7СКНА

РН7СК
РН7СК
Идентификаторы
Символ	РН7СК
ген NCBI	125050
Другие данные
Локус	Хр.6 п12.2

7СКНА
7СКНА
	Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности 7SK
Идентификаторы
Символ	7СК
Рфам	RF00100
Другие данные
РНК Тип	Ген
Домен(ы)	Эукариоты
ТАК	ТАК: 0000274
PDB Структуры	ПДБе

В молекулярной биологии 7SK — это обильная малая ядерная РНК, обнаруженная у многоклеточных животных . ^[1] Он играет роль в регуляции транскрипции, контролируя положительный фактор элонгации транскрипции P-TEFb . ^[2] 7SK обнаружен в небольшом ядерном рибонуклеопротеиновом комплексе (мяРНП) с рядом других белков, которые регулируют стабильность и функцию комплекса.

Структура

Раннее исследование показало, что 7SK в клетках связана с рядом белков, а исследование вторичной структуры позволило создать модель спаривания оснований между различными участками РНК. ^[3] Прорыв в функционировании 7SK snRNP произошел после открытия того, что компонентом комплекса является положительный фактор элонгации транскрипции P-TEFb. ^[4]^[5] 7SK связывается с циклинзависимой киназной активностью P-TEFb и ингибирует ее посредством действия РНК-связывающих белков HEXIM1. ^[6]^[7] или HEXIM2 . ^[8]^[9] Гамма-фосфат на 5'-конце 7SK метилируется ферментом, кэпирующим метилфосфат MEPCE, который является конститутивным компонентом 7SK snRNP. ^[10] Родственный La белок LARP7 также связан с 7SK, предположительно частично за счет его взаимодействия с 3'-концом РНК. ^[11]^[12]^[13] Снижение MEPCE или LARP7 посредством нокдауна, опосредованного siRNA, приводит к дестабилизации 7SK in vivo. Подмножество 7SK snRNP лишено P-TEFb и HEXIM, но вместо этого содержит hnRNP. ^[14]

Функция

Основная функция 7SK snRNP — контроль P-TEFb, фактора, который регулирует фазу элонгации транскрипции. ^[2] Киназная активность P-TEFb ингибируется, когда фактор находится в 7SK snRNP. P-TEFb может высвобождаться из 7SK snRNP либо трансактиватором ВИЧ Tat , либо бромодомен содержащим белком BRD4, . Это высвобождение приводит к конформационному изменению РНК 7SK и выбросу HEXIM. ^[15] hnRNP стабилизируют комплекс, в котором отсутствуют P-TEFb и HEXIM. После того, как P-TEFb действует на определенные гены, он повторно секвестрируется в 7SK snRNP неизвестным механизмом. 7SK snRNP охарактеризован как у человека, так и у дрозофилы. ^[16] Подробный обзор. ^[14]

