PDCD4

PDCD4
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	2KZT, 2GGF, 2RG8, 2ZU6, 3EIJ
Идентификаторы
Псевдонимы	PDCD4 , H731, запрограммированная гибель клеток 4 (ингибитор неопластической трансформации), запрограммированная гибель клеток 4
Внешние идентификаторы	Омим : 608610 ; MGI : 107490 ; Гомологен : 7879 ; GeneCards : PDCD4 ; OMA : PDCD4 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 10 (human)
End	110,900,006 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 19 (mouse)
End	53,918,291 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	body of pancreas; ; skin of abdomen; ; skin of leg; ; rectum; ; right lobe of thyroid gland; ; left lobe of thyroid gland; ; minor salivary glands; ; left ovary; ; ventricular zone; ; right ovary;
	Top expressed in
	lacrimal gland; ; submandibular gland; ; parotid gland; ; lobe of prostate; ; pyloric antrum; ; aortic valve; ; ascending aorta; ; Ileal epithelium; ; pineal gland; ; corneal stroma;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	protein binding; RNA binding;
Cellular component	cytoplasm; nucleus; cytosol; nucleoplasm;
Biological process	regulation of protein metabolic process; negative regulation of cell cycle; negative regulation of apoptotic process; negative regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of JUN kinase activity; positive regulation of smooth muscle cell apoptotic process; negative regulation of myofibroblast differentiation; apoptotic process; positive regulation of endothelial cell apoptotic process; BMP signaling pathway; epithelial to mesenchymal transition involved in cardiac fibroblast development; negative regulation of vascular associated smooth muscle cell differentiation; positive regulation of inflammatory response; cellular response to lipopolysaccharide; negative regulation of cytokine production involved in inflammatory response; positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling; interleukin-12-mediated signaling pathway; negative regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation; positive regulation of vascular associated smooth muscle cell apoptotic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	27250
	18569
	ENSG00000150593
	Ensmusg00000024975
	Q53EL6
	Q61823
	NM_145341 ; NM_001199492 ; NM_014456
	NM_001168491 ; NM_001168492 ; NM_011050
	NP_001186421 ; NP_055271 ; NP_663314
	NP_001161963 ; NP_001161964 ; NP_035180
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Программированный белок гибели клеток 4 - это белок , который у людей кодируется PDCD4 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Это одна из целей OnComir, miRn21 . ^{[ 7 ]}

Функция

Этот ген кодирует белок, локализованный в ядре в пролиферирующих клетках. Экспрессия этого гена модулируется цитокинами в естественных убийце и Т -клетках. Считается, что генный продукт играет роль в апоптозе, но специфическая роль еще не была определена. Были идентифицированы две транскрипты, кодирующие разные изоформы. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что PDCD4 взаимодействует с RPS13 , ^{[ 8 ]} рибосомный белок L5 , ^{[ 8 ]} P62, LC3 и убиквитин [9]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000150593 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000024975 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Azzoni L, Zatsepina O, Abebe B, Bennett IM, Kanakaraj P, Perussia B (1998). «Дифференциальная регуляция транскрипции CD161 и нового гена, 197/15a, IL-2, IL-15 и IL-12 в NK и T-клетках». Журнал иммунологии . 161 (7): 3493–500. doi : 10.4049/jimmunol.161.7.3493 . PMID 9759869 . S2CID 21776266 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Entrezgene 27250
^ Франкель Л.Б., Кристофферсен Н.Р., Якобсен А., Линдоу М., Крог А., Лунд А.Х. (2008). «Запрограммированная гибель клеток 4 (PDCD4) является важной функциональной мишенью микроРНК MIR-21 в клетках рака молочной железы» . Журнал биологической химии . 283 (2): 1026–33. doi : 10.1074/jbc.m707224200 . PMID 17991735 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Kang MJ, Ahn HS, Lee Jy, Matsuhashi S, Park Wy (2002). «Повышение регуляции PDCD4 в стареющему человеческому диплоидным фибробластам». Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 293 (1): 617–21. doi : 10.1016/s0006-291x (02) 00264-4 . PMID 12054647 .

9.  Manirujjaman M, Ozaki I, Murata Y, Guo J, Xia J, Nishioka K, Perveen R,Takahashi H,  Anzai K, Matsuhashi S (2020). "Degradation of the Tumor Suppressor PDCD4 Is Impaired by the Suppression of p62/SQSTM1 and Autophagy". Cells. 9(1): 218. doi.org/10.3390/cells9010218.

