Фактор XIII

фактор свертывания крови XIII,
полипептид B
фактор свертывания крови XIII, ; полипептид B
Идентификаторы
Символ	F13B
ген NCBI	2165
HGNC	3534
МОЙ БОГ	134580
RefSeq	НМ_001994
ЮниПрот	P05160
Другие данные
Локус	1 q31-q32.1
Structures
показывать Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

показывать Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

фактор свертывания крови XIII,
Полипептид А1
фактор свертывания крови XIII, ; Полипептид А1
	Неактивный гомодимер пептида А1, все домены и основные каталитические остатки показаны разными цветами.
Идентификаторы
Символ	Ф13А1
Альт. символы	Ф13А
ген NCBI	2162
HGNC	3531
МОЙ БОГ	134570
RefSeq	НМ_000129
ЮниПрот	P00488
Другие данные
Номер ЕС	2.3.2.13
Локус	Хр. 6 п24.2-п23
Structures
показывать Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

Фактор XIII , или фактор стабилизации фибрина , представляет собой белок плазмы и зимоген . Он активируется тромбином до фактора XIIIa , который сшивает фибрин при коагуляции . Дефицит XIII ухудшает стабильность сгустка и увеличивает склонность к кровотечениям. ^{[ 1 ]}

Человек XIII представляет собой гетеротетрамер . Он состоит из 2 ферментативных пептидов А и 2 неферментативных пептидов В. XIIIa представляет собой димер активированных пептидов А. ^{[ 1 ]}

Функция

В крови тромбины расщепляют фибриногены до фибринов во время коагуляции, и на основе фибрина образуется сгусток крови. Фактор XIII представляет собой трансглутаминазу , которая циркулирует в крови человека в виде гетеротетрамера , состоящего из двух субъединиц А и двух субъединиц В. Фактор XIII связывается со сгустком через свои B-единицы. В присутствии фибринов тромбин эффективно расщепляет R 37– G 38 пептидную связь каждого звена А внутри XIII тетрамера. Единицы A высвобождают свои N-концевые активационные пептиды . ^{[ 1 ]}

Обе нековалентно связанные единицы B теперь способны диссоциировать от тетрамера с помощью ионов кальция (Ca ²⁺) в крови; эти ионы также активируют оставшийся димер из двух единиц А посредством конформационного изменения. ^{[ 1 ]}

Фактор XIIIa (димер двух активных единиц А) сшивает фибрины внутри сгустка, образуя изопептидные связи между различными глютаминами и лизинами фибринов. Эти связи делают тромб физически более прочным и защищают его от преждевременного ферментативного разрушения ( фибринолиза ). ^{[ 1 ]}

У человека плазмин , антитромбин и TFPI являются наиболее значимыми протеолитическими ингибиторами активного фактора XIIIa. α2-макроглобулин является значимым непротеолитическим ингибитором. ^{[ 1 ]}

Активационные пептиды (розовые) единиц А удаляются тромбином (IIa) в присутствии фибрина. Единицы B (серые) высвобождаются с помощью кальция, а димер единицы A активируется (формы XIIIa).
XIIIa сшивает фибрин (упрощенное изображение)

Генетика

Человеческий фактор XIII состоит из субъединиц А и В. субъединицы Ген F13A1 . Он находится на хромосоме 6 в позиции 6p24–25. Его размер превышает 160 т.п.н. , он имеет 14 интронов и 15 экзонов . Его мРНК имеет размер 3,9 т.п.н. Он имеет 5'-UTR размером 84 п.н. и 3'-UTR размером 1,6 кб.п. F13A1 Экзон(ы) ^{[ 1 ]}

1 код 5' UTR
пептид активации 2-кода
2–4 код β-сэндвич
4–12 код каталитического домена
12–13 код β-ствол 1
13–15 код β-ствол 2