Ссылки

^ Дирибарн Г., Бенсауд О (2009). «7SK РНК, некодирующая РНК, регулирующая P-TEFb, общий фактор транскрипции» . Биология РНК . 6 (2): 122–8. дои : 10.4161/rna.6.2.8115 . ПМИД 19246988 .
^ Jump up to: ^а ^б Петерлин Б.М., Броги Дж.Э., Прайс Д.Х. (2012). «7SK мяРНК: некодирующая РНК, которая играет важную роль в регуляции транскрипции эукариот» . Междисциплинарные обзоры Wiley. РНК . 3 (1): 92–103. дои : 10.1002/wrna.106 . ПМЦ 3223291 . ПМИД 21853533 .
^ Вассарман Д.А., Стейц Дж.А. (июль 1991 г.). «Структурный анализ рибонуклеопротеина 7SK (РНП), самого распространенного малого РНП человека с неизвестной функцией» . Молекулярная и клеточная биология . 11 (7): 3432–45. дои : 10.1128/MCB.11.7.3432 . ПМК 361072 . ПМИД 1646389 .
^ Нгуен В.Т., Кисс Т., Михелс А.А., Бенсауде О. (ноябрь 2001 г.). «Малая ядерная РНК 7SK связывается и ингибирует активность комплексов CDK9/циклин Т». Природа . 414 (6861): 322–5. Бибкод : 2001Natur.414..322N . дои : 10.1038/35104581 . ПМИД 11713533 . S2CID 4341651 .
^ Ян З, Чжу Ц, Луо К, Чжоу Ц (ноябрь 2001 г.). «Малая ядерная РНК 7SK ингибирует киназу CDK9/циклин Т1, контролируя транскрипцию». Природа . 414 (6861): 317–22. Бибкод : 2001Natur.414..317Y . дои : 10.1038/35104575 . ПМИД 11713532 . S2CID 4379065 .
^ Михельс А.А., Нгуен В.Т., Фральди А., Лабас В., Эдвардс М., Боннет Ф. и др. (июль 2003 г.). «РНК MAQ1 и 7SK взаимодействуют с комплексами CDK9/циклин Т транскрипционно-зависимым образом» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (14): 4859–69. дои : 10.1128/MCB.23.14.4859-4869.2003 . ПМК 162212 . ПМИД 12832472 .
^ Йик Дж.Х., Чен Р., Нишимура Р., Дженнингс Дж.Л., Линк Эй.Дж., Чжоу К. (октябрь 2003 г.). «Ингибирование транскрипции киназы P-TEFb (CDK9/Cyclin T) и РНК-полимеразы II за счет скоординированного действия мяРНК HEXIM1 и 7SK» . Молекулярная клетка . 12 (4): 971–82. дои : 10.1016/S1097-2765(03)00388-5 . ПМИД 14580347 .
^ Байерс С.А., Прайс Дж.П., Купер Дж.Дж., Ли Кью, Прайс Д.Х. (апрель 2005 г.). «HEXIM2, родственный HEXIM1 белок, регулирует положительный фактор элонгации транскрипции b посредством ассоциации с 7SK» . Журнал биологической химии . 280 (16): 16360–7. дои : 10.1074/jbc.M500424200 . ПМИД 15713662 .
^ Йик Дж. Х., Чен Р., Пезда А.С., Чжоу Ц (апрель 2005 г.). «Компенсаторный вклад HEXIM1 и HEXIM2 в поддержание баланса активных и неактивных комплексов положительного фактора элонгации транскрипции b для контроля транскрипции» . Журнал биологической химии . 280 (16): 16368–76. дои : 10.1074/jbc.M500912200 . ПМИД 15713661 .
^ Джеронимо С., Форже Д., Бушар А., Ли Кью, Чуа Дж., Пойтрас С. и др. (июль 2007 г.). «Систематический анализ сети взаимодействия белков транскрипционного аппарата человека выявил идентичность фермента, кэпирующего 7SK» . Молекулярная клетка . 27 (2): 262–74. doi : 10.1016/j.molcel.2007.06.027 . ПМЦ 4498903 . ПМИД 17643375 .
^ Крюгер Б.Дж., Джеронимо С., Рой Б.Б., Бушар А., Баррандон С., Байерс С.А. и др. (апрель 2008 г.). «LARP7 является стабильным компонентом 7SK snRNP, тогда как P-TEFb, HEXIM1 и hnRNP A1 обратимо связаны» . Исследования нуклеиновых кислот . 36 (7): 2219–29. дои : 10.1093/нар/gkn061 . ПМК 2367717 . ПМИД 18281698 .
^ Маркерт А., Гримм М., Мартинес Дж., Визнер Дж., Мейерханс А., Мейухас О. и др. (июнь 2008 г.). «La-родственный белок LARP7 является компонентом рибонуклеопротеина 7SK и влияет на транскрипцию генов клеточной и вирусной полимеразы II» . Отчеты ЭМБО . 9 (6): 569–75. дои : 10.1038/embor.2008.72 . ПМЦ 2427381 . ПМИД 18483487 .
^ Хе Н., Джахчан Н.С., Хонг Э., Ли Кью, Бэйфилд М.А., Марайя Р.Дж. и др. (март 2008 г.). «Связанный с La белок модулирует целостность 7SK snRNP, подавляя P-TEFb-зависимую элонгацию транскрипции и онкогенез» . Молекулярная клетка . 29 (5): 588–99. doi : 10.1016/j.molcel.2008.01.003 . ПМК 6239424 . ПМИД 18249148 .
^ Jump up to: ^а ^б C Куарежма А.Дж., Бугай А., Барборик М. (сентябрь 2016 г.). «Взлом контроля элонгации РНК-полимеразы II с помощью 7SK snRNP и P-TEFb» . Исследования нуклеиновых кислот . 44 (16): 7527–39. дои : 10.1093/nar/gkw585 . ПМК 5027500 . ПМИД 27369380 .
^ Крюгер Б.Дж., Варзаванд К., Купер Дж.Дж., Прайс Д.Х. (август 2010 г.). Благосклонный М.В. (ред.). «Механизм высвобождения P-TEFb и HEXIM1 из 7SK snRNP вирусными и клеточными активаторами включает конформационные изменения в 7SK» . ПЛОС ОДИН . 5 (8): е12335. Бибкод : 2010PLoSO...512335K . дои : 10.1371/journal.pone.0012335 . ПМЦ 2925947 . ПМИД 20808803 .
^ Нгуен Д., Крюгер Б.Дж., Седоре С.С., Броги Дж.Э., Роджерс Дж.Т., Раджендра Т.К. и др. (июль 2012 г.). «мяРНП 7SK дрозофилы и существенная роль dHEXIM в развитии» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (12): 5283–97. дои : 10.1093/нар/gks191 . ПМЦ 3384314 . ПМИД 22379134 .

