СНРПБ2

СНРПБ2
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB показывать Список идентификационных кодов PDB 1A9N
Идентификаторы
Псевдонимы	SNRPB2 , Msl1, U2B'', малый ядерный рибонуклеопротеидный полипептид B2
Внешние идентификаторы	Опустить : 603520 ; МГИ : 104805 ; Гомологен : 37728 ; Генные карты : SNRPB2 ; ОМА : SNRPB2 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 20 (human) Band 20p12.1 Start 16,729,961 bp End 16,742,564 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 2 (mouse) Band 2|2 G1 Start 142,904,959 bp End 142,914,773 bp
показывать экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in oocyte secondary oocyte ganglionic eminence Achilles tendon monocyte epithelium of nasopharynx skin of hip appendix islet of Langerhans superficial temporal artery Top expressed in medial ganglionic eminence abdominal wall primitive streak maxillary prominence mandibular prominence dermis otic placode ventricular zone cumulus cell embryo More reference expression data BioGPS More reference expression data
показывать Генная онтология Molecular function nucleic acid binding snRNA stem-loop binding protein binding RNA binding snRNP binding U1 snRNA binding Cellular component catalytic step 2 spliceosome spliceosomal complex U2 snRNP small nuclear ribonucleoprotein complex fibrillar center nucleoplasm nuclear speck U1 snRNP U2-type catalytic step 2 spliceosome nucleus U2-type precatalytic spliceosome Biological process mRNA processing RNA splicing mRNA splicing, via spliceosome Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи Разновидность Человек Мышь Входить 6629 20639 Вместе ENSG00000125870 ENSMUSG00000008333 ЮниПрот P08579 Q9CQI7 RefSeq (мРНК) НМ_198220 НМ_003092 НМ_021335 RefSeq (белок) НП_003083 НП_937863 НП_067310 Местоположение (UCSC) Чр 20: 16,73 – 16,74 Мб Chr 2: 142,9 – 142,91 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Малый ядерный рибонуклеопротеин B U2 — белок , который у человека кодируется SNRPB2 геном .

Белок, кодируемый этим геном, связывается со стволовой петлей IV малого ядерного рибонуклеопротеина U2 (мяРНП U2) в присутствии мяРНП-А'. Кодируемый белок может играть роль в сплайсинге пре-мРНК . Аутоантитела пациентов с системной красной волчанкой часто распознают эпитопы кодируемого белка. два варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок. Для этого гена обнаружено

Дальнейшее чтение

• Фини Р.Дж., Зиве Г.В. (1990). «Ядерный обмен белков, специфичных для snRNP U1 и U2» . Дж. Клеточная Биол . 110 (4): 871–81. дои : 10.1083/jcb.110.4.871 . ПМК   2116108 . ПМИД   2139037 .
• Лайтинен Дж., Сарис П., Хёлтта Э., Петтерссон I (1995). Ген белка «U2-snRNP B» представляет собой ген, индуцирующий ранний рост». J. Cell. Biochem . 58 (4): 490–8. : 10.1002 /jcb.240580412 . PMID   7593271. . S2CID   24548645 doi
• Хун В., Беннетт М., Сяо Ю. и др. (1997). «Ассоциация U2 snRNP со сплайсосомным комплексом E». Нуклеиновые кислоты Рез . 25 (2): 354–61. дои : 10.1093/нар/25.2.354 . ПМК   146436 . ПМИД   9016565 .
• Лю Ц, Фишер Ю, Ван Ф, Дрейфусс Г (1997). «Продукт гена заболевания спинальной мышечной атрофией, SMN, и связанный с ним белок SIP1 находятся в комплексе со сплайсосомными белками snRNP» . Клетка . 90 (6): 1013–21. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80367-0 . ПМИД   9323129 . S2CID   10855404 .
• Мораиту М., Патрину-Джоргула М., Гиалис А. (1998). «Структурные/функциональные свойства многокомпонентной структуры млекопитающих, содержащей все основные сплайсосомные малые ядерные рибонуклеопротеиновые частицы» . Биохим. Дж . 332 (1): 135–44. дои : 10.1042/bj3320135 . ПМЦ   1219461 . ПМИД   9576861 .
• Прайс С.Р., Эванс П.Р., Нагай К. (1998). «Кристаллическая структура сплайсосомного белкового комплекса U2B»-U2A', связанного с фрагментом малой ядерной РНК U2». Nature . 394 (6694): 645–50. Bibcode : 1998Natur.394..645P . doi : 10.1038/29234 . ПМИД   9716128 . S2CID   204999419 .
• Нойбауэр Г., Кинг А., Раппсилбер Дж. и др. (1998). «Масс-спектрометрия и поиск в базе данных EST позволяют охарактеризовать мультибелковый сплайсосомный комплекс». Нат. Жене . 20 (1): 46–50. дои : 10.1038/1700 . ПМИД   9731529 . S2CID   585778 .
• Бюлер Д., Рейкер В., Люрманн Р., Фишер У. (2000). «Основная роль тюдоровского домена SMN в сборке сплайсосомных U-мяРНП: последствия спинальной мышечной атрофии» . Хм. Мол. Жене . 8 (13): 2351–7. дои : 10.1093/hmg/8.13.2351 . ПМИД   10556282 .
• Пеллицони Л., Шарру Б., Раппсильбер Дж. и др. (2001). «Функциональное взаимодействие между комплексом выживающих мотонейронов и РНК-полимеразой II» . Дж. Клеточная Биол . 152 (1): 75–85. дои : 10.1083/jcb.152.1.75 . ПМЦ   2193649 . ПМИД   11149922 .
• Делоукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. и др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ 20 хромосомы человека» . Природа . 414 (6866): 865–71. Бибкод : 2001Natur.414..865D . дои : 10.1038/414865a . ПМИД   11780052 .
• Фонг Ю.В., Чжоу Ц (2002). «Стимулирующее влияние факторов сплайсинга на элонгацию транскрипции». Природа . 414 (6866): 929–33. дои : 10.1038/414929а . ПМИД   11780068 . S2CID   1518837 .
• Юрица М.С., Ликлайдер Л.Дж., Гиги С.Р. и др. (2002). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, подходящих для трехмерного структурного анализа» . РНК . 8 (4): 426–39. дои : 10.1017/S1355838202021088 . ПМК   1370266 . ПМИД   11991638 .
• Чунг С., Чжоу З., Хаддлстон К.А. и др. (2002). «Кривая шея является компонентом сплайсосомы человека и участвует в процессе сплайсинга». Биохим. Биофиз. Акта . 1576 (3): 287–97. дои : 10.1016/S0167-4781(02)00368-8 . ПМИД   12084575 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК   528928 . ПМИД   15489334 .
• Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Нат. Биотехнология . 23 (1): 94–101. дои : 10.1038/nbt1046 . ПМИД   15592455 . S2CID   7200157 .
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ   1847948 . ПМИД   17353931 .