СНРПГ

СНРПГ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3CW1, 3PGW, 3S6N, 4F7U, 4PJO, 4V98, 4WZJ, 3JCR
Идентификаторы
Псевдонимы	SNRPG , SMG, Sm-G, малый ядерный рибонуклеопротеидный полипептид G
Внешние идентификаторы	Опустить : 603542 ; МГИ : 1915261 ; Гомологен : 37730 ; GeneCards : SNRPG ; ОМА : СНРПГ - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	70,293,740 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 6 (mouse)
End	86,356,310 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ganglionic eminence; ; ventricular zone; ; endometrium; ; placenta; ; mucosa of transverse colon; ; islet of Langerhans; ; right adrenal gland; ; left adrenal gland; ; left adrenal cortex; ; right adrenal cortex;
	Top expressed in
	maxillary prominence; ; embryo; ; mandibular prominence; ; embryo; ; ventricular zone; ; epiblast; ; hand; ; somite; ; medial ganglionic eminence; ; abdominal wall;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; RNA binding;
Cellular component	cytoplasm; SMN-Sm protein complex; cytosol; catalytic step 2 spliceosome; spliceosomal tri-snRNP complex; U5 snRNP; U12-type spliceosomal complex; U2 snRNP; methylosome; U7 snRNP; precatalytic spliceosome; small nuclear ribonucleoprotein complex; P granule; spliceosomal complex; U4 snRNP; U2-type prespliceosome; nucleus; nucleoplasm; U1 snRNP; U4/U6 x U5 tri-snRNP complex; U2-type precatalytic spliceosome; U2-type catalytic step 2 spliceosome;
Biological process	termination of RNA polymerase II transcription; mRNA processing; spliceosomal complex assembly; RNA splicing; histone mRNA metabolic process; import into nucleus; spliceosomal snRNP assembly; mRNA splicing, via spliceosome;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6637
	68011
	ENSG00000143977
	ENSMUSG00000057278
	P62308 ; Q49AN9
	P62309
showНМ_003096 ; НМ_001317165 ; НМ_001317166 ; НМ_001317167 ; НМ_001317168 ;
	NM_001317169; NM_001317171
	НМ_026506
showНП_001304094 ; НП_001304095 ; НП_001304096 ; НП_001304097 ; НП_001304098 ;
	NP_001304100; NP_003087; NP_001304097.1; NP_001304098.1
	НП_080782
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Малый ядерный рибонуклеопротеин G — белок , который у человека кодируется SNRPG геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что SNRPG взаимодействует с DDX20. ^{[ 7 ]} и ТАСС1 . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000143977 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000057278 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Герман Х, Фабрицио П., Рейкер В.А., Фулаки К., Хорниг Х., Брамс Х., Люрманн Р. (июнь 1995 г.). «Белки snRNP Sm разделяют два эволюционно консервативных мотива последовательности, которые участвуют в белок-белковых взаимодействиях Sm» . ЭМБО Дж . 14 (9): 2076–88. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07199.x . ПМЦ 398308 . ПМИД 7744013 .
^ «Ген Энтрез: полипептид G малого ядерного рибонуклеопротеина SNRPG» .
^ Шарру Б., Пеллицони Л., Перкинсон Р.А., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (декабрь 1999 г.). «Gemin3: новый белок DEAD box, который взаимодействует с SMN, продуктом гена спинальной мышечной атрофии, и является компонентом драгоценных камней» . Дж. Клеточная Биол . 147 (6): 1181–94. дои : 10.1083/jcb.147.6.1181 . ПМК 2168095 . ПМИД 10601333 .
^ Конте Н., Шараф-Жофре Э., Делаваль Б., Аделаида Дж., Жинестье С., Женье Дж., Иснардон Д., Жакмье Дж., Бирнбаум Д. (август 2002 г.). «Канцерогенез и контроль трансляции: TACC1 подавляется при раке человека и связывается с регуляторами мРНК» . Онкоген . 21 (36): 5619–30. дои : 10.1038/sj.onc.1205658 . ПМИД 12165861 .

