ХНРНПЛ

ХНРНПЛ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3R27, 3TO8
Идентификаторы
Псевдонимы	HNRNPL , HNRPL, hnRNP-L, P/OKcl.14, гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин L
Внешние идентификаторы	Опустить : 603083 ; МГИ : 104816 ; Гомологен : 1174 ; GeneCards : HNRNPL ; ОМА : HNRNPL — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	38,852,347 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	28,521,691 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; left lobe of thyroid gland; ; right lobe of thyroid gland; ; skin of abdomen; ; body of uterus; ; granulocyte; ; skin of leg; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; right uterine tube;
	Top expressed in
	neural layer of retina; ; genital tubercle; ; ventricular zone; ; tail of embryo; ; spermatocyte; ; epiblast; ; lip; ; superior frontal gyrus; ; endocardial cushion; ; yolk sac;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; pre-mRNA intronic binding; nucleic acid binding; RNA binding; mRNA 3'-UTR binding; mRNA CDS binding;
Cellular component	cytoplasm; ribonucleoprotein granule; extracellular exosome; membrane; nucleus; nucleoplasm; pronucleus; cytosol; perinuclear region of cytoplasm; ribonucleoprotein complex;
Biological process	mRNA splicing, via spliceosome; mRNA processing; RNA processing; RNA metabolic process; regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome; circadian rhythm; cellular response to amino acid starvation; positive regulation of translation; negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome; response to peptide; positive regulation of mRNA binding;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	3191
	15388
	ENSG00000104824 ; ENSG00000282947
	ENSMUSG00000015165
	P14866
	Q8R081
	НМ_001005335 ; НМ_001533
	НМ_177301
	НП_001005335 ; НП_001524
showНП_796275 ; НП_001389864 ; НП_001389865 ; НП_001389866 ; НП_001389867 ;
	NP_001389868
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин L — белок , который у человека кодируется HNRNPL геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Гетерогенные ядерные РНК (hnRNA), которые включают предшественники мРНК и зрелые мРНК, связаны со специфическими белками с образованием гетерогенных рибонуклеопротеиновых (hnRNP) комплексов. Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин L входит в число белков, стабильно связанных с комплексами hnRNP, и наряду с другими белками hnRNP, вероятно, играет важную роль в формировании, упаковке, процессинге и функционировании мРНК. Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин L присутствует в нуклеоплазме в составе комплекса HNRP. Белки HNRP также были идентифицированы вне нуклеоплазмы. Обмен hnRNP на мРНК-связывающие белки сопровождает транспорт мРНК из ядра в цитоплазму. Поскольку было показано, что белки HNRP перемещаются между ядром и цитоплазмой , вполне возможно, что они также выполняют цитоплазматические функции. Для этого гена обнаружено два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что HNRNPL взаимодействует с:

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000282947 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000104824, ENSG00000282947 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015165 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Пинол-Рома С., Суонсон М.С., Галл Дж.Г., Дрейфусс Г. (январь 1990 г.). «Новый гетерогенный ядерный белок RNP с уникальным распределением в возникающих транскриптах» . J Клеточная Биол . 109 (6, часть 1): 2575–87. дои : 10.1083/jcb.109.6.2575 . ПМК 2115934 . ПМИД 2687284 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин HNRPL L» .
^ Обердорффер С., Мойта Л.Ф., Нимс Д., Фрейтас Р.П., Хакоэн Н., Рао А. (август 2008 г.). «Регуляция альтернативного сплайсинга CD45 с помощью гетерогенного рибонуклеопротеина, hnRNPLL» . Наука . 321 (5889): 686–91. Бибкод : 2008Sci...321..686O . дои : 10.1126/science.1157610 . ПМЦ 2791692 . ПМИД 18669861 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Ким Дж.Х., Хам Б., Ким Ю.К., Чой М., Чан С.К. (май 2000 г.). «Белко-белковое взаимодействие между hnRNP, перемещающимися между ядром и цитоплазмой». Дж. Мол. Биол . 298 (3): 395–405. дои : 10.1006/jmbi.2000.3687 . ПМИД 10772858 .
^ Хам Б., Чо ОХ, Ким Дж.Э., Ким Й.К., Ким Дж.Х., О Ю.Л., Чан С.К. (апрель 1998 г.). «Белок, связывающий полипиримидиновый тракт, взаимодействует с HnRNP L» . ФЭБС Летт . 425 (3): 401–6. дои : 10.1016/S0014-5793(98)00269-5 . ПМИД 9563502 . S2CID 4980318 .

