HMGCS2

HMGCS2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	2WYA
Идентификаторы
Псевдонимы	HMGCS2 , 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-синтаза 2
Внешние идентификаторы	Опустить : 600234 ; МГИ : 101939 ; Гомологен : 38066 ; Генные карты : HMGCS2 ; OMA : HMGCS2 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	119,768,905 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	98,218,054 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right lobe of liver; ; mucosa of transverse colon; ; jejunal mucosa; ; rectum; ; mucosa of sigmoid colon; ; duodenum; ; renal medulla; ; human kidney; ; thoracic diaphragm; ; apex of heart;
	Top expressed in
	left lobe of liver; ; lumbar spinal ganglion; ; Stroma of ovary; ; migratory enteric neural crest cell; ; retinal pigment epithelium; ; duodenum; ; gastrula; ; tunica media of zone of aorta; ; vestibular sensory epithelium; ; sexually immature organism;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	transferase activity; catalytic activity; hydroxymethylglutaryl-CoA synthase activity;
Cellular component	mitochondrion; mitochondrial matrix;
Biological process	steroid metabolic process; sterol biosynthetic process; lipid metabolism; cholesterol metabolic process; isoprenoid biosynthetic process; cholesterol biosynthetic process; metabolism; steroid biosynthetic process; ketone body biosynthetic process; regulation of lipid metabolic process; acetyl-CoA metabolic process; farnesyl diphosphate biosynthetic process, mevalonate pathway;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	3158
	15360
	ENSG00000134240
	ENSMUSG00000027875
	P54868
	P54869
	НМ_001166107 ; НМ_005518
	НМ_008256
	НП_001159579 ; НП_005509
	НП_032282
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-синтаза 2 (митохондриальная) представляет собой фермент человека, кодируемый HMGCS2 геном . ^{[ 5 ]}

Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к семейству HMG-CoA-синтаз . Это митохондриальный фермент, который катализирует вторую и лимитирующую скорость реакцию кетогенеза , метаболический путь, который обеспечивает энергию, полученную из липидов, для различных органов во время лишения углеводов, например, при голодании, путем добавления третьей ацетильной группы к ацетоацетил-КоА. , производящая HMG-CoA. ^{[ 6 ]}

альтернативно сплайсированные варианты транскрипта, кодирующие разные изоформы. Для этого гена были обнаружены ^{[ 5 ]}

Клиническое значение

Мутации в этом гене связаны с дефицитом митохондриальной HMG-CoA-синтазы (также известной как HMGCS2D), что влияет на синтез кетоновых тел. ^{[ 7 ]} Пострадавшие пациенты не могут осуществлять кетогенез во время голодания и в периоды более высокой потребности в энергии, такие как лихорадка и энергичные физические упражнения. Обычно обнаруживается поражение сердечной мышцы и головного мозга, а также гипогликемия (не всегда присутствует). ^{[ 8 ]} и повышенная концентрация жирных кислот в крови. Смертность составляет 20%. ^{[ 9 ]} Анализ мочи на органические кислоты можно использовать для выявления вероятных случаев, которые в дальнейшем можно подтвердить с помощью секвенирования ДНК. ^{[ 10 ]}

возникновение

HMGCS2 не обнаружен у китообразных , слонов и летучих мышей Старого Света . Известно, что фруктовые летучие мыши очень чувствительны к голоданию, как и люди с HMGCS2D. Две другие группы, похоже, разработали другие способы борьбы с голодом. ^{[ 11 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000134240 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027875 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-синтаза 2 (митохондриальная)» .
^ Драббе С., Пельцер А., Слентер Д., Уиллигаген Э. (февраль 2023 г.). «Нарушения синтеза кетоновых тел (Homo sapiens)» . Вики-пути .
^ Аледо Р., Мир С., Далтон Р.Н., Тернер С., Пи Дж., Хегардт Ф.Г. и др. (февраль 2006 г.). «Уточнение диагностики дефицита митохондриальной HMG-CoA-синтазы». Журнал наследственных метаболических заболеваний . 29 (1): 207–211. дои : 10.1007/s10545-006-0214-2 . ПМИД 16601895 . S2CID 24866271 .
^ Конлон, штат Техас; Фицсаймонс, ЧП; Боровицкова, И; Кирби, Ф; Мерфи, С; Кнерр, я; Крашелл, Э. (сентябрь 2020 г.). «Гипогликемия не является определяющим признаком метаболического кризиса при дефиците митохондриальной 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-синтазы: дополнительные доказательства наличия специфических биохимических маркеров, которые могут помочь в диагностике» . Отчеты JIMD . 55 (1): 26–31. дои : 10.1002/jmd2.12146 . ПМЦ 7463059 . ПМИД 32905056 .
^ Дэн, Ма; Дэн, Ю (11 ноября 2018 г.). «Случай митохондриального дефицита 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-синтазы и обзор литературы» [Митохондриальный дефицит 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-синтазы: отчет о случае и литература). обзор]. Китайский журнал современной педиатрии (на китайском языке) 20 (11): 930–933 . 10.7499/ . ISSN 1008-8830 . PMC 7389032. j.issn.1008-8830.2018.11.010 PMID 30477625 .
^ Конлон, штат Техас; Фицсаймонс, ЧП; Боровицкова, И; Кирби, Ф; Мерфи, С; Кнерр, я; Крашелл, Э. (сентябрь 2020 г.). «Гипогликемия не является определяющим признаком метаболического кризиса при дефиците митохондриальной 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-синтазы: дополнительные доказательства наличия специфических биохимических маркеров, которые могут помочь в диагностике» . Отчеты JIMD . 55 (1): 26–31. дои : 10.1002/jmd2.12146 . ПМЦ 7463059 . ПМИД 32905056 .
^ Джебб Д., Хиллер М. (октябрь 2018 г.). «Периодическая потеря HMGCS2 показывает, что кетогенез не важен для эволюции мозга крупных млекопитающих» . электронная жизнь . 7 : е38906. doi : 10.7554/eLife.38906 . ПМК 6191284 . ПМИД 30322448 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P54868 (человеческая гидроксиметилглутарил-КоА-синтаза, митохондриальная) в PDBe-KB .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000134240 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027875 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-синтаза 2 (митохондриальная)» .