Дальнейшее чтение

Генрихс В., Хакл В., Люрманн Р. (1992). «Прямое связывание малого ядерного рибонуклеопротеина G с сайтом Sm малой ядерной РНК. Сшивание белка G ультрафиолетовым светом с участком AAU внутри сайта Sm (AAUUUGUGG) малого ядерного рибонуклеопротеина U1, восстановленного in vitro». Дж. Мол. Биол . 227 (1): 15–28. дои : 10.1016/0022-2836(92)90678-D . ПМИД 1387914 .
Плессель Г., Люрманн Р., Кастнер Б. (1997). «Электронная микроскопия промежуточных продуктов сборки ядра snRNP: морфологическое сходство между гетеромером белка без РНК (EFG) и интактным ядром snRNP». Дж. Мол. Биол . 265 (2): 87–94. дои : 10.1006/jmbi.1996.0713 . ПМИД 9020971 .
Фьюри М.Г., Чжан В., Христодулопулос I, Зиве Г.В. (1997). «Множественный белок: белковые взаимодействия между общими коровыми белками мяРНП». Эксп. Сотовый Res . 237 (1): 63–9. дои : 10.1006/excr.1997.3750 . ПМИД 9417867 .
Бюлер Д., Рейкер В., Люрманн Р., Фишер У. (1999). «Основная роль тюдоровского домена SMN в сборке сплайсосомных U-мяРНП: последствия спинальной мышечной атрофии» . Хм. Мол. Жене . 8 (13): 2351–7. дои : 10.1093/hmg/8.13.2351 . ПМИД 10556282 .
Шарру Б., Пеллицони Л., Перкинсон Р.А., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (1999). «Gemin3: новый белок DEAD box, который взаимодействует с SMN, продуктом гена спинальной мышечной атрофии, и является компонентом драгоценных камней» . Дж. Клеточная Биол . 147 (6): 1181–94. дои : 10.1083/jcb.147.6.1181 . ПМК 2168095 . ПМИД 10601333 .
Шарру Б., Пеллицони Л., Перкинсон Р.А., Йонг Дж., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (2000). «Gemin4. Новый компонент комплекса SMN, который содержится как в драгоценных камнях, так и в ядрышках» . Дж. Клеточная Биол . 148 (6): 1177–86. дои : 10.1083/jcb.148.6.1177 . ПМК 2174312 . ПМИД 10725331 .
Урлауб Х., Рейкер В.А., Костка С., Люрманн Р. (2001). «Взаимодействие белка Sm и сайта Sm РНК внутри внутреннего кольца основной структуры сплайсосомного мяРНП» . ЭМБО Дж . 20 (1–2): 187–96. дои : 10.1093/emboj/20.1.187 . ПМК 140196 . ПМИД 11226169 .
Пеллицони Л., Бэккон Дж., Раппсилбер Дж., Манн М., Дрейфус Дж. (2002). «Очистка нативной выживаемости комплексов мотонейронов и идентификация Gemin6 как нового компонента» . Ж. Биол. Хим . 277 (9): 7540–5. дои : 10.1074/jbc.M110141200 . ПМИД 11748230 .
Юрица М.С., Ликлайдер Л.Дж., Гиги С.Р., Григорьев Н., Мур М.Дж. (2002). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, подходящих для трехмерного структурного анализа» . РНК . 8 (4): 426–39. дои : 10.1017/S1355838202021088 . ПМК 1370266 . ПМИД 11991638 .
Конте Н., Шараф-Жофре Э., Делаваль Б., Аделаида Дж., Жинестье С., Женье Дж., Иснардон Д., Жакмье Дж., Бирнбаум Д. (2002). «Канцерогенез и контроль трансляции: TACC1 подавляется при раке человека и связывается с регуляторами мРНК» . Онкоген . 21 (36): 5619–30. дои : 10.1038/sj.onc.1205658 . ПМИД 12165861 .
Конте Н., Делаваль Б., Жинестье С., Ферран А., Иснардон Д., Ларрок С., Прижан С., Серафин Б., Жакемье Дж., Бирнбаум Д. (2003). «Белковый комплекс TACC1-chTOG-Aurora A при раке молочной железы». Онкоген . 22 (50): 8102–16. дои : 10.1038/sj.onc.1206972 . ПМИД 14603251 . S2CID 10536264 .
Уилл С.Л., Шнайдер С., Хоссбах М., Урлауб Х., Раухут Р., Эльбашир С., Тушль Т., Люрманн Р. (2004). «Человеческий 18S U11/U12 snRNP содержит набор новых белков, не обнаруженных в U2-зависимой сплайсосоме» . РНК . 10 (6): 929–41. дои : 10.1261/rna.7320604 . ПМЦ 1370585 . ПМИД 15146077 .
Ма Ю, Дости Дж., Дрейфусс Г., Ван Дуйн Г.Д. (2005). «Гетеродимер Gemin6-Gemin7 из комплекса выживания мотонейронов имеет структуру, подобную белку Sm» . Структура . 13 (6): 883–92. дои : 10.1016/j.str.2005.03.014 . ПМИД 15939020 .
Стелцль Ю, Ворм Ю, Лаловски М, Хениг К, Брембек Ф.Х., Гёлер Х, Стродике М, Ценкнер М, Шенхерр А, Кеппен С, Тимм Дж, Минцлафф С, Абрахам С, Бок Н, Китцманн С, Гёдде А, Токсёз Е , Дроге А., Кробич С., Корн Б., Бирчмайер В., Лерах Х., Ванкер Э.Э. (2005). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома» . Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . ПМИД 16169070 .
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж, Зогби Х.И., Смоляр А, Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( 2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Серажевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О., Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дювел. Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P62308 (малый ядерный рибонуклеопротеин G) в PDBe-KB .

