ХНРНПЦ

ХНРНПЦ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1TXP, 1WF2, 2MXY, 2MZ1, 3LN4
Идентификаторы
Псевдонимы	HNRNPC , C1, C2, HNRNP, HNRPC, SNRPC, гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин C (C1/C2), гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин C
Внешние идентификаторы	Опустить : 164020 ; МГИ : 107795 ; Гомологен : 74524 ; GeneCards : HNRNPC ; ОМА : HNRNPC — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 14 (human)
End	21,269,494 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 14 (mouse)
End	52,341,485 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; Achilles tendon; ; monocyte; ; left ovary; ; smooth muscle tissue; ; right uterine tube; ; epithelium of colon; ; right ovary; ; appendix;
	Top expressed in
	primitive streak; ; condyle; ; medial ganglionic eminence; ; fossa; ; abdominal wall; ; internal carotid artery; ; external carotid artery; ; renal corpuscle; ; endothelial cell of lymphatic vessel; ; migratory enteric neural crest cell;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; N6-methyladenosine-containing RNA binding; poly(U) RNA binding; mRNA 3'-UTR binding; protein binding; identical protein binding; nucleosomal DNA binding; nucleic acid binding; telomerase RNA binding; RNA binding;
Cellular component	cytosol; catalytic step 2 spliceosome; membrane; nucleoplasm; telomerase holoenzyme complex; extracellular exosome; spliceosomal complex; nucleus; actin cytoskeleton; extracellular region; protein-containing complex;
Biological process	negative regulation of telomere maintenance via telomerase; mRNA processing; osteoblast differentiation; 3'-UTR-mediated mRNA stabilization; mRNA splicing, via spliceosome; RNA splicing; RNA metabolic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	3183
	15381
	ENSG00000092199
	ENSMUSG00000060373
	P07910
	Q9Z204
	НМ_001077442 ; НМ_001077443 ; НМ_004500 ; НМ_031314
showНМ_001170981 ; НМ_001170982 ; НМ_001170983 ; НМ_001170984 ; НМ_016884 ;
	NM_001360172; NM_001360173; NM_001360174; NM_001360175; NM_001360176; NM_001360177; NM_001360178; NM_001360179; NM_001360180; NM_001360181; NM_001360182; NM_001360183; NM_001360184
	НП_001070910 ; НП_001070911 ; НП_004491 ; НП_112604
showНП_001164452 ; НП_001164453 ; НП_001164454 ; НП_001164455 ; НП_058580 ;
	NP_001347101; NP_001347102; NP_001347103; NP_001347104; NP_001347105; NP_001347106; NP_001347107; NP_001347108; NP_001347109; NP_001347110; NP_001347111; NP_001347112; NP_001347113
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гетерогенные ядерные рибонуклеопротеины C1/C2 — белок , который у человека кодируется HNRNPC геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Он аномально экспрессируется у плодов как ЭКО, так и ИКСИ , что может способствовать увеличению риска врожденных дефектов при этих ВРТ . ^{[ 7 ]}

