IPO13

IPO13
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2X19, 2XWU, 3ZJY
Идентификаторы
Псевдонимы	ИПО13 , ИМП13, КАП13, ЛГЛ2, РАНБП13, импорт 13
Внешние идентификаторы	Опустить : 610411 ; МГИ : 2385205 ; Гомологен : 40968 ; Генные карты : IPO13 ; ОМА : IPO13 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	43,968,022 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	117,772,196 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	C1 segment; ; gastrocnemius muscle; ; apex of heart; ; muscle of thigh; ; putamen; ; corpus callosum; ; right hemisphere of cerebellum; ; inferior ganglion of vagus nerve; ; right frontal lobe; ; external globus pallidus;
	Top expressed in
	muscle of thigh; ; neural layer of retina; ; skeletal muscle tissue; ; knee joint; ; medial head of gastrocnemius muscle; ; vastus lateralis muscle; ; extraocular muscle; ; temporal muscle; ; triceps brachii muscle; ; ankle;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; nuclear localization sequence binding;
Cellular component	nucleus; nuclear membrane; cytoplasm;
Biological process	protein import into nucleus; protein transport; intracellular protein transport;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9670
	230673
	ENSG00000117408
	ENSMUSG00000033365
	О94829
	Q8K0C1
	НМ_014652
	НМ_146152
	НП_055467
	НП_666264
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Импортин-13 — это белок , кодируемый геном IPO13 у человека. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Импортин-13 является членом семейства импортинов -β ядерных транспортных рецепторов (NTR) и впервые был идентифицирован как транспортный рецептор в 2000 году. ^{[ 8 ]} Согласно вторичной структуре PREDiction на основе PSI-бласта (PSIPRED), импортин-13 содержит 38 α-спиралей . ^{[ 9 ]} Импортин-13 вмещает целый ряд грузов благодаря своей гибкой суперспиральной структуре и системе связывания и высвобождения грузов, которая отличается от других импортин-подобных транспортных рецепторов. ^{[ 8 ]}^{[ 10 ]} IPO13 широко экспрессируется в различных тканях человеческого организма, включая сердце, ^{[ 11 ]} роговица, ^{[ 11 ]} легкие плода, ^{[ 11 ]} мозг, ^{[ 11 ]} рак эндометрия , ^{[ 11 ]} и яички. ^{[ 10 ]}

Ядерно-цитоплазматический транспорт

В эукариотических клетках макромолекулы размером более ~40 кДа активно транспортируются между ядерным и цитозольным компартментом через комплексы ядерных пор (NPC) через растворимые транспортные рецепторы. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 12 ]} Импортин-β-подобные факторы представляют собой самый крупный класс NTR и классифицируются как импортины или экспортины в зависимости от направления транспорта груза и их реакции на градиент RanGTP через ядерную оболочку . ^{[ 13 ]} Импортины загружают свои грузы в цитоплазму в отсутствие RanGTP и высвобождают свои грузы в ядре при связывании RanGTP. Экспортины связывают свои грузы в ядре в присутствии RanGTP и высвобождают свои грузы в цитоплазме при гидролизе RanGTP . ^{[ 8 ]}^{[ 11 ]}^{[ 13 ]} В отличие от других импортинов, импортин-13 представляет собой универсальный рецептор ядерного транспорта с двунаправленной транспортной способностью, так что он опосредует ядерный импорт определенных грузов и ядерный экспорт других грузов. Другими рецепторами ядерного транспорта, которые, как сообщается, облегчают как ядерный импорт, так и экспорт макромолекул, являются экспортин 5 (Msn5 в дрожжах) и экспортин 4. ^{[ 8 ]}

С-концевая дуга большинства импортинов является основным местом связывания грузов. Благодаря своей двунаправленной транспортной способности различные регионы импортина-13 взаимодействуют с грузами, облегчая импорт или экспорт. Например, фермент конъюгации убиквитина 9 ( Ubc9 ) в первую очередь взаимодействует с N-концевой областью, ^{[ 8 ]} и характеристика кристаллических структур импортина-13 показывает, что почти все известные ядерные импортные грузы связываются с его N-концевыми областями. ^{[ 10 ]} Низкие общие или активные концентрации импортина-13 в ядре показывают, что импортин-13 является фактором, ограничивающим скорость ядерного импорта и экспорта белков-грузов. ^{[ 8 ]}