статья о гене на хромосоме 2 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000143977 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000057278 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7744013-5] Герман Х, Фабрицио П., Рейкер В.А., Фулаки К., Хорниг Х., Брамс Х., Люрманн Р. (июнь 1995 г.). «Белки snRNP Sm разделяют два эволюционно консервативных мотива последовательности, которые участвуют в белок-белковых взаимодействиях Sm» . ЭМБО Дж . 14 (9): 2076–88. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07199.x . ПМЦ 398308 . ПМИД 7744013 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: полипептид G малого ядерного рибонуклеопротеина SNRPG» .

[pmid10601333-7] Шарру Б., Пеллицони Л., Перкинсон Р.А., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (декабрь 1999 г.). «Gemin3: новый белок DEAD box, который взаимодействует с SMN, продуктом гена спинальной мышечной атрофии, и является компонентом драгоценных камней» . Дж. Клеточная Биол . 147 (6): 1181–94. дои : 10.1083/jcb.147.6.1181 . ПМК 2168095 . ПМИД 10601333 .

[pmid12165861-8] Конте Н., Шараф-Жофре Э., Делаваль Б., Аделаида Дж., Жинестье С., Женье Дж., Иснардон Д., Жакмье Дж., Бирнбаум Д. (август 2002 г.). «Канцерогенез и контроль трансляции: TACC1 подавляется при раке человека и связывается с регуляторами мРНК» . Онкоген . 21 (36): 5619–30. дои : 10.1038/sj.onc.1205658 . ПМИД 12165861 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

v т и РНК-связывающий белок : рибонуклеопротеины.
мяРНП	А А1 Б Б2 С Д1 Д2 Д3 И Ф Г Н Сплайсосомная РНК 70K / U1 СНРНП200
hnRNP	А0 С л Р
Другая транскрипция	Теломераза
Перевод	Рибосома
Рибонуклеопротеин хранилища частицы	Главный белок свода
Другой	Частица распознавания сигнала