Малый ядерный рибонуклеопротеин полипептид А

СНРПА
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1AUD, 1DRZ, 1DZ5, 1FHT, 1M5K, 1M5O, 1M5P, 1M5V, 1NU4, 1OIA, 1SJ3, 1SJ4, 1SJF, 1U6B, 1URN, 1VBX, 1VBY, 1VBZ, 1VC0, 1VC5, 1VC6, 1ZZN, 2A3J, 2NZ4, 2OIH, 2OJ3, 2U1A, 3BO2, 3BO3, 3BO4, 3CUL, 3CUN, 3EGZ, 3G8S, 3G8T, 3G96, 3G9C, 3HHN, 3IIN, 3IRW, 3IWN, 3K0J, 3L3C, 3MUM, 3MUR, 3MUT, 3MUV, 3MXH, 3P49, 3PGW, 3R1H, 3R1L, 3UCU, 3UCZ, 3UD3, 3UD4, 4C4W, 4PR6, 4PRF, 4W90, 4YB1, 5DDO, 5DDR, 5DDQ, 5DDP, 5FJ4
Идентификаторы
Псевдонимы	SNRPA , Mud1, U1-A, U1A, малый ядерный рибонуклеопротеидный полипептид А
Внешние идентификаторы	Опустить : 182285 ; МГИ : 1855690 ; Гомологен : 3380 ; GeneCards : SNRPA ; ОМА : SNRPA – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	40,765,389 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	26,895,696 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ganglionic eminence; ; mucosa of transverse colon; ; left ovary; ; ventricular zone; ; canal of the cervix; ; right ovary; ; body of uterus; ; right lobe of thyroid gland; ; popliteal artery; ; tibial arteries;
	Top expressed in
	epiblast; ; yolk sac; ; ventricular zone; ; tail of embryo; ; neural tube; ; genital tubercle; ; ganglionic eminence; ; embryo; ; embryo; ; mesencephalon;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	U1 snRNA binding; snRNA stem-loop binding; protein binding; RNA binding; nucleic acid binding; U1 snRNP binding; identical protein binding;
Cellular component	spliceosomal complex; nucleus; nucleoplasm; U1 snRNP;
Biological process	mRNA processing; regulation of mRNA polyadenylation; RNA splicing; mRNA splicing, via spliceosome;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6626
	53607
	ENSG00000077312
	ENSMUSG00000061479
	P09012
	Q62189
	НМ_004596
	НМ_001046637 ; НМ_001285825 ; НМ_015782
	НП_004587
	НП_001040102 ; НП_001272754 ; НП_056597
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Малый ядерный рибонуклеопротеин А U1 — белок , который у человека кодируется SNRPA геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что малый ядерный рибонуклеопротеин полипептид А взаимодействует с CDC5L . ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000077312 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000061479 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Шонк Д., ван Дейк П., Ригманн П., Трапман Дж., Холм С., Уиллкокс Т.С., Силлекенс П., ван Венрой В., Виммер Э., Гертс ван Кессель А. (январь 1991 г.). «Отнесение семи генов к различным интервалам средней части хромосомы человека 19q, окружающей область гена миотонической дистрофии». Цитогенетика и клеточная генетика . 54 (1–2): 15–9. дои : 10.1159/000132946 . ПМИД 1701111 .
^ «Ген Энтрез: полипептид А малого ядерного рибонуклеопротеина SNRPA» .
^ Аджух П., Кастер Б., Панов К., Зомердейк Дж.К., Манн М., Ламонд А.И. (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии» . Журнал ЭМБО . 19 (23): 6569–81. дои : 10.1093/emboj/19.23.6569 . ПМК 305846 . ПМИД 11101529 .

