snRNP70

СНРНП70
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2L5I, 2L5J, 3CW1, 3PGW, 4PJO, 4PKD
Идентификаторы
Псевдонимы	SNRNP70 , RNPU1Z, RPU1, SNRP70, Snp1, U1-70K, U170K, U1AP, U1RNP, SnRNP70, субъединица 70 малого ядерного рибонуклеопротеина U1.
Внешние идентификаторы	Опустить : 180740 ; МГИ : 98341 ; Гомологен : 20672 ; Генные карты : SNRNP70 ; OMA : SNRNP70 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	49,108,605 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	45,045,166 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right hemisphere of cerebellum; ; sural nerve; ; right uterine tube; ; right lobe of thyroid gland; ; left ovary; ; body of uterus; ; right ovary; ; left lobe of thyroid gland; ; canal of the cervix; ; body of pancreas;
	Top expressed in
	neural layer of retina; ; genital tubercle; ; tail of embryo; ; primary visual cortex; ; superior frontal gyrus; ; ventricular zone; ; yolk sac; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; lip; ; epiblast;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; nucleic acid binding; mRNA binding; U1 snRNP binding; U1 snRNA binding; RNA binding;
Cellular component	nuclear speck; nucleoplasm; precatalytic spliceosome; spliceosomal complex; commitment complex; U2-type prespliceosome; nucleus; U1 snRNP; cytoplasm;
Biological process	mRNA splicing, via spliceosome; positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome; mRNA processing; negative regulation of chaperone-mediated autophagy; regulation of RNA splicing; RNA splicing; regulation of ATP-dependent activity; negative regulation of protein refolding; cellular response to tumor necrosis factor; cellular response to retinoic acid; cellular response to transforming growth factor beta stimulus;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6625
	20637
	ENSG00000104852
	ENSMUSG00000063511
	P08621
	Q62376
	НМ_001009820 ; НМ_001301069 ; НМ_003089
	НМ_009224
	НП_001287998 ; НП_003080
	НП_033250
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

snRNP70, также известный как малый ядерный рибонуклеопротеин U1 массой 70 кДа, представляет собой белок ^{[ 5 ]} у людей это кодируется SNRNP70 геном . ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} snRNP70 представляет собой небольшой ядерный рибонуклеопротеин , который связывается со сплайсосомальной РНК U1 , образуя U1snRNP, основной компонент сплайсосомы . Белок U1-70K и другие компоненты сплайсосомного комплекса образуют нерастворимые в детергентах агрегаты как в спорадических, так и в семейных случаях болезни Альцгеймера у человека . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} U1-70K локализуется совместно с тау в нейрофибриллярных клубках при болезни Альцгеймера .

Взаимодействия

Было показано, что snRNP70 взаимодействует с ASF/SF2 , ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} СРПК1 , ^{[ 12 ]}^{[ 13 ]} и ЗРАНБ2 . ^{[ 14 ]}