Функция

Этот ген принадлежит к подсемейству повсеместно экспрессируемых гетерогенных ядерных рибонуклеопротеинов (hnRNP). hnRNP представляют собой РНК-связывающие белки и образуют комплекс с гетерогенной ядерной РНК (hnRNA). Эти белки связаны с пре-мРНК в ядре и, по-видимому, влияют на процессинг пре-мРНК (ссылка: Koenig J. Nature Structure and Molecular Biology 2010: iCLIP) и другие аспекты метаболизма и транспорта мРНК. Хотя все hnRNP присутствуют в ядре, некоторые, по-видимому, перемещаются между ядром и цитоплазмой. Белки hnRNP обладают отличными свойствами связывания нуклеиновых кислот. Регуляция транскрипции с помощью гормонального 1,25-дигидроксивитамина D(3) ( кальцитриола ) включает захват элементов ответа на витамин D (VDRE) HNRNPC или 1,25(OH)(2)D(3)-связанного рецептора витамина D (VDR). . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} Эта связь нарушается повышенным уровнем HNRNPC, вызывая у обоих людей форму наследственного резистентного к витамину D рахита (HVDRR). ^{[ 8 ]} и нечеловекообразные приматы. ^{[ 11 ]} Белок, кодируемый этим геном, может действовать как тетрамер и участвовать в сборке частиц 40S hnRNP. Видоспецифичная тетрамеризация субъединиц HNRNPC важна для связывания с нуклеиновыми кислотами, при этом сверхэкспрессия основных субъединиц HNRNPC человека в остеобластных клетках мыши придает устойчивость к витамину D. ^{[ 12 ]} Для этого гена описано множество вариантов транскрипта, кодирующих по крайней мере две разные изоформы. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что HNRNPC взаимодействует с Grb2 . ^{[ 13 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000092199 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000060373 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Накагава Т.Ю., Суонсон М.С., Уолд Б.Дж., Дрейфусс Дж. (май 1986 г.). «Молекулярное клонирование кДНК белков ядерной рибонуклеопротеиновой частицы C: семейство консервативных генов» . Proc Natl Acad Sci США . 83 (7): 2007–11. Бибкод : 1986ПНАС...83.2007Н . дои : 10.1073/pnas.83.7.2007 . ПМК 323219 . ПМИД 3457372 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин HNRPC C (C1/C2)» .
^ Чжан Ю, Чжан ЮЛ, Фэн С, Ву ЮТ, Лю АКС, Шэн Цзи, Цай Дж, Хуан ХФ (сентябрь 2008 г.). «Сравнительный протеомный анализ плаценты человека, полученной с помощью вспомогательных репродуктивных технологий». Протеомика . 8 (20): 4344–56. дои : 10.1002/pmic.200800294 . ПМИД 18792929 . S2CID 206362532 .
^ Jump up to: ^а ^б Лиссе Т.С., Лю Т., Ирмлер М., Беккерс Дж., Чен Х., Адамс Дж.С., Хьюисон М. (март 2011 г.). «Нацеливание на гены с помощью белка, связывающего элементы ответа на витамин D, раскрывает роль витамина D в передаче сигналов mTOR остеобластов» . ФАСЕБ Дж . 25 (3): 937–47. дои : 10.1096/fj.10-172577 . ПМК 3042839 . ПМИД 21123297 .
^ Чен Х., Хьюисон М., Адамс Дж.С. (декабрь 2006 г.). «Функциональная характеристика гетерогенного ядерного рибонуклеарного белка C1/C2 при устойчивости к витамину D: новый белок, связывающий элемент ответа» . J Биол Хим . 281 (51): 39114–20. дои : 10.1074/jbc.m608006200 . ПМИД 17071612 .
^ Лиссе Т.С., Хьюисон М., Адамс Дж.С. (март 2011 г.). «Белки, связывающие элементы гормонального ответа: новые регуляторы передачи сигналов витамина D и эстрогена» . Стероиды . 76 (4): 331–9. doi : 10.1016/j.steroids.2011.01.002 . ПМЦ 3042887 . ПМИД 21236284 .
^ Адамс Дж.С., Чен Х., Чун Р.Ф., Нгуен Л., Ву С., Рен С.Ю., Барсони Дж., Гакад М.А. (февраль 2003 г.). «Новые регуляторы действия и метаболизма витамина D: уроки, извлеченные в зоопарке Лос-Анджелеса». J Cell Biochem . 88 (2): 308–14. дои : 10.1002/jcb.10333 . ПМИД 12520531 . S2CID 25970432 .
^ Лиссе Т.С., Вадивел К., Баджадж С.П., Чун Р.Ф., Хьюисон М., Адамс Дж.С. (июль 2014 г.). «Гетеродимерная структура гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина C1/C2 диктует 1,25-дигидроксивитамин D-направленные транскрипционные события в остеобластах» . Исследование костей . 2 : 14011–. дои : 10.1038/boneres.2014.11 . ПМК 4261231 . ПМИД 25506471 .
^ Ромеро Ф., Рамос-Моралес Ф., Домингес А., Риос Р.М., Швайгхоффер Ф., Токе Б., Пинтор-Торо Х.А., Фишер С., Тортолеро М. (март 1998 г.). «Grb2 и его апоптотическая изоформа Grb3-3 связываются с гетерогенным ядерным рибонуклеопротеином C, и эти взаимодействия модулируются поли(U) РНК» . Ж. Биол. Хим . 273 (13): 7776–81. дои : 10.1074/jbc.273.13.7776 . ПМИД 9516488 .