Дальнейшее чтение

Хоффман Д.В., Query CC, Golden BL, White SW, Keene JD (март 1991 г.). «РНК-связывающий домен белкового компонента A малого ядерного рибонуклеопротеина U1, проанализированный методом ЯМР-спектроскопии, структурно подобен рибосомальным белкам» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 88 (6): 2495–9. Бибкод : 1991PNAS...88.2495H . дои : 10.1073/pnas.88.6.2495 . ПМК 51259 . ПМИД 1826055 .
Нелиссен Р.Л., Силлекенс П.Т., Бейер Р.П., Гертс ван Кессель А.Х., ван Венроой В.Дж. (июнь 1991 г.). «Структура, хромосомная локализация и эволюционная консервативность гена, кодирующего белок A, специфичный для мяРНП U1 человека». Джин . 102 (2): 189–96. дои : 10.1016/0378-1119(91)90077-О . ПМИД 1831431 .
Джессен Т.Х., Обридж С., Тео Ч., Притчард С., Нагай К. (ноябрь 1991 г.). «Идентификация молекулярных контактов между малым ядерным рибонуклеопротеином U1 A и РНК U1» . Журнал ЭМБО . 10 (11): 3447–56. дои : 10.1002/j.1460-2075.1991.tb04909.x . ПМК 453073 . ПМИД 1833186 .
Нагай К., Обридж С., Джессен Т.Х., Ли Дж., Эванс П.Р. (декабрь 1990 г.). «Кристаллическая структура РНК-связывающего домена малого ядерного рибонуклеопротеина А U1». Природа . 348 (6301): 515–20. Бибкод : 1990Natur.348..515N . дои : 10.1038/348515a0 . ПМИД 2147232 . S2CID 4336326 .
Силлекенс П.Т., Хабетс В.Дж., Бейер Р.П., ван Венрой В.Дж. (декабрь 1987 г.). «Клонирование кДНК человеческого белка A, связанного с мяРНК U1: обширная гомология между белками, специфичными для мяРНП U1 и U2» . Журнал ЭМБО . 6 (12): 3841–8. дои : 10.1002/j.1460-2075.1987.tb02721.x . ПМЦ 553857 . ПМИД 2962859 .
Обридж К., Ито Н., Эванс П.Р., Тео Ч., Нагай К. (декабрь 1994 г.). «Кристаллическая структура с разрешением 1,92 А РНК-связывающего домена сплайсосомного белка U1A в комплексе со шпилькой РНК». Природа . 372 (6505): 432–8. Бибкод : 1994Natur.372..432O . дои : 10.1038/372432a0 . ПМИД 7984237 . S2CID 9404488 .
Хоу П.В., Нагай К., Нейхаус Д., Варани Дж. (август 1994 г.). «ЯМР-исследования распознавания мяРНК U1 N-концевым доменом RNP человеческого белка U1A» . Журнал ЭМБО . 13 (16): 3873–81. дои : 10.1002/j.1460-2075.1994.tb06698.x . ПМК 395300 . ПМИД 8070414 .
Аллен Ф.Х., Губсер CC, Хоу П.В., Нагай К., Нойхаус Д., Варани Дж. (апрель 1996 г.). «Специфичность рибонуклеопротеинового взаимодействия, определяемая сворачиванием РНК при составлении комплекса». Природа . 380 (6575): 646–50. Бибкод : 1996Natur.380..646A . дои : 10.1038/380646a0 . ПМИД 8602269 . S2CID 4265453 .
Авис Дж. М., Аллен Ф. Х., Хоу П. В., Варани Дж., Нагай К., Нойхаус Д. (март 1996 г.). «Структура раствора N-концевого домена RNP белка U1A: роль С-концевых остатков в стабильности структуры и связывании РНК». Журнал молекулярной биологии . 257 (2): 398–411. дои : 10.1006/jmbi.1996.0171 . ПМИД 8609632 .
Лу Дж., Холл КБ (август 1997 г.). «Третичная структура RBD2 и динамика основной цепи RBD1 и RBD2 человеческого белка U1A, определенная с помощью ЯМР-спектроскопии». Биохимия . 36 (34): 10393–405. дои : 10.1021/bi9709811 . ПМИД 9265619 .
Аллен Ф.Х., Хоу П.В., Нойхаус Д., Варани Дж. (сентябрь 1997 г.). «Структурные основы РНК-связывающей специфичности белка U1A человека» . Журнал ЭМБО . 16 (18): 5764–72. дои : 10.1093/emboj/16.18.5764 . ПМК 1170207 . ПМИД 9312034 .
Нойбауэр Г., Кинг А., Раппсилбер Дж., Кальвио С., Уотсон М., Аджух П., Слиман Дж., Ламонд А., Манн М. (сентябрь 1998 г.). «Масс-спектрометрия и поиск в базе данных EST позволяют охарактеризовать мультибелковый сплайсосомный комплекс». Природная генетика . 20 (1): 46–50. дои : 10.1038/1700 . ПМИД 9731529 . S2CID 585778 .