Роль в аутоиммунитете

Антитела к snRNP70 связаны со смешанным заболеванием соединительной ткани . ^{[ 15 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000104852 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000063511 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Спритц Р.А., Странк К., Суровы К.С., Хох С.О., Бартон Д.Е., Франке У. (декабрь 1987 г.). «Белок snRNP U1-70K человека: клонирование кДНК, хромосомная локализация, экспрессия, альтернативный сплайсинг и РНК-связывание» . Исследования нуклеиновых кислот . 15 (24): 10373–91. дои : 10.1093/нар/15.24.10373 . ПМК 339950 . ПМИД 2447561 .
^ «Ген Энтрез: малый ядерный рибонуклеопротеин SNRP70, полипептид массой 70 кДа (антиген RNP)» .
^ Спритц Р.А., Странк К., Суровы К.С., Моренвейзер Х.В. (октябрь 1990 г.). «Ген рибонуклеопротеинового антигена человека U1-70K: организация, нуклеотидная последовательность и картирование с локусом 19q13.3». Геномика . 8 (2): 371–9. дои : 10.1016/0888-7543(90)90295-6 . ПМИД 2147422 .
^ Дайнер И, Хейлз СМ, Бишоф И, Рабенольд Л, Дуонг ДМ, Йи Х, Лаур О, Гиринг М, Тронкосо Дж, Тамбисетти М, Ла Джей Джей, Леви А.И., Сейфрид Н.Т. (декабрь 2014 г.). «Агрегационные свойства малого ядерного рибонуклеопротеина U1-70K при болезни Альцгеймера» . Журнал биологической химии . 289 (51): 35296–313. дои : 10.1074/jbc.M114.562959 . ПМЦ 4271217 . ПМИД 25355317 .
^ Хейлз СМ, Сейфрид Н.Т., Даммер Э.Б., Дуонг Д., Йи Х, Гиринг М., Тронкосо Дж.К., Мафсон Э.Дж., Тамбисетти М., Леви А.И., Ла Дж.Дж. (апрель 2014 г.). «Малые ядерные рибонуклеопротеины U1 (мяРНП) агрегируют при болезни Альцгеймера из-за аутосомно-доминантных генетических мутаций и трисомии 21» . Молекулярная нейродегенерация . 9:15 . дои : 10.1186/1750-1326-9-15 . ПМК 4022210 . ПМИД 24773620 .
^ Сяо С.Х., Мэнли Дж.Л. (ноябрь 1998 г.). «Фосфорилирование-дефосфорилирование по-разному влияет на активность фактора сплайсинга ASF/SF2» . Журнал ЭМБО . 17 (21): 6359–67. дои : 10.1093/emboj/17.21.6359 . ПМК 1170960 . ПМИД 9799243 .
^ Цао В., Гарсиа-Бланко, Массачусетс (август 1998 г.). «Домен, богатый серином/аргинином, в белке U1 70k человека необходим и достаточен для связывания ASF/SF2» . Журнал биологической химии . 273 (32): 20629–35. дои : 10.1074/jbc.273.32.20629 . ПМИД 9685421 .
^ Ван ХИ, Линь В., Дайк Дж.А., Йикли Дж.М., Сонгян З., Кэнтли Л.С., Фу XD (февраль 1998 г.). «SRPK2: дифференциально экспрессируемая специфичная для белка SR киназа, участвующая в обеспечении взаимодействия и локализации факторов сплайсинга пре-мРНК в клетках млекопитающих» . Журнал клеточной биологии . 140 (4): 737–50. дои : 10.1083/jcb.140.4.737 . ПМК 2141757 . ПМИД 9472028 .
^ Камачи М., Ле ТМ, Ким С.Дж., Гейгер М.Е., Андерсон П., Утц П.Дж. (ноябрь 2002 г.). «Человеческие аутоиммунные сыворотки как молекулярные зонды для идентификации сигнального пути аутоантигенной киназы» . Журнал экспериментальной медицины . 196 (9): 1213–25. дои : 10.1084/jem.20021167 . ПМК 2194102 . ПМИД 12417631 .
^ Адамс DJ, ван дер Вейден Л., Майеда А., Стамм С., Моррис Б.Дж., Раско Дж.Э. (июль 2001 г.). «ZNF265 — новый сплайсосомный белок, способный индуцировать альтернативный сплайсинг» . Журнал клеточной биологии . 154 (1): 25–32. дои : 10.1083/jcb.200010059 . ПМК 2196870 . ПМИД 11448987 .
^ Сато Т., Фуджи Т., Ёкояма Т., Фудзита Ю., Имура Ю., Юкава Н., Кавабата Д., Нодзима Т., Омура К., Усуи Т., Мимори Т. (декабрь 2010 г.). «Антитела к RNP U1 в спинномозговой жидкости связаны с центральными нервно-психическими проявлениями при системной красной волчанке и смешанных заболеваниях соединительной ткани». Артрит и ревматизм . 62 (12): 3730–40. дои : 10.1002/арт.27700 . hdl : 2433/142082 . ПМИД 20722023 .