Внешние ссылки

человека Расположение генома 7SK и страница сведений о гене 7SK в браузере генома UCSC .
человека Расположение генома RN7SK и RN7SK страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

[1] Дирибарн Г., Бенсауд О (2009). «7SK РНК, некодирующая РНК, регулирующая P-TEFb, общий фактор транскрипции» . Биология РНК . 6 (2): 122–8. дои : 10.4161/rna.6.2.8115 . ПМИД 19246988 .

[Peterlin-2] Jump up to: ^а ^б Петерлин Б.М., Броги Дж.Э., Прайс Д.Х. (2012). «7SK мяРНК: некодирующая РНК, которая играет важную роль в регуляции транскрипции эукариот» . Междисциплинарные обзоры Wiley. РНК . 3 (1): 92–103. дои : 10.1002/wrna.106 . ПМЦ 3223291 . ПМИД 21853533 .

[3] Вассарман Д.А., Стейц Дж.А. (июль 1991 г.). «Структурный анализ рибонуклеопротеина 7SK (РНП), самого распространенного малого РНП человека с неизвестной функцией» . Молекулярная и клеточная биология . 11 (7): 3432–45. дои : 10.1128/MCB.11.7.3432 . ПМК 361072 . ПМИД 1646389 .

[4] Нгуен В.Т., Кисс Т., Михелс А.А., Бенсауде О. (ноябрь 2001 г.). «Малая ядерная РНК 7SK связывается и ингибирует активность комплексов CDK9/циклин Т». Природа . 414 (6861): 322–5. Бибкод : 2001Natur.414..322N . дои : 10.1038/35104581 . ПМИД 11713533 . S2CID 4341651 .

[5] Ян З, Чжу Ц, Луо К, Чжоу Ц (ноябрь 2001 г.). «Малая ядерная РНК 7SK ингибирует киназу CDK9/циклин Т1, контролируя транскрипцию». Природа . 414 (6861): 317–22. Бибкод : 2001Natur.414..317Y . дои : 10.1038/35104575 . ПМИД 11713532 . S2CID 4379065 .

[6] Михельс А.А., Нгуен В.Т., Фральди А., Лабас В., Эдвардс М., Боннет Ф. и др. (июль 2003 г.). «РНК MAQ1 и 7SK взаимодействуют с комплексами CDK9/циклин Т транскрипционно-зависимым образом» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (14): 4859–69. дои : 10.1128/MCB.23.14.4859-4869.2003 . ПМК 162212 . ПМИД 12832472 .

[7] Йик Дж.Х., Чен Р., Нишимура Р., Дженнингс Дж.Л., Линк Эй.Дж., Чжоу К. (октябрь 2003 г.). «Ингибирование транскрипции киназы P-TEFb (CDK9/Cyclin T) и РНК-полимеразы II за счет скоординированного действия мяРНК HEXIM1 и 7SK» . Молекулярная клетка . 12 (4): 971–82. дои : 10.1016/S1097-2765(03)00388-5 . ПМИД 14580347 .