[6] Драббе С., Пельцер А., Слентер Д., Уиллигаген Э. (февраль 2023 г.). «Нарушения синтеза кетоновых тел (Homo sapiens)» . Вики-пути .

[7] Аледо Р., Мир С., Далтон Р.Н., Тернер С., Пи Дж., Хегардт Ф.Г. и др. (февраль 2006 г.). «Уточнение диагностики дефицита митохондриальной HMG-CoA-синтазы». Журнал наследственных метаболических заболеваний . 29 (1): 207–211. дои : 10.1007/s10545-006-0214-2 . ПМИД 16601895 . S2CID 24866271 .

[pmid32905056-8] Конлон, штат Техас; Фицсаймонс, ЧП; Боровицкова, И; Кирби, Ф; Мерфи, С; Кнерр, я; Крашелл, Э. (сентябрь 2020 г.). «Гипогликемия не является определяющим признаком метаболического кризиса при дефиците митохондриальной 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-синтазы: дополнительные доказательства наличия специфических биохимических маркеров, которые могут помочь в диагностике» . Отчеты JIMD . 55 (1): 26–31. дои : 10.1002/jmd2.12146 . ПМЦ 7463059 . ПМИД 32905056 .

[9] Дэн, Ма; Дэн, Ю (11 ноября 2018 г.). «Случай митохондриального дефицита 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-синтазы и обзор литературы» [Митохондриальный дефицит 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-синтазы: отчет о случае и литература). обзор]. Китайский журнал современной педиатрии (на китайском языке) 20 (11): 930–933 . 10.7499/ . ISSN 1008-8830 . PMC 7389032. j.issn.1008-8830.2018.11.010 PMID 30477625 .

[10] Конлон, штат Техас; Фицсаймонс, ЧП; Боровицкова, И; Кирби, Ф; Мерфи, С; Кнерр, я; Крашелл, Э. (сентябрь 2020 г.). «Гипогликемия не является определяющим признаком метаболического кризиса при дефиците митохондриальной 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-синтазы: дополнительные доказательства наличия специфических биохимических маркеров, которые могут помочь в диагностике» . Отчеты JIMD . 55 (1): 26–31. дои : 10.1002/jmd2.12146 . ПМЦ 7463059 . ПМИД 32905056 .

[11] Джебб Д., Хиллер М. (октябрь 2018 г.). «Периодическая потеря HMGCS2 показывает, что кетогенез не важен для эволюции мозга крупных млекопитающих» . электронная жизнь . 7 : е38906. doi : 10.7554/eLife.38906 . ПМК 6191284 . ПМИД 30322448 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

v т и Трансферазы : ацилтрансферазы ( EC 2.3)
2.3.1: other than amino-acyl groups	acetyltransferases: Acetyl-Coenzyme A acetyltransferase N-Acetylglutamate synthase Choline acetyltransferase Dihydrolipoyl transacetylase Acetyl-CoA C-acyltransferase Beta-galactoside transacetylase Chloramphenicol acetyltransferase N-acetyltransferase Serotonin N-acetyl transferase HGSNAT ARD1A Histone acetyltransferase P300/CBP NAT2 palmitoyltransferases: Carnitine O-palmitoyltransferase CPT1 CPT2 Serine C-palmitoyltransferase SPTLC1 SPTLC2 other: Acyltransferase like 2 Aminolevulinic acid synthase Beta-ketoacyl-ACP synthase Glyceronephosphate O-acyltransferase Lecithin—cholesterol acyltransferase Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 2-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase ABHD5
2.3.2: Aminoacyltransferases	Gamma-glutamyl transpeptidase Peptidyl transferase Transglutaminase Tissue transglutaminase Keratinocyte transglutaminase Factor XIII
2.3.3: converted into alkyl on transfer	Citrate synthase Decylcitrate synthase Citrate (Re)-synthase Decylhomocitrate synthase 2-methylcitrate synthase 2-ethylmalate synthase 3-ethylmalate synthase ATP citrate lyase Malate synthase HMG-CoA synthase HMGCS2 2-hydroxyglutarate synthase 3-propylmalate synthase 2-isopropylmalate synthase Homocitrate synthase Sulfoacetaldehyde acetyltransferase

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)