Рибосомный белок 40 -х годов S13

RPS13
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 4KZY, 3J7R, 4D61, 4KZX, 4D5L, 5FLX, 4UJD, 3J7P, 4KZZ, 4UJE, 4UJC
Идентификаторы
Псевдонимы	RPS13 , S13, рибосомный белок S13
Внешние идентификаторы	Омим : 180476 ; MGI : 1915302 ; Гомологен : 128182 ; GeneCards : RPS13 ; OMA : RPS13 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	17,077,715 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	115,933,430 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	monocyte; ; ganglionic eminence; ; lymph node; ; left ovary; ; right ovary; ; canal of the cervix; ; gonad; ; gallbladder; ; uterine tube; ; endometrium;
	Top expressed in
	epiblast; ; embryo; ; embryo; ; lens; ; ventricular zone; ; spleen; ; ganglionic eminence; ; thymus; ; primary oocyte; ; neural tube;
	More reference expression data
	n/a
showДжин Онтология
Molecular function	small ribosomal subunit rRNA binding; structural constituent of ribosome; protein binding; mRNA binding; 5.8S rRNA binding; RNA binding; mRNA 5'-UTR binding;
Cellular component	cytosol; ribosome; membrane; focal adhesion; intracellular anatomical structure; cytosolic small ribosomal subunit; nucleolus; extracellular exosome; nucleus; nucleoplasm; extracellular matrix; postsynaptic density;
Biological process	viral transcription; SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; translational initiation; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; negative regulation of RNA splicing; protein biosynthesis; rRNA processing;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6207
	68052
	ENSG00000110700
	Ensmusg00000090862
	P62277
	P62301
	NM_001017
	NM_026533
	NP_001008
	NP_080809
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Рибосомный белок 40S S13 - это белок , который у людей кодируется RPS13 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Рибосомы , органеллы , которые катализируют синтез белка , состоят из небольших субъединиц 40 -х годов и субъединицы больших 60 -х годов . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и приблизительно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомный белок , который является компонентом субъединицы 40 -х годов. Белок принадлежит к семейству рибосомных белков S15P. Он расположен в цитоплазме . Было показано, что белок связывается с 5,8S рРНК у крыс. Ген -продукт ортолога E. coli (рибосомный белок S15) функционирует на ранних этапах сборки рибосом. Этот ген совместно транскрибируется с двумя U14 небольшими генами нуклеолярной РНК , которые расположены в его третьем и пятом интронах. Как типично для генов, кодирующих рибосомные белки, существует множественные обработанные псевдогены этого гена, диспергированные через геном. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что RPS13 взаимодействует с PDCD4 . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000110700 - Ensembl , май 2017
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000090862 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Chadeneau C, Lemoullac B, Denis Mg (август 1993). «Клонирование и анализ кДНК рибосомного белка человека S13» . Нуклеиновые кислоты Res . 21 (12): 2945. DOI : 10.1093/NAR/21.12.2945 . PMC 309694 . PMID 8332508 .
^ Кенмочи Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Е., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т, Пейдж Д.К. (август 1998). «Карта 75 человеческих рибосомных генов белка» . Геном Res . 8 (5): 509–23. doi : 10.1101/gr.8.5.509 . PMID 9582194 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: рибосомный белок RPS13 S13» .
^ Kang MJ, Ahn HS, Lee Jy, Matsuhashi S, Park Wy (апрель 2002 г.). «Повышение регуляции PDCD4 в стареющему человеческому диплоидным фибробластам». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 293 (1): 617–21. doi : 10.1016/s0006-291x (02) 00264-4 . PMID 12054647 .