Взаимодействия

Идентифицировано по меньшей мере 255 субстратов импортина-13. По данным Baade et al., основными импортными грузами импортина-13 являются Ubc9, CHRAC1 и POLE3 . ^{[ 8 ]} Другими известными импортными грузами импортина-13 являются MAGOH , ^{[ 8 ]} НФЮБ , ^{[ 8 ]} ДР1 , ^{[ 8 ]} ДРАП1 , ^{[ 8 ]} РБМ8 , ^{[ 14 ]} гомеодоменные транскрипционные факторы парного типа (TF), ^{[ 14 ]} миоподинм, ^{[ 14 ]} глюкокортикоидный рецептор (ГР), ^{[ 14 ]} РФПЛ3 , ^{[ 11 ]} и комплекс РБМ8-МГН. ^{[ 15 ]} Основным экспортным грузом импортина-13 является EIF1A. ^{[ 8 ]} Другие известные экспортные грузы импортина-13 включают HMG20A. ^{[ 11 ]} и E1F4G2 . ^{[ 10 ]} Кроме того, импортин-13 регулирует ядерный экспорт факторов транскрипции SPI и KLF4 в условиях окислительного стресса. ^{[ 12 ]}

Некоторые импортные грузы импортина-13 связываются с импортином-13 только в виде гетеродимеров , и никакого взаимодействия только с мономерами не наблюдается. ^{[ 8 ]} например, с ядерным импортом комплекса NF-YB/NF-YC. ^{[ 13 ]} Уолтер и др. продемонстрировали, что импортин-13 опосредует ядерный импорт пар гистонов CHRAC-15/17 и p12/CHRAC-17 только в гетеродимеризованных формах этих субстратов. Кроме того, платформа связывания импортина-13 включает положительно заряженные аминокислоты, консервативные между субъединицами гистоновых складок, что позволяет предположить, что связывание и транспортировка гетеродимеров через импортин-13 управляются электростатическими взаимодействиями . ^{[ 9 ]}