Дальнейшее чтение

Гёрлах М., Виттекинд М., Бекман Р.А., Мюллер Л., Дрейфус Г. (1992). «Взаимодействие РНК-связывающего домена белков hnRNP C с РНК» . ЭМБО Дж . 11 (9): 3289–95. дои : 10.1002/j.1460-2075.1992.tb05407.x . ПМК 556863 . ПМИД 1380452 .
Виттекинд М., Герлах М., Фридрихс М., Дрейфус Г., Мюллер Л. (1992). «Назначения ЯМР 1H, 13C и 15N и глобальная картина сворачивания РНК-связывающего домена белков hnRNP C человека». Биохимия . 31 (27): 6254–65. дои : 10.1021/bi00142a013 . ПМИД 1385725 .
Берд К.Г., Суонсон М.С., Герлах М., Дрейфус Г. (1990). «Первичные структуры гетерогенных ядерных белков рибонуклеопротеинов A2, B1 и C2: разнообразие РНК-связывающих белков создается небольшими пептидными вставками» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 86 (24): 9788–92. Бибкод : 1989PNAS...86.9788B . дои : 10.1073/pnas.86.24.9788 . ПМК 298587 . ПМИД 2557628 .
Меррилл Б.М., Барнетт С.Ф., ЛеСтуржон В.М., Уильямс К.Р. (1989). «Различия в первичной структуре белков C1 и C2 частиц ядерного рибонуклеопротеина HeLa 40S» . Нуклеиновые кислоты Рез . 17 (21): 8441–9. дои : 10.1093/нар/17.21.8441 . ПМК 335017 . ПМИД 2587210 .
Суонсон М.С., Накагава Т.Ю., ЛеВан К., Дрейфусс Г. (1987). «Первичная структура белков ядерной рибонуклеопротеиновой частицы C человека: консервативность последовательности и доменной структуры в гетерогенных ядерных РНК, мРНК и пре-рРНК-связывающих белках» . Мол. Клетка. Биол . 7 (5): 1731–9. дои : 10.1128/mcb.7.5.1731 . ПМЦ 365274 . ПМИД 3110598 .
Себийон П., Бельджорд К., Каплан Х.К., Броуди Э., Мари Дж. (1995). «Мутация AT на G в полипиримидиновом тракте второго интрона человеческого гена бета-глобина снижает эффективность сплайсинга in vitro: доказательства повышенного взаимодействия hnRNP C» . Нуклеиновые кислоты Рез . 23 (17): 3419–25. дои : 10.1093/нар/23.17.3419 . ПМК 307219 . ПМИД 7567451 .
Като С., Секине С., О С.В., Ким Н.С., Умезава Ю., Абэ Н., Ёкояма-Кобаяши М., Аоки Т. (1995). «Создание банка полноразмерной кДНК человека». Джин . 150 (2): 243–50. дои : 10.1016/0378-1119(94)90433-2 . ПМИД 7821789 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Хуанг М., Реч Дж.Э., Нортингтон С.Дж., Фликер П.Ф., Майеда А., Крайнер А.Р., Лесторджен В.М. (1994). «Тетрамер C-белка связывает от 230 до 240 нуклеотидов пре-мРНК и образует зародыши сборки 40S гетерогенных ядерных рибонуклеопротеиновых частиц» . Мол. Клетка. Биол . 14 (1): 518–33. дои : 10.1128/mcb.14.1.518 . ПМК 358402 . ПМИД 8264621 .
Гамильтон Б.Дж., Надь Э., Мальтер Дж.С., Аррик Б.А., Ригби В.Ф. (1993). «Ассоциация гетерогенных ядерных белков рибонуклеопротеина A1 и C с повторяющимися последовательностями AUUUA» . Ж. Биол. Хим . 268 (12): 8881–7. дои : 10.1016/S0021-9258(18)52955-0 . ПМИД 8473331 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Ромеро Ф, Рамос-Моралес Ф, Домингес А, Риос Р.М., Швайгхоффер Ф, Токе Б, Пинтор-Торо Х.А., Фишер С., Тортолеро М (1998). «Grb2 и его апоптотическая изоформа Grb3-3 связываются с гетерогенным ядерным рибонуклеопротеином C, и эти взаимодействия модулируются поли(U) РНК» . Ж. Биол. Хим . 273 (13): 7776–81. дои : 10.1074/jbc.273.13.7776 . ПМИД 9516488 .
