Малый ядерный рибонуклеопротеин полипептид C

СНРПК
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2VRD, 3CW1, 4PJO
Идентификаторы
Псевдонимы	SNRPC , U1C, Yhc1, полипептид C малого ядерного рибонуклеопротеина.
Внешние идентификаторы	Опустить : 603522 ; МГИ : 109489 ; Гомологен : 136764 ; GeneCards : SNRPC ; ОМА : SNRPC - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	34,773,857 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	28,070,942 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	apex of heart; ; left testis; ; right testis; ; right auricle; ; left ventricle; ; mucosa of transverse colon; ; ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; muscle of thigh; ; gastrocnemius muscle;
	Top expressed in
	yolk sac; ; ventricular zone; ; embryo; ; morula; ; embryo; ; neural layer of retina; ; muscle of thigh; ; granulocyte; ; blastocyst; ; lip;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein homodimerization activity; zinc ion binding; metal ion binding; protein binding; single-stranded RNA binding; nucleic acid binding; U1 snRNA binding; pre-mRNA 5'-splice site binding; U1 snRNP binding; RNA binding; mRNA binding;
Cellular component	Cajal body; prespliceosome; U1 snRNP; nucleus; commitment complex; nucleoplasm; U2-type prespliceosome;
Biological process	spliceosomal snRNP assembly; mRNA 5'-splice site recognition; mRNA splicing, via spliceosome;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6631
	20630
	ENSG00000124562
	ENSMUSG00000024217
	P09234
	Q62241
	НМ_003093
	НМ_011432
	НП_003084
	НП_035562
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Малый ядерный рибонуклеопротеин C U1 — белок , который у человека кодируется SNRPC геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что малый ядерный рибонуклеопротеин полипептид C взаимодействует с областью точки разрыва 1 саркомы Юинга . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000124562 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024217 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Силлекенс П.Т., Бейер Р.П., Хабетс В.Дж., ван Венрой В.Дж. (сентябрь 1988 г.). «Человеческий U1 snRNP-специфичный белок C: полная кДНК и последовательность белка и идентификация мультигенного семейства у млекопитающих» . Исследования нуклеиновых кислот . 16 (17): 8307–21. дои : 10.1093/нар/16.17.8307 . ПМК 338560 . ПМИД 2971157 .
^ Гунневик Дж. М., ван Арссен Ю., Вассенаар Р., Легрен П., ван Венрой В. Дж., Нелиссен Р. Л. (декабрь 1995 г.). «Гомодимеризация белка C, специфичного для мяРНП U1 человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 23 (23): 4864–71. дои : 10.1093/нар/23.23.4864 . ПМК 307476 . ПМИД 8532530 .
^ «Ген Энтрез: полипептид C малого ядерного рибонуклеопротеина SNRPC» .
^ Кнуп Л.Л., Бейкер С.Дж. (август 2000 г.). «Фактор сплайсинга U1C подавляет трансактивацию, опосредованную EWS/FLI» . Журнал биологической химии . 275 (32): 24865–71. дои : 10.1074/jbc.M001661200 . ПМИД 10827180 .