Дальнейшее чтение

Дрейфусс Г., Чой Ю.Д., Адам С.А. (1990). «Рибонуклеопротеиновые структуры на пути образования мРНК». Эндокр. Рез . 15 (4): 441–74. дои : 10.3109/07435808909036348 . ПМИД 2576798 .
Расмуссен Х.Х., Ван Дамм Дж., Пуйпе М. и др. (1993). «Микропоследовательности 145 белков, записанные в базе данных двумерных гелевых белков нормальных эпидермальных кератиноцитов человека». Электрофорез . 13 (12): 960–9. дои : 10.1002/elps.11501301199 . ПМИД 1286667 . S2CID 41855774 .
Хам Б., Чо ОХ, Ким Дж.Э. и др. (1998). «Белок, связывающий полипиримидиновый тракт, взаимодействует с HnRNP L» . ФЭБС Летт . 425 (3): 401–6. дои : 10.1016/S0014-5793(98)00269-5 . ПМИД 9563502 . S2CID 4980318 .
Ши С.К., Клаффи К.П. (1999). «Регуляция стабильности мРНК фактора роста эндотелия сосудов человека при гипоксии с помощью гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина L» . Ж. Биол. Хим . 274 (3): 1359–65. дои : 10.1074/jbc.274.3.1359 . ПМИД 9880507 .
Гамильтон Б.Дж., Николс Р.К., Цукамото Х. и др. (1999). «hnRNP A2 и hnRNP L связывают 3'UTR мРНК транспортера глюкозы 1 и существуют в виде комплекса in vivo» . Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 261 (3): 646–51. дои : 10.1006/bbrc.1999.1040 . ПМИД 10441480 .
Диас Нето Э., Корреа Р.Г., Верёвски-Алмейда С. и др. (2000). «Секвенирование транскриптома человека с помощью меток последовательности, экспрессируемых ORF» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (7): 3491–6. Бибкод : 2000PNAS...97.3491D . дои : 10.1073/pnas.97.7.3491 . ПМК 16267 . ПМИД 10737800 .
Ким Дж.Х., Хам Б., Ким Ю.К. и др. (2000). «Белко-белковое взаимодействие между hnRNP, перемещающимися между ядром и цитоплазмой». Дж. Мол. Биол . 298 (3): 395–405. дои : 10.1006/jmbi.2000.3687 . ПМИД 10772858 .
Шнырева М., Шуллери Д.С., Сузуки Х. и др. (2000). «Взаимодействие двух многофункциональных белков. Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин К и Y-бокс-связывающий белок» . Ж. Биол. Хим . 275 (20): 15498–503. дои : 10.1074/jbc.275.20.15498 . ПМИД 10809782 .
Ито М., Ситидзё С., Цуда Н. и др. (2001). «Молекулярные основы опосредованного Т-клетками распознавания клеток рака поджелудочной железы». Рак Рез . 61 (5): 2038–46. ПМИД 11280764 .
Кунингер Д.Т., Изуми Т., Папаконстантину Дж., Митра С. (2002). «Человеческая AP-эндонуклеаза 1 и hnRNP-L взаимодействуют с nCaRE-подобным репрессорным элементом в промоторе AP-эндонуклеазы 1» . Нуклеиновые кислоты Рез . 30 (3): 823–9. дои : 10.1093/нар/30.3.823 . ПМЦ 100287 . ПМИД 11809897 .
Содерберг М., Раффалли-Матье Ф., Ланг М.А. (2002). «Воспаление модулирует взаимодействие гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина (hnRNP) I/белка, связывающего полипиримидиновый тракт, и hnRNP L с 3'-нетранслируемой областью мРНК мышиной индуцируемой синтазы оксида азота». Мол. Фармакол . 62 (2): 423–31. дои : 10.1124/моль.62.2.423 . ПМИД 12130696 . S2CID 14855837 .
Хуэй Дж., Штангл К., Лейн В.С., Биндерейф А. (2007). «HnRNP L стимулирует сплайсинг гена eNOS путем связывания с повторами CA переменной длины». Нат. Структура. Биол . 10 (1): 33–7. дои : 10.1038/nsb875 . ПМИД 12447348 . S2CID 19057994 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Костейн В.Дж., Мишра Р.К. (2003). «PLG регулирует экспрессию hnRNP-L в полосатом теле и префронтальной коре крыс: идентификация с помощью ddPCR». Пептиды . 24 (1): 137–46. дои : 10.1016/S0196-9781(02)00286-3 . ПМИД 12576095 . S2CID 44677561 .
Хуэй Дж., Райтер Г., Биндерейф А. (2003). «Новая функциональная роль повторов CA и hnRNP L в стабильности РНК» . РНК . 9 (8): 931–6. дои : 10.1261/rna.5660803 . ПМК 1370459 . ПМИД 12869704 .
Гулессерян Т., Энгидаворк Э., Фунтулакис М., Любец Г. (2004). «Снижение уровня белка Lupus La в мозге и увеличение белка U5, специфичного для малого рибонуклеопротеина массой 40 кДа, при синдроме Дауна плода». Клетка. Мол. Биол. (Шумный-ле-гранд) . 49 (5): 733–8. ПМИД 14528909 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Ченг Дж., Капранов П., Дренков Дж. и др. (2005). «Транскрипционные карты 10 хромосом человека с разрешением 5 нуклеотидов». Наука . 308 (5725): 1149–54. Бибкод : 2005Sci...308.1149C . дои : 10.1126/science.1108625 . ПМИД 15790807 . S2CID 13047538 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 19 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000282947 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000104824, ENSG00000282947 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015165 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid2687284-5] Пинол-Рома С., Суонсон М.С., Галл Дж.Г., Дрейфусс Г. (январь 1990 г.). «Новый гетерогенный ядерный белок RNP с уникальным распределением в возникающих транскриптах» . J Клеточная Биол . 109 (6, часть 1): 2575–87. дои : 10.1083/jcb.109.6.2575 . ПМК 2115934 . ПМИД 2687284 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин HNRPL L» .

