ХНРНПР

ХНРНПР
Доступные структуры
ПДБ	Поиск Human UniProt: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	2DK2
Идентификаторы
Псевдонимы	HNRNPR , HNRPR, hnRNP-R, гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин R
Внешние идентификаторы	Опустить : 607201 ; МГИ : 1891692 ; Гомологен : 4251 ; GeneCards : HNRNPR ; ОМА : HNRNPR - ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	23,344,336 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	136,086,758 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; Achilles tendon; ; appendix; ; smooth muscle tissue; ; epithelium of colon; ; islet of Langerhans; ; rectum; ; monocyte; ; left ovary;
	Top expressed in
	ventricular zone; ; tail of embryo; ; genital tubercle; ; hand; ; neural layer of retina; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; yolk sac; ; ganglionic eminence; ; embryo; ; Rostral migratory stream;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	mRNA 3'-UTR binding; nucleic acid binding; protein binding; RNA binding; mRNA binding;
Cellular component	nucleolus; cytoplasm; axon terminus; growth cone; nucleus; intracellular membrane-bounded organelle; dendrite; endoplasmic reticulum; catalytic step 2 spliceosome; spliceosomal complex; nucleoplasm; ribonucleoprotein complex;
Biological process	circadian rhythm; positive regulation of mRNA catabolic process; mRNA destabilization; negative regulation of catalytic activity; mRNA processing; mRNA splicing, via spliceosome; RNA splicing; RNA metabolic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	10236
	74326
	ENSG00000282958 ; ENSG00000125944
	ENSMUSG00000066037
	О43390
	н/д
показывать НМ_001102397 ; НМ_001102398 ; НМ_001102399 ; НМ_001297620 ; НМ_001297621 ;
	NM_001297622; NM_005826
	НМ_001277121 ; НМ_001277122 ; НМ_001277123 ; НМ_028871 ; НМ_001355182
показывать НП_001095867 ; НП_001095868 ; НП_001095869 ; НП_001284549 ; НП_001284550 ;
	NP_001284551; NP_005817
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин R — белок , который у человека кодируется HNRNPR геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Этот ген принадлежит к подсемейству повсеместно экспрессируемых гетерогенных ядерных рибонуклеопротеинов (hnRNP). hnRNP представляют собой РНК-связывающие белки и образуют комплекс с гетерогенной ядерной РНК (hnRNA). Эти белки связаны с пре- мРНК в ядре и, по-видимому, влияют на процессинг пре-мРНК и другие аспекты метаболизма и транспорта мРНК. Хотя все hnRNP присутствуют в ядре, некоторые, по-видимому, перемещаются между ядром и цитоплазмой. Белки hnRNP обладают отличными свойствами связывания нуклеиновых кислот. Белок, кодируемый этим геном, имеет три повтора доменов RRM , которые связываются с РНК, а также содержит мотив ядерной локализации. ^{[ 6 ]}

HNRNPR вместе со своим основным партнером по взаимодействию с РНК, 7SK , необходим для роста аксонов в мотонейронах. ^{[ 7 ]} Истощение HNRNPR из первичных мотонейронов ингибирует развитие аксонов, но не приводит к усиленной гибели мотонейронов. ^{[ 7 ]} Он также играет важную роль в аксональной транслокации мРНК β-актина , непосредственно связываясь с 3'-UTR мРНК β-актина. ^{[ 8 ]}

HNRNPR усиливает c-fos транскрипцию in vitro , образуя комплекс с кофакторами PC4 и медиатором . ^{[ 9 ]}