Дальнейшее чтение

Уилк Х.Э., Шефер К.П., Агрис П.Ф., Боак А.М., Ковач С.А. (июль 1991 г.). «Ассоциация U1 SnRNP с HnRNP включает начальное неспецифическое независимое от сайта сплайсинга взаимодействие белка U1 SnRNP с HnRNA». Молекулярная и клеточная биохимия . 106 (1): 55–66. дои : 10.1007/BF00231189 . ПМИД 1833625 . S2CID 22696966 .
Запрос CC, Bentley RC, Keene JD (апрель 1989 г.). «Общий мотив узнавания РНК, идентифицированный в пределах определенного РНК-связывающего домена U1 белка 70K U1 snRNP». Клетка . 57 (1): 89–101. дои : 10.1016/0092-8674(89)90175-X . ПМИД 2467746 . S2CID 22127152 .
Дю Кло TW (октябрь 1989 г.). «С-реактивный белок реагирует с малым ядерным рибонуклеопротеином U1» . Журнал иммунологии . 143 (8): 2553–9. дои : 10.4049/jimmunol.143.8.2553 . ПМИД 2477447 . S2CID 84070596 .
Тайссен Х., Этцеродт М., Ройтер Р., Шнайдер К., Лотспайх Ф., Аргос П., Люрманн Р., Филипсон Л. (декабрь 1986 г.). «Клонирование кДНК человека для белка 70K, связанного с РНК U1» . Журнал ЭМБО . 5 (12): 3209–17. дои : 10.1002/j.1460-2075.1986.tb04631.x . ПМЦ 1167314 . ПМИД 3028775 .
Ромак Дж. М., Графф Д. Х., Кин Дж. Д. (июль 1994 г.). «Белок 70K малого ядерного рибонуклеопротеина U1 (snRNP) транспортируется независимо от частиц snRNP U1 посредством сигнала ядерной локализации в РНК-связывающем домене» . Молекулярная и клеточная биология . 14 (7): 4662–70. дои : 10.1128/MCB.14.7.4662 . ПМЦ 358839 . ПМИД 7516470 .
Ву JY, Маниатис Т. (декабрь 1993 г.). «Специфические взаимодействия между белками, участвующими в выборе места сплайсинга и регулируемом альтернативном сплайсинге». Клетка . 75 (6): 1061–70. дои : 10.1016/0092-8674(93)90316-I . ПМИД 8261509 . S2CID 22951690 .
Воппманн А., Уилл К.Л., Корнштедт Ю., Зуо П., Мэнли Дж.Л., Люрманн Р. (июнь 1993 г.). «Идентификация киназной активности, связанной с snRNP, которая фосфорилирует богатые аргинином/серином домены, типичные для факторов сплайсинга» . Исследования нуклеиновых кислот . 21 (12): 2815–22. дои : 10.1093/нар/21.12.2815 . ПМК 309659 . ПМИД 8332490 .
Нортеманн В., Берг Х., Станке Г., Уолтер М., Хант Н., Феннинг С. (декабрь 1995 г.). «Идентификация ингибирующего элемента в антигене человеческого рибонуклеопротеина массой 68 кДа (U1)». Экспрессия и очистка белков . 6 (6): 748–56. дои : 10.1006/преп.1995.0005 . ПМИД 8746626 .
Чжан WJ, Ву JY (октябрь 1996 г.). «Функциональные свойства p54, нового белка SR, активного в конститутивном и альтернативном сплайсинге» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (10): 5400–8. дои : 10.1128/MCB.16.10.5400 . ПМК 231539 . ПМИД 8816452 .
Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .
Хун В., Беннетт М., Сяо Ю., Фельд Крамер Р., Ван С., Рид Р. (январь 1997 г.). «Ассоциация U2 snRNP со сплайсосомным комплексом E» . Исследования нуклеиновых кислот . 25 (2): 354–61. дои : 10.1093/нар/25.2.354 . ПМК 146436 . ПМИД 9016565 .
Кляйн Гунневик Дж. М., ван Арссен Ю., ван дер Кемп А., Нелиссен Р., Пруйн Г. Дж., ван Венрой В. Дж. (август 1997 г.). «Ядерное накопление белка C, специфичного для мяРНП U1, происходит за счет диффузии и удержания в ядре». Экспериментальные исследования клеток . 235 (1): 265–73. дои : 10.1006/excr.1997.3663 . ПМИД 9281376 .
Чжан WJ, Ву JY (февраль 1998 г.). «Sip1, новый белок, содержащий домен RS, необходимый для сплайсинга пре-мРНК» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (2): 676–84. дои : 10.1128/MCB.18.2.676 . ПМЦ 108778 . ПМИД 9447963 .
Бленкоу Б.Дж., Исснер Р., Никерсон Дж.А., Шарп П.А. (апрель 1998 г.). «Коактиватор сплайсинга пре-мРНК» . Гены и развитие . 12 (7): 996–1009. дои : 10.1101/gad.12.7.996 . ПМК 316672 . ПМИД 9531537 .
Цао В., Гарсиа-Бланко, Массачусетс (август 1998 г.). «Домен, богатый серином/аргинином, в белке U1 70k человека необходим и достаточен для связывания ASF/SF2» . Журнал биологической химии . 273 (32): 20629–35. дои : 10.1074/jbc.273.32.20629 . ПМИД 9685421 .
Нойбауэр Г., Кинг А., Раппсилбер Дж., Кальвио С., Уотсон М., Аджух П., Слиман Дж., Ламонд А., Манн М. (сентябрь 1998 г.). «Масс-спектрометрия и поиск в базе данных EST позволяют охарактеризовать мультибелковый сплайсосомный комплекс». Природная генетика . 20 (1): 46–50. дои : 10.1038/1700 . ПМИД 9731529 . S2CID 585778 .
Сяо С.Х., Мэнли Дж.Л. (ноябрь 1998 г.). «Фосфорилирование-дефосфорилирование по-разному влияет на активность фактора сплайсинга ASF/SF2» . Журнал ЭМБО . 17 (21): 6359–67. дои : 10.1093/emboj/17.21.6359 . ПМК 1170960 . ПМИД 9799243 .
Дюмортье Х., Кляйн Гунневик Дж., Руссель Дж.П., ван Арссен Ю., Бриан Дж.П., ван Венрой В.Дж., Мюллер С. (декабрь 1998 г.). «На поверхности белка в растворе и на частице сплайсосомного U1 snRNP человека экспонируются по меньшей мере три линейные области, но не домен цинкового пальца белка U1C» . Исследования нуклеиновых кислот . 26 (23): 5486–91. дои : 10.1093/нар/26.23.5486 . ПМК 147990 . ПМИД 9826776 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000104852 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000063511 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid2447561-5] Спритц Р.А., Странк К., Суровы К.С., Хох С.О., Бартон Д.Е., Франке У. (декабрь 1987 г.). «Белок snRNP U1-70K человека: клонирование кДНК, хромосомная локализация, экспрессия, альтернативный сплайсинг и РНК-связывание» . Исследования нуклеиновых кислот . 15 (24): 10373–91. дои : 10.1093/нар/15.24.10373 . ПМК 339950 . ПМИД 2447561 .

