СНРПБ

СНРПБ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1D3B, 3CW1, 3PGW, 4PJO, 4WZJ, 3JCR
Идентификаторы
Псевдонимы	SNRPB , COD, SNRPB1, Sm-B/B', SmB/B', SmB/SmB', snRNP-B, CCMS, малые ядерные рибонуклеопротеиновые полипептиды B и B1
Внешние идентификаторы	Опустить : 182282 ; МГИ : 98342 ; Гомологен : 134543 ; GeneCards : SNRPB ; ОМА : СНРПБ - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 20 (human)
End	2,470,853 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	130,021,323 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	granulocyte; ; mucosa of transverse colon; ; mucosa of esophagus; ; skin of leg; ; skin of abdomen; ; thymus; ; left uterine tube; ; mucosa of pharynx; ; lymph node; ; gingival epithelium;
	Top expressed in
	choroid plexus of fourth ventricle; ; somite; ; lactiferous gland; ; abdominal wall; ; mandibular prominence; ; maxillary prominence; ; primitive streak; ; entorhinal cortex; ; embryo; ; CA3 field;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	histone pre-mRNA DCP binding; U2 snRNA binding; protein binding; telomerase RNA binding; RNA binding; U1 snRNP binding; U2 snRNP binding;
Cellular component	cytoplasm; SMN-Sm protein complex; cytosol; catalytic step 2 spliceosome; U4/U6 x U5 tri-snRNP complex; histone pre-mRNA 3'end processing complex; U5 snRNP; U12-type spliceosomal complex; U2 snRNP; U1 snRNP; methylosome; U7 snRNP; small nuclear ribonucleoprotein complex; telomerase holoenzyme complex; spliceosomal complex; U4 snRNP; extracellular exosome; U2-type prespliceosome; nucleus; nucleoplasm; U2-type precatalytic spliceosome; U2-type catalytic step 2 spliceosome;
Biological process	mRNA splicing, via spliceosome; termination of RNA polymerase II transcription; mRNA processing; spliceosomal snRNP assembly; RNA splicing; histone mRNA metabolic process; protein methylation; import into nucleus; brain development;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6628
	20638
	ENSG00000125835
	ENSMUSG00000027404
	P14678
	P27048
	НМ_198216 ; НМ_003091
	НМ_009225
	НП_003082 ; НП_937859
	НП_033251
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белки B и B', ассоциированные с малыми ядерными рибонуклеопротеинами, представляют собой белок , который у человека кодируется SNRPB геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является одним из нескольких ядерных белков, которые встречаются среди малых рибонуклеопротеиновых частиц (мяРНП) U1, U2, U4/U6 и U5. Эти мяРНП участвуют в сплайсинге пре-мРНК, а кодируемый белок может также играть роль в сплайсинге пре-мРНК или структуре мяРНП. Аутоантитела пациентов с системной красной волчанкой часто распознают эпитопы кодируемого белка. Для этого гена обнаружено два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы (В и В'). ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что SNRPB взаимодействует с DDX20. ^{[ 7 ]} и Койлин . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000125835 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027404 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Гриффит А.Дж., Шмаусс К., Крафт Дж. (июль 1992 г.). «Мышиный ген, кодирующий высококонсервативный белок Sm B, содержит нефункциональный альтернативный 3'-сайт сплайсинга». Джин . 114 (2): 195–201. дои : 10.1016/0378-1119(92)90574-9 . ПМИД 1376292 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: малые ядерные рибонуклеопротеиновые полипептиды SNRPB B и B1» .
^ Шарру Б., Пеллицони Л., Перкинсон Р.А., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (декабрь 1999 г.). «Gemin3: новый белок DEAD box, который взаимодействует с SMN, продуктом гена спинальной мышечной атрофии, и является компонентом драгоценных камней» . Дж. Клеточная Биол . 147 (6): 1181–94. дои : 10.1083/jcb.147.6.1181 . ПМК 2168095 . ПМИД 10601333 .
^ Хеберт, доктор медицинских наук, Шимчик П.В., Шпаргель КБ, Матера АГ (октябрь 2001 г.). «Коилин образует мост между тельцами Кахаля и SMN, белком спинальной мышечной атрофии» . Генс Дев . 15 (20): 2720–9. дои : 10.1101/gad.908401 . ПМК 312817 . ПМИД 11641277 .