Функция

Импортин-13 играет важную роль в регуляции развития мозга и легких. ^{[ 10 ]} сперматогенез и спермиогенез , ^{[ 10 ]} дифференцировка эмбриональных стволовых клеток , ^{[ 16 ]} ядерный импорт c-Jun в клетки меланомы, ^{[ 17 ]} и транскрипционный ответ на окислительный стресс . ^{[ 12 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000117408 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033365 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Миядзима Н., Танака А. и др. (октябрь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XI. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 5 (5): 277–286. дои : 10.1093/dnares/5.5.277 . ПМИД 9872452 .
^ Мингот Дж. М., Костка С., Крафт Р., Хартманн Э., Герлих Д. (июль 2001 г.). «Импортин 13: новый посредник ядерного импорта и экспорта» . Журнал ЭМБО . 20 (14): 3685–3694. дои : 10.1093/emboj/20.14.3685 . ПМК 125545 . ПМИД 11447110 .
^ «Ген Энтрез: импортин IPO13 13» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н Бааде И., Шпилнер С., Шмитт К., Валериус О., Келенбах Р.Х. (июль 2018 г.). «Расширенная идентификация и глубокая проверка грузов импортина 13» . Молекулярная и клеточная протеомика . 17 (7): 1337–1353. дои : 10.1074/mcp.ra118.000623 . ПМК 6030721 . ПМИД 29666159 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Уокер П., Денеке Д., Кале Дж. (апрель 2009 г.). «Импортин 13 опосредует ядерный импорт гетеродимеров комплекса доступности хроматина, содержащих гистоновую складку» . Журнал биологической химии . 284 (17): 11652–11662. дои : 10.1074/jbc.m806820200 . ПМК 2670169 . ПМИД 19218565 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж [ PubMed ] Фатима С., Вагстафф К.М., Лиу К.Г., Дэвис Р.Г., Танака С.С., Ямагути Ю.Л. и др. (март 2017 г.). «Интерактом ингибирующей изоформы ядерного транспортера Импортина 13» . Биохимия и биофизика Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1864 (3): 546–561. дои : 10.1016/j.bbamcr.2016.12.017 . ПМИД 27993670 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час Зохуд Б.А., Го П., Зохуд Б.А., Ли Ф., Хао Дж.Дж., Шань X и др. (октябрь 2020 г.). «Импортин 13 способствует прогрессированию НМРЛ, опосредуя ядерную транслокацию RFPL3 и усиление экспрессии hTERT» . Смерть клеток и болезни . 11 (10): 879. doi : 10.1038/s41419-020-03101-9 . ПМЦ 7575581 . ПМИД 33082305 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Гаевска К.А., Лескесен Х., Рамиалисон М., Вагстафф К.М., Янс Д.А. (октябрь 2021 г.). «Ядерный транспортер импортин-13 играет ключевую роль в транскрипционной реакции на окислительный стресс» . Природные коммуникации . 12 (1): 5904. Бибкод : 2021NatCo..12.5904G . дои : 10.1038/s41467-021-26125-x . ПМК 8501021 . ПМИД 34625540 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Кале Дж., Бааке М., Денеке Д., Альбиг В. (июль 2005 г.). «Субъединицы гетеротримерного транскрипционного фактора NF-Y импортируются в ядро разными путями, включающими импортин бета и импортин 13» . Молекулярная и клеточная биология . 25 (13): 5339–5354. дои : 10.1128/mcb.25.13.5339-5354.2005 . ПМК 1157003 . ПМИД 15964792 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Тао Т., Лан Дж., Лукач Г.Л., Хаче Р.Дж., Каплан Ф. (декабрь 2006 г.). «Импортин 13 регулирует ядерный импорт глюкокортикоидного рецептора в эпителиальные клетки дыхательных путей». Американский журнал респираторной клеточной и молекулярной биологии . 35 (6): 668–680. дои : 10.1165/rcmb.2006-0073OC . OCLC 869605347 . ПМИД 16809634 .
^ Мингот Дж. М., Костка С., Крафт Р., Хартманн Э., Герлих Д. (июль 2001 г.). «Импортин 13: новый посредник ядерного импорта и экспорта» . Журнал ЭМБО . 20 (14): 3685–3694. дои : 10.1093/emboj/20.14.3685 . ПМК 125545 . ПМИД 11447110 .
^ Фатима С., Вагстафф К.М., Лим С.М., Поло Дж.М., Янг Дж.К., Янс Д.А. (январь 2021 г.). «Ядерный транспортер импортин 13 имеет решающее значение для выживания клеток во время дифференцировки эмбриональных стволовых клеток». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 534 : 141–148. дои : 10.1016/j.bbrc.2020.11.099 . ПМИД 33333437 . S2CID 229316304 .
^ Каппельманн-Фенцль М., Куфал С., Крупар Р., Шадендорф Д., Уманский В., Вардимон Л. и др. (ноябрь 2019 г.). «Образование комплекса с мономерным α-тубулином и импортином 13 способствует стабильности белка c-Jun и необходимо для ядерной транслокации и активности c-Jun» . Раки . 11 (11): 1806. doi : 10.3390/cancers11111806 . ПМК 6895814 . ПМИД 31744174 .

Дальнейшее чтение

Плоски Дж.Э., Шамшер М.К., Раду А. (июнь 2004 г.). «Факторы транскрипции гомеодомена парного типа импортируются в ядро кариоферином 13» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (11): 4824–4834. дои : 10.1128/MCB.24.11.4824-4834.2004 . ПМК 416398 . ПМИД 15143176 .
Чжан С., Суизи Н.Б., Ганьон С., Маскат Б., Келер Д., Пост М., Каплан Ф. (апрель 2000 г.). «Новый гомолог кариоферина-бета регулируется в легких плода с точки зрения развития и гормонально». Американский журнал респираторной клеточной и молекулярной биологии . 22 (4): 451–459. дои : 10.1165/ajrcmb.22.4.3929 . ПМИД 10745026 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000117408 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033365 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9872452-5] Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Миядзима Н., Танака А. и др. (октябрь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XI. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 5 (5): 277–286. дои : 10.1093/dnares/5.5.277 . ПМИД 9872452 .

[pmid11447110-6] Мингот Дж. М., Костка С., Крафт Р., Хартманн Э., Герлих Д. (июль 2001 г.). «Импортин 13: новый посредник ядерного импорта и экспорта» . Журнал ЭМБО . 20 (14): 3685–3694. дои : 10.1093/emboj/20.14.3685 . ПМК 125545 . ПМИД 11447110 .

[entrez-7] «Ген Энтрез: импортин IPO13 13» .

