Малый ядерный рибонуклеопротеидный полипептид E

SNRPE
Доступные структуры
ПДБ	Поиск Human UniProt: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	3CW1, 3PGW, 3S6N, 4F7U, 4PJO, 4V98, 4WZJ, 3JCR
Идентификаторы
Псевдонимы	SNRPE , B-raf, HYPT11, SME, Sm-E, малый ядерный рибонуклеопротеидный полипептид E, snRNP-E
Внешние идентификаторы	Опустить : 128260 ; МГИ : 3650419 ; Гомологен : 136765 ; GeneCards : SNRPE ; ОМА : SNRPE - ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	203,871,152 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ganglionic eminence; ; ventricular zone; ; left ovary; ; right ovary; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; body of pancreas; ; canal of the cervix; ; ectocervix; ; body of uterus; ; mucosa of transverse colon;
	n/a
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	protein binding; RNA binding;
Cellular component	cytoplasm; SMN-Sm protein complex; cytosol; catalytic step 2 spliceosome; U12-type spliceosomal complex; nucleoplasm; methylosome; U7 snRNP; small nuclear ribonucleoprotein complex; pICln-Sm protein complex; telomerase holoenzyme complex; spliceosomal complex; U4 snRNP; nucleus; U5 snRNP; U2 snRNP; U4/U6 x U5 tri-snRNP complex; precatalytic spliceosome; U1 snRNP; U2-type catalytic step 2 spliceosome; U2-type precatalytic spliceosome;
Biological process	hair cycle; mRNA splicing, via spliceosome; termination of RNA polymerase II transcription; mRNA processing; spliceosomal snRNP assembly; spliceosomal complex assembly; histone mRNA metabolic process; import into nucleus; RNA splicing;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	6635
	102632439
	ENSG00000182004
	н/д
	P62304
	н/д
	НМ_001304464 ; НМ_003094 ; НМ_001328637 ; НМ_001328638
	н/д
	НП_001291393 ; НП_001315566 ; НП_001315567 ; НП_003085
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Малый ядерный рибонуклеопротеин Е — белок , который у человека кодируется SNRPE геном . ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что малый ядерный рибонуклеопротеин полипептид E взаимодействует с DDX20. ^{[ 7 ]} и малый ядерный рибонуклеопротеиновый полипептид F. ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000182004 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Fautsch MP, Wieben ED (декабрь 1991 г.). «Регуляция транскрипции гена белка малого ядерного рибонуклеопротеина Е. Идентификация цис-действующих последовательностей, гомологичных генам, кодирующим рибосомальные белки» . Журнал биологической химии . 266 (34): 23288–95. дои : 10.1016/S0021-9258(18)54495-1 . ПМИД 1835977 .
^ Нейсвангер К., Стэнфорд Д.Р., Спаркс Р.С., Нисимура Д., Мохандас Т., Клисак И., Хайнцманн С., Вибен Э.Д. (август 1990 г.). «Присвоение гена малого ядерного рибонуклеопротеина E (SNRPE) хромосоме человека 1q25-q43». Геномика . 7 (4): 503–8. дои : 10.1016/0888-7543(90)90192-W . ПМИД 2143747 .
^ «Ген Энтрез: полипептид Е малого ядерного рибонуклеопротеина SNRPE» .
^ Шарру Б., Пеллицони Л., Перкинсон Р.А., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (декабрь 1999 г.). «Gemin3: новый белок DEAD box, который взаимодействует с SMN, продуктом гена спинальной мышечной атрофии, и является компонентом драгоценных камней» . Журнал клеточной биологии . 147 (6): 1181–94. дои : 10.1083/jcb.147.6.1181 . ПМК 2168095 . ПМИД 10601333 .
^ Фьюри М.Г., Чжан В., Христодулопулос I, Зиве Г.В. (ноябрь 1997 г.). «Множественный белок: белковые взаимодействия между общими коровыми белками мяРНП». Экспериментальные исследования клеток . 237 (1): 63–9. дои : 10.1006/excr.1997.3750 . ПМИД 9417867 .