Дальнейшее чтение

Уилл КЛ, Люрманн Р. (2001). «Биогенез, структура и функции сплайсосомного UsnRNP». Курс. Мнение. Клеточная Биол . 13 (3): 290–301. дои : 10.1016/S0955-0674(00)00211-8 . hdl : 11858/00-001M-0000-0012-F770-0 . ПМИД 11343899 .
Шмаусс С., Лернер М.Р. (1990). «Близкородственные малые ядерные рибонуклеопротеиновые полипептиды N и B/B' различимы по антителам, а также по различиям в их мРНК и генных структурах» . Ж. Биол. Хим . 265 (18): 10733–9. дои : 10.1016/S0021-9258(18)87008-9 . ПМИД 1693924 .
Элкон К.Б., Хайнс Дж.Дж., Чу Дж.Л., Парнасса А. (1990). «Картирование эпитопов рекомбинантных пептидов HeLa SmB и B', полученных с помощью полимеразной цепной реакции» . Дж. Иммунол . 145 (2): 636–43. дои : 10.4049/jimmunol.145.2.636 . ПМИД 1694885 .
Чу Дж.Л., Элкон КБ (1991). «Маленькие ядерные рибонуклеопротеины, SmB и B', являются продуктами одного гена». Джин . 97 (2): 311–2. дои : 10.1016/0378-1119(91)90069-Н . ПМИД 1825643 .
Шарп Н.Г., Уильямс Д.Г., Лэтчман Д.С. (1990). «Регулируемая экспрессия белка малых ядерных рибонуклеопротеиновых частиц SmN при дифференцировке эмбриональных стволовых клеток» . Мол. Клетка. Биол . 10 (12): 6817–20. дои : 10.1128/mcb.10.12.6817 . ПМЦ 362965 . ПМИД 2174118 .
Шмаусс С., Макаллистер Г., Охосоне Ю., Хардин Дж. А., Лернер М. Р. (1989). «Сравнение мяРНП-ассоциированных Sm-аутоантигенов: человеческого N, крысиного N и человеческого B/B' » . Нуклеиновые кислоты Рез . 17 (4): 1733–43. дои : 10.1093/нар/17.4.1733 . ПМЦ 331831 . ПМИД 2522186 .
Фини Р.Дж., Заутерер Р.А., Фини Дж.Л., Зиве Г.В. (1989). «Цитоплазматическая сборка и ядерное накопление зрелых малых ядерных рибонуклеопротеиновых частиц» . Ж. Биол. Хим . 264 (10): 5776–83. дои : 10.1016/S0021-9258(18)83617-1 . ПМИД 2522439 .
Охосоне Ю, Мимори Т, Гриффит А, Акизуки М, Хомма М, Крафт Дж, Хардин Дж. А. (1989). «Молекулярное клонирование кДНК, кодирующей аутоантиген Sm: получение кДНК для полипептида B серии U малых ядерных рибонуклеопротеиновых частиц» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 86 (11): 4249–53. Бибкод : 1989PNAS...86.4249O . дои : 10.1073/pnas.86.11.4249 . ПМК 287428 . ПМИД 2524838 .
ван Дам А., Винкель И., Зийлстра-Баальберген Дж., Сминк Р., Кайперс Х.Т. (1989). «Клонированные человеческие белки snRNP B и B' различаются только карбокси-концевой частью» . ЭМБО Дж . 8 (12): 3853–60. дои : 10.1002/j.1460-2075.1989.tb08563.x . ПМК 402073 . ПМИД 2531083 .
Хантрисс Дж.Д., Лэтчман Д.С., Уильямс Д.Г. (1993). «Аутоантитела к волчанке различают высоко гомологичные полипептиды Sm B/B' и SmN путем связывания эпитопа, ограниченного B/B' » . Клин. Эксп. Иммунол . 92 (2): 263–7. дои : 10.1111/j.1365-2249.1993.tb03390.x . ПМК 1554819 . ПМИД 7683587 .
Джеррелли Д., Гримальди К., Хорн Д., Махадева У., Шарп Н., Лэтчман Д.С. (1993). «Сердечная форма тканеспецифического белка SmN идентична мозговой и эмбриональной формам белка». Дж. Мол. Клетка. Кардиол . 25 (3): 321–9. дои : 10.1006/jmcc.1993.1038 . ПМИД 8510173 .
Саймонс А., Меламед-Бессудо С., Волкович Р., Сперлинг Дж., Сперлинг Р., Айзенбах Л., Роттер В. (1997). «ПАКТ: клонирование и характеристика клеточного белка, связывающего р53, который взаимодействует с Rb» . Онкоген . 14 (2): 145–55. дои : 10.1038/sj.onc.1200825 . ПМИД 9010216 .
Лю Ц, Фишер Ю, Ван Ф, Дрейфусс Г (1997). «Продукт гена заболевания спинальной мышечной атрофией, SMN, и связанный с ним белок SIP1 находятся в комплексе со сплайсосомными белками snRNP» . Клетка . 90 (6): 1013–21. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80367-0 . ПМИД 9323129 . S2CID 10855404 .