Дальнейшее чтение

Ямамото К., Миура Х., Морой Ю., Ёсиноя С., Гото М., Нисиока К., Миямото Т. (январь 1988 г.). «Выделение и характеристика комплементарной ДНК, экспрессирующей полипептид малого ядерного рибонуклеопротеина C человека U1» . Журнал иммунологии . 140 (1): 311–7. дои : 10.4049/jimmunol.140.1.311 . ПМИД 2961811 . S2CID 45846091 .
Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Нелиссен Р.Л., Гунневик Дж.М., Ламбермон М.Х., Ван Венрой В.Дж. (январь 1997 г.). «Клонирование и характеристика двух процессированных псевдогенов и кДНК для мышиного белка C, специфичного для мяРНП U1». Джин . 184 (2): 273–8. дои : 10.1016/S0378-1119(96)00612-9 . hdl : 2066/27882 . ПМИД 9031639 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Дюмортье Х., Кляйн Гунневик Дж., Руссель Дж.П., ван Арссен Ю., Бриан Дж.П., ван Венрой В.Дж., Мюллер С. (декабрь 1998 г.). «На поверхности белка в растворе и на частице сплайсосомного U1 snRNP человека экспонируются по меньшей мере три линейные области, но не домен цинкового пальца белка U1C» . Исследования нуклеиновых кислот . 26 (23): 5486–91. дои : 10.1093/нар/26.23.5486 . ПМК 147990 . ПМИД 9826776 .
Шарру Б., Пеллицони Л., Перкинсон Р.А., Йонг Дж., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (март 2000 г.). «Gemin4. Новый компонент комплекса SMN, который содержится как в драгоценных камнях, так и в ядрышках» . Журнал клеточной биологии . 148 (6): 1177–86. дои : 10.1083/jcb.148.6.1177 . ПМК 2174312 . ПМИД 10725331 .
Кнуп Л.Л., Бейкер С.Дж. (август 2000 г.). «Фактор сплайсинга U1C подавляет трансактивацию, опосредованную EWS/FLI» . Журнал биологической химии . 275 (32): 24865–71. дои : 10.1074/jbc.M001661200 . ПМИД 10827180 .
Пеллиццони Л., Бэккон Дж., Раппсилбер Дж., Манн М., Дрейфус Дж. (март 2002 г.). «Очистка нативной выживаемости комплексов мотонейронов и идентификация Gemin6 как нового компонента» . Журнал биологической химии . 277 (9): 7540–5. дои : 10.1074/jbc.M110141200 . ПМИД 11748230 .
Фёрх П., Пуиг О., Мартинес С., Серафин Б., Валькарсель Х. (декабрь 2002 г.). «Регулятор сплайсинга TIA-1 взаимодействует с U1-C, способствуя рекрутированию мяРНП U1 в 5'-сайты сплайсинга» . Журнал ЭМБО . 21 (24): 6882–92. дои : 10.1093/emboj/cdf668 . ПМК 139089 . ПМИД 12486009 .
Раш Дж., Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Дж., Чжан Х., Чжа К.М., Полакевич Р.Д., Комб М.Дж. (январь 2005 г.). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Природная биотехнология . 23 (1): 94–101. дои : 10.1038/nbt1046 . ПМИД 15592455 . S2CID 7200157 .
Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К., Онг С.Е., Лион К.Э., Ламонд А.И., Манн М. (январь 2005 г.). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД 15635413 . S2CID 4344740 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 6 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000124562 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024217 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid2971157-5] Силлекенс П.Т., Бейер Р.П., Хабетс В.Дж., ван Венрой В.Дж. (сентябрь 1988 г.). «Человеческий U1 snRNP-специфичный белок C: полная кДНК и последовательность белка и идентификация мультигенного семейства у млекопитающих» . Исследования нуклеиновых кислот . 16 (17): 8307–21. дои : 10.1093/нар/16.17.8307 . ПМК 338560 . ПМИД 2971157 .

[pmid8532530-6] Гунневик Дж. М., ван Арссен Ю., Вассенаар Р., Легрен П., ван Венрой В. Дж., Нелиссен Р. Л. (декабрь 1995 г.). «Гомодимеризация белка C, специфичного для мяРНП U1 человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 23 (23): 4864–71. дои : 10.1093/нар/23.23.4864 . ПМК 307476 . ПМИД 8532530 .

[entrez-7] «Ген Энтрез: полипептид C малого ядерного рибонуклеопротеина SNRPC» .

[pmid10827180-8] Кнуп Л.Л., Бейкер С.Дж. (август 2000 г.). «Фактор сплайсинга U1C подавляет трансактивацию, опосредованную EWS/FLI» . Журнал биологической химии . 275 (32): 24865–71. дои : 10.1074/jbc.M001661200 . ПМИД 10827180 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

v т и РНК-связывающий белок : рибонуклеопротеины.
мяРНП	А А1 Б Б2 С Д1 Д2 Д3 И Ф Г Н Сплайсосомная РНК 70K / U1 СНРНП200
hnRNP	А0 С л Р
Другая транскрипция	Теломераза
Перевод	Рибосома
Рибонуклеопротеин хранилища частицы	Главный белок свода
Другой	Частица распознавания сигнала