[pmid18669861-7] Обердорффер С., Мойта Л.Ф., Нимс Д., Фрейтас Р.П., Хакоэн Н., Рао А. (август 2008 г.). «Регуляция альтернативного сплайсинга CD45 с помощью гетерогенного рибонуклеопротеина, hnRNPLL» . Наука . 321 (5889): 686–91. Бибкод : 2008Sci...321..686O . дои : 10.1126/science.1157610 . ПМЦ 2791692 . ПМИД 18669861 .

[pmid10772858-8] Jump up to: ^а ^б ^с Ким Дж.Х., Хам Б., Ким Ю.К., Чой М., Чан С.К. (май 2000 г.). «Белко-белковое взаимодействие между hnRNP, перемещающимися между ядром и цитоплазмой». Дж. Мол. Биол . 298 (3): 395–405. дои : 10.1006/jmbi.2000.3687 . ПМИД 10772858 .

[pmid9563502-9] Хам Б., Чо ОХ, Ким Дж.Э., Ким Й.К., Ким Дж.Х., О Ю.Л., Чан С.К. (апрель 1998 г.). «Белок, связывающий полипиримидиновый тракт, взаимодействует с HnRNP L» . ФЭБС Летт . 425 (3): 401–6. дои : 10.1016/S0014-5793(98)00269-5 . ПМИД 9563502 . S2CID 4980318 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

v т и РНК-связывающий белок : рибонуклеопротеины.
snRNP	A A1 B B2 C D1 D2 D3 E F G N 70K/U1 spliceosomal RNA SNRNP200
hnRNP	A0 C L R
Other transcription	Telomerase
Translation	Ribosome
Vault ribonucleoprotein particles	Major vault protein
Other	Signal recognition particle