[8] Байерс С.А., Прайс Дж.П., Купер Дж.Дж., Ли Кью, Прайс Д.Х. (апрель 2005 г.). «HEXIM2, родственный HEXIM1 белок, регулирует положительный фактор элонгации транскрипции b посредством ассоциации с 7SK» . Журнал биологической химии . 280 (16): 16360–7. дои : 10.1074/jbc.M500424200 . ПМИД 15713662 .

[9] Йик Дж. Х., Чен Р., Пезда А.С., Чжоу Ц (апрель 2005 г.). «Компенсаторный вклад HEXIM1 и HEXIM2 в поддержание баланса активных и неактивных комплексов положительного фактора элонгации транскрипции b для контроля транскрипции» . Журнал биологической химии . 280 (16): 16368–76. дои : 10.1074/jbc.M500912200 . ПМИД 15713661 .

[10] Джеронимо С., Форже Д., Бушар А., Ли Кью, Чуа Дж., Пойтрас С. и др. (июль 2007 г.). «Систематический анализ сети взаимодействия белков транскрипционного аппарата человека выявил идентичность фермента, кэпирующего 7SK» . Молекулярная клетка . 27 (2): 262–74. doi : 10.1016/j.molcel.2007.06.027 . ПМЦ 4498903 . ПМИД 17643375 .

[11] Крюгер Б.Дж., Джеронимо С., Рой Б.Б., Бушар А., Баррандон С., Байерс С.А. и др. (апрель 2008 г.). «LARP7 является стабильным компонентом 7SK snRNP, тогда как P-TEFb, HEXIM1 и hnRNP A1 обратимо связаны» . Исследования нуклеиновых кислот . 36 (7): 2219–29. дои : 10.1093/нар/gkn061 . ПМК 2367717 . ПМИД 18281698 .

[12] Маркерт А., Гримм М., Мартинес Дж., Визнер Дж., Мейерханс А., Мейухас О. и др. (июнь 2008 г.). «La-родственный белок LARP7 является компонентом рибонуклеопротеина 7SK и влияет на транскрипцию генов клеточной и вирусной полимеразы II» . Отчеты ЭМБО . 9 (6): 569–75. дои : 10.1038/embor.2008.72 . ПМЦ 2427381 . ПМИД 18483487 .

[13] Хе Н., Джахчан Н.С., Хонг Э., Ли Кью, Бэйфилд М.А., Марайя Р.Дж. и др. (март 2008 г.). «Связанный с La белок модулирует целостность 7SK snRNP, подавляя P-TEFb-зависимую элонгацию транскрипции и онкогенез» . Молекулярная клетка . 29 (5): 588–99. doi : 10.1016/j.molcel.2008.01.003 . ПМК 6239424 . ПМИД 18249148 .

[Quaresma_2016-14] Jump up to: ^а ^б C Куарежма А.Дж., Бугай А., Барборик М. (сентябрь 2016 г.). «Взлом контроля элонгации РНК-полимеразы II с помощью 7SK snRNP и P-TEFb» . Исследования нуклеиновых кислот . 44 (16): 7527–39. дои : 10.1093/nar/gkw585 . ПМК 5027500 . ПМИД 27369380 .

[15] Крюгер Б.Дж., Варзаванд К., Купер Дж.Дж., Прайс Д.Х. (август 2010 г.). Благосклонный М.В. (ред.). «Механизм высвобождения P-TEFb и HEXIM1 из 7SK snRNP вирусными и клеточными активаторами включает конформационные изменения в 7SK» . ПЛОС ОДИН . 5 (8): е12335. Бибкод : 2010PLoSO...512335K . дои : 10.1371/journal.pone.0012335 . ПМЦ 2925947 . ПМИД 20808803 .

[16] Нгуен Д., Крюгер Б.Дж., Седоре С.С., Броги Дж.Э., Роджерс Дж.Т., Раджендра Т.К. и др. (июль 2012 г.). «мяРНП 7SK дрозофилы и существенная роль dHEXIM в развитии» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (12): 5283–97. дои : 10.1093/нар/gks191 . ПМЦ 3384314 . ПМИД 22379134 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]