1999 г.). «Ассоциированный с рибосомой белок LBP/p40 связывается с белком S21 рибосомы 40S: анализ с использованием дрожжевой двухгибридной системы». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 256 (2): 385–90. дои : 10.1006/bbrc.1999.0343 . ПМИД 10079194 .

Дальнейшее чтение

Вул И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомальных белков млекопитающих». Биохимия и клеточная биология . 73 (11–12): 933–47. дои : 10.1139/o95-101 . ПМИД 8722009 .
Костанян И.А., Астапова М.В., Старовойтова Е.В., Драницына С.М., Липкин В.М. (апрель 1995 г.). «[Новый фактор дифференциации из культуральной среды линии клеток HL-60, обработанной ретиноевой кислотой. Выделение и определение первичной структуры]». Биоорганическая химия . 21 (4): 243–8. ПМИД 7786314 .
Костанян И.А., Астапова М.В., Старовойтова Е.В., Драницына С.М., Липкин В.М. (декабрь 1994 г.). «Новый фактор дифференцировки клеток лейкемии человека 8,2 кДа: выделение и первичная структура» . Письма ФЭБС . 356 (2–3): 327–9. дои : 10.1016/0014-5793(94)01306-3 . ПМИД 7805865 . S2CID 43322576 .
Владимиров С.Н., Иванов А.В., Карпова Г.Г., Мусолямов АК, Егоров Т.А., Тиде Б, Виттманн-Либольд Б, Отто А (июль 1996 г.). «Характеристика белков малых рибосомальных субъединиц человека с помощью N-концевого и внутреннего секвенирования, а также масс-спектрометрии» . Европейский журнал биохимии . 239 (1): 144–9. дои : 10.1111/j.1432-1033.1996.0144u.x . ПМИД 8706699 .
Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .
Сато М., Саэки Ю., Танака К., Канеда Ю. (март 1999 г.). «Ассоциированный с рибосомой белок LBP/p40 связывается с белком S21 рибосомы 40S: анализ с использованием дрожжевой двухгибридной системы». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 256 (2): 385–90. дои : 10.1006/bbrc.1999.0343 . ПМИД 10079194 .
Смирнова Е.В., Ракитина Т.В., Евтодиенко А, Костанян И.А., Липкин В.М. (май 2000 г.). «Клонирование и характеристика гена рибосомного белка S21 человека [». Биоорганическая химия . 26 (5): 392–6. ПМИД 10900511 .
Ёшихама М., Уэчи Т., Асакава С., Кавасаки К., Като С., Хига С., Маэда Н., Миношима С., Танака Т., Симидзу Н., Кенмоти Н. (март 2002 г.). «Гены рибосомальных белков человека: секвенирование и сравнительный анализ 73 генов» . Геномные исследования . 12 (3): 379–90. дои : 10.1101/гр.214202 . ПМК 155282 . ПМИД 11875025 .
Ю Ю, Джи Х, Дудна Дж. А., Лири Дж. А. (июнь 2005 г.). «Масс-спектрометрический анализ 40S рибосомальной субъединицы человека: нативные и IRES-связанные комплексы ВГС» . Белковая наука . 14 (6): 1438–46. дои : 10.1110/ps.041293005 . ПМЦ 2253395 . ПМИД 15883184 .
О JH, Ян Джо, Хан Й, Ким М.Р., Бён СС, Чон Й.Дж., Ким Дж.М., Сон КС, Но СМ, Ким С., Ю Х.С., Ким Й.С., Ким НС (декабрь 2005 г.). «Транскриптомный анализ рака желудка человека». Геном млекопитающих . 16 (12): 942–54. дои : 10.1007/s00335-005-0075-2 . ПМИД 16341674 . S2CID 69278 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 20 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000171858 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039001 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8332502-5] Бхат К.С., Моррисон С.Г. (июнь 1993 г.). «Первичная структура рибосомного белка S21 человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 21 (12): 2939. doi : 10.1093/nar/21.12.2939 . ПМК 309688 . ПМИД 8332502 .

[pmid9582194-6] Кенмоти Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Э., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж DC (май 1998 г.). «Карта 75 генов рибосомальных белков человека» . Геномные исследования . 8 (5): 509–23. дои : 10.1101/гр.8.5.509 . ПМИД 9582194 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: рибосомальный белок S21 RPS21» .

[pmid16169070-8] Стелцль Ю, Ворм Ю, Лаловски М, Хениг К, Брембек Ф.Х., Гёлер Х, Стродике М, Ценкнер М, Шенхерр А, Кеппен С, Тимм Дж, Минцлафф С, Абрахам С, Бок Н, Китцманн С, Гёдде А, Токсёз Е , Дроге А., Кробич С., Корн Б., Бирчмайер В., Лерах Х., Ванкер Э.Э. (сентябрь 2005 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . ПМИД 16169070 . S2CID 8235923 .

[pmid10079194-9] Сато М., Саэки Ю., Танака К., Канеда Ю. (март 1999 г.). «Ассоциированный с рибосомой белок LBP/p40 связывается с белком S21 рибосомы 40S: анализ с использованием дрожжевой двухгибридной системы». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 256 (2): 385–90. дои : 10.1006/bbrc.1999.0343 . ПМИД 10079194 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]