Нойбауэр Г., Кинг А., Раппсилбер Дж., Кальвио С., Уотсон М., Аджух П., Слиман Дж., Ламонд А., Манн М. (1998). «Масс-спектрометрия и поиск в базе данных EST позволяют охарактеризовать мультибелковый сплайсосомный комплекс». Нат. Жене . 20 (1): 46–50. дои : 10.1038/1700 . ПМИД 9731529 . S2CID 585778 .
Селла О., Герлиц Г., Ле С.И., Элрой-Стейн О. (1999). «Индуцированная дифференцировкой внутренняя трансляция c-sis мРНК: анализ цис-элементов и их связанного с дифференцировкой связывания с белком C hnRNP» . Мол. Клетка. Биол . 19 (8): 5429–40. дои : 10.1128/mcb.19.8.5429 . ПМЦ 84385 . ПМИД 10409733 .
Ван В., Фюрно Х., Ченг Х., Колдуэлл М.К., Хаттер Д., Лю Ю., Холбрук Н., Гороспе М. (2000). «HuR регулирует стабилизацию мРНК p21 под действием УФ-света» . Мол. Клетка. Биол . 20 (3): 760–9. дои : 10.1128/MCB.20.3.760-769.2000 . ПМК 85192 . ПМИД 10629032 .
Спонгберг К., Виклунд Л., Шварц С. (2000). «HuR, белок, участвующий в распаде мРНК онкогенов и факторов роста, связывается с 3'-концами РНК вируса гепатита С обеих полярностей» . Вирусология . 274 (2): 378–90. дои : 10.1006/виро.2000.0461 . ПМИД 10964780 .
Шахид Л., Брасуэлл Э.Х., ЛеСтуржон В.М., Крезель А.М. (2001). «Антипараллельный пучок из четырех спиралей ориентирует сайты связывания РНК с высоким сродством в hnRNP C: механизм активности РНК-шаперонина». Дж. Мол. Биол . 305 (4): 817–28. дои : 10.1006/jmbi.2000.4331 . ПМИД 11162094 .
Андерсен Дж.С., Лион CE, Фокс А.Х., Люнг А.К., Лам Ю.В., Стин Х., Манн М., Ламонд А.И. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Курс. Биол . 12 (1): 1–11. Бибкод : 2002CBio...12....1A . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . ПМИД 11790298 .
Стоун-младший, Коллинз Т. (2002). «Быстрое фосфорилирование гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина C1/C2 в ответ на физиологические уровни перекиси водорода в эндотелиальных клетках человека» . Ж. Биол. Хим . 277 (18): 15621–8. дои : 10.1074/jbc.M112153200 . ПМИД 11877401 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000092199 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000060373 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid3457372-5] Накагава Т.Ю., Суонсон М.С., Уолд Б.Дж., Дрейфусс Дж. (май 1986 г.). «Молекулярное клонирование кДНК белков ядерной рибонуклеопротеиновой частицы C: семейство консервативных генов» . Proc Natl Acad Sci США . 83 (7): 2007–11. Бибкод : 1986ПНАС...83.2007Н . дои : 10.1073/pnas.83.7.2007 . ПМК 323219 . ПМИД 3457372 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин HNRPC C (C1/C2)» .