Дальнейшее чтение

Заутерер Р.А., Гоял А., Зиве Г.В. (январь 1990 г.). «Цитоплазматическая сборка небольших ядерных рибонуклеопротеиновых частиц из промежуточных продуктов, не содержащих 6 S и 20 S РНК, в фибробластах мыши L929» . Журнал биологической химии . 265 (2): 1048–58. дои : 10.1016/S0021-9258(19)40157-9 . ПМИД 1688550 .
Стэнфорд Д.Р., Роледер А., Нейсвангер К., Вибен Э.Д. (июль 1987 г.). «Последовательность ДНК аутоиммунного антигена Sm человека. Семейство мультигенов содержит процессированный псевдоген» . Журнал биологической химии . 262 (21): 9931–4. дои : 10.1016/S0021-9258(18)61052-X . ПМИД 2440864 .
Фини Р.Дж., Заутерер Р.А., Фини Дж.Л., Зиве Г.В. (апрель 1989 г.). «Цитоплазматическая сборка и ядерное накопление зрелых малых ядерных рибонуклеопротеиновых частиц» . Журнал биологической химии . 264 (10): 5776–83. дои : 10.1016/S0021-9258(18)83617-1 . ПМИД 2522439 .
Стэнфорд Д.Р., Перри К.А., Холики Э.Л., Роледер А.М., Вибен Э.Д. (ноябрь 1988 г.). «Ген белка малого ядерного рибонуклеопротеина Е содержит четыре интрона и имеет сходство с генами рибосомальных белков» . Журнал биологической химии . 263 (33): 17772–9. дои : 10.1016/S0021-9258(19)77902-2 . ПМИД 2972723 .
Стэнфорд Д.Р., Кель М., Перри К.А., Холики Э.Л., Харви С.Е., Роледер А.М., Редер К., Лурманн Р., Вибен Э.Д. (ноябрь 1988 г.). «Полная первичная структура белка snRNP E человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 16 (22): 10593–605. дои : 10.1093/нар/16.22.10593 . ПМК 338926 . ПМИД 2974536 .
Воппманн А., Ринке Дж., Люрманн Р. (декабрь 1988 г.). «Прямое сшивание белков snRNP F и 70K с snRNA ультрафиолетовым излучением in situ» . Исследования нуклеиновых кислот . 16 (23): 10985–1004. дои : 10.1093/нар/16.23.10985 . ПМК 338992 . ПМИД 2974540 .
Камияма Т., Аоки Н., Юаса Ю. (март 1993 г.). «Онкоген B-raf: активация путем перестроек и присвоение 7-й хромосоме человека» . Японский журнал исследований рака . 84 (3): 250–6. дои : 10.1111/j.1349-7006.1993.tb02864.x . ПМК 5919149 . ПМИД 8098025 .
Плессель Г., Люрманн Р., Кастнер Б. (январь 1997 г.). «Электронная микроскопия промежуточных продуктов сборки ядра snRNP: морфологическое сходство между гетеромером белка без РНК (EFG) и интактным ядром snRNP». Журнал молекулярной биологии . 265 (2): 87–94. дои : 10.1006/jmbi.1996.0713 . ПМИД 9020971 .
Лю Ц, Фишер Ю, Ван Ф, Дрейфусс Г (сентябрь 1997 г.). «Продукт гена заболевания спинальной мышечной атрофией, SMN, и связанный с ним белок SIP1 находятся в комплексе со сплайсосомными белками snRNP» . Клетка . 90 (6): 1013–21. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80367-0 . ПМИД 9323129 . S2CID 10855404 .
Фьюри М.Г., Чжан В., Христодулопулос I, Зиве Г.В. (ноябрь 1997 г.). «Множественный белок: белковые взаимодействия между общими коровыми белками мяРНП». Экспериментальные исследования клеток . 237 (1): 63–9. дои : 10.1006/excr.1997.3750 . ПМИД 9417867 .
Камбах С., Уок С., Янг Р., Авис Дж. М., де ла Фортель Э., Рейкер В. А., Люрманн Р., Ли Дж., Нагай К. (февраль 1999 г.). «Кристаллические структуры двух белковых комплексов Sm и их значение для сборки сплайсосомных мяРНП» . Клетка . 96 (3): 375–87. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80550-4 . ПМИД 10025403 . S2CID 17379935 .
Шарру Б., Пеллицони Л., Перкинсон Р.А., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (декабрь 1999 г.). «Gemin3: новый белок DEAD box, который взаимодействует с SMN, продуктом гена спинальной мышечной атрофии, и является компонентом драгоценных камней» . Журнал клеточной биологии . 147 (6): 1181–94. дои : 10.1083/jcb.147.6.1181 . ПМК 2168095 . ПМИД 10601333 .
Шарру Б., Пеллицони Л., Перкинсон Р.А., Йонг Дж., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (март 2000 г.). «Gemin4. Новый компонент комплекса SMN, который содержится как в драгоценных камнях, так и в ядрышках» . Журнал клеточной биологии . 148 (6): 1177–86. дои : 10.1083/jcb.148.6.1177 . ПМК 2174312 . ПМИД 10725331 .
Урлауб Х., Рейкер В.А., Костка С., Люрманн Р. (январь 2001 г.). «Взаимодействие белка Sm и сайта Sm РНК внутри внутреннего кольца основной структуры сплайсосомного мяРНП» . Журнал ЭМБО . 20 (1–2): 187–96. дои : 10.1093/emboj/20.1.187 . ПМК 140196 . ПМИД 11226169 .
Губиц А.К., Мурелатос З., Абель Л., Раппсилбер Дж. , Манн М., Дрейфус Г. (февраль 2002 г.). «Gemin5, новый белковый компонент повторов WD комплекса SMN, который связывает белки Sm» . Журнал биологической химии . 277 (7): 5631–6. дои : 10.1074/jbc.M109448200 . ПМИД 11714716 .
Пеллиццони Л., Бэккон Дж., Раппсилбер Дж., Манн М., Дрейфус Дж. (март 2002 г.). «Очистка нативной выживаемости комплексов мотонейронов и идентификация Gemin6 как нового компонента» . Журнал биологической химии . 277 (9): 7540–5. дои : 10.1074/jbc.M110141200 . ПМИД 11748230 .
Фризен В.Дж., Вайс А., Паушкин С., Абель Л., Раппсилбер Дж., Манн М., Дрейфусс Г. (март 2002 г.). «Новый белковый компонент WD-повторов метилосомы связывает белки Sm» . Журнал биологической химии . 277 (10): 8243–7. дои : 10.1074/jbc.M109984200 . ПМИД 11756452 .
Юрица М.С., Ликлайдер Л.Дж., Гиги С.Р., Григорьев Н., Мур М.Дж. (апрель 2002 г.). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, подходящих для трехмерного структурного анализа» . РНК . 8 (4): 426–39. дои : 10.1017/S1355838202021088 . ПМК 1370266 . ПМИД 11991638 .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000182004 – Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1835977-4] Fautsch MP, Wieben ED (декабрь 1991 г.). «Регуляция транскрипции гена белка малого ядерного рибонуклеопротеина Е. Идентификация цис-действующих последовательностей, гомологичных генам, кодирующим рибосомальные белки» . Журнал биологической химии . 266 (34): 23288–95. дои : 10.1016/S0021-9258(18)54495-1 . ПМИД 1835977 .