[Baade_2018-8] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н Бааде И., Шпилнер С., Шмитт К., Валериус О., Келенбах Р.Х. (июль 2018 г.). «Расширенная идентификация и глубокая проверка грузов импортина 13» . Молекулярная и клеточная протеомика . 17 (7): 1337–1353. дои : 10.1074/mcp.ra118.000623 . ПМК 6030721 . ПМИД 29666159 .

[Walker_2009-9] Jump up to: ^а ^б ^с Уокер П., Денеке Д., Кале Дж. (апрель 2009 г.). «Импортин 13 опосредует ядерный импорт гетеродимеров комплекса доступности хроматина, содержащих гистоновую складку» . Журнал биологической химии . 284 (17): 11652–11662. дои : 10.1074/jbc.m806820200 . ПМК 2670169 . ПМИД 19218565 .

[Fatima_2017-10] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж [ PubMed ] Фатима С., Вагстафф К.М., Лиу К.Г., Дэвис Р.Г., Танака С.С., Ямагути Ю.Л. и др. (март 2017 г.). «Интерактом ингибирующей изоформы ядерного транспортера Импортина 13» . Биохимия и биофизика Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1864 (3): 546–561. дои : 10.1016/j.bbamcr.2016.12.017 . ПМИД 27993670 .

[Zohud_2020-11] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час Зохуд Б.А., Го П., Зохуд Б.А., Ли Ф., Хао Дж.Дж., Шань X и др. (октябрь 2020 г.). «Импортин 13 способствует прогрессированию НМРЛ, опосредуя ядерную транслокацию RFPL3 и усиление экспрессии hTERT» . Смерть клеток и болезни . 11 (10): 879. doi : 10.1038/s41419-020-03101-9 . ПМЦ 7575581 . ПМИД 33082305 .

[Gajewska_2021-12] Jump up to: ^а ^б ^с Гаевска К.А., Лескесен Х., Рамиалисон М., Вагстафф К.М., Янс Д.А. (октябрь 2021 г.). «Ядерный транспортер импортин-13 играет ключевую роль в транскрипционной реакции на окислительный стресс» . Природные коммуникации . 12 (1): 5904. Бибкод : 2021NatCo..12.5904G . дои : 10.1038/s41467-021-26125-x . ПМК 8501021 . ПМИД 34625540 .

[Kahle_2005-13] Jump up to: ^а ^б ^с Кале Дж., Бааке М., Денеке Д., Альбиг В. (июль 2005 г.). «Субъединицы гетеротримерного транскрипционного фактора NF-Y импортируются в ядро разными путями, включающими импортин бета и импортин 13» . Молекулярная и клеточная биология . 25 (13): 5339–5354. дои : 10.1128/mcb.25.13.5339-5354.2005 . ПМК 1157003 . ПМИД 15964792 .

[Tao_2006-14] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Тао Т., Лан Дж., Лукач Г.Л., Хаче Р.Дж., Каплан Ф. (декабрь 2006 г.). «Импортин 13 регулирует ядерный импорт глюкокортикоидного рецептора в эпителиальные клетки дыхательных путей». Американский журнал респираторной клеточной и молекулярной биологии . 35 (6): 668–680. дои : 10.1165/rcmb.2006-0073OC . OCLC 869605347 . ПМИД 16809634 .

[15] Мингот Дж. М., Костка С., Крафт Р., Хартманн Э., Герлих Д. (июль 2001 г.). «Импортин 13: новый посредник ядерного импорта и экспорта» . Журнал ЭМБО . 20 (14): 3685–3694. дои : 10.1093/emboj/20.14.3685 . ПМК 125545 . ПМИД 11447110 .

[16] Фатима С., Вагстафф К.М., Лим С.М., Поло Дж.М., Янг Дж.К., Янс Д.А. (январь 2021 г.). «Ядерный транспортер импортин 13 имеет решающее значение для выживания клеток во время дифференцировки эмбриональных стволовых клеток». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 534 : 141–148. дои : 10.1016/j.bbrc.2020.11.099 . ПМИД 33333437 . S2CID 229316304 .

[17] Каппельманн-Фенцль М., Куфал С., Крупар Р., Шадендорф Д., Уманский В., Вардимон Л. и др. (ноябрь 2019 г.). «Образование комплекса с мономерным α-тубулином и импортином 13 способствует стабильности белка c-Jun и необходимо для ядерной транслокации и активности c-Jun» . Раки . 11 (11): 1806. doi : 10.3390/cancers11111806 . ПМК 6895814 . ПМИД 31744174 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]