Ген субъединицы B представляет собой F13B . Он находится на хромосоме 1 в позиции 1q31–32.1. Он занимает 28 т.п.н., имеет 11 интронов и 12 экзонов. Его мРНК имеет размер 2,2 т.п.н. Экзон 1 кодирует 5'-UTR. Экзоны 2–12 кодируют 10 различных доменов суши . ^{[ 1 ]}

Структура

Фактор XIII крови человека представляет собой гетеротетрамер двух линейных полипептидов A и двух B, или «единиц». А-единицы потенциально каталитические; Единицы B — нет. Единицы образуют димерный центр. Нековалентно связанные единицы B образуют кольцевую структуру вокруг центра. Единицы B удаляются, когда XIII активируется до XIIIa. Димеры, содержащие только звенья А, также встречаются внутри клеток, таких как тромбоциты . В крови также встречаются большие количества единичных единиц B (мономеров). Известно, что эти димеры и мономеры не участвуют в коагуляции, тогда как тетрамеры участвуют. ^{[ 1 ]}

Единицы А имеют массу около 83 кДа , 731 аминокислотный остаток, 5 белковых доменов (указаны от N-концевого до С-концевого , номера остатков указаны в скобках): ^{[ 1 ]}

пептид активации (1–37)
β-сэндвич (38–184)
каталитический домен (185–515), в котором остатки C 314, H 373, D 396 и W 279 участвуют в катализе
β-ствол 1 (516–628)
β-ствол 2 (629–731)

Единицы B представляют собой гликопротеины . Каждый имеет массу около 80 кДа (8,5% массы приходится на углеводы ), 641 остаток и 10 суши-доменов . Каждый домен имеет около 60 остатков и 2 внутренние дисульфидные связи . ^{[ 1 ]}

Физиология

Субъединицы человеческого фактора XIII производятся преимущественно тромбоцитами и другими клетками костномозгового происхождения. Субъединицы B секретируются гепатоцитами в кровь . Единицы A и B объединяются в крови с образованием гетеротетрамеров из двух единиц A и двух единиц B. в плазме крови Концентрация гетеротетрамеров составляет 14–48 мг/л, период полувыведения – 9–14 дней. ^{[ 1 ]}

Сгусток, не стабилизированный FXIIIa, растворим в мочевине с концентрацией 5 моль/л , тогда как стабилизированный сгусток устойчив к этому явлению. ^{[ 2 ]}

Дефицит фактора XIII

Дефицит фактора XIII , хотя, как правило, встречается редко, при этом в Иране наблюдается самый высокий уровень заболеваемости этим заболеванием в мире - 473 случая. В городе Хаш , расположенном в провинциях Систан и Белуджистан , самый высокий уровень заболеваемости в Иране, с высоким уровнем кровнородственных браков. ^{[ 3 ]}

Диагностическое использование

Уровни фактора XIII не измеряются рутинно, но могут рассматриваться у пациентов с необъяснимой склонностью к кровотечениям. Поскольку фермент весьма специфичен по отношению к моноцитам и макрофагам , определение присутствия фактора XIII может быть использовано для выявления и классификации злокачественных заболеваний с участием этих клеток. ^{[ 4 ]}

Открытие

Дефицит фактора XIII также известен как фактор Лаки-Лорана, в честь Калмана Лаки и Ласло Лоранда , ученых, которые впервые предположили его существование в 1948 году. ^{[ 2 ]} Конференция 2005 года рекомендовала стандартизировать номенклатуру. ^{[ 4 ]}