Дальнейшее чтение

Wool Ig, Chan YL, Glück A (1996). «Структура и эволюция рибосомных белков млекопитающих». Биохимия. Клеточная биол . 73 (11–12): 933–47. doi : 10.1139/O95-101 . PMID 8722009 .
Suzuki K, Olvera J, Wool IG (1990). «Первичная структура рибосомного белка крысы S13». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 171 (2): 519–24. doi : 10.1016/0006-291x (90) 91176-S . PMID 2403345 .
Владимиров С.Н., Иванов А.В., Карпова Г.Г. и др. (1996). «Характеристика белков с малой рибосом-субъединицей человека с помощью N-концевого и внутреннего секвенирования и масс-спектрометрии» . Евро. J. Biochem . 239 (1): 144–9. doi : 10.1111/j.1432-1033.1996.0144u.x . PMID 8706699 .
Кенмочи Н., Хига С., Йошихама М., Танака Т. (1996). «U14 Snornas кодируются в интронах гена рибосомного белка человека S13». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 228 (2): 371–4. doi : 10.1006/bbrc.1996.1668 . PMID 8920921 .
Caldwell GM, Eddy RL, Day CD, et al. (2001). «Картирование генов и транскрибированных последовательностей в области богатой генов 400 т. Д. на хромосоме человека 11p15.1 → P14». Цитогенет. Клеточная генера . 92 (1–2): 103–7. doi : 10.1159/000056877 . PMID 11306805 . S2CID 46081338 .
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, et al. (2002). «Переданный протеомный анализ человеческого ядры» . Карт Биол . 12 (1): 1–11. Bibcode : 2002cbio ... 12 .... 1a . doi : 10.1016/s0960-9822 (01) 00650-9 . PMID 11790298 . S2CID 14132033 .
Kang MJ, Ahn HS, Lee Jy, et al. (2002). «Повышение регуляции PDCD4 в стареющему человеческому диплоидным фибробластам». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 293 (1): 617–21. doi : 10.1016/s0006-291x (02) 00264-4 . PMID 12054647 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Lundgren J, Masson P, Realini CA, Young P (2003). «Использование РНК -интерференции и комплементации для изучения функции субъединицы протеасомы Drosophila и человека 26S S13» . Мол Клетка. Биол . 23 (15): 5320–30. doi : 10.1128/mcb.23.15.5320-5330.2003 . PMC 165711 . PMID 12861018 .
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, et al. (2004). «Физическая и функциональная карта человеческого пути передачи сигнала TNF-альфа/NF-Kappa B». НАТ Клеточная биол . 6 (2): 97–105. doi : 10.1038/ncb1086 . PMID 14743216 . S2CID 11683986 .
Shi Y, Zhai H, Wang X, et al. (2004). «Рибосомальные белки S13 и L23 способствуют устойчивости к множественной лекарственной устойчивости в раковых клетках желудка путем подавления вызванного препаратом апоптоз». Эксплуат Ячейка . 296 (2): 337–46. doi : 10.1016/j.yexcr.2004.02.009 . PMID 15149863 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «Статус, качество и расширение полноразмерного проекта кДНК NIH: коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Res . 14 (10b): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Rush J, Moritz A, Lee Ka, et al. (2005). «Иммуноаффиническое профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». НАТ Биотехнол . 23 (1): 94–101. doi : 10.1038/nbt1046 . PMID 15592455 . S2CID 7200157 .
Малигин А., Парахневич Н., Карпова Г. (2005). «Рибосомальный белок человека S13: клонирование, экспрессия, рефолдирование и структурная стабильность». Биохим. Биофиз. Акт . 1747 (1): 93–7. doi : 10.1016/j.bbapap.2004.10.001 . PMID 15680243 .
Yu Y, Ji H, Doudna JA, Leary JA (2005). «Масс-спектрометрический анализ рибосомальной субъединицы 40-х годов: нативные и HCV-связанные комплексы» . Белок Sci . 14 (6): 1438–46. doi : 10.1110/ps.041293005 . PMC 2253395 . PMID 15883184 .
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). «На пути к масштабе протеома карты взаимодействия белкового белка человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005natur.437.1173r . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). «Глобальная динамика фосфорилирования в Global, in vivo и сайт в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Uniprot : P62277 (рибосомный белок 40S S13) в PDBE-KB .

Эта связанная с белком статья является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000110700 - Ensembl , май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000090862 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid8332508-5] Chadeneau C, Lemoullac B, Denis Mg (август 1993). «Клонирование и анализ кДНК рибосомного белка человека S13» . Нуклеиновые кислоты Res . 21 (12): 2945. DOI : 10.1093/NAR/21.12.2945 . PMC 309694 . PMID 8332508 .

[pmid9582194-6] Кенмочи Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Е., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т, Пейдж Д.К. (август 1998). «Карта 75 человеческих рибосомных генов белка» . Геном Res . 8 (5): 509–23. doi : 10.1101/gr.8.5.509 . PMID 9582194 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: рибосомный белок RPS13 S13» .

[pmid12054647-8] Kang MJ, Ahn HS, Lee Jy, Matsuhashi S, Park Wy (апрель 2002 г.). «Повышение регуляции PDCD4 в стареющему человеческому диплоидным фибробластам». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 293 (1): 617–21. doi : 10.1016/s0006-291x (02) 00264-4 . PMID 12054647 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]