Взаимодействия

Было показано, что HNRNPR взаимодействует с SMN1 , ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} ПРМТ1 , ^{[ 12 ]}^{[ 13 ]} ТДП-43 , ^{[ 14 ]} и ФУС/TLS . ^{[ 14 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ENSG00000125944 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000282958, ENSG00000125944 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000066037 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Хассфельд В., Чан Э.К., Мэтисон Д.А., Портман Д., Дрейфусс Г., Штайнер Г., Тан Э.М. (январь 1998 г.). «Молекулярное определение гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина R (hnRNP R) с использованием аутоиммунного антитела: иммунологическая связь с hnRNP P» . Исследования нуклеиновых кислот . 26 (2): 439–45. дои : 10.1093/нар/26.2.439 . ПМК 147279 . ПМИД 9421497 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин R HNRPR» .
^ Перейти обратно: ^а ^б Бризе М., Саал-Бауэрншуберт Л., Джи К., Моради М., Ганави Х., Уль М., Аппенцеллер С., Бакофен Р., Сендтнер М. (март 2018 г.). «hnRNP R и его основной интерактор, некодирующая РНК 7SK, корегулируют аксональный транскриптом мотонейронов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 115 (12): E2859-68. Бибкод : 2018PNAS..115E2859B . дои : 10.1073/pnas.1721670115 . ISSN 1091-6490 . ПМЦ 5866599 . ПМИД 29507242 .
^ Глинка М, Херрманн Т, Функ Н, Гавличек С, Россолл В, Винклер С, Сендтнер М (2010). «Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин-R необходим для аксональной транслокации мРНК бета-актина в мотонейронах спинного мозга» . Молекулярная генетика человека . 19 (10): 1951–66. дои : 10.1093/hmg/ddq073 . ISSN 1460-2083 . ПМИД 20167579 .
^ Фукуда А., Накадай Т., Симада М., Хисатакэ К. (2009). «Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин R усиливает транскрипцию с естественно настроенного промотора c-fos in vitro» . Журнал биологической химии . 284 (35): 23472–80. дои : 10.1074/jbc.M109.013656 . ПМК 2749121 . ПМИД 19581295 .
^ Мурелатос З., Абель Л., Йонг Дж., Катаока Н., Дрейфус Г. (октябрь 2001 г.). «SMN взаимодействует с новым семейством hnRNP и сплайсосомных белков» . Журнал ЭМБО . 20 (19): 5443–52. дои : 10.1093/emboj/20.19.5443 . ПМЦ 125643 . ПМИД 11574476 .
^ Россолл В., Кренинг А.К., Ондорф У.М., Стигборн С., Яблонка С., Сендтнер М. (январь 2002 г.). «Специфическое взаимодействие Smn, генного продукта, определяющего спинальную мышечную атрофию, с hnRNP-R и gry-rbp/hnRNP-Q: роль Smn в процессинге РНК в моторных аксонах?» . Молекулярная генетика человека . 11 (1): 93–105. дои : 10.1093/hmg/11.1.93 . ПМИД 11773003 .
^ Вада К., Иноуэ К., Хагивара М. (август 2002 г.). «Идентификация метилированных белков с помощью аргинин-N-метилтрансферазы 1, PRMT1, с новой стратегией экспрессионного клонирования». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1591 (1–3): 1–10. дои : 10.1016/S0167-4889(02)00202-1 . ПМИД 12183049 .
^ Стелцль Ю, Ворм Ю, Лаловски М, Хениг К, Брембек Ф.Х., Гёлер Х, Стродике М, Ценкнер М, Шенхерр А, Кеппен С, Тимм Дж, Минцлафф С, Абрахам С, Бок Н, Китцманн С, Гёдде А, Токсёз Е , Дроге А., Кробич С., Корн Б., Бирчмайер В., Лерах Х., Ванкер Э.Э. (сентябрь 2005 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . ПМИД 16169070 . S2CID 8235923 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Линг СК, Альбукерке КП, Хан Дж.С., Лажье-Туренн К., Токунага С., Чжоу Х., Кливленд Д.В. (июль 2010 г.). «Связанные с ALS мутации в TDP-43 повышают его стабильность и способствуют образованию комплексов TDP-43 с FUS/TLS» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (30): 13318–23. Бибкод : 2010PNAS..10713318L . дои : 10.1073/pnas.1008227107 . ПМЦ 2922163 . ПМИД 20624952 .