Фьюри М.Г., Чжан В., Христодулопулос I, Зиве Г.В. (1997). «Множественный белок: белковые взаимодействия между общими коровыми белками мяРНП». Эксп. Сотовый Res . 237 (1): 63–9. дои : 10.1006/excr.1997.3750 . ПМИД 9417867 .
Бедфорд М.Т., Рид Р., Ледер П. (1998). «Взаимодействия, опосредованные доменом WW, обнаруживают связанный со сплайсосомами белок, который связывает третий класс мотивов, богатых пролином: мотив, богатый пролином и метионином» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 95 (18): 10602–7. Бибкод : 1998PNAS...9510602B . дои : 10.1073/pnas.95.18.10602 . ПМК 27941 . ПМИД 9724750 .
Камбах С., Уок С., Янг Р., Авис Дж. М., де ла Фортель Э., Рейкер В. А., Люрманн Р., Ли Дж., Нагай К. (1999). «Кристаллические структуры двух белковых комплексов Sm и их значение для сборки сплайсосомных мяРНП» . Клетка . 96 (3): 375–87. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80550-4 . ПМИД 10025403 . S2CID 17379935 .
Грей Т.А., Смитвик М.Дж., Шальдах М.А., Мартоне Д.Л., Грейвс Дж.А., МакКэрри Дж.Р., Николлс Р.Д. (1999). «Согласованная регуляция и молекулярная эволюция дуплицированных локусов SNRPB'/B и SNRPN» . Нуклеиновые кислоты Рез . 27 (23): 4577–84. дои : 10.1093/нар/27.23.4577 . ПМК 148745 . ПМИД 10556313 .
Шарру Б., Пеллицони Л., Перкинсон Р.А., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (1999). «Gemin3: новый белок DEAD box, который взаимодействует с SMN, продуктом гена спинальной мышечной атрофии, и является компонентом драгоценных камней» . Дж. Клеточная Биол . 147 (6): 1181–94. дои : 10.1083/jcb.147.6.1181 . ПМК 2168095 . ПМИД 10601333 .
Шарру Б., Пеллицони Л., Перкинсон Р.А., Йонг Дж., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (2000). «Gemin4. Новый компонент комплекса SMN, который содержится как в драгоценных камнях, так и в ядрышках» . Дж. Клеточная Биол . 148 (6): 1177–86. дои : 10.1083/jcb.148.6.1177 . ПМК 2174312 . ПМИД 10725331 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 20 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000125835 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027404 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1376292-5] Гриффит А.Дж., Шмаусс К., Крафт Дж. (июль 1992 г.). «Мышиный ген, кодирующий высококонсервативный белок Sm B, содержит нефункциональный альтернативный 3'-сайт сплайсинга». Джин . 114 (2): 195–201. дои : 10.1016/0378-1119(92)90574-9 . ПМИД 1376292 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: малые ядерные рибонуклеопротеиновые полипептиды SNRPB B и B1» .

[pmid10601333-7] Шарру Б., Пеллицони Л., Перкинсон Р.А., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (декабрь 1999 г.). «Gemin3: новый белок DEAD box, который взаимодействует с SMN, продуктом гена спинальной мышечной атрофии, и является компонентом драгоценных камней» . Дж. Клеточная Биол . 147 (6): 1181–94. дои : 10.1083/jcb.147.6.1181 . ПМК 2168095 . ПМИД 10601333 .

[pmid11641277-8] Хеберт, доктор медицинских наук, Шимчик П.В., Шпаргель КБ, Матера АГ (октябрь 2001 г.). «Коилин образует мост между тельцами Кахаля и SMN, белком спинальной мышечной атрофии» . Генс Дев . 15 (20): 2720–9. дои : 10.1101/gad.908401 . ПМК 312817 . ПМИД 11641277 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

v т и РНК-связывающий белок : рибонуклеопротеины.
snRNP	A A1 B B2 C D1 D2 D3 E F G N 70K/U1 spliceosomal RNA SNRNP200
hnRNP	A0 C L R
Other transcription	Telomerase
Translation	Ribosome
Vault ribonucleoprotein particles	Major vault protein
Other	Signal recognition particle