[pmid2143747-5] Нейсвангер К., Стэнфорд Д.Р., Спаркс Р.С., Нисимура Д., Мохандас Т., Клисак И., Хайнцманн С., Вибен Э.Д. (август 1990 г.). «Присвоение гена малого ядерного рибонуклеопротеина E (SNRPE) хромосоме человека 1q25-q43». Геномика . 7 (4): 503–8. дои : 10.1016/0888-7543(90)90192-W . ПМИД 2143747 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: полипептид Е малого ядерного рибонуклеопротеина SNRPE» .

[pmid10601333-7] Шарру Б., Пеллицони Л., Перкинсон Р.А., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (декабрь 1999 г.). «Gemin3: новый белок DEAD box, который взаимодействует с SMN, продуктом гена спинальной мышечной атрофии, и является компонентом драгоценных камней» . Журнал клеточной биологии . 147 (6): 1181–94. дои : 10.1083/jcb.147.6.1181 . ПМК 2168095 . ПМИД 10601333 .

[pmid9417867-8] Фьюри М.Г., Чжан В., Христодулопулос I, Зиве Г.В. (ноябрь 1997 г.). «Множественный белок: белковые взаимодействия между общими коровыми белками мяРНП». Экспериментальные исследования клеток . 237 (1): 63–9. дои : 10.1006/excr.1997.3750 . ПМИД 9417867 .

[1]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

v т и РНК-связывающий белок : рибонуклеопротеины.
snRNP	A A1 B B2 C D1 D2 D3 E F G N 70K/U1 spliceosomal RNA SNRNP200
hnRNP	A0 C L R
Other transcription	Telomerase
Translation	Ribosome
Vault ribonucleoprotein particles	Major vault protein
Other	Signal recognition particle