Ферре-Д'Амаре А.Р., Чжоу К., Дудна Дж.А. (октябрь 1998 г.). «Кристаллическая структура рибозима вируса гепатита дельта». Природа . 395 (6702): 567–74. Бибкод : 1998Natur.395..567F . дои : 10.1038/26912 . ПМИД 9783582 . S2CID 4359811 .
Лутц К.С., Кук С., О'Коннор Дж.П., Кобаяши Р., Алвин Дж.К. (декабрь 1998 г.). «Комплекс(ы) U1A (SF-A) без snRNP: идентификация наибольшей субъединицы как PSF, фактора сплайсинга, связанного с белком, связывающим полипиримидиновый тракт» . РНК . 4 (12): 1493–9. дои : 10.1017/S1355838298981183 . ПМЦ 1369720 . ПМИД 9848648 .
Хетцер М., Маттай И.В. (январь 2000 г.). «АТФ-зависимый, Ran-независимый механизм ядерного импорта сплайсосомных белков U1A и U2B» . Журнал клеточной биологии . 148 (2): 293–303. doi : 10.1083/jcb.148.2.293 . PMC 2174293 . PMID 10648562
Кляйн Гунневик Дж. М., Хусейн Р. И., ван Арссен И., Паласиос Д., де Йонг Р., ван Венрой В. Дж., Гундерсон С. И. (март 2000 г.). «Четырнадцать остатков U1 snRNP-специфичного белка U1A необходимы для гомодимеризации, кооперативного связывания РНК и ингибирования полиаденилирования» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (6): 2209–17. дои : 10.1128/MCB.20.6.2209-2217.2000 . ПМЦ 110837 . ПМИД 10688667 .
Варани Л., Гундерсон С.И., Маттай И.В., Кей Л.Е., Нейхаус Д., Варани Г. (апрель 2000 г.). «Структура ЯМР комплекса белок U1A 38 кДа - РНК PIE раскрывает основу совместной регуляции полиаденилирования белком U1A человека». Структурная биология природы . 7 (4): 329–35. дои : 10.1038/74101 . ПМИД 10742179 . S2CID 13432764 .
Аджух П., Кастер Б., Панов К., Зомердейк Дж.К., Манн М., Ламонд А.И. (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии» . Журнал ЭМБО . 19 (23): 6569–81. дои : 10.1093/emboj/19.23.6569 . ПМК 305846 . ПМИД 11101529 .
Симмонс А., Алувихаре В., МакМайкл А. (июнь 2001 г.). «Nef запускает программу транскрипции в Т-клетках, имитируя односигнальную активацию Т-клеток и индуцируя медиаторы вирулентности ВИЧ» . Иммунитет . 14 (6): 763–77. дои : 10.1016/S1074-7613(01)00158-3 . ПМИД 11420046 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 19 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000077312 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000061479 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1701111-5] Шонк Д., ван Дейк П., Ригманн П., Трапман Дж., Холм С., Уиллкокс Т.С., Силлекенс П., ван Венрой В., Виммер Э., Гертс ван Кессель А. (январь 1991 г.). «Отнесение семи генов к различным интервалам средней части хромосомы человека 19q, окружающей область гена миотонической дистрофии». Цитогенетика и клеточная генетика . 54 (1–2): 15–9. дои : 10.1159/000132946 . ПМИД 1701111 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: полипептид А малого ядерного рибонуклеопротеина SNRPA» .

[pmid11101529-7] Аджух П., Кастер Б., Панов К., Зомердейк Дж.К., Манн М., Ламонд А.И. (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии» . Журнал ЭМБО . 19 (23): 6569–81. дои : 10.1093/emboj/19.23.6569 . ПМК 305846 . ПМИД 11101529 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

v т и РНК-связывающий белок : рибонуклеопротеины.
snRNP	A A1 B B2 C D1 D2 D3 E F G N 70K/U1 spliceosomal RNA SNRNP200
hnRNP	A0 C L R
Other transcription	Telomerase
Translation	Ribosome
Vault ribonucleoprotein particles	Major vault protein
Other	Signal recognition particle