Дальнейшее чтение

Мурелатос З., Абель Л., Йонг Дж., Катаока Н., Дрейфус Г. (октябрь 2001 г.). «SMN взаимодействует с новым семейством hnRNP и сплайсосомных белков» . Журнал ЭМБО . 20 (19): 5443–52. дои : 10.1093/emboj/20.19.5443 . ПМЦ 125643 . ПМИД 11574476 .
Россолл В., Кренинг А.К., Ондорф У.М., Стигборн С., Яблонка С., Сендтнер М. (январь 2002 г.). «Специфическое взаимодействие Smn, генного продукта, определяющего спинальную мышечную атрофию, с hnRNP-R и gry-rbp/hnRNP-Q: роль Smn в процессинге РНК в моторных аксонах?» . Молекулярная генетика человека . 11 (1): 93–105. дои : 10.1093/hmg/11.1.93 . ПМИД 11773003 .
Юрица М.С., Ликлайдер Л.Дж., Гиги С.Р., Григорьев Н., Мур М.Дж. (апрель 2002 г.). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, подходящих для трехмерного структурного анализа» . РНК . 8 (4): 426–39. дои : 10.1017/S1355838202021088 . ПМК 1370266 . ПМИД 11991638 .
Вада К., Иноуэ К., Хагивара М. (август 2002 г.). «Идентификация метилированных белков с помощью аргинин-N-метилтрансферазы 1, PRMT1, с новой стратегией экспрессионного клонирования». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1591 (1–3): 1–10. дои : 10.1016/S0167-4889(02)00202-1 . ПМИД 12183049 .
Ангенштейн Ф., Эванс А.М., Сеттледж Р.Э., Моран С.Т., Линг С.К., Клинцова А.Ю., Шабановиц Дж., Хант Д.Ф., Гриноф В.Т. (октябрь 2002 г.). «Рецептор активированной C-киназы является частью рибонуклеопротеиновых комплексов, связанных с полиА-мРНК в нейронах» . Журнал неврологии . 22 (20): 8827–37. doi : 10.1523/jneurosci.22-20-08827.2002 . ПМК 6757688 . ПМИД 12388589 .
Хассель С., Эйхнер А., Якимович М., Хеллман У., Кнаус П., Сушельницкий С. (май 2004 г.). «Белки, связанные с костным морфогенетическим белковым рецептором типа II (BMPR-II), идентифицированные с помощью двумерного гель-электрофореза и масс-спектрометрии». Протеомика . 4 (5): 1346–58. дои : 10.1002/pmic.200300770 . ПМИД 15188402 . S2CID 6773754 .
Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К., Онг С.Е., Лион К.Э., Ламонд А.И., Манн М. (январь 2005 г.). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД 15635413 . S2CID 4344740 .
Хуан Дж, Чен XH, Ву К, Сюй П (май 2005 г.). «Клонирование и экспрессия новой изоформы гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина-R». НейроОтчёт . 16 (7): 727–30. дои : 10.1097/00001756-200505120-00014 . ПМИД 15858414 . S2CID 42006801 .
Кимура К, Вакамацу А, Судзуки Ю, Ота Т, Нисикава Т, Ямашита Р, Ямамото Дж, Секине М, Цуритани К, Вакагури Х, Исии С, Сугияма Т, Сайто К, Исоно Ю, Ириэ Р, Кушида Н, Ёнеяма Т , Оцука Р., Канда К., Ёкой Т., Кондо Х., Вагацума М., Муракава К., Исида С., Исибаши Т., Такахаши-Фуджи А., Танасе Т., Нагай К., Кикучи Х., Накаи К., Исогай Т., Сугано С. (январь 2006 г.) «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов» . Геномные исследования . 16 (1): 55–65 . 10.1101 . ПМЦ 1356129 . гр.4039406 /
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Серажевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О, Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дьюэл Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .
Шафрански К., Шиндлер С., Тауден С., Хиллер М., Хус К., Ян Н., Шрайбер С., Бакофен Р., Платцер М. (2007). «Нарушение правил сплайсинга: динуклеотиды TG функционируют как альтернативные 3'-сайты сплайсинга в U2-зависимых интронах» . Геномная биология . 8 (8): 154 р. дои : 10.1186/gb-2007-8-8-r154 . ПМК 2374985 . ПМИД 17672918 .

Внешние ссылки

HNRNPR Расположение человеческого гена в браузере генома UCSC .
Подробная информация о гене человека HNRNPR в браузере генома UCSC .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O43390 (Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин R) в PDBe-KB .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с ENSG00000125944 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000282958, ENSG00000125944 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000066037 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9421497-5] Хассфельд В., Чан Э.К., Мэтисон Д.А., Портман Д., Дрейфусс Г., Штайнер Г., Тан Э.М. (январь 1998 г.). «Молекулярное определение гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина R (hnRNP R) с использованием аутоиммунного антитела: иммунологическая связь с hnRNP P» . Исследования нуклеиновых кислот . 26 (2): 439–45. дои : 10.1093/нар/26.2.439 . ПМК 147279 . ПМИД 9421497 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин R HNRPR» .