[zhang-7] Чжан Ю, Чжан ЮЛ, Фэн С, Ву ЮТ, Лю АКС, Шэн Цзи, Цай Дж, Хуан ХФ (сентябрь 2008 г.). «Сравнительный протеомный анализ плаценты человека, полученной с помощью вспомогательных репродуктивных технологий». Протеомика . 8 (20): 4344–56. дои : 10.1002/pmic.200800294 . ПМИД 18792929 . S2CID 206362532 .

[Lisse-8] Jump up to: ^а ^б Лиссе Т.С., Лю Т., Ирмлер М., Беккерс Дж., Чен Х., Адамс Дж.С., Хьюисон М. (март 2011 г.). «Нацеливание на гены с помощью белка, связывающего элементы ответа на витамин D, раскрывает роль витамина D в передаче сигналов mTOR остеобластов» . ФАСЕБ Дж . 25 (3): 937–47. дои : 10.1096/fj.10-172577 . ПМК 3042839 . ПМИД 21123297 .

[Chen-9] Чен Х., Хьюисон М., Адамс Дж.С. (декабрь 2006 г.). «Функциональная характеристика гетерогенного ядерного рибонуклеарного белка C1/C2 при устойчивости к витамину D: новый белок, связывающий элемент ответа» . J Биол Хим . 281 (51): 39114–20. дои : 10.1074/jbc.m608006200 . ПМИД 17071612 .

[Lisse2-10] Лиссе Т.С., Хьюисон М., Адамс Дж.С. (март 2011 г.). «Белки, связывающие элементы гормонального ответа: новые регуляторы передачи сигналов витамина D и эстрогена» . Стероиды . 76 (4): 331–9. doi : 10.1016/j.steroids.2011.01.002 . ПМЦ 3042887 . ПМИД 21236284 .

[Adams-11] Адамс Дж.С., Чен Х., Чун Р.Ф., Нгуен Л., Ву С., Рен С.Ю., Барсони Дж., Гакад М.А. (февраль 2003 г.). «Новые регуляторы действия и метаболизма витамина D: уроки, извлеченные в зоопарке Лос-Анджелеса». J Cell Biochem . 88 (2): 308–14. дои : 10.1002/jcb.10333 . ПМИД 12520531 . S2CID 25970432 .

[Lisse3-12] Лиссе Т.С., Вадивел К., Баджадж С.П., Чун Р.Ф., Хьюисон М., Адамс Дж.С. (июль 2014 г.). «Гетеродимерная структура гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина C1/C2 диктует 1,25-дигидроксивитамин D-направленные транскрипционные события в остеобластах» . Исследование костей . 2 : 14011–. дои : 10.1038/boneres.2014.11 . ПМК 4261231 . ПМИД 25506471 .

[pmid9516488-13] Ромеро Ф., Рамос-Моралес Ф., Домингес А., Риос Р.М., Швайгхоффер Ф., Токе Б., Пинтор-Торо Х.А., Фишер С., Тортолеро М. (март 1998 г.). «Grb2 и его апоптотическая изоформа Grb3-3 связываются с гетерогенным ядерным рибонуклеопротеином C, и эти взаимодействия модулируются поли(U) РНК» . Ж. Биол. Хим . 273 (13): 7776–81. дои : 10.1074/jbc.273.13.7776 . ПМИД 9516488 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

v т и РНК-связывающий белок : рибонуклеопротеины.
snRNP	A A1 B B2 C D1 D2 D3 E F G N 70K/U1 spliceosomal RNA SNRNP200
hnRNP	A0 C L R
Other transcription	Telomerase
Translation	Ribosome
Vault ribonucleoprotein particles	Major vault protein
Other	Signal recognition particle