См. также

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л Мушбек Л., Беречки З., Баголи З., Комароми И., Катона Э (июль 2011 г.). «Фактор XIII: фактор свертывания крови с множеством плазменных и клеточных функций». Физиологические обзоры . 91 (3): 931–72. doi : 10.1152/physrev.00016.2010 . ПМИД 21742792 . S2CID 24703788 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Лаки К., Лоранд Л. (сентябрь 1948 г.). «О растворимости сгустков фибрина». Наука . 108 (2802): 280. Бибкод : 1948Sci...108..280L . дои : 10.1126/science.108.2802.280 . ПМИД 17842715 .
^ Доргалале А., Надери М., Хоссейни М.С., Ализаде С., Хоссейни С., Табибиан С. и др. (2015). «Дефицит фактора XIII в Иране: комплексный обзор литературы. Семинары по тромбозу и гемостазу». 41 (3): 323–29. {{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется |journal= ( помощь )
^ Перейти обратно: ^а ^б Мушбек Л., Ариенс Р.А., Ичиносе А. (январь 2007 г.). «Фактор XIII: рекомендуемые термины и сокращения» . Журнал тромбозов и гемостаза . 5 (1): 181–83. дои : 10.1111/j.1538-7836.2006.02182.x . ПМИД 16938124 . S2CID 20424049 .

Внешние ссылки

[a-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л Мушбек Л., Беречки З., Баголи З., Комароми И., Катона Э (июль 2011 г.). «Фактор XIII: фактор свертывания крови с множеством плазменных и клеточных функций». Физиологические обзоры . 91 (3): 931–72. doi : 10.1152/physrev.00016.2010 . ПМИД 21742792 . S2CID 24703788 .

[Laki-2] Перейти обратно: ^а ^б Лаки К., Лоранд Л. (сентябрь 1948 г.). «О растворимости сгустков фибрина». Наука . 108 (2802): 280. Бибкод : 1948Sci...108..280L . дои : 10.1126/science.108.2802.280 . ПМИД 17842715 .

[3] Доргалале А., Надери М., Хоссейни М.С., Ализаде С., Хоссейни С., Табибиан С. и др. (2015). «Дефицит фактора XIII в Иране: комплексный обзор литературы. Семинары по тромбозу и гемостазу». 41 (3): 323–29. {{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется |journal= ( помощь )

[Muszbek-4] Перейти обратно: ^а ^б Мушбек Л., Ариенс Р.А., Ичиносе А. (январь 2007 г.). «Фактор XIII: рекомендуемые термины и сокращения» . Журнал тромбозов и гемостаза . 5 (1): 181–83. дои : 10.1111/j.1538-7836.2006.02182.x . ПМИД 16938124 . S2CID 20424049 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

v т и Трансферазы : ацилтрансферазы ( EC 2.3)
2.3.1: other than amino-acyl groups	acetyltransferases: Acetyl-Coenzyme A acetyltransferase N-Acetylglutamate synthase Choline acetyltransferase Dihydrolipoyl transacetylase Acetyl-CoA C-acyltransferase Beta-galactoside transacetylase Chloramphenicol acetyltransferase N-acetyltransferase Serotonin N-acetyl transferase HGSNAT ARD1A Histone acetyltransferase P300/CBP NAT2 palmitoyltransferases: Carnitine O-palmitoyltransferase CPT1 CPT2 Serine C-palmitoyltransferase SPTLC1 SPTLC2 other: Acyltransferase like 2 Aminolevulinic acid synthase Beta-ketoacyl-ACP synthase Glyceronephosphate O-acyltransferase Lecithin—cholesterol acyltransferase Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 2-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase ABHD5
2.3.2: Aminoacyltransferases	Gamma-glutamyl transpeptidase Peptidyl transferase Transglutaminase Tissue transglutaminase Keratinocyte transglutaminase Factor XIII
2.3.3: converted into alkyl on transfer	Citrate synthase Decylcitrate synthase Citrate (Re)-synthase Decylhomocitrate synthase 2-methylcitrate synthase 2-ethylmalate synthase 3-ethylmalate synthase ATP citrate lyase Malate synthase HMG-CoA synthase HMGCS2 2-hydroxyglutarate synthase 3-propylmalate synthase 2-isopropylmalate synthase Homocitrate synthase Sulfoacetaldehyde acetyltransferase

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)