[pmid29507242-7] Перейти обратно: ^а ^б Бризе М., Саал-Бауэрншуберт Л., Джи К., Моради М., Ганави Х., Уль М., Аппенцеллер С., Бакофен Р., Сендтнер М. (март 2018 г.). «hnRNP R и его основной интерактор, некодирующая РНК 7SK, корегулируют аксональный транскриптом мотонейронов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 115 (12): E2859-68. Бибкод : 2018PNAS..115E2859B . дои : 10.1073/pnas.1721670115 . ISSN 1091-6490 . ПМЦ 5866599 . ПМИД 29507242 .

[pmid20167579-8] Глинка М, Херрманн Т, Функ Н, Гавличек С, Россолл В, Винклер С, Сендтнер М (2010). «Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин-R необходим для аксональной транслокации мРНК бета-актина в мотонейронах спинного мозга» . Молекулярная генетика человека . 19 (10): 1951–66. дои : 10.1093/hmg/ddq073 . ISSN 1460-2083 . ПМИД 20167579 .

[Fukuda_et_al._2009-9] Фукуда А., Накадай Т., Симада М., Хисатакэ К. (2009). «Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин R усиливает транскрипцию с естественно настроенного промотора c-fos in vitro» . Журнал биологической химии . 284 (35): 23472–80. дои : 10.1074/jbc.M109.013656 . ПМК 2749121 . ПМИД 19581295 .

[pmid11574476-10] Мурелатос З., Абель Л., Йонг Дж., Катаока Н., Дрейфус Г. (октябрь 2001 г.). «SMN взаимодействует с новым семейством hnRNP и сплайсосомных белков» . Журнал ЭМБО . 20 (19): 5443–52. дои : 10.1093/emboj/20.19.5443 . ПМЦ 125643 . ПМИД 11574476 .

[pmid11773003-11] Россолл В., Кренинг А.К., Ондорф У.М., Стигборн С., Яблонка С., Сендтнер М. (январь 2002 г.). «Специфическое взаимодействие Smn, генного продукта, определяющего спинальную мышечную атрофию, с hnRNP-R и gry-rbp/hnRNP-Q: роль Smn в процессинге РНК в моторных аксонах?» . Молекулярная генетика человека . 11 (1): 93–105. дои : 10.1093/hmg/11.1.93 . ПМИД 11773003 .

[pmid12183049-12] Вада К., Иноуэ К., Хагивара М. (август 2002 г.). «Идентификация метилированных белков с помощью аргинин-N-метилтрансферазы 1, PRMT1, с новой стратегией экспрессионного клонирования». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1591 (1–3): 1–10. дои : 10.1016/S0167-4889(02)00202-1 . ПМИД 12183049 .

[pmid16169070-13] Стелцль Ю, Ворм Ю, Лаловски М, Хениг К, Брембек Ф.Х., Гёлер Х, Стродике М, Ценкнер М, Шенхерр А, Кеппен С, Тимм Дж, Минцлафф С, Абрахам С, Бок Н, Китцманн С, Гёдде А, Токсёз Е , Дроге А., Кробич С., Корн Б., Бирчмайер В., Лерах Х., Ванкер Э.Э. (сентябрь 2005 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . ПМИД 16169070 . S2CID 8235923 .

[pmid20624952-14] Перейти обратно: ^а ^б Линг СК, Альбукерке КП, Хан Дж.С., Лажье-Туренн К., Токунага С., Чжоу Х., Кливленд Д.В. (июль 2010 г.). «Связанные с ALS мутации в TDP-43 повышают его стабильность и способствуют образованию комплексов TDP-43 с FUS/TLS» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (30): 13318–23. Бибкод : 2010PNAS..10713318L . дои : 10.1073/pnas.1008227107 . ПМЦ 2922163 . ПМИД 20624952 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

v т и РНК-связывающий белок : рибонуклеопротеины.
snRNP	A A1 B B2 C D1 D2 D3 E F G N 70K/U1 spliceosomal RNA SNRNP200
hnRNP	A0 C L R
Other transcription	Telomerase
Translation	Ribosome
Vault ribonucleoprotein particles	Major vault protein
Other	Signal recognition particle