Дальнейшее чтение

Гёке Р., Грегель С., Гёке А., Арнольд Р., Шмидт Х., Ланкат-Бетгерет Б. (2004). «Программированный белок гибели клеток 4 (PDCD4) действует как супрессор опухоли в нейроэндокринных опухолевых клетках». Анналы нью -йоркской академии наук . 1014 (1): 220–1. BIBCODE : 2004NYASA1014..220G . doi : 10.1196/annals.1294.024 . PMID 15153438 . S2CID 9284462 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-капитализация: простой метод замены структуры крышки эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Шибахара К., Асано М., Ишида Ю., Аоки Т., Коике Т., Хонджо Т (1995). «Выделение нового мышиного гена MA-3, который индуцируется при запрограммированной гибели клеток». Ген . 166 (2): 297–301. doi : 10.1016/0378-1119 (95) 00607-9 . PMID 8543179 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). «Строительство и характеристика обогащенной полной длиной и библиотекой кДНК с 5'-эндом». Ген . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/s0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Йошинага Х., Мацухаши С., Фудзияма С., Масаки З. (1999). «Новый ген PDCD4 человека (H731), экспрессируемый в пролиферативных клетках, экспрессируется в малых эпителиальных клетках протока молочной железы, что выявлено антителом против H731». Патология International . 49 (12): 1067–77. doi : 10.1046/j.1440-1827.1999.00995.x . PMID 10632927 . S2CID 968499 .
Soejima H, Miyoshi O, Yoshinaga H, Masaki Z, Ozaki I, Kajiwara S, Niikawa N, Matsuhashi S, Mukai T (1999) ¹ Из запрограммированной гибели клеток 4 гена (PDCD4) к группе хромосом человека 10q24 с помощью гибридизации in situ ». Цитогенетическое исследование и геном . 87 (1–2): 113–4. : 10.1159 /000015408 . PMID 10640828. . S2CID 34560093 DOI
Kang MJ, Ahn HS, Lee Jy, Matsuhashi S, Park Wy (2002). «Повышение регуляции PDCD4 в стареющему человеческому диплоидным фибробластам». Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 293 (1): 617–21. doi : 10.1016/s0006-291x (02) 00264-4 . PMID 12054647 .
Чен Й., Кноэль Т., Кристиансен Г., Петас А., Гарбер М.Е., Мацухаши С., Озаки И., Петерсен I (2003). «Потеря экспрессии PDCD4 при раке легких человека коррелирует с прогрессированием опухоли и прогнозом». Журнал патологии . 200 (5): 640–6. doi : 10.1002/path.1378 . PMID 12898601 . S2CID 25899458 .
Ян Х.С., Чо М.Х., Закович Х., Хегамиер Г., Соненберг Н., Колберн Н.Х. (2004). «Новая функция доменов MA-3 в трансформации и супрессоре трансляции PDCD4 необходима для его связывания с фактором инициации эукариотической трансляции 4A» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (9): 3894–906. doi : 10.1128/mcb.24.9.3894-3906.2004 . PMC 387765 . PMID 15082783 .
Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (2004). «Надежное фосфопротеомное профилирование сайтов фосфорилирования тирозина из Т -клеток человека с использованием иммобилизованной аффинной хроматографии металлов и тандемной масс -спектрометрии». Аналитическая химия . 76 (10): 2763–72. doi : 10.1021/ac035352d . PMID 15144186 .
Göke R, Barth P, Schmidt A, Samans B, Lankat-Buttgereit B (2004). «Программированный белок гибели клеток 4 подавляет CDK1/CDC2 путем индукции p21WAF1/CIP1». AJP: физиология клеток . 287 (6): C1541–6. doi : 10.1152/ajpcell.00025.2004 . PMID 15317660 . S2CID 83565566 .
Раш Дж, Мориц А., Ли Ка, Го А., Госс В.Л., Спек Э.Дж., Чжан Х., Чжа XM, Полакевич Р.Д., Комп М.Дж. (2004). «Иммуноаффиническое профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nature Biotechnology . 23 (1): 94–101. doi : 10.1038/nbt1046 . PMID 15592455 . S2CID 7200157 .
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, et al. (2005). «На пути к масштабе протеома карты сети взаимодействия белка-белка-белка» ». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005natur.437.1173r . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
Palamarchuk, Efanov A, Maximov V, Aqeilan RI, Croce CM, Pekarsky Y (2005). «AKT фосфорилирует и регулирует белок супрессора опухоли PDCD4 » РАНКА 65 (24): 11282–6 Doi : 10.1158/0008-5472.can- 05-3 PMID 16357133
Ян Х.С., Мэтьюз С.П., Клер Т., Ван К., Бейкер А.Р., Ли К.К., Тан Т.Х., Колберн Н.Х. (2006). «Окружающий супрессор PDCD4 подавляет экспрессию митоген-активируемой протеинкиназы киназы киназы киназы для подавления инвазии клеток карциномы толстой кишки» . Молекулярная и клеточная биология . 26 (4): 1297–306. doi : 10.1128/mcb.26.4.1297-1306.2006 . PMC 1367180 . PMID 16449643 .

Эта статья о гене на хромосоме человека 10 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000150593 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000024975 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid9759869-5] Azzoni L, Zatsepina O, Abebe B, Bennett IM, Kanakaraj P, Perussia B (1998). «Дифференциальная регуляция транскрипции CD161 и нового гена, 197/15a, IL-2, IL-15 и IL-12 в NK и T-клетках». Журнал иммунологии . 161 (7): 3493–500. doi : 10.4049/jimmunol.161.7.3493 . PMID 9759869 . S2CID 21776266 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} Entrezgene 27250

[7] Франкель Л.Б., Кристофферсен Н.Р., Якобсен А., Линдоу М., Крог А., Лунд А.Х. (2008). «Запрограммированная гибель клеток 4 (PDCD4) является важной функциональной мишенью микроРНК MIR-21 в клетках рака молочной железы» . Журнал биологической химии . 283 (2): 1026–33. doi : 10.1074/jbc.m707224200 . PMID 17991735 .

[pmid12054647-8] Jump up to: ^а ^{беременный} Kang MJ, Ahn HS, Lee Jy, Matsuhashi S, Park Wy (2002). «Повышение регуляции PDCD4 в стареющему человеческому диплоидным фибробластам». Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 293 (1): 617–21. doi : 10.1016/s0006-291x (02) 00264-4 . PMID 12054647 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]