[6] «Ген Энтрез: малый ядерный рибонуклеопротеин SNRP70, полипептид массой 70 кДа (антиген RNP)» .

[pmid2147422-7] Спритц Р.А., Странк К., Суровы К.С., Моренвейзер Х.В. (октябрь 1990 г.). «Ген рибонуклеопротеинового антигена человека U1-70K: организация, нуклеотидная последовательность и картирование с локусом 19q13.3». Геномика . 8 (2): 371–9. дои : 10.1016/0888-7543(90)90295-6 . ПМИД 2147422 .

[8] Дайнер И, Хейлз СМ, Бишоф И, Рабенольд Л, Дуонг ДМ, Йи Х, Лаур О, Гиринг М, Тронкосо Дж, Тамбисетти М, Ла Джей Джей, Леви А.И., Сейфрид Н.Т. (декабрь 2014 г.). «Агрегационные свойства малого ядерного рибонуклеопротеина U1-70K при болезни Альцгеймера» . Журнал биологической химии . 289 (51): 35296–313. дои : 10.1074/jbc.M114.562959 . ПМЦ 4271217 . ПМИД 25355317 .

[9] Хейлз СМ, Сейфрид Н.Т., Даммер Э.Б., Дуонг Д., Йи Х, Гиринг М., Тронкосо Дж.К., Мафсон Э.Дж., Тамбисетти М., Леви А.И., Ла Дж.Дж. (апрель 2014 г.). «Малые ядерные рибонуклеопротеины U1 (мяРНП) агрегируют при болезни Альцгеймера из-за аутосомно-доминантных генетических мутаций и трисомии 21» . Молекулярная нейродегенерация . 9:15 . дои : 10.1186/1750-1326-9-15 . ПМК 4022210 . ПМИД 24773620 .

[pmid9799243-10] Сяо С.Х., Мэнли Дж.Л. (ноябрь 1998 г.). «Фосфорилирование-дефосфорилирование по-разному влияет на активность фактора сплайсинга ASF/SF2» . Журнал ЭМБО . 17 (21): 6359–67. дои : 10.1093/emboj/17.21.6359 . ПМК 1170960 . ПМИД 9799243 .

[pmid9685421-11] Цао В., Гарсиа-Бланко, Массачусетс (август 1998 г.). «Домен, богатый серином/аргинином, в белке U1 70k человека необходим и достаточен для связывания ASF/SF2» . Журнал биологической химии . 273 (32): 20629–35. дои : 10.1074/jbc.273.32.20629 . ПМИД 9685421 .

[pmid9472028-12] Ван ХИ, Линь В., Дайк Дж.А., Йикли Дж.М., Сонгян З., Кэнтли Л.С., Фу XD (февраль 1998 г.). «SRPK2: дифференциально экспрессируемая специфичная для белка SR киназа, участвующая в обеспечении взаимодействия и локализации факторов сплайсинга пре-мРНК в клетках млекопитающих» . Журнал клеточной биологии . 140 (4): 737–50. дои : 10.1083/jcb.140.4.737 . ПМК 2141757 . ПМИД 9472028 .

[pmid12417631-13] Камачи М., Ле ТМ, Ким С.Дж., Гейгер М.Е., Андерсон П., Утц П.Дж. (ноябрь 2002 г.). «Человеческие аутоиммунные сыворотки как молекулярные зонды для идентификации сигнального пути аутоантигенной киназы» . Журнал экспериментальной медицины . 196 (9): 1213–25. дои : 10.1084/jem.20021167 . ПМК 2194102 . ПМИД 12417631 .

[pmid11448987-14] Адамс DJ, ван дер Вейден Л., Майеда А., Стамм С., Моррис Б.Дж., Раско Дж.Э. (июль 2001 г.). «ZNF265 — новый сплайсосомный белок, способный индуцировать альтернативный сплайсинг» . Журнал клеточной биологии . 154 (1): 25–32. дои : 10.1083/jcb.200010059 . ПМК 2196870 . ПМИД 11448987 .

[pmid20722023-15] Сато Т., Фуджи Т., Ёкояма Т., Фудзита Ю., Имура Ю., Юкава Н., Кавабата Д., Нодзима Т., Омура К., Усуи Т., Мимори Т. (декабрь 2010 г.). «Антитела к RNP U1 в спинномозговой жидкости связаны с центральными нервно-психическими проявлениями при системной красной волчанке и смешанных заболеваниях соединительной ткани». Артрит и ревматизм . 62 (12): 3730–40. дои : 10.1002/арт.27700 . hdl : 2433/142082 . ПМИД 20722023 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

v т и РНК-связывающий белок : рибонуклеопротеины.
snRNP	A A1 B B2 C D1 D2 D3 E F G N 70K/U1 spliceosomal RNA SNRNP200
hnRNP	A0 C L R
Other transcription	Telomerase
Translation	Ribosome
Vault ribonucleoprotein particles	Major vault protein
Other	Signal recognition particle